Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A420HIQ6

Protein Details
Accession A0A420HIQ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
224-249QKEPREQKERPSRPPRERRERGPPANBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
151-176PRRRRISGRGRGRGGRGRGRAGRTGR
217-248EQKESKEQKEPREQKERPSRPPRERRERGPPA
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 14, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSSTMNDVTAAINDVTATLSKASISDNPAETDQSDRDAHKEAVLASAAEGRRLYIGNLAYATTEGELQSFFKGYSIESTSIPKNPRTDRPVGYAFVDLTSSAEAERAIAELSGQEILERKVSVQLARKPEPPSEKANSNGAEIGTGGETEPRRRRISGRGRGRGGRGRGRAGRTGRDPPAIHDKGTEIENTENSPLPSETTENPHATEKKEEVEPKEQKESKEQKEPREQKERPSRPPRERRERGPPANGVPSKTKVMVANLPYDLSEEKLKELFSDYEPLSAKIALRPIPRFMVKKLQARNEPRKGRGFGFVNLASNELQDRAVTEMNGKEVEGREIAVKVAIDSPDKISEDLNTQASGGADGSTNPSEGANGTTINDGTNDKFPSIGLNGTAETIAATA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.1
3 0.1
4 0.1
5 0.08
6 0.08
7 0.08
8 0.09
9 0.12
10 0.15
11 0.19
12 0.23
13 0.24
14 0.26
15 0.27
16 0.28
17 0.26
18 0.26
19 0.23
20 0.23
21 0.24
22 0.22
23 0.24
24 0.28
25 0.28
26 0.24
27 0.25
28 0.22
29 0.21
30 0.21
31 0.18
32 0.14
33 0.19
34 0.18
35 0.17
36 0.17
37 0.15
38 0.16
39 0.16
40 0.16
41 0.15
42 0.16
43 0.15
44 0.16
45 0.16
46 0.14
47 0.14
48 0.14
49 0.09
50 0.09
51 0.07
52 0.07
53 0.08
54 0.08
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.13
62 0.16
63 0.17
64 0.17
65 0.22
66 0.24
67 0.3
68 0.33
69 0.32
70 0.36
71 0.4
72 0.48
73 0.51
74 0.55
75 0.53
76 0.56
77 0.55
78 0.5
79 0.45
80 0.38
81 0.31
82 0.24
83 0.21
84 0.14
85 0.11
86 0.09
87 0.08
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.06
99 0.06
100 0.05
101 0.05
102 0.07
103 0.08
104 0.1
105 0.1
106 0.09
107 0.13
108 0.15
109 0.19
110 0.25
111 0.3
112 0.37
113 0.4
114 0.45
115 0.43
116 0.48
117 0.5
118 0.46
119 0.47
120 0.44
121 0.44
122 0.41
123 0.44
124 0.39
125 0.33
126 0.31
127 0.24
128 0.19
129 0.15
130 0.13
131 0.08
132 0.07
133 0.06
134 0.08
135 0.09
136 0.16
137 0.22
138 0.27
139 0.29
140 0.31
141 0.35
142 0.42
143 0.52
144 0.55
145 0.6
146 0.63
147 0.65
148 0.66
149 0.68
150 0.64
151 0.59
152 0.56
153 0.49
154 0.47
155 0.48
156 0.47
157 0.49
158 0.45
159 0.44
160 0.4
161 0.43
162 0.4
163 0.4
164 0.37
165 0.34
166 0.41
167 0.38
168 0.33
169 0.28
170 0.26
171 0.22
172 0.22
173 0.19
174 0.1
175 0.1
176 0.11
177 0.11
178 0.12
179 0.11
180 0.1
181 0.11
182 0.1
183 0.09
184 0.1
185 0.11
186 0.11
187 0.15
188 0.19
189 0.18
190 0.19
191 0.22
192 0.23
193 0.22
194 0.24
195 0.2
196 0.19
197 0.22
198 0.25
199 0.25
200 0.33
201 0.37
202 0.37
203 0.45
204 0.46
205 0.43
206 0.5
207 0.55
208 0.5
209 0.56
210 0.58
211 0.57
212 0.65
213 0.72
214 0.69
215 0.71
216 0.67
217 0.67
218 0.73
219 0.73
220 0.73
221 0.75
222 0.77
223 0.77
224 0.86
225 0.87
226 0.87
227 0.85
228 0.82
229 0.82
230 0.83
231 0.78
232 0.74
233 0.67
234 0.59
235 0.62
236 0.56
237 0.48
238 0.41
239 0.37
240 0.33
241 0.3
242 0.29
243 0.21
244 0.23
245 0.25
246 0.24
247 0.24
248 0.22
249 0.21
250 0.19
251 0.19
252 0.16
253 0.13
254 0.14
255 0.11
256 0.12
257 0.13
258 0.13
259 0.12
260 0.15
261 0.16
262 0.14
263 0.19
264 0.17
265 0.21
266 0.22
267 0.22
268 0.2
269 0.19
270 0.18
271 0.15
272 0.19
273 0.2
274 0.24
275 0.25
276 0.27
277 0.31
278 0.35
279 0.36
280 0.36
281 0.41
282 0.44
283 0.5
284 0.54
285 0.58
286 0.62
287 0.69
288 0.76
289 0.76
290 0.76
291 0.75
292 0.75
293 0.7
294 0.63
295 0.61
296 0.54
297 0.46
298 0.45
299 0.4
300 0.35
301 0.32
302 0.31
303 0.23
304 0.2
305 0.18
306 0.13
307 0.11
308 0.09
309 0.09
310 0.11
311 0.12
312 0.11
313 0.14
314 0.14
315 0.16
316 0.16
317 0.15
318 0.16
319 0.16
320 0.18
321 0.15
322 0.14
323 0.14
324 0.14
325 0.15
326 0.13
327 0.12
328 0.1
329 0.13
330 0.14
331 0.14
332 0.15
333 0.18
334 0.21
335 0.22
336 0.21
337 0.19
338 0.19
339 0.21
340 0.23
341 0.22
342 0.18
343 0.17
344 0.17
345 0.17
346 0.16
347 0.12
348 0.09
349 0.08
350 0.08
351 0.12
352 0.12
353 0.12
354 0.12
355 0.11
356 0.11
357 0.12
358 0.14
359 0.11
360 0.11
361 0.12
362 0.13
363 0.13
364 0.13
365 0.14
366 0.14
367 0.16
368 0.21
369 0.22
370 0.2
371 0.2
372 0.2
373 0.22
374 0.22
375 0.21
376 0.17
377 0.17
378 0.17
379 0.18
380 0.18
381 0.13