Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A439CPN0

Protein Details
Accession A0A439CPN0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-32LLGTSSRSSRPSRRRTSSKASRAKSPSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-28RPSRRRTSSKASRA
Subcellular Location(s) mito 10, nucl 8.5, cyto_nucl 7.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047544  RING-HC_RBR_RNF216  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
CDD cd16630  RING-HC_RBR_RNF216  
Amino Acid Sequences MFLSNLLGTSSRSSRPSRRRTSSKASRAKSPSHIRLSSASSSSLSQSQSQTQANEGPSRSEYIVDESQLEPIAPLPNDILSLNNDLESLSSLFPDIQVEVFREMLSNLSDESKLFVITDMLLKNPATYVKGRRLTAEQLAGQKTPVSKTETFRTSAYKIAVRALALQEFKGLSRSTIDAVLSESNYSYLDARPTLVDLSSKSWKFAISSILFRRKPVTSSEAETHPLVYWRSSEGGLLVPAVKATGNAELDRELFEELILPLKALEKDTRERADRALALSVQTEEAEACEATYECACCYTDSVFEEITTCSADGHMVCFRCVQHSITEAVFGQGWQASIQKDTGTLRCPAVSSTECQGCISSDHIRRAMHDTEKGTEILEKLDQRLAEHGLLSSGLPLVRCPFCSYAEVDELYMPTDARPPKIRLSGVPNVILMLLAILLSPASLFLAIVSFICLVLSWNSSVRSFVSRHFAAALSRYQRRAVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.54
3 0.63
4 0.69
5 0.75
6 0.81
7 0.84
8 0.88
9 0.89
10 0.89
11 0.88
12 0.81
13 0.81
14 0.78
15 0.76
16 0.75
17 0.74
18 0.73
19 0.72
20 0.69
21 0.62
22 0.6
23 0.59
24 0.53
25 0.45
26 0.37
27 0.29
28 0.28
29 0.28
30 0.28
31 0.24
32 0.24
33 0.25
34 0.28
35 0.32
36 0.34
37 0.32
38 0.31
39 0.35
40 0.34
41 0.36
42 0.32
43 0.3
44 0.28
45 0.31
46 0.28
47 0.25
48 0.22
49 0.23
50 0.25
51 0.22
52 0.23
53 0.2
54 0.21
55 0.19
56 0.18
57 0.12
58 0.12
59 0.15
60 0.13
61 0.13
62 0.13
63 0.13
64 0.14
65 0.14
66 0.14
67 0.12
68 0.15
69 0.15
70 0.14
71 0.13
72 0.12
73 0.13
74 0.13
75 0.12
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.1
82 0.08
83 0.08
84 0.09
85 0.1
86 0.12
87 0.12
88 0.12
89 0.11
90 0.11
91 0.11
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.12
99 0.11
100 0.1
101 0.1
102 0.09
103 0.08
104 0.09
105 0.13
106 0.11
107 0.11
108 0.13
109 0.13
110 0.12
111 0.13
112 0.14
113 0.13
114 0.17
115 0.22
116 0.3
117 0.36
118 0.37
119 0.38
120 0.41
121 0.42
122 0.42
123 0.4
124 0.33
125 0.33
126 0.35
127 0.32
128 0.29
129 0.26
130 0.23
131 0.21
132 0.21
133 0.22
134 0.23
135 0.27
136 0.34
137 0.35
138 0.36
139 0.35
140 0.37
141 0.32
142 0.32
143 0.31
144 0.26
145 0.24
146 0.24
147 0.24
148 0.2
149 0.2
150 0.18
151 0.19
152 0.16
153 0.16
154 0.14
155 0.14
156 0.13
157 0.14
158 0.12
159 0.09
160 0.1
161 0.11
162 0.11
163 0.12
164 0.12
165 0.1
166 0.11
167 0.12
168 0.1
169 0.09
170 0.08
171 0.07
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.13
186 0.19
187 0.19
188 0.19
189 0.19
190 0.19
191 0.19
192 0.19
193 0.22
194 0.17
195 0.23
196 0.28
197 0.37
198 0.37
199 0.37
200 0.39
201 0.33
202 0.32
203 0.3
204 0.28
205 0.22
206 0.25
207 0.27
208 0.26
209 0.27
210 0.25
211 0.22
212 0.17
213 0.17
214 0.13
215 0.11
216 0.1
217 0.09
218 0.1
219 0.1
220 0.09
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.07
225 0.07
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.05
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.08
236 0.09
237 0.09
238 0.1
239 0.09
240 0.07
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.08
250 0.08
251 0.09
252 0.11
253 0.13
254 0.17
255 0.22
256 0.26
257 0.27
258 0.27
259 0.27
260 0.28
261 0.26
262 0.23
263 0.2
264 0.16
265 0.14
266 0.14
267 0.13
268 0.09
269 0.08
270 0.07
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.04
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.06
281 0.05
282 0.07
283 0.08
284 0.07
285 0.09
286 0.09
287 0.11
288 0.12
289 0.13
290 0.12
291 0.12
292 0.12
293 0.11
294 0.11
295 0.09
296 0.08
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.06
301 0.08
302 0.11
303 0.11
304 0.12
305 0.14
306 0.14
307 0.16
308 0.18
309 0.17
310 0.15
311 0.17
312 0.18
313 0.16
314 0.17
315 0.15
316 0.13
317 0.12
318 0.1
319 0.09
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.09
324 0.09
325 0.1
326 0.11
327 0.1
328 0.12
329 0.14
330 0.16
331 0.16
332 0.18
333 0.18
334 0.18
335 0.18
336 0.17
337 0.19
338 0.18
339 0.18
340 0.21
341 0.22
342 0.22
343 0.22
344 0.22
345 0.18
346 0.18
347 0.19
348 0.22
349 0.25
350 0.29
351 0.32
352 0.32
353 0.33
354 0.38
355 0.39
356 0.36
357 0.36
358 0.34
359 0.33
360 0.35
361 0.33
362 0.28
363 0.24
364 0.2
365 0.17
366 0.19
367 0.17
368 0.17
369 0.2
370 0.19
371 0.18
372 0.21
373 0.21
374 0.18
375 0.17
376 0.15
377 0.13
378 0.13
379 0.12
380 0.09
381 0.08
382 0.08
383 0.07
384 0.08
385 0.13
386 0.14
387 0.16
388 0.19
389 0.2
390 0.22
391 0.24
392 0.26
393 0.25
394 0.27
395 0.26
396 0.23
397 0.21
398 0.19
399 0.18
400 0.16
401 0.12
402 0.09
403 0.16
404 0.17
405 0.22
406 0.28
407 0.31
408 0.37
409 0.44
410 0.45
411 0.44
412 0.5
413 0.53
414 0.51
415 0.48
416 0.41
417 0.35
418 0.33
419 0.27
420 0.18
421 0.1
422 0.06
423 0.04
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.03
430 0.03
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.05
435 0.05
436 0.06
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.07
441 0.06
442 0.08
443 0.09
444 0.11
445 0.12
446 0.14
447 0.17
448 0.17
449 0.19
450 0.19
451 0.22
452 0.22
453 0.25
454 0.31
455 0.29
456 0.3
457 0.31
458 0.3
459 0.28
460 0.29
461 0.33
462 0.33
463 0.38
464 0.39