Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A420HT78

Protein Details
Accession A0A420HT78    Localization Confidence Low Confidence Score 9.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
377-401QNLRAGKAVVKKPRKYEHIRGAWKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
387-391KKPRK
Subcellular Location(s) plas 8, nucl 5, mito 5, cyto 5, cyto_nucl 5, cyto_mito 5, mito_nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001584  Integrase_cat-core  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50994  INTEGRASE  
Amino Acid Sequences MTLDTRDYILGCLECCRNGTARRTQTQSSPRVDEPMILFGIDFIGLIPNSNLTLEETIQCCYPQLQYFNFETKGKLDYGYSGKGSFSHVFMAIDYFSRFVWAFPCAAPYQSKAIRCLIWLFGLFGCPIVIYANIGTHFAGSKMARFLKSQEVLYIPAPSAAKRATGMIEKANDLFERVMKGIAVKPDWPIYVHRAAYEMNRRKIKHLGHSPYEILFGYHPPSSLELAIPHIKRTKLMLDLQNFDFERLDSEEVMAEAVFHHVAKVEARRSDILRKDDWRRQVQKGKHDLGVSQYRNYTLGSLVMVYDHIHAKEKLHAAYRGPFVVTGYGGHNRKNFSIQQVNGERVKNTFHGDQLKPFRLREGYLVTEQEQTIPTYQNLRAGKAVVKKPRKYEHIRGAWKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.22
4 0.25
5 0.31
6 0.38
7 0.44
8 0.5
9 0.56
10 0.6
11 0.61
12 0.64
13 0.67
14 0.68
15 0.64
16 0.61
17 0.56
18 0.55
19 0.52
20 0.47
21 0.39
22 0.35
23 0.28
24 0.22
25 0.2
26 0.15
27 0.15
28 0.11
29 0.08
30 0.05
31 0.07
32 0.07
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.09
37 0.09
38 0.1
39 0.09
40 0.11
41 0.12
42 0.16
43 0.16
44 0.17
45 0.17
46 0.17
47 0.15
48 0.15
49 0.18
50 0.19
51 0.22
52 0.24
53 0.28
54 0.32
55 0.36
56 0.38
57 0.34
58 0.31
59 0.28
60 0.28
61 0.24
62 0.21
63 0.17
64 0.19
65 0.22
66 0.24
67 0.24
68 0.22
69 0.21
70 0.21
71 0.25
72 0.22
73 0.18
74 0.17
75 0.16
76 0.16
77 0.16
78 0.17
79 0.12
80 0.12
81 0.11
82 0.1
83 0.08
84 0.1
85 0.1
86 0.09
87 0.11
88 0.11
89 0.12
90 0.11
91 0.15
92 0.13
93 0.15
94 0.16
95 0.17
96 0.22
97 0.25
98 0.27
99 0.27
100 0.29
101 0.28
102 0.27
103 0.27
104 0.22
105 0.19
106 0.17
107 0.16
108 0.13
109 0.13
110 0.12
111 0.1
112 0.09
113 0.07
114 0.06
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.07
120 0.07
121 0.08
122 0.08
123 0.07
124 0.08
125 0.07
126 0.1
127 0.09
128 0.1
129 0.14
130 0.17
131 0.18
132 0.19
133 0.21
134 0.26
135 0.28
136 0.27
137 0.24
138 0.22
139 0.23
140 0.23
141 0.21
142 0.13
143 0.13
144 0.13
145 0.12
146 0.13
147 0.11
148 0.11
149 0.11
150 0.12
151 0.11
152 0.13
153 0.14
154 0.15
155 0.16
156 0.16
157 0.16
158 0.16
159 0.14
160 0.13
161 0.12
162 0.09
163 0.1
164 0.1
165 0.09
166 0.08
167 0.1
168 0.11
169 0.13
170 0.13
171 0.12
172 0.13
173 0.14
174 0.15
175 0.14
176 0.14
177 0.16
178 0.2
179 0.19
180 0.18
181 0.17
182 0.18
183 0.22
184 0.3
185 0.33
186 0.35
187 0.41
188 0.41
189 0.43
190 0.49
191 0.48
192 0.47
193 0.49
194 0.49
195 0.46
196 0.48
197 0.46
198 0.4
199 0.37
200 0.28
201 0.19
202 0.13
203 0.11
204 0.1
205 0.1
206 0.09
207 0.09
208 0.1
209 0.11
210 0.11
211 0.1
212 0.08
213 0.11
214 0.17
215 0.17
216 0.18
217 0.2
218 0.2
219 0.21
220 0.22
221 0.22
222 0.21
223 0.27
224 0.3
225 0.3
226 0.34
227 0.34
228 0.36
229 0.34
230 0.3
231 0.24
232 0.18
233 0.16
234 0.14
235 0.15
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.09
240 0.1
241 0.07
242 0.05
243 0.04
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.09
251 0.13
252 0.17
253 0.18
254 0.21
255 0.23
256 0.26
257 0.33
258 0.37
259 0.37
260 0.37
261 0.42
262 0.48
263 0.52
264 0.58
265 0.6
266 0.6
267 0.65
268 0.69
269 0.69
270 0.71
271 0.74
272 0.69
273 0.63
274 0.57
275 0.49
276 0.47
277 0.5
278 0.42
279 0.35
280 0.32
281 0.29
282 0.29
283 0.28
284 0.22
285 0.13
286 0.12
287 0.1
288 0.09
289 0.08
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.09
294 0.1
295 0.11
296 0.14
297 0.15
298 0.16
299 0.22
300 0.25
301 0.27
302 0.3
303 0.32
304 0.31
305 0.36
306 0.37
307 0.32
308 0.29
309 0.26
310 0.21
311 0.2
312 0.17
313 0.13
314 0.14
315 0.21
316 0.22
317 0.26
318 0.29
319 0.3
320 0.32
321 0.36
322 0.35
323 0.36
324 0.43
325 0.4
326 0.47
327 0.48
328 0.52
329 0.51
330 0.5
331 0.42
332 0.35
333 0.37
334 0.3
335 0.3
336 0.27
337 0.29
338 0.35
339 0.37
340 0.45
341 0.5
342 0.56
343 0.54
344 0.53
345 0.53
346 0.47
347 0.46
348 0.42
349 0.4
350 0.36
351 0.36
352 0.39
353 0.35
354 0.35
355 0.33
356 0.3
357 0.25
358 0.22
359 0.21
360 0.21
361 0.21
362 0.23
363 0.24
364 0.3
365 0.3
366 0.31
367 0.31
368 0.31
369 0.35
370 0.39
371 0.46
372 0.49
373 0.57
374 0.62
375 0.69
376 0.76
377 0.8
378 0.8
379 0.83
380 0.83
381 0.83