FuNGI

A0A439CS42

Protein Details

Accession

A0A439CS42

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
256-292	QIGINKKSKKSKKMLEKATEKVKRHERKKNANQQLNF	Hydrophilic
494-517	LLAKWKEEEKKRKRAEKGLPDNPD	Basic
682-720	EGKSTTNKEKARKKNFLMTLGKAKSKQKRSLVATRNVLK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
255-284	HQIGINKKSKKSKKMLEKATEKVKRHERKK
500-510	EEEKKRKRAEK
658-738	AREGKPNREEHKSTTAIRKSKKEAEGKSTTNKEKARKKNFLMTLGKAKSKQKRSLVATRNVLKAHVQRSKSGGRRRNGVSK

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto 7, cyto_mito 6.5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR027312 Sda1 IPR007949 SDA1_C IPR012977 SDA1_N
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0015031 P:protein transport GO:0042273 P:ribosomal large subunit biogenesis GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF08158 NUC130_3NT PF05285 SDA1

Amino Acid Sequences

MPKRKVTAAEKVEGLAILQWKLRKDPLAYQTEFIELWQHFDSARERVLADPLGVDAESLVTFREHMDLIAHCADKYPDITAGFPDSLKDILTTHHATLDPTLREKIVTSLSLLRRKEVIDSAYLLPIFWTLLISTPSKTLRALLYQKIISDVRETNTRAKNHKVNRTLQHALYNLVVDKTTPKALWAVKVVRDLWRRRIWDDAKPVDIMRQAAMSDDPKTVASAVKFFLGSDKEREEFEDESSDEEAVDVRKVKHQIGINKKSKKSKKMLEKATEKVKRHERKKNANQQLNFSALHLLLDPQGFCESLFEKHLQNRKSKLPLGNKLDILQLVTRLVGLHKLTILPLYSYFTSHLTPRQQSVTSFMASLAQATHSLVPPETIEVLLQKIANEFVSEASNVEVCAAGINAIREICARQPLAMNEALLQDLVEYRKSKDKGVSMAAKGLLSLYREQGAEMLKKRDRGKDATIGLKTGEIKEHKFGEEQIGEIEGLELLAKWKEEEKKRKRAEKGLPDNPDAAEKNEEEDDDEFNQSDWEVASTDSDESGEWIRVAESDDEAEPEPELKKRKVDGEVEEEEADEEAEAPIDFMKLATTQLLTPADLAKLKELRLEASINKAMGGNKRKGIEARHTDEGLTAEQIEAPAMLRKSTKEERVALAREGKPNREEHKSTTAIRKSKKEAEGKSTTNKEKARKKNFLMTLGKAKSKQKRSLVATRNVLKAHVQRSKSGGRRRNGVSK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.22
3	0.18
4	0.15
5	0.18
6	0.2
7	0.22
8	0.26
9	0.31
10	0.33
11	0.34
12	0.42
13	0.48
14	0.53
15	0.53
16	0.5
17	0.47
18	0.44
19	0.4
20	0.3
21	0.28
22	0.19
23	0.21
24	0.21
25	0.2
26	0.18
27	0.22
28	0.25
29	0.22
30	0.24
31	0.21
32	0.21
33	0.22
34	0.26
35	0.23
36	0.2
37	0.16
38	0.15
39	0.14
40	0.13
41	0.12
42	0.07
43	0.07
44	0.07
45	0.07
46	0.07
47	0.06
48	0.07
49	0.08
50	0.1
51	0.09
52	0.09
53	0.12
54	0.12
55	0.17
56	0.21
57	0.21
58	0.19
59	0.2
60	0.21
61	0.2
62	0.2
63	0.18
64	0.17
65	0.17
66	0.18
67	0.18
68	0.21
69	0.2
70	0.19
71	0.18
72	0.15
73	0.15
74	0.14
75	0.13
76	0.1
77	0.1
78	0.17
79	0.19
80	0.18
81	0.21
82	0.21
83	0.21
84	0.25
85	0.3
86	0.27
87	0.27
88	0.28
89	0.25
90	0.25
91	0.25
92	0.24
93	0.21
94	0.19
95	0.18
96	0.25
97	0.32
98	0.39
99	0.39
100	0.37
101	0.36
102	0.36
103	0.37
104	0.33
105	0.28
106	0.23
107	0.26
108	0.26
109	0.26
110	0.25
111	0.22
112	0.17
113	0.15
114	0.13
115	0.09
116	0.08
117	0.05
118	0.08
119	0.1
120	0.11
121	0.12
122	0.16
123	0.18
124	0.18
125	0.19
126	0.19
127	0.19
128	0.26
129	0.31
130	0.31
131	0.35
132	0.35
133	0.35
134	0.37
135	0.35
136	0.28
137	0.27
138	0.25
139	0.22
140	0.27
141	0.3
142	0.34
143	0.4
144	0.45
145	0.45
146	0.51
147	0.57
148	0.6
149	0.67
150	0.66
151	0.68
152	0.69
153	0.73
154	0.7
155	0.62
156	0.59
157	0.5
158	0.44
159	0.36
160	0.3
161	0.22
162	0.18
163	0.16
164	0.1
165	0.12
166	0.13
167	0.14
168	0.13
169	0.13
170	0.18
171	0.2
172	0.23
173	0.27
174	0.29
175	0.29
176	0.33
177	0.34
178	0.37
179	0.43
180	0.45
181	0.47
182	0.5
183	0.5
184	0.48
185	0.56
186	0.52
187	0.52
188	0.57
189	0.52
190	0.47
191	0.45
192	0.43
193	0.36
194	0.34
195	0.27
196	0.18
197	0.15
198	0.13
199	0.12
200	0.14
201	0.13
202	0.13
203	0.12
204	0.13
205	0.12
206	0.12
207	0.12
208	0.13
209	0.12
210	0.12
211	0.12
212	0.12
213	0.12
214	0.12
215	0.15
216	0.15
217	0.16
218	0.18
219	0.21
220	0.2
221	0.21
222	0.23
223	0.23
224	0.2
225	0.2
226	0.19
227	0.16
228	0.17
229	0.17
230	0.15
231	0.12
232	0.1
233	0.1
234	0.08
235	0.09
236	0.1
237	0.11
238	0.16
239	0.18
240	0.19
241	0.23
242	0.28
243	0.35
244	0.43
245	0.53
246	0.57
247	0.63
248	0.68
249	0.73
250	0.76
251	0.77
252	0.75
253	0.74
254	0.76
255	0.77
256	0.81
257	0.81
258	0.79
259	0.75
260	0.77
261	0.75
262	0.66
263	0.65
264	0.65
265	0.66
266	0.69
267	0.73
268	0.73
269	0.77
270	0.85
271	0.88
272	0.88
273	0.87
274	0.79
275	0.74
276	0.67
277	0.58
278	0.47
279	0.37
280	0.28
281	0.19
282	0.17
283	0.12
284	0.09
285	0.08
286	0.08
287	0.08
288	0.07
289	0.08
290	0.08
291	0.07
292	0.08
293	0.08
294	0.09
295	0.11
296	0.12
297	0.14
298	0.2
299	0.27
300	0.29
301	0.34
302	0.37
303	0.41
304	0.45
305	0.48
306	0.5
307	0.52
308	0.57
309	0.58
310	0.57
311	0.52
312	0.47
313	0.42
314	0.34
315	0.27
316	0.18
317	0.12
318	0.08
319	0.08
320	0.07
321	0.06
322	0.06
323	0.08
324	0.07
325	0.07
326	0.07
327	0.08
328	0.08
329	0.08
330	0.08
331	0.06
332	0.06
333	0.08
334	0.08
335	0.09
336	0.1
337	0.1
338	0.11
339	0.12
340	0.16
341	0.18
342	0.19
343	0.2
344	0.22
345	0.21
346	0.21
347	0.24
348	0.22
349	0.18
350	0.17
351	0.15
352	0.13
353	0.12
354	0.12
355	0.07
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.07
360	0.06
361	0.07
362	0.06
363	0.07
364	0.06
365	0.07
366	0.06
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.06
378	0.06
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.06
386	0.06
387	0.05
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.05
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.06
398	0.07
399	0.07
400	0.1
401	0.1
402	0.1
403	0.13
404	0.13
405	0.16
406	0.15
407	0.14
408	0.12
409	0.12
410	0.11
411	0.09
412	0.08
413	0.05
414	0.06
415	0.07
416	0.08
417	0.09
418	0.11
419	0.19
420	0.2
421	0.22
422	0.25
423	0.28
424	0.29
425	0.34
426	0.38
427	0.31
428	0.32
429	0.31
430	0.26
431	0.23
432	0.19
433	0.14
434	0.1
435	0.11
436	0.09
437	0.1
438	0.1
439	0.1
440	0.12
441	0.13
442	0.17
443	0.2
444	0.26
445	0.26
446	0.33
447	0.37
448	0.41
449	0.43
450	0.43
451	0.45
452	0.45
453	0.47
454	0.48
455	0.44
456	0.38
457	0.33
458	0.3
459	0.26
460	0.19
461	0.21
462	0.17
463	0.18
464	0.22
465	0.23
466	0.22
467	0.22
468	0.22
469	0.23
470	0.21
471	0.19
472	0.16
473	0.15
474	0.13
475	0.12
476	0.11
477	0.05
478	0.05
479	0.04
480	0.04
481	0.04
482	0.05
483	0.05
484	0.06
485	0.11
486	0.19
487	0.29
488	0.4
489	0.49
490	0.59
491	0.68
492	0.77
493	0.79
494	0.81
495	0.82
496	0.82
497	0.83
498	0.81
499	0.77
500	0.7
501	0.63
502	0.54
503	0.48
504	0.38
505	0.29
506	0.24
507	0.19
508	0.19
509	0.18
510	0.18
511	0.15
512	0.15
513	0.16
514	0.15
515	0.15
516	0.13
517	0.13
518	0.13
519	0.11
520	0.1
521	0.07
522	0.06
523	0.06
524	0.06
525	0.06
526	0.07
527	0.08
528	0.07
529	0.08
530	0.07
531	0.08
532	0.09
533	0.09
534	0.08
535	0.08
536	0.08
537	0.08
538	0.1
539	0.1
540	0.09
541	0.1
542	0.1
543	0.12
544	0.12
545	0.12
546	0.1
547	0.11
548	0.12
549	0.15
550	0.21
551	0.22
552	0.27
553	0.3
554	0.36
555	0.4
556	0.44
557	0.45
558	0.46
559	0.47
560	0.44
561	0.41
562	0.35
563	0.28
564	0.23
565	0.17
566	0.1
567	0.07
568	0.05
569	0.05
570	0.05
571	0.05
572	0.05
573	0.05
574	0.05
575	0.04
576	0.05
577	0.05
578	0.06
579	0.07
580	0.08
581	0.08
582	0.12
583	0.13
584	0.13
585	0.13
586	0.14
587	0.15
588	0.16
589	0.17
590	0.18
591	0.2
592	0.2
593	0.23
594	0.22
595	0.22
596	0.22
597	0.25
598	0.21
599	0.25
600	0.28
601	0.24
602	0.24
603	0.25
604	0.26
605	0.31
606	0.37
607	0.35
608	0.37
609	0.39
610	0.41
611	0.43
612	0.45
613	0.47
614	0.49
615	0.5
616	0.5
617	0.49
618	0.46
619	0.44
620	0.4
621	0.3
622	0.22
623	0.16
624	0.11
625	0.11
626	0.11
627	0.09
628	0.08
629	0.07
630	0.11
631	0.12
632	0.13
633	0.15
634	0.16
635	0.25
636	0.32
637	0.39
638	0.4
639	0.43
640	0.47
641	0.53
642	0.55
643	0.52
644	0.53
645	0.5
646	0.53
647	0.54
648	0.53
649	0.5
650	0.54
651	0.55
652	0.55
653	0.54
654	0.52
655	0.56
656	0.56
657	0.57
658	0.6
659	0.63
660	0.62
661	0.66
662	0.68
663	0.67
664	0.71
665	0.75
666	0.74
667	0.72
668	0.73
669	0.73
670	0.71
671	0.73
672	0.72
673	0.7
674	0.69
675	0.69
676	0.7
677	0.72
678	0.77
679	0.78
680	0.79
681	0.8
682	0.81
683	0.81
684	0.81
685	0.77
686	0.73
687	0.72
688	0.68
689	0.67
690	0.63
691	0.65
692	0.66
693	0.69
694	0.72
695	0.7
696	0.74
697	0.77
698	0.81
699	0.82
700	0.81
701	0.81
702	0.78
703	0.74
704	0.65
705	0.59
706	0.55
707	0.53
708	0.53
709	0.52
710	0.48
711	0.47
712	0.53
713	0.62
714	0.64
715	0.67
716	0.65
717	0.64
718	0.7

A0A439CS42

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer