Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A420HND4

Protein Details
Accession A0A420HND4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
193-214VAFKSKPGKKFKGKNSYKVTKGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
198-205KPGKKFKG
Subcellular Location(s) mito_nucl 12.333, mito 12, nucl 11.5, cyto_mito 8.333
Family & Domain DBs
Pfam View protein in Pfam  
PF14223  Retrotran_gag_2  
Amino Acid Sequences MSVSTIISTKLKGTENYAVWALRMTAYLRRQGFISVTETDDVSNETNDYALADIELCLEDGPLLRIQHIKRAPLLWVTLRNLYTPKDLSADFLVIKEFFNCKLSNFDTMEDFLNTSRRLLDSMAQRGIGLPKKVIFTQYLNNLTNNYENIKSKIMQTLSKNFDGYSLDEMFSNLLDEANRLQSKADISQTALVAFKSKPGKKFKGKNSYKVTKGMLCRHCHRTNHTTSDCFELFPEKIPKKFKGSGLHSKLELWTRHTSDGVKNVKDNKVLTPKLINLDGMHVDPTIESIL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.34
3 0.36
4 0.37
5 0.32
6 0.28
7 0.28
8 0.22
9 0.15
10 0.15
11 0.14
12 0.19
13 0.22
14 0.3
15 0.3
16 0.3
17 0.3
18 0.31
19 0.3
20 0.26
21 0.26
22 0.2
23 0.2
24 0.2
25 0.2
26 0.18
27 0.17
28 0.16
29 0.13
30 0.12
31 0.1
32 0.09
33 0.09
34 0.09
35 0.09
36 0.07
37 0.06
38 0.05
39 0.05
40 0.05
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.05
45 0.05
46 0.05
47 0.06
48 0.07
49 0.1
50 0.1
51 0.11
52 0.17
53 0.18
54 0.27
55 0.29
56 0.3
57 0.29
58 0.3
59 0.31
60 0.27
61 0.3
62 0.25
63 0.27
64 0.27
65 0.29
66 0.28
67 0.27
68 0.27
69 0.26
70 0.26
71 0.22
72 0.21
73 0.19
74 0.18
75 0.19
76 0.18
77 0.18
78 0.14
79 0.13
80 0.13
81 0.11
82 0.11
83 0.11
84 0.11
85 0.1
86 0.13
87 0.13
88 0.13
89 0.17
90 0.19
91 0.22
92 0.22
93 0.22
94 0.2
95 0.21
96 0.21
97 0.17
98 0.15
99 0.11
100 0.13
101 0.13
102 0.12
103 0.11
104 0.1
105 0.11
106 0.11
107 0.15
108 0.18
109 0.22
110 0.22
111 0.21
112 0.21
113 0.21
114 0.24
115 0.23
116 0.18
117 0.14
118 0.15
119 0.17
120 0.17
121 0.18
122 0.16
123 0.15
124 0.18
125 0.23
126 0.27
127 0.26
128 0.26
129 0.25
130 0.24
131 0.23
132 0.2
133 0.16
134 0.13
135 0.13
136 0.15
137 0.15
138 0.15
139 0.15
140 0.19
141 0.19
142 0.21
143 0.23
144 0.3
145 0.32
146 0.33
147 0.32
148 0.27
149 0.27
150 0.23
151 0.21
152 0.17
153 0.14
154 0.13
155 0.13
156 0.13
157 0.12
158 0.1
159 0.09
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.06
165 0.12
166 0.12
167 0.12
168 0.12
169 0.13
170 0.15
171 0.17
172 0.18
173 0.13
174 0.14
175 0.16
176 0.16
177 0.15
178 0.14
179 0.11
180 0.12
181 0.11
182 0.15
183 0.22
184 0.26
185 0.33
186 0.41
187 0.51
188 0.58
189 0.68
190 0.73
191 0.75
192 0.79
193 0.81
194 0.82
195 0.81
196 0.75
197 0.71
198 0.64
199 0.58
200 0.58
201 0.58
202 0.55
203 0.53
204 0.56
205 0.6
206 0.63
207 0.62
208 0.63
209 0.62
210 0.62
211 0.66
212 0.63
213 0.57
214 0.52
215 0.54
216 0.46
217 0.38
218 0.31
219 0.25
220 0.22
221 0.25
222 0.34
223 0.31
224 0.37
225 0.43
226 0.46
227 0.5
228 0.55
229 0.56
230 0.56
231 0.6
232 0.66
233 0.66
234 0.66
235 0.59
236 0.54
237 0.51
238 0.48
239 0.42
240 0.36
241 0.37
242 0.37
243 0.38
244 0.39
245 0.39
246 0.37
247 0.44
248 0.46
249 0.41
250 0.44
251 0.49
252 0.51
253 0.53
254 0.5
255 0.49
256 0.52
257 0.51
258 0.49
259 0.47
260 0.46
261 0.46
262 0.46
263 0.39
264 0.29
265 0.32
266 0.3
267 0.25
268 0.22
269 0.17
270 0.16
271 0.14