Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A439CZT3

Protein Details
Accession A0A439CZT3    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
570-591DSTHRCGKTNVKKISRSKGISRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 16.5, cyto_mito 12.333, cyto 7, cyto_nucl 5.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018165  Ala-tRNA-synth_IIc_core  
IPR018164  Ala-tRNA-synth_IIc_N  
IPR037202  ESCRT_assembly_dom  
IPR018163  Thr/Ala-tRNA-synth_IIc_edit  
IPR009000  Transl_B-barrel_sf  
IPR012947  tRNA_SAD  
IPR007143  Vps28  
IPR017899  VPS28_C  
IPR037206  VPS28_C_sf  
IPR017898  VPS28_N  
IPR038358  VPS28_N_sf  
Gene Ontology GO:0000813  C:ESCRT I complex  
GO:0004813  F:alanine-tRNA ligase activity  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006419  P:alanyl-tRNA aminoacylation  
GO:0032509  P:endosome transport via multivesicular body sorting pathway  
GO:0072666  P:establishment of protein localization to vacuole  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0043162  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway  
GO:0007034  P:vacuolar transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF01411  tRNA-synt_2c  
PF07973  tRNA_SAD  
PF03997  VPS28  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50860  AA_TRNA_LIGASE_II_ALA  
PS51310  VPS28_C  
PS51313  VPS28_N  
Amino Acid Sequences MASRQAYAPTPHSYVPNTTISATINLDEEVKLAETRAERDLQDSLAEIFSIIVTLDELERAFLKDAIPESDYTEICERSLKQYKSILADETVAKAFVGLEEFKAEWDVSYNVPACATTCPRAHDVQLEVPRATERLKVGMPSTAVTASTGTAPQPAVATDSKSGQLILKATEDFITFLDALRLGLLAKDQLHPLLTDIIQSANKVTDRDFENRGKIIQWLITLNQMKATEELSEHQARELELDINSAYSAAFASHSYTEALVDYQPSPVRLHTCMQCGSGSIHGNAFAIGRPRDLHYIPSEAMSGQFTSSAAPLEGRNFFVFPLLCPPVDDILKCSKVSRSNHPLQTVVRAVRSVASLEEANRGLFKGANEEDHVLVTDQTIFHPQGGGQPSDVGVIRAASGASFDVSAVRMNSVTEGEVLHLGRFADGSSQFKPGETVTQTIDSEKRILYSRYHTAGHVLGGAVRHLLEKEVANFDELKASHFPESAACEFQGLIEGKWKDSIQARVDAYINKDMPVEIDFWNEDDFRANGLERLIPDRKAMGMADDEKFRVVKILGCEVYPCGGTHVDSTHRCGKTNVKKISRSKGISRVSYTLP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.36
3 0.36
4 0.32
5 0.3
6 0.29
7 0.27
8 0.27
9 0.24
10 0.2
11 0.17
12 0.16
13 0.16
14 0.14
15 0.13
16 0.12
17 0.12
18 0.11
19 0.1
20 0.14
21 0.15
22 0.18
23 0.21
24 0.23
25 0.22
26 0.25
27 0.26
28 0.23
29 0.21
30 0.19
31 0.17
32 0.14
33 0.13
34 0.11
35 0.09
36 0.08
37 0.07
38 0.06
39 0.04
40 0.04
41 0.05
42 0.05
43 0.06
44 0.06
45 0.08
46 0.09
47 0.1
48 0.12
49 0.12
50 0.12
51 0.15
52 0.17
53 0.19
54 0.19
55 0.18
56 0.19
57 0.23
58 0.22
59 0.22
60 0.24
61 0.22
62 0.21
63 0.24
64 0.23
65 0.28
66 0.38
67 0.36
68 0.38
69 0.43
70 0.47
71 0.48
72 0.49
73 0.41
74 0.33
75 0.34
76 0.3
77 0.27
78 0.23
79 0.18
80 0.15
81 0.13
82 0.11
83 0.09
84 0.11
85 0.09
86 0.09
87 0.11
88 0.11
89 0.11
90 0.13
91 0.12
92 0.09
93 0.11
94 0.12
95 0.11
96 0.16
97 0.16
98 0.15
99 0.15
100 0.15
101 0.14
102 0.17
103 0.2
104 0.21
105 0.22
106 0.25
107 0.29
108 0.31
109 0.31
110 0.31
111 0.3
112 0.33
113 0.37
114 0.37
115 0.34
116 0.32
117 0.31
118 0.29
119 0.26
120 0.22
121 0.17
122 0.17
123 0.18
124 0.19
125 0.2
126 0.21
127 0.21
128 0.18
129 0.18
130 0.14
131 0.13
132 0.12
133 0.12
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.08
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.11
144 0.11
145 0.13
146 0.13
147 0.15
148 0.15
149 0.15
150 0.15
151 0.13
152 0.14
153 0.13
154 0.13
155 0.13
156 0.13
157 0.13
158 0.14
159 0.13
160 0.11
161 0.1
162 0.11
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.06
174 0.08
175 0.09
176 0.1
177 0.1
178 0.11
179 0.1
180 0.11
181 0.12
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.11
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.11
190 0.12
191 0.12
192 0.12
193 0.15
194 0.18
195 0.22
196 0.27
197 0.28
198 0.31
199 0.31
200 0.31
201 0.27
202 0.24
203 0.22
204 0.17
205 0.15
206 0.13
207 0.13
208 0.19
209 0.2
210 0.19
211 0.2
212 0.19
213 0.18
214 0.18
215 0.18
216 0.11
217 0.11
218 0.12
219 0.14
220 0.16
221 0.16
222 0.16
223 0.16
224 0.15
225 0.15
226 0.15
227 0.11
228 0.09
229 0.1
230 0.09
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.05
235 0.04
236 0.04
237 0.03
238 0.04
239 0.04
240 0.06
241 0.06
242 0.07
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.08
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.09
252 0.09
253 0.1
254 0.11
255 0.11
256 0.14
257 0.14
258 0.18
259 0.18
260 0.21
261 0.21
262 0.21
263 0.2
264 0.18
265 0.17
266 0.17
267 0.16
268 0.13
269 0.12
270 0.11
271 0.11
272 0.1
273 0.1
274 0.07
275 0.09
276 0.09
277 0.1
278 0.1
279 0.12
280 0.15
281 0.15
282 0.16
283 0.14
284 0.17
285 0.16
286 0.16
287 0.15
288 0.11
289 0.12
290 0.1
291 0.08
292 0.06
293 0.06
294 0.05
295 0.05
296 0.06
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.06
301 0.08
302 0.09
303 0.1
304 0.1
305 0.1
306 0.1
307 0.11
308 0.11
309 0.09
310 0.13
311 0.13
312 0.13
313 0.13
314 0.14
315 0.14
316 0.15
317 0.15
318 0.12
319 0.17
320 0.19
321 0.19
322 0.19
323 0.21
324 0.27
325 0.31
326 0.37
327 0.4
328 0.46
329 0.5
330 0.51
331 0.49
332 0.43
333 0.43
334 0.38
335 0.31
336 0.23
337 0.19
338 0.18
339 0.16
340 0.16
341 0.12
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.09
346 0.12
347 0.11
348 0.11
349 0.1
350 0.1
351 0.09
352 0.1
353 0.09
354 0.12
355 0.12
356 0.14
357 0.15
358 0.16
359 0.16
360 0.15
361 0.15
362 0.1
363 0.09
364 0.08
365 0.08
366 0.06
367 0.07
368 0.1
369 0.09
370 0.09
371 0.09
372 0.09
373 0.14
374 0.16
375 0.16
376 0.13
377 0.13
378 0.13
379 0.15
380 0.14
381 0.09
382 0.07
383 0.07
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.04
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.04
393 0.05
394 0.05
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.08
401 0.08
402 0.08
403 0.07
404 0.07
405 0.07
406 0.09
407 0.09
408 0.08
409 0.09
410 0.09
411 0.08
412 0.08
413 0.07
414 0.09
415 0.11
416 0.14
417 0.15
418 0.19
419 0.19
420 0.19
421 0.2
422 0.17
423 0.21
424 0.19
425 0.19
426 0.18
427 0.21
428 0.21
429 0.23
430 0.24
431 0.19
432 0.19
433 0.18
434 0.18
435 0.18
436 0.2
437 0.21
438 0.25
439 0.3
440 0.32
441 0.33
442 0.31
443 0.3
444 0.29
445 0.26
446 0.2
447 0.14
448 0.12
449 0.11
450 0.11
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.07
455 0.08
456 0.09
457 0.1
458 0.13
459 0.16
460 0.16
461 0.17
462 0.17
463 0.17
464 0.2
465 0.18
466 0.19
467 0.17
468 0.19
469 0.19
470 0.19
471 0.19
472 0.16
473 0.22
474 0.21
475 0.21
476 0.19
477 0.18
478 0.17
479 0.17
480 0.2
481 0.16
482 0.14
483 0.2
484 0.21
485 0.21
486 0.24
487 0.24
488 0.22
489 0.27
490 0.34
491 0.3
492 0.36
493 0.36
494 0.35
495 0.38
496 0.36
497 0.35
498 0.35
499 0.32
500 0.26
501 0.26
502 0.23
503 0.22
504 0.21
505 0.19
506 0.12
507 0.14
508 0.14
509 0.15
510 0.17
511 0.16
512 0.15
513 0.15
514 0.15
515 0.13
516 0.15
517 0.14
518 0.13
519 0.15
520 0.17
521 0.16
522 0.23
523 0.25
524 0.24
525 0.25
526 0.25
527 0.25
528 0.24
529 0.23
530 0.18
531 0.2
532 0.23
533 0.25
534 0.26
535 0.25
536 0.25
537 0.25
538 0.22
539 0.2
540 0.17
541 0.18
542 0.2
543 0.28
544 0.27
545 0.27
546 0.29
547 0.27
548 0.27
549 0.24
550 0.2
551 0.14
552 0.14
553 0.15
554 0.16
555 0.19
556 0.25
557 0.26
558 0.32
559 0.39
560 0.39
561 0.4
562 0.42
563 0.49
564 0.52
565 0.6
566 0.64
567 0.64
568 0.72
569 0.79
570 0.86
571 0.85
572 0.81
573 0.79
574 0.78
575 0.78
576 0.75
577 0.71