Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A420HD91

Protein Details
Accession A0A420HD91    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
93-119DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAKEAKEKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
395-419RRRKQIEDRREANNKRRKIEKDRGG
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MQSKPKIVSPVIEEQPRNIDGQIIPVDSRGPNPNGEEFDNLYLDMNGIVHPCSHPEDGPAPKNEDEMMMAIFKYTDRVVKMVRPRKLLMIAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAKEAKEKADDKAEFVKLLKSQGNNIEDSEVKVAWDSNEITPGTPFMDILAASLRYWIAYKLNTDLAWANMKVIISDSTVPGEGEHKIMEFIRSQRSSPHHDPNTRHVMYGLDADLIMLGLGTHEPYFRVLREDVFAQDSKPRVCKLCNQAGHEARECTGAPKIKVGEFDEKENAPHIKPYIWLHVSILREYLAAELFVPNQPFKFDLERAIDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIRENGIDTLIAIWRDNIPTMGGYLTKDGHVDLERAQIILRGLAKQEDAIFRRRKQIEDRREANNKRRKIEKDRGGRGMLNESSNLQESPPINRQNINHRHSAPSGLPIFAPGDISKEARALTYDMVVNRGANFKATQANKSAAAALRSRINGNTEEKSCGTSEETATDFKTTPATSKRKASVLEDENSNTHEQTPRSNSLQTATDEPPIDTVRLWEEGYADRYYEQKFGADPKDIAFRYQVARDYVEGLAWVLLYYFQGCPSWEWYYPYHYAPFAADFAEISDMKISFKKGRIFRPFEQLMGVLPAGSRQAIPKEFHHLMTNPDSEIIDFYPDDFTIDLNGKKWAWQGVALLPFIDSKRLLDAMAKIYPHLPTEVAARNSVGKDVMLFAENDQLLYDEVAKNFYSKKQGSRNFKLNPKISQGLSGEIEKNDAHLPHSSLISPLTSGSLPNLDDDRSITVHYQMPRFNFIHKSMLLRGATIPPPALTLEEIEATRDKAVRSGRSYGGVPLNGDGRGRKQFNYGSTNHQYNQNNNHQRQHNYSANYGSNFATNPFPELLQSWQQPPSGGYVNYGRGQASYQSTPQQYLNHQNSNYPAFNRGSTGNFRGQSSGPRQYEPYR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.49
3 0.45
4 0.41
5 0.31
6 0.29
7 0.21
8 0.27
9 0.27
10 0.23
11 0.22
12 0.21
13 0.24
14 0.21
15 0.25
16 0.26
17 0.25
18 0.27
19 0.3
20 0.35
21 0.35
22 0.37
23 0.36
24 0.32
25 0.33
26 0.3
27 0.26
28 0.22
29 0.18
30 0.16
31 0.13
32 0.1
33 0.09
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.1
38 0.13
39 0.17
40 0.19
41 0.19
42 0.22
43 0.29
44 0.36
45 0.42
46 0.43
47 0.44
48 0.42
49 0.43
50 0.39
51 0.33
52 0.26
53 0.21
54 0.18
55 0.14
56 0.13
57 0.11
58 0.11
59 0.1
60 0.11
61 0.11
62 0.14
63 0.15
64 0.19
65 0.22
66 0.29
67 0.4
68 0.47
69 0.52
70 0.54
71 0.54
72 0.56
73 0.58
74 0.53
75 0.45
76 0.42
77 0.36
78 0.31
79 0.3
80 0.24
81 0.2
82 0.18
83 0.15
84 0.1
85 0.13
86 0.19
87 0.26
88 0.37
89 0.46
90 0.55
91 0.66
92 0.74
93 0.8
94 0.84
95 0.83
96 0.79
97 0.8
98 0.8
99 0.8
100 0.81
101 0.79
102 0.72
103 0.75
104 0.71
105 0.64
106 0.63
107 0.53
108 0.46
109 0.47
110 0.44
111 0.37
112 0.35
113 0.36
114 0.28
115 0.33
116 0.33
117 0.27
118 0.31
119 0.37
120 0.39
121 0.35
122 0.34
123 0.32
124 0.28
125 0.29
126 0.26
127 0.18
128 0.15
129 0.14
130 0.14
131 0.12
132 0.15
133 0.15
134 0.13
135 0.18
136 0.18
137 0.18
138 0.18
139 0.18
140 0.15
141 0.13
142 0.12
143 0.08
144 0.09
145 0.08
146 0.08
147 0.11
148 0.1
149 0.1
150 0.11
151 0.1
152 0.09
153 0.1
154 0.11
155 0.12
156 0.13
157 0.15
158 0.17
159 0.2
160 0.2
161 0.21
162 0.21
163 0.2
164 0.22
165 0.2
166 0.18
167 0.16
168 0.16
169 0.14
170 0.15
171 0.13
172 0.11
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.13
177 0.12
178 0.12
179 0.12
180 0.11
181 0.11
182 0.11
183 0.1
184 0.11
185 0.11
186 0.12
187 0.14
188 0.17
189 0.25
190 0.27
191 0.27
192 0.32
193 0.37
194 0.45
195 0.48
196 0.55
197 0.55
198 0.6
199 0.64
200 0.66
201 0.7
202 0.62
203 0.54
204 0.44
205 0.37
206 0.31
207 0.29
208 0.21
209 0.11
210 0.1
211 0.1
212 0.09
213 0.08
214 0.06
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.04
220 0.04
221 0.05
222 0.05
223 0.08
224 0.1
225 0.11
226 0.15
227 0.15
228 0.16
229 0.18
230 0.19
231 0.18
232 0.2
233 0.2
234 0.17
235 0.2
236 0.23
237 0.24
238 0.26
239 0.27
240 0.27
241 0.29
242 0.36
243 0.41
244 0.47
245 0.5
246 0.51
247 0.57
248 0.59
249 0.61
250 0.55
251 0.48
252 0.38
253 0.35
254 0.31
255 0.23
256 0.23
257 0.23
258 0.21
259 0.24
260 0.25
261 0.24
262 0.28
263 0.3
264 0.34
265 0.31
266 0.34
267 0.34
268 0.32
269 0.31
270 0.32
271 0.29
272 0.2
273 0.22
274 0.19
275 0.16
276 0.19
277 0.21
278 0.26
279 0.25
280 0.25
281 0.24
282 0.27
283 0.28
284 0.25
285 0.22
286 0.14
287 0.13
288 0.13
289 0.12
290 0.08
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.1
296 0.11
297 0.1
298 0.1
299 0.11
300 0.12
301 0.14
302 0.17
303 0.16
304 0.2
305 0.23
306 0.25
307 0.25
308 0.27
309 0.24
310 0.2
311 0.19
312 0.14
313 0.1
314 0.08
315 0.08
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.07
323 0.07
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.07
328 0.08
329 0.12
330 0.15
331 0.15
332 0.15
333 0.16
334 0.15
335 0.15
336 0.14
337 0.09
338 0.05
339 0.06
340 0.07
341 0.06
342 0.06
343 0.07
344 0.08
345 0.09
346 0.09
347 0.08
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.09
360 0.1
361 0.1
362 0.1
363 0.13
364 0.13
365 0.12
366 0.12
367 0.12
368 0.11
369 0.12
370 0.12
371 0.09
372 0.1
373 0.1
374 0.1
375 0.09
376 0.11
377 0.14
378 0.16
379 0.23
380 0.29
381 0.3
382 0.39
383 0.4
384 0.42
385 0.48
386 0.56
387 0.58
388 0.62
389 0.64
390 0.62
391 0.7
392 0.73
393 0.73
394 0.71
395 0.66
396 0.61
397 0.65
398 0.65
399 0.65
400 0.69
401 0.68
402 0.7
403 0.71
404 0.71
405 0.65
406 0.58
407 0.5
408 0.44
409 0.36
410 0.27
411 0.2
412 0.16
413 0.15
414 0.15
415 0.14
416 0.09
417 0.11
418 0.11
419 0.16
420 0.21
421 0.24
422 0.24
423 0.27
424 0.3
425 0.37
426 0.45
427 0.44
428 0.42
429 0.4
430 0.42
431 0.39
432 0.4
433 0.3
434 0.26
435 0.23
436 0.18
437 0.17
438 0.14
439 0.14
440 0.11
441 0.12
442 0.07
443 0.08
444 0.08
445 0.09
446 0.09
447 0.09
448 0.09
449 0.08
450 0.09
451 0.08
452 0.07
453 0.08
454 0.1
455 0.09
456 0.1
457 0.1
458 0.09
459 0.09
460 0.11
461 0.09
462 0.09
463 0.09
464 0.09
465 0.15
466 0.16
467 0.17
468 0.18
469 0.19
470 0.19
471 0.19
472 0.19
473 0.14
474 0.15
475 0.14
476 0.13
477 0.14
478 0.14
479 0.15
480 0.14
481 0.15
482 0.16
483 0.18
484 0.21
485 0.19
486 0.21
487 0.2
488 0.21
489 0.19
490 0.17
491 0.15
492 0.13
493 0.12
494 0.11
495 0.12
496 0.12
497 0.12
498 0.12
499 0.11
500 0.1
501 0.12
502 0.1
503 0.13
504 0.21
505 0.26
506 0.28
507 0.33
508 0.35
509 0.36
510 0.38
511 0.37
512 0.37
513 0.36
514 0.35
515 0.31
516 0.3
517 0.27
518 0.27
519 0.24
520 0.16
521 0.13
522 0.14
523 0.13
524 0.17
525 0.22
526 0.24
527 0.26
528 0.26
529 0.25
530 0.24
531 0.26
532 0.23
533 0.22
534 0.2
535 0.21
536 0.2
537 0.2
538 0.2
539 0.17
540 0.16
541 0.11
542 0.11
543 0.1
544 0.11
545 0.11
546 0.09
547 0.1
548 0.11
549 0.14
550 0.13
551 0.12
552 0.11
553 0.13
554 0.15
555 0.15
556 0.13
557 0.11
558 0.12
559 0.16
560 0.18
561 0.18
562 0.17
563 0.17
564 0.23
565 0.23
566 0.23
567 0.19
568 0.18
569 0.18
570 0.21
571 0.22
572 0.17
573 0.18
574 0.17
575 0.19
576 0.17
577 0.15
578 0.12
579 0.09
580 0.08
581 0.07
582 0.06
583 0.03
584 0.03
585 0.04
586 0.05
587 0.05
588 0.05
589 0.06
590 0.07
591 0.08
592 0.12
593 0.16
594 0.16
595 0.18
596 0.19
597 0.24
598 0.26
599 0.26
600 0.24
601 0.2
602 0.2
603 0.17
604 0.17
605 0.13
606 0.11
607 0.09
608 0.07
609 0.08
610 0.1
611 0.09
612 0.08
613 0.09
614 0.09
615 0.1
616 0.12
617 0.14
618 0.16
619 0.21
620 0.28
621 0.33
622 0.42
623 0.51
624 0.57
625 0.57
626 0.62
627 0.58
628 0.51
629 0.46
630 0.36
631 0.27
632 0.21
633 0.18
634 0.09
635 0.08
636 0.08
637 0.07
638 0.07
639 0.07
640 0.07
641 0.11
642 0.15
643 0.18
644 0.19
645 0.27
646 0.28
647 0.29
648 0.31
649 0.28
650 0.28
651 0.31
652 0.3
653 0.22
654 0.22
655 0.2
656 0.17
657 0.17
658 0.13
659 0.1
660 0.09
661 0.09
662 0.09
663 0.09
664 0.1
665 0.08
666 0.08
667 0.09
668 0.12
669 0.12
670 0.12
671 0.15
672 0.14
673 0.16
674 0.17
675 0.18
676 0.16
677 0.16
678 0.17
679 0.19
680 0.22
681 0.2
682 0.18
683 0.16
684 0.17
685 0.15
686 0.16
687 0.11
688 0.09
689 0.12
690 0.12
691 0.12
692 0.13
693 0.15
694 0.17
695 0.2
696 0.19
697 0.17
698 0.19
699 0.19
700 0.18
701 0.16
702 0.12
703 0.1
704 0.16
705 0.22
706 0.22
707 0.21
708 0.21
709 0.23
710 0.23
711 0.23
712 0.18
713 0.11
714 0.1
715 0.11
716 0.11
717 0.09
718 0.09
719 0.09
720 0.14
721 0.14
722 0.13
723 0.12
724 0.12
725 0.11
726 0.11
727 0.13
728 0.1
729 0.1
730 0.13
731 0.13
732 0.14
733 0.16
734 0.19
735 0.25
736 0.27
737 0.35
738 0.43
739 0.52
740 0.61
741 0.67
742 0.73
743 0.72
744 0.76
745 0.77
746 0.73
747 0.68
748 0.65
749 0.61
750 0.52
751 0.5
752 0.43
753 0.37
754 0.34
755 0.32
756 0.27
757 0.23
758 0.24
759 0.18
760 0.19
761 0.18
762 0.17
763 0.16
764 0.16
765 0.18
766 0.18
767 0.19
768 0.18
769 0.16
770 0.16
771 0.15
772 0.13
773 0.1
774 0.11
775 0.1
776 0.1
777 0.1
778 0.12
779 0.11
780 0.13
781 0.15
782 0.13
783 0.13
784 0.15
785 0.16
786 0.14
787 0.16
788 0.14
789 0.16
790 0.21
791 0.24
792 0.27
793 0.29
794 0.3
795 0.35
796 0.36
797 0.37
798 0.37
799 0.36
800 0.38
801 0.36
802 0.37
803 0.34
804 0.4
805 0.35
806 0.31
807 0.3
808 0.29
809 0.3
810 0.26
811 0.24
812 0.17
813 0.18
814 0.18
815 0.17
816 0.12
817 0.12
818 0.12
819 0.13
820 0.13
821 0.14
822 0.15
823 0.15
824 0.16
825 0.17
826 0.16
827 0.19
828 0.25
829 0.3
830 0.34
831 0.38
832 0.38
833 0.39
834 0.4
835 0.4
836 0.39
837 0.34
838 0.3
839 0.26
840 0.26
841 0.23
842 0.24
843 0.21
844 0.22
845 0.29
846 0.31
847 0.31
848 0.35
849 0.39
850 0.44
851 0.49
852 0.46
853 0.46
854 0.51
855 0.55
856 0.5
857 0.54
858 0.52
859 0.53
860 0.6
861 0.61
862 0.64
863 0.64
864 0.71
865 0.69
866 0.7
867 0.7
868 0.7
869 0.66
870 0.59
871 0.58
872 0.55
873 0.52
874 0.48
875 0.42
876 0.35
877 0.29
878 0.26
879 0.24
880 0.22
881 0.19
882 0.2
883 0.19
884 0.19
885 0.18
886 0.19
887 0.23
888 0.26
889 0.29
890 0.29
891 0.32
892 0.32
893 0.32
894 0.31
895 0.31
896 0.29
897 0.26
898 0.25
899 0.27
900 0.31
901 0.32
902 0.33
903 0.28
904 0.23
905 0.24
906 0.25
907 0.27
908 0.26
909 0.27
910 0.33
911 0.35
912 0.37
913 0.39
914 0.39
915 0.4
916 0.47
917 0.51
918 0.52
919 0.51
920 0.52
921 0.53
922 0.55
923 0.53
924 0.44
925 0.41
926 0.35
927 0.36
928 0.35
929 0.33
930 0.31
931 0.34
932 0.37
933 0.4
934 0.39
935 0.4
936 0.4
937 0.39
938 0.43
939 0.44
940 0.49
941 0.44
942 0.45