Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A420I0U2

Protein Details
Accession A0A420I0U2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
540-579ISSTQPGKKRTKDGERLPAKRRKLSKKRMPKNFEEGKKLDBasic
586-610KRDRSDFRPSTKKGKKRILELTQGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
546-602GKKRTKDGERLPAKRRKLSKKRMPKNFEEGKKLDPERWLAKRDRSDFRPSTKKGKKR
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 9, mito 6, cyto 2, plas 1, pero 1, E.R. 1, golg 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013699  Signal_recog_part_SRP72_RNA-bd  
IPR026270  SRP72  
IPR031545  SRP_TPR-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0005786  C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting  
GO:0008312  F:7S RNA binding  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF08492  SRP72  
PF17004  SRP_TPR_like  
Amino Acid Sequences MANPAARLTALLGKISVVDNEEALDVASKALKASKENSDALHTKVVALIKLERFEDALQALNNGRQNTLALCTLEKAYALYKMGKLTEAELLLSEANKRALKHLAAQVAYRAEKFKAAMSYYKDLRSEKSLIEGEDVDILVNISATDAQLEWQENGNGTDQKNDLPSSDYVDIFEISYNSACKSIARKDFMTAYGGLERARELCEALDEMSEEEKKLEILPIMLQQAYVLTKLGKQNEAENLHNLVNLDKLEPSSKVIAHNNCLAFSKPKNPFIAQRIISSIPKLSNFDQLFWYQANILQRNKIIVAIEAQKYLGVARSTSKSILKSMPTISSHCNQLSVLNAAANARNKTGKSGLKAIIPLLEKRPKDVGLILLVVQLCVLTDNLGQAIFRLESFLNGLEKSSIAEDQDVRFAPGLIGLLVSLYRLSGRKKPMKSILLKAASYWSQRNKPVISILYAACLSLFQSQDPKDLSSANQLLKSMRRKNPNDPVALAGYIAACDSESIEMVSPDVDRLTPVSHLISGIDIDALENSGIPSFHISSTQPGKKRTKDGERLPAKRRKLSKKRMPKNFEEGKKLDPERWLAKRDRSDFRPSTKKGKKRILELTQGGFQHTNARNKGRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.17
4 0.13
5 0.13
6 0.12
7 0.13
8 0.13
9 0.11
10 0.1
11 0.1
12 0.08
13 0.08
14 0.09
15 0.09
16 0.1
17 0.14
18 0.16
19 0.19
20 0.24
21 0.31
22 0.35
23 0.38
24 0.39
25 0.42
26 0.42
27 0.41
28 0.41
29 0.33
30 0.27
31 0.29
32 0.29
33 0.22
34 0.23
35 0.26
36 0.24
37 0.27
38 0.27
39 0.24
40 0.24
41 0.24
42 0.24
43 0.18
44 0.18
45 0.16
46 0.17
47 0.18
48 0.2
49 0.24
50 0.22
51 0.21
52 0.19
53 0.2
54 0.19
55 0.2
56 0.19
57 0.16
58 0.16
59 0.17
60 0.18
61 0.17
62 0.16
63 0.14
64 0.12
65 0.15
66 0.16
67 0.18
68 0.19
69 0.21
70 0.22
71 0.22
72 0.22
73 0.2
74 0.22
75 0.19
76 0.17
77 0.14
78 0.15
79 0.13
80 0.13
81 0.13
82 0.11
83 0.16
84 0.18
85 0.18
86 0.21
87 0.25
88 0.27
89 0.32
90 0.36
91 0.37
92 0.36
93 0.36
94 0.36
95 0.35
96 0.35
97 0.29
98 0.26
99 0.2
100 0.21
101 0.22
102 0.22
103 0.22
104 0.23
105 0.27
106 0.31
107 0.36
108 0.38
109 0.41
110 0.41
111 0.38
112 0.38
113 0.38
114 0.35
115 0.29
116 0.32
117 0.3
118 0.27
119 0.28
120 0.25
121 0.2
122 0.18
123 0.18
124 0.11
125 0.09
126 0.08
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.05
136 0.08
137 0.09
138 0.1
139 0.11
140 0.12
141 0.12
142 0.14
143 0.16
144 0.18
145 0.17
146 0.19
147 0.18
148 0.19
149 0.21
150 0.2
151 0.18
152 0.17
153 0.18
154 0.2
155 0.21
156 0.2
157 0.18
158 0.18
159 0.18
160 0.15
161 0.15
162 0.09
163 0.08
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.1
170 0.15
171 0.22
172 0.28
173 0.32
174 0.32
175 0.34
176 0.37
177 0.36
178 0.33
179 0.26
180 0.2
181 0.18
182 0.18
183 0.15
184 0.13
185 0.12
186 0.11
187 0.11
188 0.1
189 0.09
190 0.08
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.08
195 0.07
196 0.08
197 0.09
198 0.1
199 0.09
200 0.09
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.1
209 0.12
210 0.11
211 0.11
212 0.09
213 0.1
214 0.1
215 0.09
216 0.07
217 0.06
218 0.1
219 0.14
220 0.16
221 0.18
222 0.18
223 0.21
224 0.27
225 0.31
226 0.29
227 0.27
228 0.27
229 0.25
230 0.25
231 0.22
232 0.15
233 0.13
234 0.12
235 0.1
236 0.08
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.11
241 0.12
242 0.12
243 0.16
244 0.21
245 0.23
246 0.24
247 0.28
248 0.26
249 0.25
250 0.25
251 0.23
252 0.2
253 0.2
254 0.27
255 0.27
256 0.31
257 0.34
258 0.34
259 0.39
260 0.4
261 0.46
262 0.38
263 0.34
264 0.33
265 0.31
266 0.3
267 0.25
268 0.22
269 0.16
270 0.16
271 0.17
272 0.16
273 0.22
274 0.22
275 0.22
276 0.22
277 0.21
278 0.22
279 0.19
280 0.18
281 0.1
282 0.11
283 0.15
284 0.17
285 0.18
286 0.18
287 0.18
288 0.18
289 0.18
290 0.17
291 0.13
292 0.09
293 0.11
294 0.13
295 0.14
296 0.13
297 0.13
298 0.12
299 0.12
300 0.11
301 0.11
302 0.07
303 0.07
304 0.09
305 0.11
306 0.12
307 0.14
308 0.16
309 0.14
310 0.17
311 0.19
312 0.18
313 0.19
314 0.19
315 0.21
316 0.2
317 0.22
318 0.22
319 0.21
320 0.23
321 0.21
322 0.2
323 0.16
324 0.16
325 0.15
326 0.13
327 0.11
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.11
332 0.13
333 0.12
334 0.13
335 0.15
336 0.15
337 0.17
338 0.22
339 0.23
340 0.23
341 0.28
342 0.28
343 0.28
344 0.28
345 0.26
346 0.24
347 0.23
348 0.21
349 0.22
350 0.27
351 0.25
352 0.27
353 0.29
354 0.26
355 0.25
356 0.25
357 0.2
358 0.15
359 0.16
360 0.13
361 0.13
362 0.12
363 0.1
364 0.09
365 0.07
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.04
370 0.04
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.06
377 0.06
378 0.05
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.08
383 0.1
384 0.09
385 0.09
386 0.1
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.09
391 0.08
392 0.07
393 0.09
394 0.1
395 0.11
396 0.14
397 0.14
398 0.13
399 0.13
400 0.13
401 0.11
402 0.1
403 0.09
404 0.06
405 0.05
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.03
411 0.03
412 0.05
413 0.08
414 0.12
415 0.18
416 0.28
417 0.36
418 0.39
419 0.47
420 0.54
421 0.6
422 0.62
423 0.63
424 0.63
425 0.59
426 0.56
427 0.49
428 0.44
429 0.39
430 0.36
431 0.36
432 0.34
433 0.35
434 0.39
435 0.44
436 0.41
437 0.4
438 0.42
439 0.37
440 0.32
441 0.29
442 0.25
443 0.22
444 0.2
445 0.18
446 0.13
447 0.11
448 0.1
449 0.11
450 0.11
451 0.1
452 0.16
453 0.17
454 0.21
455 0.23
456 0.23
457 0.2
458 0.21
459 0.21
460 0.23
461 0.28
462 0.26
463 0.26
464 0.26
465 0.27
466 0.33
467 0.42
468 0.43
469 0.46
470 0.54
471 0.58
472 0.67
473 0.75
474 0.75
475 0.7
476 0.61
477 0.57
478 0.49
479 0.43
480 0.33
481 0.23
482 0.16
483 0.12
484 0.1
485 0.06
486 0.04
487 0.04
488 0.05
489 0.05
490 0.05
491 0.06
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.07
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.07
501 0.08
502 0.09
503 0.1
504 0.11
505 0.12
506 0.12
507 0.12
508 0.12
509 0.11
510 0.1
511 0.09
512 0.08
513 0.06
514 0.06
515 0.06
516 0.06
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.06
521 0.06
522 0.06
523 0.1
524 0.11
525 0.11
526 0.14
527 0.14
528 0.2
529 0.3
530 0.37
531 0.4
532 0.47
533 0.56
534 0.6
535 0.69
536 0.72
537 0.74
538 0.76
539 0.8
540 0.82
541 0.83
542 0.85
543 0.85
544 0.84
545 0.81
546 0.8
547 0.81
548 0.81
549 0.82
550 0.85
551 0.86
552 0.89
553 0.92
554 0.94
555 0.92
556 0.89
557 0.88
558 0.87
559 0.84
560 0.81
561 0.74
562 0.68
563 0.69
564 0.63
565 0.57
566 0.51
567 0.51
568 0.51
569 0.54
570 0.56
571 0.54
572 0.61
573 0.66
574 0.69
575 0.71
576 0.68
577 0.72
578 0.72
579 0.74
580 0.75
581 0.71
582 0.75
583 0.76
584 0.79
585 0.79
586 0.82
587 0.8
588 0.79
589 0.85
590 0.82
591 0.82
592 0.79
593 0.73
594 0.68
595 0.61
596 0.55
597 0.45
598 0.37
599 0.37
600 0.38
601 0.42
602 0.44