Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A420HIB0

Protein Details
Accession A0A420HIB0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
172-209REEGSRQKYRSPQKRRDGSRYRDKQSLKTNPPRKSDKTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
170-205RKREEGSRQKYRSPQKRRDGSRYRDKQSLKTNPPRK
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MHLKAKYTKTSESTASTYMSKTQSFPDYYNVEEHGIDNAWETLKLYRRKLSAADALLKTTYPDKGLFHLLTKALSDKYNSILDGLRTNPQTSIEERLHILQEKEEDSKVRSIQAHPAKGKLRHFSTRRGSDVSMTDVQANMLCYRCDGEDHVSRDCPYAEAIKDYAIALRKREEGSRQKYRSPQKRRDGSRYRDKQSLKTNPPRKSDKTSHGYAARKNASDTSTYDSCDEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.37
3 0.32
4 0.29
5 0.3
6 0.3
7 0.26
8 0.24
9 0.26
10 0.3
11 0.32
12 0.32
13 0.33
14 0.31
15 0.32
16 0.33
17 0.3
18 0.26
19 0.23
20 0.22
21 0.17
22 0.15
23 0.14
24 0.12
25 0.11
26 0.1
27 0.1
28 0.11
29 0.13
30 0.21
31 0.27
32 0.31
33 0.35
34 0.36
35 0.39
36 0.4
37 0.41
38 0.4
39 0.37
40 0.4
41 0.35
42 0.35
43 0.32
44 0.3
45 0.25
46 0.2
47 0.18
48 0.12
49 0.13
50 0.13
51 0.16
52 0.21
53 0.2
54 0.2
55 0.21
56 0.2
57 0.19
58 0.18
59 0.18
60 0.14
61 0.14
62 0.14
63 0.13
64 0.16
65 0.16
66 0.16
67 0.15
68 0.14
69 0.14
70 0.15
71 0.15
72 0.17
73 0.16
74 0.17
75 0.16
76 0.17
77 0.18
78 0.17
79 0.22
80 0.18
81 0.18
82 0.19
83 0.19
84 0.19
85 0.19
86 0.17
87 0.12
88 0.13
89 0.14
90 0.15
91 0.14
92 0.14
93 0.14
94 0.16
95 0.16
96 0.17
97 0.17
98 0.16
99 0.24
100 0.29
101 0.33
102 0.31
103 0.36
104 0.37
105 0.4
106 0.43
107 0.4
108 0.39
109 0.42
110 0.44
111 0.48
112 0.52
113 0.52
114 0.5
115 0.47
116 0.43
117 0.37
118 0.35
119 0.31
120 0.24
121 0.2
122 0.18
123 0.15
124 0.14
125 0.13
126 0.13
127 0.09
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.1
135 0.14
136 0.2
137 0.23
138 0.25
139 0.25
140 0.25
141 0.26
142 0.24
143 0.19
144 0.14
145 0.15
146 0.14
147 0.14
148 0.14
149 0.13
150 0.14
151 0.13
152 0.15
153 0.17
154 0.18
155 0.18
156 0.2
157 0.23
158 0.25
159 0.28
160 0.34
161 0.39
162 0.46
163 0.55
164 0.56
165 0.6
166 0.67
167 0.75
168 0.76
169 0.76
170 0.78
171 0.77
172 0.84
173 0.86
174 0.88
175 0.87
176 0.86
177 0.86
178 0.86
179 0.81
180 0.79
181 0.74
182 0.72
183 0.72
184 0.73
185 0.73
186 0.74
187 0.78
188 0.77
189 0.81
190 0.82
191 0.78
192 0.77
193 0.75
194 0.74
195 0.72
196 0.68
197 0.68
198 0.67
199 0.67
200 0.63
201 0.64
202 0.6
203 0.54
204 0.52
205 0.48
206 0.42
207 0.39
208 0.36
209 0.34
210 0.3
211 0.3