Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A439D309

Protein Details
Accession A0A439D309    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
97-117TGVWVIRKQTRRKRDPEDEIIHydrophilic
322-348KTPKTPTSGTSKLKRKKSKTGQTPTSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
319-340AGDKTPKTPTSGTSKLKRKKSK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 15, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR016612  Mediator_Med6_fun  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MAAQNEPPLDEIQWRHPQSAQQMQGIHSNSVLFYFAQSPFFDPTSNNAVLANQAMFNPAMFHLIQTREAFEGRLREMSGLEFIVAQEPAETAPGTGTGVWVIRKQTRRKRDPEDEIIVHATYYIVGENIYMAPTLAQVLSFRMVSCARPDGSQQTEFRQYVLIPIGQTNISSALNKCFPMADEARIWSPSQGHVYKMAQTTNPRPRNATESKETTPRPDGKAASNRATGAPDPKRPDPVLSTFDLVRHAEHSMLVHLQSGGDYEDENPITGKPGAFNLSKTGRTDKLQVPGITALNTSFKSTSILDLGGKKTKDASSKAGDKTPKTPTSGTSKLKRKKSKTGQTPTSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.4
3 0.41
4 0.45
5 0.48
6 0.54
7 0.5
8 0.44
9 0.45
10 0.44
11 0.48
12 0.46
13 0.38
14 0.28
15 0.25
16 0.2
17 0.18
18 0.18
19 0.11
20 0.1
21 0.13
22 0.14
23 0.16
24 0.17
25 0.19
26 0.21
27 0.22
28 0.21
29 0.18
30 0.22
31 0.26
32 0.26
33 0.23
34 0.2
35 0.19
36 0.2
37 0.2
38 0.16
39 0.1
40 0.09
41 0.11
42 0.1
43 0.1
44 0.1
45 0.09
46 0.11
47 0.1
48 0.11
49 0.14
50 0.16
51 0.2
52 0.19
53 0.2
54 0.19
55 0.2
56 0.2
57 0.19
58 0.21
59 0.19
60 0.2
61 0.19
62 0.18
63 0.18
64 0.18
65 0.16
66 0.12
67 0.11
68 0.09
69 0.08
70 0.09
71 0.09
72 0.07
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.07
77 0.07
78 0.05
79 0.05
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.07
86 0.08
87 0.1
88 0.14
89 0.2
90 0.28
91 0.38
92 0.47
93 0.57
94 0.65
95 0.72
96 0.78
97 0.81
98 0.82
99 0.79
100 0.77
101 0.67
102 0.6
103 0.53
104 0.43
105 0.32
106 0.24
107 0.16
108 0.08
109 0.08
110 0.05
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.05
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.05
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.05
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.09
131 0.1
132 0.12
133 0.13
134 0.13
135 0.14
136 0.15
137 0.18
138 0.21
139 0.24
140 0.24
141 0.24
142 0.3
143 0.29
144 0.28
145 0.24
146 0.2
147 0.17
148 0.18
149 0.15
150 0.09
151 0.09
152 0.1
153 0.09
154 0.09
155 0.08
156 0.08
157 0.07
158 0.08
159 0.09
160 0.1
161 0.11
162 0.12
163 0.11
164 0.1
165 0.1
166 0.13
167 0.14
168 0.14
169 0.13
170 0.14
171 0.15
172 0.16
173 0.16
174 0.12
175 0.11
176 0.11
177 0.16
178 0.15
179 0.15
180 0.18
181 0.19
182 0.22
183 0.23
184 0.22
185 0.19
186 0.23
187 0.31
188 0.38
189 0.43
190 0.4
191 0.41
192 0.42
193 0.47
194 0.48
195 0.44
196 0.39
197 0.39
198 0.41
199 0.45
200 0.44
201 0.4
202 0.42
203 0.41
204 0.38
205 0.37
206 0.37
207 0.37
208 0.45
209 0.46
210 0.43
211 0.4
212 0.37
213 0.34
214 0.34
215 0.28
216 0.28
217 0.29
218 0.31
219 0.35
220 0.36
221 0.4
222 0.39
223 0.4
224 0.36
225 0.36
226 0.34
227 0.3
228 0.3
229 0.25
230 0.25
231 0.25
232 0.21
233 0.17
234 0.15
235 0.14
236 0.12
237 0.12
238 0.12
239 0.11
240 0.11
241 0.11
242 0.1
243 0.09
244 0.09
245 0.08
246 0.08
247 0.07
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.1
252 0.1
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.13
257 0.14
258 0.13
259 0.1
260 0.13
261 0.17
262 0.17
263 0.18
264 0.22
265 0.25
266 0.28
267 0.3
268 0.33
269 0.32
270 0.34
271 0.4
272 0.38
273 0.41
274 0.45
275 0.43
276 0.4
277 0.4
278 0.38
279 0.32
280 0.27
281 0.22
282 0.18
283 0.18
284 0.18
285 0.15
286 0.15
287 0.17
288 0.17
289 0.18
290 0.16
291 0.17
292 0.18
293 0.22
294 0.27
295 0.31
296 0.3
297 0.28
298 0.31
299 0.34
300 0.37
301 0.37
302 0.4
303 0.42
304 0.5
305 0.53
306 0.56
307 0.58
308 0.55
309 0.57
310 0.6
311 0.55
312 0.52
313 0.5
314 0.48
315 0.51
316 0.56
317 0.58
318 0.59
319 0.65
320 0.69
321 0.78
322 0.84
323 0.83
324 0.85
325 0.87
326 0.89
327 0.89
328 0.91