Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A420I5U1

Protein Details
Accession A0A420I5U1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-30QATLKHVSPKSKNRRSSLFIHydrophilic
300-333STKKAMPRSMSKAKPNNKSKSKSKVKSTVSSNKHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
302-325KKAMPRSMSKAKPNNKSKSKSKVK
Subcellular Location(s) mito 13mito_nucl 13, nucl 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR037431  REX4_DEDDh_dom  
IPR047021  REXO1/3/4-like  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0008408  F:3'-5' exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00929  RNase_T  
CDD cd06144  REX4_like  
Amino Acid Sequences MELSSNWLKLQATLKHVSPKSKNRRSSLFIETQNNPAIKRRRLSANSHRTSTSKTSSDTKSMNSVFTEDSNISKKTSNPGILSQTFSSLSLWAHENDISASDLAEAYGGKLQKNMTVISDVINGGLQDKVEIGKYVGIDCEMVGVGTKDRSVLARVSIVNFHGVQVYDSFVKPIEFVTNWRTEISGVSANSMKTAREFKEVQKNVASILKDRIVVGHALWNDFKVMQLSHPRRDIRDTSLFSGFQQFSSGRPGLKLLADKVLGVEIQNGRHSSIEDARATMFIFRRYKSALEAEHIQRFSTKKAMPRSMSKAKPNNKSKSKSKVKSTVSSNKH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.47
3 0.51
4 0.56
5 0.58
6 0.63
7 0.68
8 0.74
9 0.79
10 0.76
11 0.81
12 0.77
13 0.74
14 0.71
15 0.69
16 0.66
17 0.64
18 0.59
19 0.56
20 0.56
21 0.51
22 0.43
23 0.44
24 0.45
25 0.45
26 0.47
27 0.48
28 0.52
29 0.56
30 0.65
31 0.67
32 0.7
33 0.69
34 0.68
35 0.65
36 0.57
37 0.57
38 0.54
39 0.49
40 0.41
41 0.38
42 0.42
43 0.44
44 0.48
45 0.44
46 0.39
47 0.41
48 0.39
49 0.37
50 0.31
51 0.29
52 0.24
53 0.23
54 0.24
55 0.17
56 0.19
57 0.21
58 0.21
59 0.21
60 0.22
61 0.22
62 0.26
63 0.31
64 0.33
65 0.31
66 0.34
67 0.4
68 0.39
69 0.41
70 0.34
71 0.3
72 0.26
73 0.24
74 0.2
75 0.14
76 0.13
77 0.11
78 0.12
79 0.11
80 0.12
81 0.12
82 0.11
83 0.1
84 0.11
85 0.11
86 0.09
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.06
91 0.06
92 0.05
93 0.05
94 0.08
95 0.09
96 0.08
97 0.1
98 0.11
99 0.13
100 0.15
101 0.14
102 0.12
103 0.13
104 0.13
105 0.12
106 0.14
107 0.11
108 0.1
109 0.09
110 0.08
111 0.07
112 0.07
113 0.06
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.07
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.11
142 0.11
143 0.12
144 0.12
145 0.12
146 0.12
147 0.11
148 0.11
149 0.09
150 0.08
151 0.08
152 0.07
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.08
162 0.07
163 0.09
164 0.13
165 0.16
166 0.16
167 0.16
168 0.16
169 0.14
170 0.14
171 0.15
172 0.14
173 0.11
174 0.12
175 0.14
176 0.13
177 0.14
178 0.14
179 0.12
180 0.11
181 0.16
182 0.16
183 0.19
184 0.22
185 0.26
186 0.37
187 0.38
188 0.38
189 0.36
190 0.35
191 0.31
192 0.33
193 0.28
194 0.19
195 0.21
196 0.2
197 0.18
198 0.18
199 0.17
200 0.14
201 0.14
202 0.12
203 0.13
204 0.12
205 0.13
206 0.13
207 0.12
208 0.12
209 0.12
210 0.12
211 0.09
212 0.09
213 0.11
214 0.22
215 0.27
216 0.31
217 0.38
218 0.4
219 0.41
220 0.46
221 0.46
222 0.42
223 0.45
224 0.44
225 0.41
226 0.42
227 0.4
228 0.34
229 0.38
230 0.31
231 0.23
232 0.22
233 0.19
234 0.17
235 0.23
236 0.24
237 0.17
238 0.17
239 0.19
240 0.18
241 0.2
242 0.22
243 0.17
244 0.2
245 0.2
246 0.19
247 0.18
248 0.17
249 0.14
250 0.12
251 0.15
252 0.13
253 0.15
254 0.19
255 0.19
256 0.19
257 0.2
258 0.2
259 0.2
260 0.23
261 0.26
262 0.23
263 0.24
264 0.23
265 0.23
266 0.23
267 0.23
268 0.2
269 0.23
270 0.26
271 0.26
272 0.29
273 0.31
274 0.33
275 0.32
276 0.36
277 0.3
278 0.31
279 0.38
280 0.4
281 0.44
282 0.43
283 0.39
284 0.37
285 0.37
286 0.35
287 0.36
288 0.35
289 0.35
290 0.45
291 0.54
292 0.55
293 0.62
294 0.68
295 0.7
296 0.74
297 0.76
298 0.77
299 0.77
300 0.82
301 0.83
302 0.85
303 0.85
304 0.86
305 0.85
306 0.86
307 0.88
308 0.86
309 0.86
310 0.86
311 0.83
312 0.83
313 0.84