FuNGI

A0A420HSS5

Protein Details

Accession

A0A420HSS5

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
796-815	SKSNEKSVKRSYTRKPTEQQ	Hydrophilic
818-843	QRLRESSREERAKQRNHRMENSNFFT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

MDDEIWRVDYRILASEHSQQKRDLIRMAAFLWRTISQGYKDSLEKNISPRKQLQDLRELCKFNSFQKEENLESQIEKLKRGPQGQNHDQWAQAWIAALISSKEIPDSVWPERRIYRENTVQGAFATLDSQKLEFARKGKDMSKPSETASSSKNNNSKXKTERTAPKCPCGERHYFNQCEHINIALRKQGYIEDKNIMENIRSWFYENDDKYDKMINSLEKNKGVLADYLQDREAYATISKSFASCRVQDKSVILDTATTNHIFHDLSRFITYEKLNVPIEVRTGDSQCFVIGTGSVRLTVLTDRGPKNIKVDNVQHIPGFHVNIIAYKAFRIGGAYLDGKSNWIRRVNDDRCVAICENSACGSFLVLEKNKTQRPNIMSFATNSKQKLSTATAETWHQRLGHMAFENINQLPSNVDGVEVIDRKKKDDRISSNILCEVCNIAVSQTNISRQPQHPGDTPFQRTHIDLIHEELGLSNERYIFHFYCQLTKFNIAYITSDRKQKTLVNCFAQAHGLIKKWGFDIQFVRMDQEAGLQSEFNEYCAENGIWLEKTPTDTKEPNGAAERSGGWIITVARKLRLQSCLPSNLWPYFVLAAVRILNRTPKKALGYKTSFELVTKRRPDLSGYRIPGSKCYVTKKNIPALQKQTSRSDIGYYISNSARNISIVWMPHGNKVISSRDVRIDEMSHFSWKDVKNPEIVPTFEDRFVSIEHGNPVDQLIEDVMEDPACIHNKIDKHASNENPSISEPKNTNDAYNNEGNLPTPRNTPEVLEENTSTSDIIIPDEIVEVYTEPTTETISKSNEKSVKRSYTRKPTEQQVLQRLRESSREERAKQRNHRMENSNFFTKASIIDHISTDDCLQSVYASFAASQTRRLHIDQLQKPPSRWDTMLSHPESSGFIGAAEIEFQSQENKGTWEEVPKPTNVKVLPLKWVFTYKLDDKGYLVKYKARICVRAAYGRNKIFDRCKI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.33
3	0.41
4	0.45
5	0.46
6	0.42
7	0.48
8	0.52
9	0.53
10	0.48
11	0.44
12	0.41
13	0.41
14	0.41
15	0.4
16	0.34
17	0.31
18	0.29
19	0.24
20	0.23
21	0.22
22	0.25
23	0.21
24	0.26
25	0.28
26	0.28
27	0.31
28	0.32
29	0.36
30	0.38
31	0.39
32	0.43
33	0.51
34	0.51
35	0.54
36	0.59
37	0.61
38	0.65
39	0.68
40	0.65
41	0.66
42	0.68
43	0.68
44	0.67
45	0.62
46	0.53
47	0.55
48	0.5
49	0.47
50	0.51
51	0.48
52	0.45
53	0.51
54	0.56
55	0.52
56	0.54
57	0.5
58	0.4
59	0.38
60	0.37
61	0.37
62	0.32
63	0.31
64	0.31
65	0.34
66	0.4
67	0.48
68	0.52
69	0.54
70	0.63
71	0.69
72	0.72
73	0.71
74	0.65
75	0.58
76	0.5
77	0.43
78	0.33
79	0.25
80	0.17
81	0.12
82	0.1
83	0.1
84	0.1
85	0.08
86	0.09
87	0.09
88	0.09
89	0.09
90	0.09
91	0.1
92	0.15
93	0.2
94	0.26
95	0.34
96	0.36
97	0.4
98	0.45
99	0.5
100	0.5
101	0.5
102	0.51
103	0.52
104	0.55
105	0.55
106	0.5
107	0.45
108	0.4
109	0.35
110	0.27
111	0.18
112	0.15
113	0.11
114	0.11
115	0.12
116	0.12
117	0.12
118	0.14
119	0.18
120	0.2
121	0.25
122	0.29
123	0.32
124	0.37
125	0.4
126	0.47
127	0.5
128	0.52
129	0.55
130	0.5
131	0.49
132	0.51
133	0.48
134	0.42
135	0.4
136	0.4
137	0.38
138	0.44
139	0.5
140	0.5
141	0.55
142	0.61
143	0.63
144	0.63
145	0.65
146	0.68
147	0.71
148	0.71
149	0.74
150	0.75
151	0.76
152	0.75
153	0.71
154	0.68
155	0.65
156	0.66
157	0.6
158	0.61
159	0.62
160	0.6
161	0.58
162	0.59
163	0.53
164	0.47
165	0.44
166	0.37
167	0.34
168	0.31
169	0.32
170	0.28
171	0.28
172	0.25
173	0.24
174	0.26
175	0.27
176	0.3
177	0.3
178	0.31
179	0.31
180	0.32
181	0.33
182	0.28
183	0.22
184	0.21
185	0.22
186	0.2
187	0.2
188	0.21
189	0.2
190	0.24
191	0.32
192	0.3
193	0.32
194	0.33
195	0.33
196	0.33
197	0.38
198	0.33
199	0.27
200	0.3
201	0.29
202	0.33
203	0.39
204	0.42
205	0.38
206	0.38
207	0.35
208	0.33
209	0.29
210	0.23
211	0.18
212	0.19
213	0.19
214	0.2
215	0.2
216	0.18
217	0.17
218	0.17
219	0.15
220	0.11
221	0.1
222	0.1
223	0.11
224	0.12
225	0.12
226	0.11
227	0.12
228	0.16
229	0.19
230	0.21
231	0.27
232	0.3
233	0.31
234	0.33
235	0.33
236	0.32
237	0.3
238	0.26
239	0.2
240	0.18
241	0.16
242	0.16
243	0.17
244	0.14
245	0.12
246	0.12
247	0.13
248	0.12
249	0.12
250	0.16
251	0.14
252	0.16
253	0.17
254	0.17
255	0.16
256	0.2
257	0.2
258	0.18
259	0.19
260	0.21
261	0.21
262	0.21
263	0.22
264	0.18
265	0.19
266	0.16
267	0.16
268	0.14
269	0.15
270	0.15
271	0.14
272	0.14
273	0.12
274	0.11
275	0.1
276	0.08
277	0.07
278	0.07
279	0.09
280	0.09
281	0.09
282	0.09
283	0.08
284	0.09
285	0.09
286	0.09
287	0.11
288	0.18
289	0.19
290	0.23
291	0.27
292	0.27
293	0.31
294	0.34
295	0.33
296	0.32
297	0.36
298	0.39
299	0.39
300	0.39
301	0.35
302	0.31
303	0.31
304	0.27
305	0.22
306	0.15
307	0.13
308	0.11
309	0.12
310	0.13
311	0.11
312	0.1
313	0.09
314	0.09
315	0.08
316	0.08
317	0.08
318	0.07
319	0.07
320	0.1
321	0.11
322	0.1
323	0.11
324	0.11
325	0.12
326	0.15
327	0.17
328	0.2
329	0.25
330	0.25
331	0.31
332	0.42
333	0.43
334	0.47
335	0.45
336	0.42
337	0.37
338	0.4
339	0.34
340	0.24
341	0.23
342	0.16
343	0.15
344	0.15
345	0.14
346	0.1
347	0.1
348	0.09
349	0.08
350	0.08
351	0.13
352	0.13
353	0.15
354	0.18
355	0.24
356	0.29
357	0.31
358	0.32
359	0.33
360	0.37
361	0.4
362	0.4
363	0.36
364	0.32
365	0.31
366	0.35
367	0.31
368	0.3
369	0.25
370	0.24
371	0.23
372	0.22
373	0.24
374	0.22
375	0.22
376	0.22
377	0.22
378	0.22
379	0.23
380	0.25
381	0.23
382	0.21
383	0.17
384	0.14
385	0.16
386	0.16
387	0.17
388	0.16
389	0.15
390	0.14
391	0.15
392	0.17
393	0.14
394	0.14
395	0.1
396	0.09
397	0.09
398	0.09
399	0.09
400	0.06
401	0.06
402	0.05
403	0.06
404	0.09
405	0.1
406	0.1
407	0.14
408	0.14
409	0.17
410	0.22
411	0.27
412	0.31
413	0.39
414	0.44
415	0.47
416	0.55
417	0.53
418	0.5
419	0.47
420	0.41
421	0.32
422	0.25
423	0.19
424	0.11
425	0.1
426	0.08
427	0.06
428	0.08
429	0.08
430	0.09
431	0.1
432	0.12
433	0.13
434	0.15
435	0.19
436	0.18
437	0.24
438	0.25
439	0.27
440	0.29
441	0.32
442	0.36
443	0.36
444	0.39
445	0.34
446	0.33
447	0.31
448	0.27
449	0.24
450	0.21
451	0.18
452	0.15
453	0.16
454	0.15
455	0.14
456	0.13
457	0.11
458	0.1
459	0.09
460	0.09
461	0.07
462	0.06
463	0.07
464	0.08
465	0.12
466	0.12
467	0.12
468	0.18
469	0.18
470	0.23
471	0.24
472	0.25
473	0.22
474	0.24
475	0.23
476	0.18
477	0.19
478	0.13
479	0.14
480	0.15
481	0.2
482	0.2
483	0.26
484	0.26
485	0.25
486	0.27
487	0.29
488	0.34
489	0.37
490	0.4
491	0.37
492	0.39
493	0.39
494	0.37
495	0.34
496	0.27
497	0.2
498	0.16
499	0.13
500	0.12
501	0.11
502	0.12
503	0.12
504	0.14
505	0.12
506	0.13
507	0.15
508	0.17
509	0.21
510	0.2
511	0.21
512	0.18
513	0.18
514	0.15
515	0.15
516	0.12
517	0.09
518	0.09
519	0.08
520	0.08
521	0.11
522	0.11
523	0.09
524	0.09
525	0.08
526	0.08
527	0.1
528	0.1
529	0.07
530	0.07
531	0.08
532	0.07
533	0.08
534	0.08
535	0.07
536	0.1
537	0.12
538	0.14
539	0.17
540	0.19
541	0.2
542	0.26
543	0.26
544	0.25
545	0.27
546	0.25
547	0.21
548	0.2
549	0.19
550	0.14
551	0.13
552	0.11
553	0.07
554	0.08
555	0.08
556	0.1
557	0.13
558	0.13
559	0.15
560	0.16
561	0.18
562	0.2
563	0.24
564	0.23
565	0.25
566	0.28
567	0.31
568	0.31
569	0.32
570	0.32
571	0.28
572	0.27
573	0.23
574	0.2
575	0.15
576	0.15
577	0.12
578	0.09
579	0.09
580	0.1
581	0.1
582	0.09
583	0.1
584	0.17
585	0.19
586	0.22
587	0.23
588	0.25
589	0.29
590	0.35
591	0.38
592	0.39
593	0.42
594	0.4
595	0.4
596	0.38
597	0.34
598	0.28
599	0.31
600	0.26
601	0.3
602	0.33
603	0.32
604	0.33
605	0.33
606	0.37
607	0.38
608	0.4
609	0.39
610	0.39
611	0.4
612	0.41
613	0.41
614	0.39
615	0.37
616	0.34
617	0.29
618	0.33
619	0.38
620	0.39
621	0.47
622	0.5
623	0.53
624	0.54
625	0.54
626	0.56
627	0.56
628	0.6
629	0.58
630	0.55
631	0.52
632	0.5
633	0.48
634	0.4
635	0.34
636	0.27
637	0.23
638	0.22
639	0.18
640	0.19
641	0.18
642	0.19
643	0.17
644	0.17
645	0.16
646	0.14
647	0.13
648	0.11
649	0.13
650	0.12
651	0.14
652	0.18
653	0.18
654	0.21
655	0.24
656	0.22
657	0.21
658	0.24
659	0.25
660	0.25
661	0.26
662	0.26
663	0.27
664	0.29
665	0.29
666	0.27
667	0.25
668	0.22
669	0.24
670	0.23
671	0.21
672	0.2
673	0.19
674	0.24
675	0.24
676	0.29
677	0.3
678	0.3
679	0.32
680	0.33
681	0.37
682	0.33
683	0.33
684	0.29
685	0.28
686	0.29
687	0.25
688	0.25
689	0.2
690	0.18
691	0.18
692	0.19
693	0.15
694	0.15
695	0.16
696	0.17
697	0.16
698	0.15
699	0.14
700	0.11
701	0.1
702	0.08
703	0.06
704	0.05
705	0.05
706	0.06
707	0.06
708	0.06
709	0.05
710	0.06
711	0.09
712	0.11
713	0.11
714	0.11
715	0.15
716	0.17
717	0.22
718	0.3
719	0.3
720	0.34
721	0.42
722	0.46
723	0.48
724	0.49
725	0.46
726	0.4
727	0.37
728	0.36
729	0.3
730	0.3
731	0.25
732	0.24
733	0.3
734	0.28
735	0.3
736	0.3
737	0.31
738	0.32
739	0.33
740	0.32
741	0.26
742	0.26
743	0.25
744	0.23
745	0.24
746	0.2
747	0.2
748	0.22
749	0.23
750	0.24
751	0.24
752	0.26
753	0.28
754	0.29
755	0.28
756	0.27
757	0.26
758	0.26
759	0.24
760	0.19
761	0.14
762	0.13
763	0.1
764	0.11
765	0.09
766	0.08
767	0.08
768	0.09
769	0.08
770	0.07
771	0.07
772	0.06
773	0.07
774	0.07
775	0.07
776	0.07
777	0.07
778	0.1
779	0.1
780	0.12
781	0.15
782	0.2
783	0.25
784	0.27
785	0.35
786	0.39
787	0.41
788	0.46
789	0.51
790	0.57
791	0.6
792	0.67
793	0.69
794	0.73
795	0.79
796	0.81
797	0.78
798	0.77
799	0.79
800	0.77
801	0.76
802	0.75
803	0.74
804	0.68
805	0.66
806	0.6
807	0.52
808	0.51
809	0.49
810	0.46
811	0.47
812	0.53
813	0.54
814	0.61
815	0.69
816	0.73
817	0.77
818	0.81
819	0.81
820	0.8
821	0.84
822	0.83
823	0.81
824	0.81
825	0.77
826	0.72
827	0.62
828	0.54
829	0.47
830	0.39
831	0.32
832	0.25
833	0.22
834	0.18
835	0.19
836	0.19
837	0.2
838	0.21
839	0.19
840	0.18
841	0.15
842	0.12
843	0.11
844	0.1
845	0.08
846	0.08
847	0.09
848	0.08
849	0.08
850	0.08
851	0.1
852	0.17
853	0.17
854	0.23
855	0.25
856	0.29
857	0.32
858	0.34
859	0.39
860	0.39
861	0.49
862	0.5
863	0.57
864	0.62
865	0.63
866	0.62
867	0.64
868	0.62
869	0.57
870	0.51
871	0.46
872	0.42
873	0.47
874	0.55
875	0.5
876	0.46
877	0.4
878	0.4
879	0.36
880	0.32
881	0.24
882	0.14
883	0.11
884	0.09
885	0.09
886	0.08
887	0.08
888	0.07
889	0.06
890	0.07
891	0.07
892	0.09
893	0.1
894	0.12
895	0.13
896	0.15
897	0.16
898	0.19
899	0.2
900	0.26
901	0.32
902	0.37
903	0.38
904	0.4
905	0.43
906	0.42
907	0.48
908	0.4
909	0.42
910	0.43
911	0.43
912	0.49
913	0.47
914	0.47
915	0.42
916	0.47
917	0.41
918	0.36
919	0.42
920	0.36
921	0.42
922	0.42
923	0.4
924	0.37
925	0.43
926	0.45
927	0.43
928	0.42
929	0.39
930	0.44
931	0.49
932	0.55
933	0.54
934	0.53
935	0.51
936	0.57
937	0.58
938	0.6
939	0.61
940	0.62
941	0.64
942	0.65
943	0.66
944	0.61
945	0.62

A0A420HSS5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer