Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A439D8V1

Protein Details
Accession A0A439D8V1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-133YREIDEKMDKRRRARRLVPPIYPRPCSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
117-120RRRA
Subcellular Location(s) nucl 9, mito 8.5, cyto_mito 8.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13432  TPR_16  
PF14559  TPR_19  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MTGRRDFLSQPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPSEDQIKEALAKRAAQLGFSDAVTGKKKDQAAEEDDNNDERFQDPDNEVGLFAGGIYDKDDDEADRIYREIDEKMDKRRRARRLVPPIYPRPCSPPLASSQFMSEVVEQITDDCYSIREAREQAERDEYERKNPKISQQFADLKRGLESITEDEWAALPEVGDLTGRNKRARQARHQRFYAVPDSVLAAASSAGELGATVADDGAVSANTGTSTNGTDGTVTDFAKIGQARDKVLQVRLDQASQNGAGTSGSATSVDPKGYLTSLAKSQLPDSAAQVGDVNRVRDLLESVIKTNPNNAPGWIAAARVEELAGKIVAARNVISRGCDHCPKSEDVWLENIRLNDQRNARIIAANAIKKNNRSVRLWVEAMKLEDDARSKKRVIRHALDHIPESEALWKEAVNLEENSDDAKLLLAKATELVPGSVDLWLALARLETPENAQKVLNRARKHRPTSHEIWIAAARLQEQLGEGDKVNVMKRAAQVLVKESAMPKREEWITEAEKCEEEGAIITCGAIIRETLGYGLDEDDDRKEAWLEDARGSIDRGMYETARAIYAYALRVFPTSKTIWLAAADLERNYGKREDLWQVLEKAVNAVPHSEVLWMMLAKEKWQAGEVDNARRVLARAFQQNPNNEDIWLAAVKLEAENDQTEQARGLLKQARQEAPTDRVWMKSAVFERQLNNHDEALDLVQQALNLFPGYPKLWMMKGHIYEDMGKKPQAREAYATGVKAVPNSVPLWLLYSRLEESMGLLPKARSVLDRARLAVPKSPELWCESVRLELRAGDKKQAESIMERARRDVPKNKQGLLWAEKIWHLTEPKQRKPRAVEAVKEAENDPVLLVAVARIFWGERRLDKAQNWFERALVRDSGLGDSWAWYYKFLVEHGTVEKREEVIRKCVGVEPRHGEVWQRIAKDPKNARRSTEEILKMVAAEVH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.3
3 0.26
4 0.23
5 0.18
6 0.15
7 0.12
8 0.12
9 0.12
10 0.12
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.21
19 0.23
20 0.25
21 0.3
22 0.31
23 0.29
24 0.31
25 0.32
26 0.31
27 0.36
28 0.38
29 0.33
30 0.32
31 0.29
32 0.28
33 0.32
34 0.33
35 0.31
36 0.28
37 0.3
38 0.3
39 0.37
40 0.36
41 0.31
42 0.28
43 0.25
44 0.23
45 0.21
46 0.22
47 0.15
48 0.2
49 0.24
50 0.25
51 0.24
52 0.29
53 0.32
54 0.33
55 0.38
56 0.4
57 0.43
58 0.48
59 0.48
60 0.45
61 0.45
62 0.44
63 0.39
64 0.32
65 0.25
66 0.19
67 0.17
68 0.17
69 0.2
70 0.19
71 0.2
72 0.22
73 0.21
74 0.2
75 0.19
76 0.16
77 0.1
78 0.09
79 0.07
80 0.05
81 0.05
82 0.07
83 0.08
84 0.07
85 0.09
86 0.09
87 0.1
88 0.11
89 0.14
90 0.13
91 0.13
92 0.14
93 0.14
94 0.15
95 0.16
96 0.16
97 0.18
98 0.27
99 0.3
100 0.41
101 0.49
102 0.54
103 0.62
104 0.7
105 0.75
106 0.76
107 0.81
108 0.82
109 0.83
110 0.86
111 0.85
112 0.85
113 0.86
114 0.82
115 0.76
116 0.67
117 0.64
118 0.59
119 0.54
120 0.47
121 0.41
122 0.42
123 0.45
124 0.44
125 0.37
126 0.35
127 0.32
128 0.29
129 0.27
130 0.2
131 0.15
132 0.14
133 0.14
134 0.11
135 0.1
136 0.12
137 0.1
138 0.09
139 0.08
140 0.08
141 0.11
142 0.14
143 0.15
144 0.18
145 0.2
146 0.23
147 0.31
148 0.33
149 0.32
150 0.37
151 0.37
152 0.36
153 0.43
154 0.41
155 0.43
156 0.5
157 0.49
158 0.49
159 0.51
160 0.56
161 0.58
162 0.61
163 0.55
164 0.55
165 0.62
166 0.58
167 0.63
168 0.55
169 0.45
170 0.41
171 0.38
172 0.29
173 0.21
174 0.21
175 0.16
176 0.16
177 0.16
178 0.15
179 0.15
180 0.15
181 0.14
182 0.12
183 0.08
184 0.07
185 0.06
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.1
191 0.16
192 0.2
193 0.23
194 0.26
195 0.33
196 0.42
197 0.5
198 0.56
199 0.62
200 0.69
201 0.75
202 0.75
203 0.72
204 0.66
205 0.63
206 0.57
207 0.47
208 0.36
209 0.27
210 0.26
211 0.22
212 0.19
213 0.13
214 0.08
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.04
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.07
240 0.08
241 0.09
242 0.09
243 0.08
244 0.08
245 0.12
246 0.13
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.16
252 0.16
253 0.14
254 0.18
255 0.19
256 0.21
257 0.23
258 0.27
259 0.26
260 0.29
261 0.31
262 0.26
263 0.31
264 0.3
265 0.3
266 0.27
267 0.24
268 0.22
269 0.19
270 0.18
271 0.11
272 0.1
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.08
281 0.1
282 0.1
283 0.09
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.13
288 0.11
289 0.12
290 0.14
291 0.16
292 0.17
293 0.17
294 0.17
295 0.18
296 0.18
297 0.16
298 0.16
299 0.17
300 0.15
301 0.15
302 0.16
303 0.13
304 0.17
305 0.19
306 0.18
307 0.14
308 0.15
309 0.15
310 0.14
311 0.15
312 0.11
313 0.14
314 0.14
315 0.15
316 0.18
317 0.19
318 0.19
319 0.23
320 0.23
321 0.22
322 0.22
323 0.2
324 0.19
325 0.17
326 0.2
327 0.15
328 0.13
329 0.11
330 0.11
331 0.11
332 0.09
333 0.09
334 0.06
335 0.06
336 0.07
337 0.06
338 0.05
339 0.06
340 0.07
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.09
345 0.11
346 0.12
347 0.12
348 0.13
349 0.16
350 0.19
351 0.25
352 0.25
353 0.27
354 0.3
355 0.32
356 0.32
357 0.33
358 0.3
359 0.25
360 0.3
361 0.27
362 0.26
363 0.25
364 0.23
365 0.21
366 0.22
367 0.23
368 0.22
369 0.24
370 0.25
371 0.26
372 0.27
373 0.26
374 0.24
375 0.23
376 0.22
377 0.25
378 0.25
379 0.25
380 0.27
381 0.28
382 0.28
383 0.36
384 0.37
385 0.36
386 0.34
387 0.37
388 0.38
389 0.41
390 0.41
391 0.35
392 0.31
393 0.29
394 0.27
395 0.22
396 0.17
397 0.13
398 0.13
399 0.13
400 0.16
401 0.18
402 0.2
403 0.22
404 0.25
405 0.31
406 0.38
407 0.43
408 0.44
409 0.47
410 0.52
411 0.55
412 0.53
413 0.48
414 0.4
415 0.33
416 0.27
417 0.21
418 0.17
419 0.13
420 0.12
421 0.11
422 0.1
423 0.1
424 0.12
425 0.12
426 0.1
427 0.1
428 0.1
429 0.1
430 0.1
431 0.1
432 0.08
433 0.07
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.04
440 0.04
441 0.05
442 0.06
443 0.06
444 0.06
445 0.06
446 0.05
447 0.06
448 0.06
449 0.05
450 0.05
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.03
457 0.03
458 0.04
459 0.05
460 0.05
461 0.07
462 0.1
463 0.11
464 0.12
465 0.12
466 0.13
467 0.18
468 0.27
469 0.31
470 0.31
471 0.37
472 0.46
473 0.55
474 0.6
475 0.62
476 0.59
477 0.6
478 0.62
479 0.63
480 0.57
481 0.48
482 0.43
483 0.36
484 0.31
485 0.24
486 0.19
487 0.12
488 0.09
489 0.09
490 0.07
491 0.07
492 0.07
493 0.07
494 0.08
495 0.07
496 0.07
497 0.08
498 0.09
499 0.1
500 0.11
501 0.1
502 0.12
503 0.13
504 0.14
505 0.15
506 0.15
507 0.15
508 0.15
509 0.17
510 0.14
511 0.14
512 0.14
513 0.17
514 0.18
515 0.18
516 0.16
517 0.18
518 0.19
519 0.19
520 0.19
521 0.21
522 0.22
523 0.23
524 0.25
525 0.22
526 0.21
527 0.2
528 0.19
529 0.12
530 0.09
531 0.07
532 0.07
533 0.06
534 0.06
535 0.05
536 0.05
537 0.05
538 0.05
539 0.04
540 0.03
541 0.04
542 0.04
543 0.04
544 0.04
545 0.04
546 0.05
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.05
551 0.06
552 0.06
553 0.07
554 0.07
555 0.07
556 0.08
557 0.07
558 0.1
559 0.13
560 0.14
561 0.14
562 0.15
563 0.15
564 0.15
565 0.15
566 0.13
567 0.1
568 0.09
569 0.09
570 0.09
571 0.09
572 0.09
573 0.09
574 0.09
575 0.08
576 0.08
577 0.07
578 0.06
579 0.08
580 0.09
581 0.09
582 0.09
583 0.09
584 0.1
585 0.11
586 0.11
587 0.13
588 0.13
589 0.13
590 0.14
591 0.14
592 0.14
593 0.14
594 0.14
595 0.11
596 0.12
597 0.11
598 0.1
599 0.11
600 0.11
601 0.11
602 0.13
603 0.12
604 0.11
605 0.12
606 0.16
607 0.19
608 0.21
609 0.24
610 0.25
611 0.25
612 0.26
613 0.25
614 0.21
615 0.18
616 0.17
617 0.14
618 0.11
619 0.11
620 0.1
621 0.1
622 0.11
623 0.09
624 0.08
625 0.07
626 0.08
627 0.07
628 0.06
629 0.1
630 0.09
631 0.1
632 0.13
633 0.13
634 0.13
635 0.14
636 0.15
637 0.12
638 0.21
639 0.24
640 0.27
641 0.29
642 0.29
643 0.28
644 0.27
645 0.26
646 0.19
647 0.2
648 0.19
649 0.24
650 0.28
651 0.35
652 0.4
653 0.44
654 0.46
655 0.45
656 0.4
657 0.32
658 0.28
659 0.21
660 0.18
661 0.13
662 0.1
663 0.07
664 0.07
665 0.07
666 0.07
667 0.07
668 0.06
669 0.07
670 0.08
671 0.09
672 0.11
673 0.11
674 0.11
675 0.11
676 0.12
677 0.12
678 0.11
679 0.16
680 0.2
681 0.21
682 0.26
683 0.32
684 0.35
685 0.34
686 0.37
687 0.36
688 0.35
689 0.35
690 0.34
691 0.29
692 0.27
693 0.28
694 0.26
695 0.22
696 0.24
697 0.24
698 0.24
699 0.27
700 0.29
701 0.29
702 0.34
703 0.38
704 0.35
705 0.35
706 0.31
707 0.27
708 0.24
709 0.22
710 0.18
711 0.15
712 0.11
713 0.09
714 0.09
715 0.09
716 0.09
717 0.08
718 0.07
719 0.06
720 0.06
721 0.06
722 0.08
723 0.09
724 0.1
725 0.11
726 0.13
727 0.15
728 0.18
729 0.22
730 0.27
731 0.28
732 0.29
733 0.29
734 0.28
735 0.32
736 0.33
737 0.34
738 0.3
739 0.3
740 0.32
741 0.32
742 0.36
743 0.35
744 0.34
745 0.33
746 0.33
747 0.38
748 0.36
749 0.35
750 0.31
751 0.27
752 0.25
753 0.21
754 0.19
755 0.12
756 0.12
757 0.12
758 0.12
759 0.11
760 0.11
761 0.14
762 0.13
763 0.14
764 0.13
765 0.15
766 0.16
767 0.15
768 0.16
769 0.12
770 0.14
771 0.19
772 0.2
773 0.17
774 0.18
775 0.18
776 0.19
777 0.2
778 0.18
779 0.14
780 0.18
781 0.25
782 0.31
783 0.33
784 0.35
785 0.39
786 0.42
787 0.43
788 0.43
789 0.39
790 0.35
791 0.35
792 0.34
793 0.31
794 0.32
795 0.33
796 0.29
797 0.28
798 0.25
799 0.29
800 0.29
801 0.29
802 0.25
803 0.24
804 0.29
805 0.34
806 0.35
807 0.36
808 0.37
809 0.37
810 0.39
811 0.38
812 0.35
813 0.29
814 0.35
815 0.38
816 0.4
817 0.39
818 0.39
819 0.45
820 0.49
821 0.54
822 0.56
823 0.56
824 0.61
825 0.66
826 0.65
827 0.6
828 0.58
829 0.59
830 0.55
831 0.48
832 0.4
833 0.36
834 0.35
835 0.35
836 0.31
837 0.27
838 0.24
839 0.28
840 0.37
841 0.44
842 0.53
843 0.61
844 0.64
845 0.68
846 0.73
847 0.75
848 0.76
849 0.74
850 0.69
851 0.67
852 0.7
853 0.63
854 0.57
855 0.48
856 0.39
857 0.32
858 0.27
859 0.19
860 0.12
861 0.11
862 0.09
863 0.08
864 0.06
865 0.06
866 0.06
867 0.06
868 0.06
869 0.06
870 0.08
871 0.14
872 0.17
873 0.2
874 0.27
875 0.32
876 0.38
877 0.43
878 0.51
879 0.56
880 0.6
881 0.61
882 0.55
883 0.52
884 0.5
885 0.48
886 0.42
887 0.34
888 0.27
889 0.24
890 0.25
891 0.25
892 0.21
893 0.19
894 0.15
895 0.14
896 0.15
897 0.17
898 0.16
899 0.15
900 0.15
901 0.18
902 0.19
903 0.18
904 0.22
905 0.19
906 0.22
907 0.28
908 0.33
909 0.31
910 0.32
911 0.33
912 0.3
913 0.34
914 0.38
915 0.36
916 0.38
917 0.41
918 0.39
919 0.4
920 0.44
921 0.47
922 0.44
923 0.48
924 0.46
925 0.46
926 0.47
927 0.46
928 0.44
929 0.41
930 0.46
931 0.42
932 0.39
933 0.41
934 0.48
935 0.52
936 0.58
937 0.64
938 0.65
939 0.7
940 0.7
941 0.7
942 0.68
943 0.69
944 0.66
945 0.66
946 0.61
947 0.52
948 0.51
949 0.45
950 0.38