Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A439D7J2

Protein Details
Accession A0A439D7J2    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
353-373ETLPKPPKVAHKRPSEHRRDDBasic
449-478YSWKTNRRSAFHRKRKRWMRTRHIVDTTRKHydrophilic
610-632EGKVEARGKLRSRKRKAGEPGVVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
456-467RSAFHRKRKRWM
608-627PAEGKVEARGKLRSRKRKAG
Subcellular Location(s) cyto 10.5, nucl 7, cyto_mito 7, cysk 4, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MHSLVEPDAWVVLRLPSGNLRVLQVTPNTTTSLGKYGSFPTNLIIQRPYNLTYELLDKRPDEKFNRLRIVPAAELYADVLSSDANTQTAEDATPAPDAEGDDGTPPTGVEYTLVDSDSGAVVASTDSVEIDASARQTLTLAEIEALKKDGTDAGRELITRLMLSHTAIEQKTEYSLAKYKLLKTRKYIRRFCVLPLDIPMLNYWHLEDKDASKIMEMREEMVALLGCWANVHFGGSDPCEAQPIAKIKQEGEDTNMEEPGTEAVQTSSPGRWIVVDDTGGLLVAAMAERMGILYPSEADKLAREQRGAKSSGSKLGESSSAQQPVAKNGEGQAQHAVKQNDDVEAKREQEEEETLPKPPKVAHKRPSEHRRDDAVPYAHANTITHIHPNSQPNLSFLRYYDFEITNLTPSPHHPLAKHLMTLSWLQLLDPDLDPTYSSPPPNVTQEEIYSWKTNRRSAFHRKRKRWMRTRHIVDTTRKGEFSGLVVASAMDPVSIMQHTVPLLAGGAPIAIYSPTIEPLTELADCYSLQRRAAWATNIPEELVEKTPEEQEQWPGNEEFPLNPSLLLGASIQTSRVRKWQVLPGRTHPLMSSKGGAEGYVFTAWKVKPAEGKVEARGKLRSRKRKAGEPGVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.14
3 0.18
4 0.21
5 0.23
6 0.24
7 0.24
8 0.25
9 0.26
10 0.28
11 0.27
12 0.28
13 0.27
14 0.28
15 0.28
16 0.26
17 0.27
18 0.24
19 0.26
20 0.23
21 0.22
22 0.22
23 0.26
24 0.3
25 0.29
26 0.27
27 0.24
28 0.3
29 0.31
30 0.32
31 0.31
32 0.27
33 0.3
34 0.33
35 0.33
36 0.28
37 0.28
38 0.26
39 0.23
40 0.29
41 0.3
42 0.3
43 0.31
44 0.31
45 0.34
46 0.38
47 0.44
48 0.42
49 0.48
50 0.54
51 0.59
52 0.66
53 0.62
54 0.6
55 0.56
56 0.56
57 0.47
58 0.39
59 0.31
60 0.23
61 0.22
62 0.2
63 0.15
64 0.1
65 0.08
66 0.07
67 0.05
68 0.06
69 0.07
70 0.06
71 0.06
72 0.07
73 0.07
74 0.08
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.1
80 0.11
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.09
88 0.1
89 0.1
90 0.11
91 0.1
92 0.09
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.07
97 0.08
98 0.1
99 0.11
100 0.11
101 0.1
102 0.1
103 0.1
104 0.1
105 0.08
106 0.06
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.05
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.06
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.1
130 0.11
131 0.11
132 0.12
133 0.1
134 0.09
135 0.1
136 0.13
137 0.12
138 0.14
139 0.15
140 0.15
141 0.17
142 0.17
143 0.17
144 0.14
145 0.14
146 0.11
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.11
152 0.11
153 0.16
154 0.16
155 0.17
156 0.15
157 0.15
158 0.16
159 0.16
160 0.16
161 0.14
162 0.2
163 0.21
164 0.26
165 0.29
166 0.35
167 0.41
168 0.48
169 0.5
170 0.52
171 0.61
172 0.64
173 0.71
174 0.73
175 0.7
176 0.71
177 0.67
178 0.63
179 0.62
180 0.53
181 0.45
182 0.39
183 0.38
184 0.29
185 0.28
186 0.25
187 0.16
188 0.15
189 0.14
190 0.12
191 0.13
192 0.13
193 0.14
194 0.15
195 0.16
196 0.19
197 0.2
198 0.19
199 0.16
200 0.18
201 0.17
202 0.2
203 0.18
204 0.15
205 0.14
206 0.14
207 0.13
208 0.11
209 0.1
210 0.06
211 0.07
212 0.06
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.06
219 0.05
220 0.06
221 0.07
222 0.08
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.1
227 0.1
228 0.09
229 0.13
230 0.16
231 0.18
232 0.19
233 0.2
234 0.19
235 0.24
236 0.26
237 0.22
238 0.21
239 0.21
240 0.21
241 0.21
242 0.2
243 0.16
244 0.13
245 0.13
246 0.1
247 0.07
248 0.06
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.07
253 0.08
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.08
264 0.08
265 0.07
266 0.07
267 0.05
268 0.04
269 0.03
270 0.02
271 0.02
272 0.02
273 0.02
274 0.02
275 0.02
276 0.02
277 0.02
278 0.02
279 0.02
280 0.03
281 0.03
282 0.04
283 0.05
284 0.05
285 0.06
286 0.06
287 0.11
288 0.17
289 0.17
290 0.18
291 0.21
292 0.25
293 0.29
294 0.3
295 0.26
296 0.26
297 0.26
298 0.31
299 0.28
300 0.24
301 0.21
302 0.2
303 0.21
304 0.16
305 0.18
306 0.16
307 0.16
308 0.16
309 0.17
310 0.17
311 0.19
312 0.21
313 0.17
314 0.14
315 0.13
316 0.19
317 0.17
318 0.18
319 0.19
320 0.17
321 0.19
322 0.24
323 0.24
324 0.19
325 0.21
326 0.2
327 0.18
328 0.19
329 0.17
330 0.15
331 0.17
332 0.18
333 0.16
334 0.16
335 0.14
336 0.14
337 0.16
338 0.15
339 0.17
340 0.16
341 0.18
342 0.19
343 0.19
344 0.18
345 0.19
346 0.27
347 0.33
348 0.42
349 0.49
350 0.57
351 0.64
352 0.74
353 0.81
354 0.81
355 0.76
356 0.71
357 0.68
358 0.6
359 0.56
360 0.53
361 0.44
362 0.35
363 0.31
364 0.28
365 0.23
366 0.2
367 0.18
368 0.12
369 0.13
370 0.13
371 0.14
372 0.13
373 0.15
374 0.19
375 0.23
376 0.25
377 0.24
378 0.24
379 0.23
380 0.26
381 0.25
382 0.21
383 0.17
384 0.19
385 0.17
386 0.19
387 0.21
388 0.18
389 0.17
390 0.19
391 0.19
392 0.17
393 0.17
394 0.15
395 0.12
396 0.13
397 0.2
398 0.21
399 0.23
400 0.21
401 0.26
402 0.33
403 0.34
404 0.33
405 0.26
406 0.22
407 0.22
408 0.23
409 0.18
410 0.13
411 0.11
412 0.1
413 0.11
414 0.12
415 0.12
416 0.11
417 0.12
418 0.1
419 0.1
420 0.1
421 0.11
422 0.14
423 0.14
424 0.15
425 0.14
426 0.17
427 0.2
428 0.24
429 0.25
430 0.22
431 0.22
432 0.22
433 0.25
434 0.25
435 0.25
436 0.25
437 0.24
438 0.29
439 0.32
440 0.36
441 0.38
442 0.4
443 0.46
444 0.53
445 0.64
446 0.68
447 0.75
448 0.78
449 0.84
450 0.9
451 0.92
452 0.91
453 0.9
454 0.9
455 0.9
456 0.89
457 0.87
458 0.85
459 0.81
460 0.78
461 0.76
462 0.69
463 0.6
464 0.52
465 0.44
466 0.36
467 0.3
468 0.24
469 0.2
470 0.16
471 0.13
472 0.13
473 0.12
474 0.11
475 0.11
476 0.09
477 0.04
478 0.04
479 0.04
480 0.05
481 0.05
482 0.06
483 0.06
484 0.08
485 0.08
486 0.08
487 0.08
488 0.07
489 0.07
490 0.06
491 0.06
492 0.04
493 0.04
494 0.04
495 0.04
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.05
500 0.06
501 0.08
502 0.09
503 0.09
504 0.09
505 0.1
506 0.12
507 0.11
508 0.11
509 0.1
510 0.1
511 0.11
512 0.13
513 0.19
514 0.19
515 0.2
516 0.2
517 0.22
518 0.26
519 0.31
520 0.31
521 0.3
522 0.33
523 0.36
524 0.35
525 0.32
526 0.28
527 0.25
528 0.24
529 0.21
530 0.18
531 0.15
532 0.16
533 0.19
534 0.2
535 0.22
536 0.21
537 0.25
538 0.3
539 0.31
540 0.33
541 0.31
542 0.3
543 0.29
544 0.28
545 0.22
546 0.19
547 0.19
548 0.15
549 0.14
550 0.13
551 0.11
552 0.1
553 0.1
554 0.08
555 0.07
556 0.09
557 0.09
558 0.11
559 0.16
560 0.18
561 0.2
562 0.27
563 0.32
564 0.35
565 0.4
566 0.48
567 0.53
568 0.58
569 0.63
570 0.62
571 0.66
572 0.62
573 0.58
574 0.5
575 0.45
576 0.42
577 0.38
578 0.34
579 0.25
580 0.28
581 0.27
582 0.25
583 0.2
584 0.17
585 0.17
586 0.16
587 0.15
588 0.12
589 0.19
590 0.19
591 0.24
592 0.25
593 0.26
594 0.31
595 0.35
596 0.43
597 0.44
598 0.48
599 0.5
600 0.56
601 0.56
602 0.53
603 0.57
604 0.57
605 0.6
606 0.67
607 0.7
608 0.72
609 0.78
610 0.82
611 0.84
612 0.87