Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A420HXT1

Protein Details
Accession A0A420HXT1    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-71LEQDYENKPRKSRKKGIENTRLPIKTHydrophilic
339-369SSTIRPRGKKVFRTKKERKFTKERKNVEQEFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
54-60PRKSRKK
343-363RPRGKKVFRTKKERKFTKERK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 10.333, mito 6.5, cyto_mito 4.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005612  CCAAT-binding_factor  
IPR011501  Noc3_N  
IPR016903  Nucleolar_cplx-assoc_3  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF03914  CBF  
PF07540  NOC3p  
Amino Acid Sequences MKLHPVVKKRKLSISLSNDDRSLSSESEVISSDESTFLSHAAKWNLEQDYENKPRKSRKKGIENTRLPIKTAEGFIQQITTVSDIGEIECGTESPSVNYSEHPSKSFSILEAKEELAKTALLLRDNDPEENVDAFKKLAQLGQTSNYTIKSLALMTQLAIYKDLIPGYRIRPLSKEDRATKVSKEVKKLRAYEQELVIGYQKYILELSRLANTERKVSIKCNTPSLASIAISCACTLLVSVPHFNFRGELIRILVNVLSSRLIDSDFLKCLETVEKLFRDDEDGGPSLDVVISLSKMMKGKGFRVDESVINLFLHLRILSEFSYKGSVNQVDKETKIESSTIRPRGKKVFRTKKERKFTKERKNVEQEFKVADITVSSEEKDRLQAETLKRVFSIYFRILKLRASNLMGAVLEGLASYAHLINQDFFGDLLEALKDLLINHNLELDVEENSPGLEKVNQNKTRDALLCIITAFALLEGQEVARAKTSLNLDLSFFIAYLYKTLYTLSLDPSIELSAKLHNTSQSNESFLSKSKLGKINFQTTTVLLLRSVSSILTPAIATQAVPPIRIAAFVKQLMTSCIQLPEKSCIAMTTLIGQVTKLHGKKIASLWNTEERRGDGIFDPVSYEVEASNPFATTIWEGELLKNHFSPAVRSEVKLIEKNIIEVK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.73
3 0.7
4 0.66
5 0.58
6 0.51
7 0.45
8 0.37
9 0.32
10 0.24
11 0.2
12 0.19
13 0.19
14 0.19
15 0.2
16 0.17
17 0.15
18 0.14
19 0.13
20 0.12
21 0.12
22 0.12
23 0.11
24 0.11
25 0.11
26 0.12
27 0.18
28 0.21
29 0.22
30 0.23
31 0.29
32 0.3
33 0.3
34 0.31
35 0.29
36 0.35
37 0.44
38 0.51
39 0.49
40 0.54
41 0.63
42 0.71
43 0.78
44 0.78
45 0.79
46 0.82
47 0.87
48 0.91
49 0.92
50 0.89
51 0.85
52 0.84
53 0.74
54 0.65
55 0.56
56 0.48
57 0.4
58 0.35
59 0.31
60 0.25
61 0.25
62 0.23
63 0.23
64 0.19
65 0.16
66 0.15
67 0.13
68 0.1
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.1
80 0.1
81 0.11
82 0.13
83 0.15
84 0.16
85 0.17
86 0.23
87 0.28
88 0.3
89 0.3
90 0.31
91 0.3
92 0.33
93 0.32
94 0.27
95 0.28
96 0.27
97 0.28
98 0.26
99 0.26
100 0.27
101 0.26
102 0.25
103 0.17
104 0.16
105 0.13
106 0.16
107 0.18
108 0.16
109 0.18
110 0.19
111 0.25
112 0.27
113 0.28
114 0.24
115 0.23
116 0.22
117 0.22
118 0.2
119 0.15
120 0.13
121 0.13
122 0.13
123 0.14
124 0.13
125 0.14
126 0.15
127 0.17
128 0.19
129 0.23
130 0.23
131 0.23
132 0.24
133 0.22
134 0.21
135 0.18
136 0.16
137 0.13
138 0.12
139 0.12
140 0.12
141 0.11
142 0.11
143 0.14
144 0.15
145 0.14
146 0.14
147 0.13
148 0.12
149 0.13
150 0.14
151 0.12
152 0.11
153 0.15
154 0.16
155 0.22
156 0.24
157 0.24
158 0.25
159 0.3
160 0.38
161 0.41
162 0.47
163 0.45
164 0.5
165 0.53
166 0.53
167 0.5
168 0.51
169 0.53
170 0.49
171 0.54
172 0.56
173 0.6
174 0.64
175 0.66
176 0.64
177 0.65
178 0.65
179 0.6
180 0.53
181 0.48
182 0.41
183 0.38
184 0.33
185 0.23
186 0.17
187 0.15
188 0.13
189 0.1
190 0.11
191 0.1
192 0.09
193 0.1
194 0.12
195 0.13
196 0.15
197 0.16
198 0.19
199 0.2
200 0.23
201 0.23
202 0.25
203 0.23
204 0.26
205 0.3
206 0.35
207 0.36
208 0.37
209 0.36
210 0.34
211 0.33
212 0.31
213 0.27
214 0.18
215 0.16
216 0.13
217 0.12
218 0.11
219 0.1
220 0.08
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.08
226 0.09
227 0.12
228 0.12
229 0.15
230 0.16
231 0.16
232 0.15
233 0.13
234 0.17
235 0.15
236 0.15
237 0.14
238 0.14
239 0.14
240 0.14
241 0.13
242 0.09
243 0.08
244 0.07
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.08
252 0.1
253 0.11
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.11
258 0.12
259 0.12
260 0.12
261 0.15
262 0.16
263 0.16
264 0.17
265 0.16
266 0.18
267 0.18
268 0.17
269 0.16
270 0.15
271 0.14
272 0.14
273 0.13
274 0.1
275 0.08
276 0.07
277 0.04
278 0.03
279 0.03
280 0.04
281 0.04
282 0.06
283 0.07
284 0.08
285 0.11
286 0.12
287 0.16
288 0.23
289 0.25
290 0.23
291 0.26
292 0.28
293 0.25
294 0.26
295 0.24
296 0.17
297 0.15
298 0.14
299 0.1
300 0.09
301 0.09
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.06
306 0.07
307 0.08
308 0.08
309 0.08
310 0.11
311 0.1
312 0.11
313 0.12
314 0.15
315 0.15
316 0.17
317 0.2
318 0.19
319 0.2
320 0.21
321 0.18
322 0.15
323 0.15
324 0.14
325 0.12
326 0.17
327 0.24
328 0.31
329 0.36
330 0.37
331 0.4
332 0.48
333 0.54
334 0.57
335 0.61
336 0.63
337 0.67
338 0.76
339 0.83
340 0.84
341 0.87
342 0.87
343 0.83
344 0.84
345 0.86
346 0.86
347 0.85
348 0.81
349 0.8
350 0.81
351 0.79
352 0.75
353 0.66
354 0.57
355 0.48
356 0.43
357 0.34
358 0.24
359 0.17
360 0.1
361 0.09
362 0.09
363 0.08
364 0.08
365 0.09
366 0.1
367 0.1
368 0.13
369 0.12
370 0.11
371 0.13
372 0.18
373 0.19
374 0.28
375 0.29
376 0.27
377 0.26
378 0.26
379 0.24
380 0.19
381 0.23
382 0.18
383 0.22
384 0.22
385 0.24
386 0.24
387 0.26
388 0.27
389 0.24
390 0.22
391 0.19
392 0.19
393 0.17
394 0.17
395 0.15
396 0.12
397 0.1
398 0.06
399 0.05
400 0.04
401 0.03
402 0.02
403 0.02
404 0.03
405 0.03
406 0.04
407 0.05
408 0.06
409 0.06
410 0.07
411 0.07
412 0.07
413 0.07
414 0.06
415 0.06
416 0.05
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.07
425 0.09
426 0.1
427 0.1
428 0.11
429 0.11
430 0.1
431 0.11
432 0.09
433 0.08
434 0.08
435 0.08
436 0.07
437 0.07
438 0.08
439 0.07
440 0.07
441 0.09
442 0.13
443 0.21
444 0.32
445 0.38
446 0.4
447 0.42
448 0.43
449 0.44
450 0.42
451 0.36
452 0.29
453 0.25
454 0.23
455 0.21
456 0.19
457 0.14
458 0.12
459 0.09
460 0.05
461 0.04
462 0.03
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.06
467 0.07
468 0.07
469 0.08
470 0.09
471 0.09
472 0.13
473 0.15
474 0.17
475 0.19
476 0.19
477 0.19
478 0.19
479 0.2
480 0.16
481 0.13
482 0.1
483 0.09
484 0.08
485 0.08
486 0.09
487 0.08
488 0.08
489 0.09
490 0.09
491 0.1
492 0.12
493 0.14
494 0.16
495 0.15
496 0.15
497 0.16
498 0.16
499 0.14
500 0.13
501 0.11
502 0.12
503 0.14
504 0.15
505 0.16
506 0.19
507 0.21
508 0.23
509 0.27
510 0.25
511 0.26
512 0.26
513 0.26
514 0.24
515 0.24
516 0.26
517 0.23
518 0.25
519 0.3
520 0.36
521 0.35
522 0.43
523 0.47
524 0.52
525 0.51
526 0.5
527 0.44
528 0.37
529 0.4
530 0.32
531 0.26
532 0.17
533 0.16
534 0.14
535 0.14
536 0.14
537 0.09
538 0.08
539 0.08
540 0.08
541 0.08
542 0.07
543 0.07
544 0.08
545 0.08
546 0.08
547 0.08
548 0.15
549 0.15
550 0.16
551 0.15
552 0.16
553 0.16
554 0.19
555 0.19
556 0.16
557 0.21
558 0.22
559 0.23
560 0.22
561 0.22
562 0.23
563 0.23
564 0.21
565 0.17
566 0.22
567 0.23
568 0.24
569 0.26
570 0.29
571 0.28
572 0.27
573 0.25
574 0.19
575 0.2
576 0.19
577 0.17
578 0.15
579 0.16
580 0.16
581 0.16
582 0.16
583 0.15
584 0.18
585 0.26
586 0.23
587 0.24
588 0.28
589 0.29
590 0.34
591 0.4
592 0.44
593 0.38
594 0.41
595 0.44
596 0.49
597 0.51
598 0.48
599 0.44
600 0.37
601 0.38
602 0.34
603 0.32
604 0.24
605 0.27
606 0.24
607 0.22
608 0.21
609 0.19
610 0.2
611 0.17
612 0.15
613 0.1
614 0.11
615 0.13
616 0.13
617 0.13
618 0.12
619 0.12
620 0.12
621 0.14
622 0.14
623 0.14
624 0.13
625 0.15
626 0.16
627 0.18
628 0.25
629 0.26
630 0.28
631 0.27
632 0.26
633 0.26
634 0.26
635 0.28
636 0.24
637 0.31
638 0.3
639 0.3
640 0.34
641 0.37
642 0.43
643 0.44
644 0.42
645 0.4
646 0.38