Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A420HJH3

Protein Details
Accession A0A420HJH3    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
56-84SERISRARESNNQKRRRRAKQIQVKIGHGHydrophilic
320-342GTSSPNSHSQKRKRSNSQGSSHSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
68-75QKRRRRAK
313-321PMLKGKKGT
330-331KR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, mito 10, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
Amino Acid Sequences MSFRRLGKEFLKMKKEEILEGVLAVNKPIGISSAQVVRDLQKHFNPSKLFAPWIESERISRARESNNQKRRRRAKQIQVKIGHGGTLDPLATGILIAGIGRGTKSLQNFLLCSKEYEAVVLFGTGTDTYDRVGKVLKRAPYKHITREIVDKALEKFRGKFMQLPPLFSALKMNGKPLYEYAREGREIPREIERRQVEVHELELVEWMEGGTHTHEAPTDEAGYMEVNVANQLWTQAGIKQKGHILDPTESDKDKENNEIQNKSDSLTSENAIHENEVKIDQSNNKPILKSETIIKQEISGKSPFFSRHYLRKPMLKGKKGTSSPNSHSQKRKRSNSQGSSHSLIHENKENVSTISKDAENTENSVVSDISISSPKVKKECISPRDENLSISQCEEQEKPPAVRLRMTVTSGFYVRSLCHDLGLAVNSTALMAELKRTRQGEYQIGESTLEYADLERGEEVWGPKVKRLLSEWQEKNPVP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.56
3 0.49
4 0.43
5 0.37
6 0.29
7 0.28
8 0.26
9 0.22
10 0.2
11 0.17
12 0.14
13 0.11
14 0.1
15 0.1
16 0.1
17 0.07
18 0.09
19 0.12
20 0.17
21 0.18
22 0.19
23 0.2
24 0.23
25 0.28
26 0.31
27 0.35
28 0.34
29 0.43
30 0.44
31 0.5
32 0.49
33 0.47
34 0.48
35 0.45
36 0.43
37 0.35
38 0.37
39 0.34
40 0.35
41 0.34
42 0.3
43 0.29
44 0.33
45 0.38
46 0.35
47 0.35
48 0.36
49 0.4
50 0.48
51 0.56
52 0.61
53 0.65
54 0.74
55 0.78
56 0.83
57 0.87
58 0.88
59 0.89
60 0.89
61 0.89
62 0.9
63 0.93
64 0.92
65 0.86
66 0.78
67 0.72
68 0.61
69 0.51
70 0.4
71 0.3
72 0.2
73 0.16
74 0.13
75 0.08
76 0.08
77 0.07
78 0.06
79 0.06
80 0.04
81 0.03
82 0.03
83 0.03
84 0.03
85 0.03
86 0.04
87 0.04
88 0.05
89 0.06
90 0.1
91 0.12
92 0.16
93 0.18
94 0.2
95 0.21
96 0.23
97 0.26
98 0.23
99 0.24
100 0.22
101 0.21
102 0.19
103 0.19
104 0.18
105 0.14
106 0.13
107 0.11
108 0.08
109 0.06
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.07
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.14
120 0.16
121 0.23
122 0.28
123 0.34
124 0.4
125 0.43
126 0.5
127 0.54
128 0.58
129 0.59
130 0.62
131 0.59
132 0.52
133 0.56
134 0.52
135 0.45
136 0.4
137 0.35
138 0.29
139 0.31
140 0.32
141 0.27
142 0.26
143 0.29
144 0.32
145 0.31
146 0.34
147 0.33
148 0.4
149 0.39
150 0.4
151 0.36
152 0.36
153 0.35
154 0.28
155 0.27
156 0.19
157 0.25
158 0.22
159 0.24
160 0.22
161 0.22
162 0.23
163 0.22
164 0.25
165 0.2
166 0.22
167 0.22
168 0.23
169 0.23
170 0.24
171 0.26
172 0.26
173 0.26
174 0.26
175 0.31
176 0.33
177 0.33
178 0.4
179 0.38
180 0.34
181 0.34
182 0.33
183 0.27
184 0.24
185 0.23
186 0.16
187 0.15
188 0.12
189 0.12
190 0.11
191 0.08
192 0.07
193 0.06
194 0.04
195 0.04
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.05
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.05
222 0.08
223 0.12
224 0.15
225 0.15
226 0.16
227 0.18
228 0.19
229 0.2
230 0.18
231 0.17
232 0.15
233 0.17
234 0.2
235 0.2
236 0.19
237 0.19
238 0.21
239 0.2
240 0.2
241 0.22
242 0.23
243 0.28
244 0.32
245 0.33
246 0.31
247 0.32
248 0.31
249 0.27
250 0.23
251 0.17
252 0.15
253 0.15
254 0.15
255 0.14
256 0.14
257 0.14
258 0.13
259 0.13
260 0.11
261 0.1
262 0.1
263 0.09
264 0.09
265 0.08
266 0.1
267 0.15
268 0.18
269 0.25
270 0.28
271 0.29
272 0.29
273 0.29
274 0.34
275 0.3
276 0.27
277 0.25
278 0.28
279 0.3
280 0.31
281 0.29
282 0.25
283 0.3
284 0.3
285 0.29
286 0.24
287 0.21
288 0.21
289 0.23
290 0.23
291 0.2
292 0.25
293 0.27
294 0.34
295 0.41
296 0.48
297 0.5
298 0.54
299 0.58
300 0.62
301 0.67
302 0.64
303 0.62
304 0.59
305 0.65
306 0.61
307 0.62
308 0.59
309 0.57
310 0.55
311 0.61
312 0.62
313 0.6
314 0.66
315 0.68
316 0.72
317 0.74
318 0.79
319 0.79
320 0.84
321 0.87
322 0.86
323 0.84
324 0.8
325 0.74
326 0.69
327 0.59
328 0.5
329 0.45
330 0.38
331 0.34
332 0.34
333 0.3
334 0.27
335 0.27
336 0.26
337 0.21
338 0.22
339 0.2
340 0.15
341 0.17
342 0.17
343 0.16
344 0.18
345 0.21
346 0.2
347 0.21
348 0.2
349 0.18
350 0.18
351 0.18
352 0.15
353 0.11
354 0.1
355 0.08
356 0.09
357 0.1
358 0.1
359 0.16
360 0.2
361 0.24
362 0.27
363 0.3
364 0.3
365 0.39
366 0.49
367 0.49
368 0.54
369 0.55
370 0.57
371 0.62
372 0.6
373 0.52
374 0.46
375 0.43
376 0.35
377 0.32
378 0.29
379 0.22
380 0.25
381 0.26
382 0.23
383 0.26
384 0.3
385 0.29
386 0.34
387 0.4
388 0.38
389 0.39
390 0.39
391 0.38
392 0.37
393 0.39
394 0.34
395 0.3
396 0.31
397 0.29
398 0.27
399 0.21
400 0.19
401 0.16
402 0.19
403 0.22
404 0.19
405 0.19
406 0.19
407 0.18
408 0.2
409 0.21
410 0.17
411 0.11
412 0.11
413 0.1
414 0.1
415 0.09
416 0.07
417 0.06
418 0.05
419 0.12
420 0.16
421 0.19
422 0.26
423 0.27
424 0.31
425 0.35
426 0.42
427 0.43
428 0.42
429 0.44
430 0.4
431 0.39
432 0.36
433 0.31
434 0.26
435 0.18
436 0.15
437 0.11
438 0.09
439 0.1
440 0.1
441 0.11
442 0.09
443 0.1
444 0.11
445 0.14
446 0.15
447 0.2
448 0.27
449 0.27
450 0.31
451 0.36
452 0.36
453 0.37
454 0.41
455 0.44
456 0.46
457 0.55
458 0.58
459 0.6