Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A420HBR8

Protein Details
Accession A0A420HBR8    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-26SEYWKSTPKFWCKHCKIFVRDTKLEHydrophilic
178-199KGFVLKKKKSHWKLPEENNKELHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
274-283KRKARNIRRK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 12.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR013085  U1-CZ_Znf_C2H2  
IPR040023  WBP4  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06220  zf-U1  
Amino Acid Sequences MSEYWKSTPKFWCKHCKIFVRDTKLETANHNASPKHQGNIKRFLRDLQRNHDKDEKDKERAKLEVARLNDIVPGKRSIVKSSLENGGRPQSHYSTSRVTDKSIVSESQRKQNLAQLAEMGISIPSELRPDMAMPGEWQVISEHFIDPDKVEANLNMTASGTRKRAIDVGEEAEDEVDKGFVLKKKKSHWKLPEENNKELDALLTTTTQFKKQYIKSEISKEIPIDNTKIYQKEKQDDHVSIKSEPCDDSKSLPQMLNEDIPDISKPTNNIFFAKRKARNIRRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.83
3 0.83
4 0.8
5 0.82
6 0.83
7 0.81
8 0.77
9 0.7
10 0.68
11 0.62
12 0.57
13 0.5
14 0.49
15 0.44
16 0.43
17 0.43
18 0.37
19 0.36
20 0.43
21 0.42
22 0.38
23 0.39
24 0.43
25 0.47
26 0.57
27 0.59
28 0.55
29 0.54
30 0.56
31 0.6
32 0.61
33 0.62
34 0.61
35 0.67
36 0.63
37 0.67
38 0.69
39 0.61
40 0.59
41 0.63
42 0.6
43 0.58
44 0.62
45 0.61
46 0.58
47 0.57
48 0.54
49 0.5
50 0.49
51 0.45
52 0.41
53 0.4
54 0.36
55 0.34
56 0.33
57 0.28
58 0.24
59 0.21
60 0.21
61 0.18
62 0.23
63 0.24
64 0.24
65 0.26
66 0.26
67 0.27
68 0.28
69 0.34
70 0.3
71 0.29
72 0.29
73 0.32
74 0.3
75 0.29
76 0.29
77 0.24
78 0.27
79 0.28
80 0.29
81 0.27
82 0.29
83 0.34
84 0.32
85 0.31
86 0.31
87 0.29
88 0.28
89 0.26
90 0.25
91 0.22
92 0.29
93 0.3
94 0.34
95 0.37
96 0.35
97 0.34
98 0.37
99 0.38
100 0.31
101 0.29
102 0.21
103 0.18
104 0.17
105 0.16
106 0.11
107 0.06
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.03
112 0.04
113 0.04
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.07
119 0.07
120 0.06
121 0.08
122 0.08
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.08
128 0.09
129 0.07
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.09
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.09
140 0.1
141 0.1
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.1
146 0.13
147 0.12
148 0.12
149 0.12
150 0.13
151 0.15
152 0.16
153 0.17
154 0.16
155 0.17
156 0.16
157 0.16
158 0.15
159 0.13
160 0.12
161 0.09
162 0.06
163 0.04
164 0.03
165 0.04
166 0.07
167 0.11
168 0.17
169 0.22
170 0.27
171 0.36
172 0.47
173 0.55
174 0.61
175 0.67
176 0.72
177 0.77
178 0.83
179 0.85
180 0.8
181 0.77
182 0.69
183 0.6
184 0.5
185 0.4
186 0.3
187 0.19
188 0.14
189 0.1
190 0.08
191 0.08
192 0.13
193 0.14
194 0.17
195 0.18
196 0.2
197 0.28
198 0.32
199 0.41
200 0.42
201 0.48
202 0.5
203 0.56
204 0.59
205 0.53
206 0.51
207 0.42
208 0.39
209 0.37
210 0.33
211 0.29
212 0.25
213 0.26
214 0.28
215 0.32
216 0.34
217 0.36
218 0.41
219 0.47
220 0.49
221 0.52
222 0.55
223 0.54
224 0.56
225 0.55
226 0.51
227 0.45
228 0.45
229 0.39
230 0.34
231 0.31
232 0.28
233 0.27
234 0.26
235 0.28
236 0.32
237 0.35
238 0.37
239 0.37
240 0.36
241 0.34
242 0.36
243 0.34
244 0.28
245 0.24
246 0.2
247 0.19
248 0.19
249 0.19
250 0.17
251 0.16
252 0.17
253 0.22
254 0.29
255 0.3
256 0.33
257 0.37
258 0.43
259 0.49
260 0.58
261 0.6
262 0.63
263 0.72