Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A420HRF6

Protein Details
Accession A0A420HRF6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-50LVDQRDQNRSPSKRKASTKHNVSLSKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
80-123PTKKAKTAASKIAPARVTASKRLANAKQQIKKTEAAKATLAKKP
Subcellular Location(s) mito 14.5, cyto_mito 11.5, cyto 7.5, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009091  RCC1/BLIP-II  
IPR000408  Reg_chr_condens  
Pfam View protein in Pfam  
PF00415  RCC1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00626  RCC1_2  
PS50012  RCC1_3  
Amino Acid Sequences MSSTVKTSAPKGLRASIRVASKNTLVDQRDQNRSPSKRKASTKHNVSLSKSSSIKILEPTSHTTKMAPKRKATDSHPEVPTKKAKTAASKIAPARVTASKRLANAKQQIKKTEAAKATLAKKPTNLEVKVKSQKKDKTVATTKSVPKKVTKAPVIINTPPTQRLDIYVFGEGSAGELGLGAHKLDGKSPVDVKRPRLNQLLSAKSVGVVQLAVGGMHCAALTHDNRILTWGVNDQGALGREAAQGGKMMDLKENADSDSDSDSDENEDSGLNPNEAEPREIDCTDIEEGTKFAAVYAGDSTTFALTTDGYVYGWGTFRGNDGILGFRQDVKIQHKPMLIPELKKITDIACGTNHVLALDTKGKVFTWGAGEQNQLARRVVSRTATGALVPREFGLGRKNIKYIGCGDYHSFAISNKGDVYSWGLNTFGQTGVPKEGLNEEDENTVHLPTKVESLGDYKFKQITGGAHHTIACTETGEVLIWGRIDNNQAGILIEDIPKENLFFDENNRPRYLTKPTQIPDIAGTWVATGNDTCIVVDTEGKAYSWGFSSNYQTGQGTDEDITKATHIDNTAVRGKKLVFAGVGGQFGVLAGCSL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.5
3 0.47
4 0.51
5 0.5
6 0.49
7 0.45
8 0.43
9 0.44
10 0.43
11 0.44
12 0.39
13 0.41
14 0.48
15 0.52
16 0.58
17 0.56
18 0.6
19 0.63
20 0.68
21 0.71
22 0.72
23 0.74
24 0.74
25 0.82
26 0.83
27 0.84
28 0.86
29 0.87
30 0.85
31 0.83
32 0.8
33 0.75
34 0.75
35 0.68
36 0.64
37 0.56
38 0.48
39 0.43
40 0.39
41 0.35
42 0.33
43 0.32
44 0.29
45 0.32
46 0.38
47 0.4
48 0.41
49 0.38
50 0.36
51 0.41
52 0.48
53 0.54
54 0.54
55 0.55
56 0.6
57 0.67
58 0.71
59 0.68
60 0.69
61 0.67
62 0.69
63 0.67
64 0.67
65 0.61
66 0.61
67 0.63
68 0.56
69 0.52
70 0.5
71 0.5
72 0.52
73 0.58
74 0.61
75 0.57
76 0.6
77 0.59
78 0.59
79 0.54
80 0.45
81 0.43
82 0.4
83 0.39
84 0.38
85 0.42
86 0.38
87 0.41
88 0.49
89 0.49
90 0.51
91 0.56
92 0.6
93 0.61
94 0.63
95 0.65
96 0.61
97 0.61
98 0.55
99 0.55
100 0.48
101 0.44
102 0.42
103 0.44
104 0.45
105 0.44
106 0.45
107 0.38
108 0.38
109 0.38
110 0.41
111 0.43
112 0.41
113 0.44
114 0.45
115 0.53
116 0.6
117 0.63
118 0.61
119 0.62
120 0.65
121 0.64
122 0.67
123 0.62
124 0.63
125 0.66
126 0.66
127 0.63
128 0.65
129 0.66
130 0.67
131 0.68
132 0.61
133 0.57
134 0.59
135 0.6
136 0.61
137 0.58
138 0.54
139 0.53
140 0.57
141 0.57
142 0.53
143 0.49
144 0.43
145 0.41
146 0.38
147 0.35
148 0.29
149 0.24
150 0.24
151 0.23
152 0.22
153 0.22
154 0.2
155 0.18
156 0.16
157 0.16
158 0.13
159 0.1
160 0.08
161 0.05
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.13
173 0.13
174 0.16
175 0.21
176 0.26
177 0.33
178 0.38
179 0.43
180 0.47
181 0.5
182 0.53
183 0.54
184 0.5
185 0.49
186 0.53
187 0.5
188 0.43
189 0.4
190 0.35
191 0.28
192 0.27
193 0.2
194 0.12
195 0.07
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.03
206 0.04
207 0.08
208 0.09
209 0.12
210 0.14
211 0.14
212 0.14
213 0.16
214 0.16
215 0.11
216 0.12
217 0.11
218 0.1
219 0.1
220 0.1
221 0.08
222 0.09
223 0.1
224 0.09
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.1
237 0.11
238 0.11
239 0.12
240 0.12
241 0.11
242 0.1
243 0.1
244 0.09
245 0.1
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.09
251 0.09
252 0.07
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.1
257 0.1
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.12
262 0.13
263 0.13
264 0.1
265 0.12
266 0.15
267 0.15
268 0.15
269 0.11
270 0.13
271 0.13
272 0.12
273 0.1
274 0.07
275 0.08
276 0.07
277 0.07
278 0.05
279 0.04
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.06
302 0.05
303 0.05
304 0.06
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.08
310 0.07
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.11
316 0.14
317 0.19
318 0.26
319 0.26
320 0.3
321 0.31
322 0.31
323 0.31
324 0.36
325 0.32
326 0.27
327 0.29
328 0.29
329 0.28
330 0.28
331 0.27
332 0.19
333 0.2
334 0.2
335 0.18
336 0.14
337 0.16
338 0.16
339 0.16
340 0.15
341 0.1
342 0.1
343 0.08
344 0.1
345 0.12
346 0.12
347 0.11
348 0.12
349 0.12
350 0.13
351 0.13
352 0.11
353 0.12
354 0.14
355 0.15
356 0.16
357 0.17
358 0.16
359 0.2
360 0.21
361 0.18
362 0.16
363 0.15
364 0.15
365 0.17
366 0.19
367 0.17
368 0.16
369 0.16
370 0.17
371 0.16
372 0.16
373 0.17
374 0.16
375 0.14
376 0.14
377 0.12
378 0.12
379 0.12
380 0.12
381 0.14
382 0.18
383 0.22
384 0.24
385 0.25
386 0.27
387 0.28
388 0.29
389 0.28
390 0.25
391 0.22
392 0.22
393 0.23
394 0.21
395 0.2
396 0.18
397 0.15
398 0.12
399 0.16
400 0.14
401 0.14
402 0.13
403 0.13
404 0.13
405 0.13
406 0.18
407 0.14
408 0.15
409 0.14
410 0.14
411 0.13
412 0.14
413 0.14
414 0.09
415 0.08
416 0.08
417 0.1
418 0.12
419 0.13
420 0.12
421 0.12
422 0.14
423 0.14
424 0.16
425 0.16
426 0.15
427 0.15
428 0.15
429 0.16
430 0.15
431 0.14
432 0.13
433 0.12
434 0.12
435 0.11
436 0.14
437 0.12
438 0.12
439 0.12
440 0.14
441 0.17
442 0.22
443 0.22
444 0.23
445 0.24
446 0.23
447 0.23
448 0.22
449 0.22
450 0.24
451 0.3
452 0.28
453 0.28
454 0.29
455 0.28
456 0.26
457 0.23
458 0.16
459 0.1
460 0.09
461 0.08
462 0.08
463 0.08
464 0.08
465 0.07
466 0.08
467 0.07
468 0.07
469 0.08
470 0.09
471 0.11
472 0.12
473 0.12
474 0.12
475 0.12
476 0.12
477 0.11
478 0.11
479 0.1
480 0.1
481 0.1
482 0.11
483 0.12
484 0.12
485 0.12
486 0.12
487 0.11
488 0.13
489 0.13
490 0.18
491 0.28
492 0.34
493 0.38
494 0.39
495 0.39
496 0.38
497 0.42
498 0.45
499 0.43
500 0.44
501 0.49
502 0.5
503 0.56
504 0.55
505 0.52
506 0.45
507 0.37
508 0.32
509 0.23
510 0.21
511 0.14
512 0.14
513 0.13
514 0.11
515 0.09
516 0.1
517 0.1
518 0.1
519 0.1
520 0.1
521 0.11
522 0.11
523 0.13
524 0.13
525 0.14
526 0.14
527 0.14
528 0.14
529 0.13
530 0.13
531 0.13
532 0.13
533 0.13
534 0.16
535 0.23
536 0.25
537 0.26
538 0.27
539 0.26
540 0.25
541 0.25
542 0.23
543 0.19
544 0.17
545 0.18
546 0.16
547 0.17
548 0.16
549 0.14
550 0.15
551 0.13
552 0.15
553 0.14
554 0.17
555 0.19
556 0.24
557 0.32
558 0.33
559 0.33
560 0.33
561 0.33
562 0.34
563 0.34
564 0.31
565 0.23
566 0.22
567 0.27
568 0.25
569 0.25
570 0.2
571 0.17
572 0.14
573 0.13
574 0.12