Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A420HD12

Protein Details
Accession A0A420HD12    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
74-98QQHHSERPFREKKLRKKVGENDTEYBasic
226-272ASKVRELDREKKKKLRARENNRRYLDKDDKKSRRRKRDVRVNDDSDIBasic
281-302TMERNRDRRESIPKHRHRNRISBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
84-89EKKLRK
230-262RELDREKKKKLRARENNRRYLDKDDKKSRRRKR
294-298KHRHR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR039875  LENG1-like  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
Amino Acid Sequences HLLGKKSWNVYNKSNIEIVRRDEAIAKAAEEAEEERMQALDAERRMQILRGEEPTAIASFDLATTSTSVSSSRQQHHSERPFREKKLRKKVGENDTEYEMRVACQKAEEAAAARDKSSLTSSMMIPHNISGQRNILQKNAEAEKEVAKKKREYEDQYTMRFSNAAGFKQNPGDSPWYSKSDRLETRHEKDFACSKDVWGNDDPGRLQRENMRMVSNDPLVMMKAGASKVRELDREKKKKLRARENNRRYLDKDDKKSRRRKRDVRVNDDSDIKYESLDNTTMERNRDRRESIPKHRHRNRIS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.5
3 0.48
4 0.47
5 0.45
6 0.4
7 0.38
8 0.36
9 0.35
10 0.33
11 0.31
12 0.27
13 0.22
14 0.18
15 0.18
16 0.17
17 0.14
18 0.14
19 0.15
20 0.14
21 0.14
22 0.13
23 0.13
24 0.13
25 0.13
26 0.14
27 0.15
28 0.16
29 0.19
30 0.18
31 0.2
32 0.21
33 0.21
34 0.22
35 0.21
36 0.24
37 0.25
38 0.26
39 0.24
40 0.24
41 0.24
42 0.21
43 0.16
44 0.12
45 0.09
46 0.07
47 0.07
48 0.07
49 0.05
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.08
56 0.1
57 0.17
58 0.23
59 0.28
60 0.34
61 0.39
62 0.45
63 0.54
64 0.62
65 0.64
66 0.65
67 0.71
68 0.71
69 0.73
70 0.77
71 0.76
72 0.77
73 0.8
74 0.82
75 0.77
76 0.8
77 0.83
78 0.82
79 0.82
80 0.75
81 0.66
82 0.61
83 0.55
84 0.46
85 0.37
86 0.26
87 0.18
88 0.17
89 0.15
90 0.11
91 0.11
92 0.11
93 0.11
94 0.12
95 0.12
96 0.09
97 0.11
98 0.15
99 0.14
100 0.14
101 0.14
102 0.13
103 0.14
104 0.14
105 0.13
106 0.1
107 0.12
108 0.12
109 0.17
110 0.18
111 0.18
112 0.16
113 0.15
114 0.18
115 0.18
116 0.18
117 0.14
118 0.15
119 0.19
120 0.23
121 0.23
122 0.21
123 0.21
124 0.21
125 0.23
126 0.23
127 0.19
128 0.16
129 0.16
130 0.19
131 0.25
132 0.29
133 0.3
134 0.31
135 0.34
136 0.37
137 0.43
138 0.46
139 0.46
140 0.49
141 0.54
142 0.55
143 0.54
144 0.52
145 0.45
146 0.38
147 0.31
148 0.23
149 0.2
150 0.17
151 0.16
152 0.16
153 0.16
154 0.18
155 0.21
156 0.21
157 0.16
158 0.16
159 0.19
160 0.18
161 0.22
162 0.24
163 0.26
164 0.27
165 0.29
166 0.29
167 0.33
168 0.38
169 0.37
170 0.43
171 0.47
172 0.5
173 0.54
174 0.53
175 0.46
176 0.44
177 0.46
178 0.39
179 0.35
180 0.3
181 0.25
182 0.27
183 0.27
184 0.28
185 0.22
186 0.25
187 0.22
188 0.24
189 0.23
190 0.23
191 0.27
192 0.23
193 0.23
194 0.25
195 0.3
196 0.33
197 0.34
198 0.32
199 0.28
200 0.29
201 0.32
202 0.26
203 0.21
204 0.16
205 0.15
206 0.13
207 0.12
208 0.1
209 0.07
210 0.09
211 0.1
212 0.12
213 0.13
214 0.14
215 0.17
216 0.21
217 0.25
218 0.29
219 0.38
220 0.47
221 0.56
222 0.63
223 0.68
224 0.74
225 0.77
226 0.81
227 0.83
228 0.83
229 0.84
230 0.88
231 0.89
232 0.9
233 0.88
234 0.83
235 0.74
236 0.73
237 0.72
238 0.71
239 0.71
240 0.72
241 0.77
242 0.82
243 0.89
244 0.9
245 0.91
246 0.92
247 0.92
248 0.92
249 0.93
250 0.94
251 0.93
252 0.92
253 0.86
254 0.78
255 0.74
256 0.64
257 0.55
258 0.46
259 0.36
260 0.27
261 0.23
262 0.21
263 0.18
264 0.18
265 0.17
266 0.17
267 0.24
268 0.27
269 0.31
270 0.37
271 0.41
272 0.47
273 0.53
274 0.55
275 0.56
276 0.63
277 0.69
278 0.72
279 0.76
280 0.8
281 0.84
282 0.89