Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A439DBD8

Protein Details
Accession A0A439DBD8    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
49-72AEPERTPSPPPRKRSPSPPHDYVLHydrophilic
301-322TEEKRKRREYRLMRKEQFKRPEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-63KFFHKLPKGAKPTAEPERTPSPPPRKRS
303-320EKRKRREYRLMRKEQFKR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028942  WHIM1_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF15612  WHIM1  
Amino Acid Sequences MADDESSELSSVSSLSSAPSEDDGEVQLKREKGILKFFHKLPKGAKPTAEPERTPSPPPRKRSPSPPHDYVLADNPDIAFIIMFRSRFNEALPKSLANFGPQELERDVTESIPGERVEHFLCAVLGLLLNRKQDVKPGHYSRALEDAISSHKNQWARIWEDKSPLSGGKTFTTMNPTERLTLLRTLVLWTLSSSEVVKGIINQSYKQNRHEDDLNQPLSVQPWGADSDRRRYFLVEGLDDTHFRVYRESNPAGFSRTWWSVAGSIDELNTLCDKLQTVDGGPKARKLAQKMQAAVPRFEATEEKRKRREYRLMRKEQFKRPEPGFSMYEGRTRGKRIRYTYSDDEDFYSDSTTRRSTRNTGTHTPAESAGPVTTASGRQVVRPSRMTVDASNNIVTTSPTHETGGTRSKEASVGRSGRPMRSAAVNHDTNGWAASKKKGYSPVDDEMDDDGDDSELDLGDDEDDHIPDEDSEEEEDDDFNEDEAMGDDDLEDGAKSMVVKLKYSPKTNGAIMDLDAFRYDGGDKRGNQPSVKAGGSPKGSPLLERSEKSIDVVTIKRQATPEVAAENPEKQHLHPSPTLALNSLQPTSLAFRESPEKTQQKSLRKSVDIFAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.07
3 0.08
4 0.09
5 0.1
6 0.12
7 0.14
8 0.13
9 0.15
10 0.16
11 0.18
12 0.18
13 0.19
14 0.23
15 0.22
16 0.22
17 0.26
18 0.29
19 0.31
20 0.41
21 0.46
22 0.48
23 0.55
24 0.59
25 0.64
26 0.62
27 0.63
28 0.59
29 0.61
30 0.63
31 0.6
32 0.59
33 0.55
34 0.59
35 0.64
36 0.63
37 0.54
38 0.52
39 0.55
40 0.54
41 0.55
42 0.57
43 0.58
44 0.6
45 0.66
46 0.71
47 0.72
48 0.76
49 0.81
50 0.82
51 0.82
52 0.83
53 0.8
54 0.73
55 0.67
56 0.61
57 0.53
58 0.5
59 0.43
60 0.34
61 0.29
62 0.26
63 0.22
64 0.21
65 0.17
66 0.09
67 0.05
68 0.09
69 0.11
70 0.12
71 0.12
72 0.15
73 0.18
74 0.19
75 0.21
76 0.26
77 0.25
78 0.31
79 0.33
80 0.31
81 0.29
82 0.34
83 0.33
84 0.26
85 0.26
86 0.21
87 0.24
88 0.23
89 0.25
90 0.21
91 0.22
92 0.19
93 0.2
94 0.2
95 0.15
96 0.16
97 0.13
98 0.13
99 0.14
100 0.14
101 0.13
102 0.14
103 0.16
104 0.16
105 0.16
106 0.15
107 0.12
108 0.12
109 0.1
110 0.1
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.11
115 0.14
116 0.15
117 0.16
118 0.18
119 0.18
120 0.25
121 0.3
122 0.32
123 0.39
124 0.44
125 0.49
126 0.51
127 0.52
128 0.46
129 0.47
130 0.4
131 0.3
132 0.25
133 0.2
134 0.21
135 0.22
136 0.22
137 0.18
138 0.22
139 0.24
140 0.24
141 0.27
142 0.3
143 0.33
144 0.4
145 0.42
146 0.41
147 0.44
148 0.44
149 0.41
150 0.36
151 0.31
152 0.26
153 0.24
154 0.23
155 0.19
156 0.21
157 0.2
158 0.19
159 0.24
160 0.23
161 0.22
162 0.23
163 0.23
164 0.22
165 0.22
166 0.23
167 0.19
168 0.2
169 0.18
170 0.16
171 0.15
172 0.15
173 0.15
174 0.14
175 0.11
176 0.09
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.08
186 0.1
187 0.13
188 0.14
189 0.15
190 0.23
191 0.31
192 0.34
193 0.38
194 0.43
195 0.41
196 0.44
197 0.47
198 0.42
199 0.4
200 0.45
201 0.41
202 0.34
203 0.33
204 0.29
205 0.25
206 0.22
207 0.15
208 0.07
209 0.07
210 0.09
211 0.1
212 0.15
213 0.17
214 0.26
215 0.29
216 0.31
217 0.3
218 0.29
219 0.29
220 0.29
221 0.29
222 0.21
223 0.19
224 0.2
225 0.2
226 0.19
227 0.18
228 0.16
229 0.13
230 0.13
231 0.14
232 0.13
233 0.18
234 0.25
235 0.26
236 0.25
237 0.26
238 0.27
239 0.28
240 0.26
241 0.22
242 0.19
243 0.19
244 0.19
245 0.17
246 0.17
247 0.16
248 0.16
249 0.16
250 0.11
251 0.1
252 0.09
253 0.09
254 0.08
255 0.07
256 0.07
257 0.06
258 0.05
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.11
266 0.13
267 0.17
268 0.17
269 0.18
270 0.19
271 0.23
272 0.26
273 0.28
274 0.34
275 0.38
276 0.43
277 0.43
278 0.46
279 0.46
280 0.44
281 0.39
282 0.32
283 0.24
284 0.2
285 0.19
286 0.17
287 0.16
288 0.25
289 0.32
290 0.37
291 0.43
292 0.5
293 0.55
294 0.6
295 0.66
296 0.67
297 0.71
298 0.75
299 0.79
300 0.78
301 0.82
302 0.83
303 0.81
304 0.79
305 0.72
306 0.68
307 0.59
308 0.58
309 0.52
310 0.48
311 0.4
312 0.34
313 0.33
314 0.27
315 0.29
316 0.25
317 0.24
318 0.22
319 0.25
320 0.29
321 0.31
322 0.37
323 0.39
324 0.45
325 0.48
326 0.53
327 0.55
328 0.54
329 0.48
330 0.42
331 0.38
332 0.31
333 0.26
334 0.19
335 0.15
336 0.11
337 0.1
338 0.11
339 0.13
340 0.15
341 0.17
342 0.2
343 0.24
344 0.32
345 0.39
346 0.44
347 0.46
348 0.49
349 0.49
350 0.47
351 0.43
352 0.35
353 0.28
354 0.21
355 0.17
356 0.11
357 0.09
358 0.08
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.11
364 0.12
365 0.13
366 0.2
367 0.23
368 0.26
369 0.28
370 0.29
371 0.27
372 0.29
373 0.3
374 0.26
375 0.29
376 0.27
377 0.26
378 0.25
379 0.22
380 0.2
381 0.18
382 0.16
383 0.11
384 0.12
385 0.12
386 0.13
387 0.14
388 0.14
389 0.15
390 0.19
391 0.26
392 0.23
393 0.22
394 0.22
395 0.22
396 0.25
397 0.25
398 0.24
399 0.23
400 0.26
401 0.26
402 0.33
403 0.35
404 0.33
405 0.34
406 0.31
407 0.26
408 0.27
409 0.28
410 0.26
411 0.31
412 0.3
413 0.29
414 0.29
415 0.28
416 0.22
417 0.22
418 0.17
419 0.11
420 0.12
421 0.17
422 0.2
423 0.21
424 0.25
425 0.33
426 0.35
427 0.4
428 0.44
429 0.45
430 0.43
431 0.42
432 0.4
433 0.32
434 0.29
435 0.22
436 0.16
437 0.11
438 0.08
439 0.07
440 0.06
441 0.05
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.06
449 0.06
450 0.07
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.08
455 0.09
456 0.08
457 0.09
458 0.09
459 0.09
460 0.1
461 0.1
462 0.1
463 0.09
464 0.11
465 0.1
466 0.09
467 0.08
468 0.07
469 0.07
470 0.08
471 0.09
472 0.06
473 0.06
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.06
478 0.05
479 0.04
480 0.04
481 0.05
482 0.05
483 0.07
484 0.12
485 0.13
486 0.15
487 0.19
488 0.3
489 0.35
490 0.4
491 0.43
492 0.43
493 0.47
494 0.48
495 0.45
496 0.37
497 0.32
498 0.28
499 0.27
500 0.22
501 0.18
502 0.17
503 0.14
504 0.11
505 0.11
506 0.12
507 0.12
508 0.17
509 0.23
510 0.25
511 0.33
512 0.42
513 0.45
514 0.44
515 0.43
516 0.43
517 0.42
518 0.4
519 0.36
520 0.3
521 0.33
522 0.36
523 0.34
524 0.3
525 0.31
526 0.31
527 0.29
528 0.3
529 0.32
530 0.35
531 0.35
532 0.38
533 0.36
534 0.37
535 0.37
536 0.35
537 0.27
538 0.26
539 0.28
540 0.29
541 0.32
542 0.33
543 0.34
544 0.33
545 0.34
546 0.32
547 0.32
548 0.3
549 0.26
550 0.26
551 0.26
552 0.27
553 0.29
554 0.27
555 0.29
556 0.27
557 0.25
558 0.34
559 0.35
560 0.4
561 0.38
562 0.41
563 0.41
564 0.44
565 0.44
566 0.35
567 0.32
568 0.29
569 0.3
570 0.26
571 0.21
572 0.18
573 0.18
574 0.21
575 0.21
576 0.19
577 0.16
578 0.19
579 0.27
580 0.3
581 0.34
582 0.4
583 0.47
584 0.48
585 0.58
586 0.63
587 0.66
588 0.72
589 0.76
590 0.74
591 0.72
592 0.72