Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A439D695

Protein Details
Accession A0A439D695    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
241-260AATHRHHHHHQHQHQQHPHDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
558-560KRR
1046-1059RRPVLGRGGAKRGG
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11, cyto 5.5, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR034397  Prp24_RRM1  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR031766  RRM_occluded  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF16842  RRM_occluded  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12296  RRM1_Prp24  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MANPVGEDSWLAYIDEQRRHASDLEARVKVVELFKAALGDEPASLRLWLTYCEYFWSLFTECQSPSPSSSSSSPSSPLSSSSWTEEERQLGRDLFSFDAALSLWSDGYNATKFRIADSHLFWDRWVAIELEQLARTRTPSGVKRISHLFRDRLQVPHATWDQTSQMFSEFLTTYNNAAYEHEFQEVTRTARDAKXAYELRESHELDLARAQRDTDREAEKAKMRQYLDWEMAQTAQAAAAAAATHRHHHHHQHQHQQHPHDPLAVPLGVGLYARALTGVFAFDDDIWNNCAVYLSSLHRNTKTHPSLYTPLLPNMLDFFQRATKHCPWSGPLWSRYILTAEDAGWSFHNVESIKHAATNTKALDSNGMTGVLDMYTAWCGFLKRTAMDPNAPEDAADVAEVGLLAALEDVELWGKRLYKDAYQGDPNFRLERILIQYLTEVKGDTEAARSHWDRLSHHSLLANSYDFWLNYYLWEMVVYASKPKAPSPTPPTPSTGSKSTRVPTVATSVLQRALMEKTLDWPERIMEVYLQHCNDYEQPDTLHYALDTVHKTRRVVAKRREREKAAAAAATYATQTQIQTEAEQAQDQAAATSTQDTIAPGSPSSGKRKRDETAKDAGEAASKKAKSVEASVDDAASQEAQSKRDRENTSVMVTNLPPDVTQTALRRYFKEYGHINSLILRQENDNMSSSALIEFRSPEDADSALLRDQKYFNQSQLSVKPGTHLTVFVSNYPPTADEAYIRRLFAHCGEIFNIRWPSLKYNAHRRFCYISFRDASAAYKATLMDGTMIEDQYKLQSKFSNPSHKKDREGAVAEGRELRVKGVHPATRENDLRSVFGKYGKVITVRLLTNLSGQHVGTAFIVFETKEQAQKALELDKTKFKSQLLEVELSKETNFRPTATIRGDGSSRAPSLAPSGDGDVAMPDDPGDMHSEEQKPTPAEIQARTMAIMNIPDTVNDARIRALTEKFGSIVKIVLRPDHAGAIVEFGEASMVGRAALGLEGFEIAPHHKLRTGSVKELFKQRAEPQQKDTSKASKAAWMPPPPTVRRPVLGRGGAKRGGLGFVAAAKKDKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.3
3 0.32
4 0.34
5 0.35
6 0.38
7 0.38
8 0.37
9 0.37
10 0.42
11 0.46
12 0.44
13 0.42
14 0.4
15 0.39
16 0.37
17 0.32
18 0.24
19 0.18
20 0.18
21 0.19
22 0.19
23 0.18
24 0.17
25 0.16
26 0.14
27 0.13
28 0.13
29 0.14
30 0.14
31 0.14
32 0.12
33 0.12
34 0.12
35 0.13
36 0.18
37 0.18
38 0.18
39 0.22
40 0.24
41 0.22
42 0.22
43 0.24
44 0.21
45 0.21
46 0.23
47 0.23
48 0.22
49 0.25
50 0.28
51 0.26
52 0.26
53 0.29
54 0.27
55 0.28
56 0.3
57 0.31
58 0.31
59 0.31
60 0.3
61 0.29
62 0.31
63 0.27
64 0.27
65 0.25
66 0.26
67 0.27
68 0.29
69 0.3
70 0.29
71 0.32
72 0.33
73 0.35
74 0.33
75 0.33
76 0.32
77 0.3
78 0.29
79 0.28
80 0.27
81 0.23
82 0.21
83 0.19
84 0.15
85 0.14
86 0.13
87 0.11
88 0.09
89 0.08
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.11
95 0.13
96 0.14
97 0.15
98 0.19
99 0.19
100 0.21
101 0.24
102 0.25
103 0.28
104 0.31
105 0.37
106 0.38
107 0.38
108 0.35
109 0.35
110 0.31
111 0.27
112 0.24
113 0.17
114 0.13
115 0.16
116 0.18
117 0.17
118 0.19
119 0.18
120 0.18
121 0.18
122 0.19
123 0.18
124 0.19
125 0.24
126 0.29
127 0.38
128 0.44
129 0.44
130 0.47
131 0.54
132 0.56
133 0.57
134 0.58
135 0.54
136 0.51
137 0.57
138 0.56
139 0.5
140 0.49
141 0.45
142 0.38
143 0.41
144 0.39
145 0.34
146 0.31
147 0.3
148 0.3
149 0.26
150 0.26
151 0.18
152 0.17
153 0.15
154 0.15
155 0.16
156 0.13
157 0.12
158 0.15
159 0.15
160 0.15
161 0.16
162 0.16
163 0.13
164 0.14
165 0.17
166 0.18
167 0.19
168 0.2
169 0.19
170 0.18
171 0.23
172 0.24
173 0.22
174 0.19
175 0.19
176 0.2
177 0.23
178 0.26
179 0.22
180 0.25
181 0.31
182 0.32
183 0.35
184 0.34
185 0.34
186 0.35
187 0.37
188 0.32
189 0.28
190 0.26
191 0.23
192 0.27
193 0.27
194 0.25
195 0.22
196 0.22
197 0.22
198 0.24
199 0.26
200 0.26
201 0.26
202 0.27
203 0.3
204 0.34
205 0.37
206 0.39
207 0.41
208 0.41
209 0.4
210 0.4
211 0.44
212 0.45
213 0.42
214 0.38
215 0.35
216 0.29
217 0.27
218 0.25
219 0.18
220 0.12
221 0.08
222 0.07
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.04
227 0.04
228 0.08
229 0.09
230 0.12
231 0.14
232 0.2
233 0.25
234 0.35
235 0.45
236 0.53
237 0.6
238 0.68
239 0.74
240 0.79
241 0.8
242 0.77
243 0.73
244 0.68
245 0.6
246 0.53
247 0.45
248 0.36
249 0.33
250 0.26
251 0.19
252 0.13
253 0.13
254 0.09
255 0.08
256 0.07
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.06
269 0.08
270 0.08
271 0.09
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.09
276 0.09
277 0.08
278 0.09
279 0.1
280 0.12
281 0.2
282 0.24
283 0.28
284 0.3
285 0.32
286 0.35
287 0.43
288 0.44
289 0.4
290 0.37
291 0.39
292 0.41
293 0.42
294 0.45
295 0.36
296 0.33
297 0.32
298 0.3
299 0.24
300 0.22
301 0.2
302 0.14
303 0.12
304 0.12
305 0.15
306 0.18
307 0.2
308 0.26
309 0.31
310 0.36
311 0.37
312 0.37
313 0.35
314 0.38
315 0.44
316 0.43
317 0.39
318 0.36
319 0.35
320 0.34
321 0.32
322 0.28
323 0.2
324 0.15
325 0.13
326 0.1
327 0.11
328 0.11
329 0.11
330 0.1
331 0.1
332 0.1
333 0.09
334 0.12
335 0.11
336 0.11
337 0.14
338 0.16
339 0.16
340 0.16
341 0.16
342 0.15
343 0.17
344 0.21
345 0.18
346 0.18
347 0.19
348 0.18
349 0.2
350 0.18
351 0.18
352 0.14
353 0.13
354 0.11
355 0.09
356 0.09
357 0.06
358 0.06
359 0.04
360 0.04
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.06
366 0.07
367 0.1
368 0.12
369 0.12
370 0.15
371 0.2
372 0.22
373 0.24
374 0.25
375 0.25
376 0.24
377 0.23
378 0.2
379 0.15
380 0.13
381 0.1
382 0.09
383 0.06
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.03
388 0.03
389 0.02
390 0.02
391 0.02
392 0.02
393 0.02
394 0.02
395 0.02
396 0.03
397 0.03
398 0.05
399 0.06
400 0.08
401 0.09
402 0.13
403 0.15
404 0.17
405 0.24
406 0.27
407 0.3
408 0.34
409 0.37
410 0.37
411 0.37
412 0.37
413 0.3
414 0.26
415 0.23
416 0.17
417 0.18
418 0.18
419 0.17
420 0.15
421 0.14
422 0.15
423 0.16
424 0.17
425 0.14
426 0.1
427 0.08
428 0.08
429 0.09
430 0.08
431 0.09
432 0.08
433 0.09
434 0.14
435 0.15
436 0.17
437 0.18
438 0.2
439 0.2
440 0.27
441 0.33
442 0.29
443 0.29
444 0.29
445 0.27
446 0.26
447 0.26
448 0.19
449 0.12
450 0.12
451 0.11
452 0.09
453 0.1
454 0.1
455 0.09
456 0.08
457 0.1
458 0.09
459 0.08
460 0.08
461 0.07
462 0.06
463 0.08
464 0.08
465 0.08
466 0.08
467 0.1
468 0.11
469 0.12
470 0.17
471 0.17
472 0.24
473 0.31
474 0.39
475 0.42
476 0.43
477 0.45
478 0.43
479 0.44
480 0.4
481 0.38
482 0.33
483 0.31
484 0.33
485 0.31
486 0.31
487 0.29
488 0.26
489 0.2
490 0.21
491 0.18
492 0.16
493 0.16
494 0.14
495 0.13
496 0.13
497 0.12
498 0.1
499 0.09
500 0.1
501 0.09
502 0.08
503 0.11
504 0.16
505 0.17
506 0.15
507 0.15
508 0.14
509 0.14
510 0.15
511 0.12
512 0.08
513 0.09
514 0.11
515 0.13
516 0.13
517 0.13
518 0.12
519 0.13
520 0.14
521 0.15
522 0.13
523 0.11
524 0.11
525 0.12
526 0.13
527 0.13
528 0.11
529 0.08
530 0.07
531 0.07
532 0.1
533 0.11
534 0.12
535 0.15
536 0.17
537 0.18
538 0.22
539 0.3
540 0.35
541 0.43
542 0.51
543 0.58
544 0.65
545 0.72
546 0.73
547 0.68
548 0.63
549 0.57
550 0.52
551 0.42
552 0.34
553 0.27
554 0.21
555 0.18
556 0.15
557 0.11
558 0.07
559 0.06
560 0.06
561 0.06
562 0.06
563 0.07
564 0.07
565 0.07
566 0.09
567 0.09
568 0.09
569 0.09
570 0.09
571 0.07
572 0.07
573 0.07
574 0.06
575 0.05
576 0.05
577 0.04
578 0.05
579 0.05
580 0.05
581 0.06
582 0.06
583 0.06
584 0.08
585 0.08
586 0.07
587 0.08
588 0.12
589 0.15
590 0.24
591 0.3
592 0.33
593 0.36
594 0.41
595 0.44
596 0.49
597 0.53
598 0.49
599 0.5
600 0.46
601 0.43
602 0.39
603 0.35
604 0.3
605 0.24
606 0.21
607 0.19
608 0.17
609 0.17
610 0.18
611 0.19
612 0.17
613 0.19
614 0.21
615 0.18
616 0.21
617 0.21
618 0.19
619 0.18
620 0.16
621 0.14
622 0.09
623 0.07
624 0.09
625 0.11
626 0.13
627 0.17
628 0.2
629 0.22
630 0.31
631 0.33
632 0.31
633 0.35
634 0.35
635 0.34
636 0.33
637 0.31
638 0.24
639 0.22
640 0.2
641 0.15
642 0.13
643 0.1
644 0.09
645 0.09
646 0.09
647 0.12
648 0.13
649 0.19
650 0.25
651 0.27
652 0.28
653 0.33
654 0.36
655 0.33
656 0.38
657 0.35
658 0.33
659 0.37
660 0.36
661 0.31
662 0.28
663 0.3
664 0.25
665 0.22
666 0.19
667 0.14
668 0.17
669 0.18
670 0.17
671 0.16
672 0.14
673 0.14
674 0.13
675 0.13
676 0.11
677 0.1
678 0.08
679 0.07
680 0.08
681 0.08
682 0.11
683 0.11
684 0.1
685 0.1
686 0.1
687 0.1
688 0.1
689 0.11
690 0.1
691 0.13
692 0.13
693 0.14
694 0.15
695 0.18
696 0.23
697 0.23
698 0.23
699 0.24
700 0.26
701 0.29
702 0.3
703 0.31
704 0.27
705 0.25
706 0.25
707 0.22
708 0.22
709 0.17
710 0.15
711 0.13
712 0.17
713 0.18
714 0.17
715 0.19
716 0.18
717 0.18
718 0.17
719 0.16
720 0.13
721 0.14
722 0.13
723 0.12
724 0.15
725 0.21
726 0.22
727 0.21
728 0.21
729 0.2
730 0.21
731 0.2
732 0.24
733 0.18
734 0.18
735 0.19
736 0.21
737 0.21
738 0.26
739 0.25
740 0.19
741 0.21
742 0.21
743 0.24
744 0.29
745 0.35
746 0.36
747 0.46
748 0.55
749 0.59
750 0.59
751 0.59
752 0.57
753 0.52
754 0.56
755 0.47
756 0.44
757 0.4
758 0.4
759 0.37
760 0.32
761 0.31
762 0.24
763 0.22
764 0.16
765 0.15
766 0.13
767 0.12
768 0.12
769 0.1
770 0.08
771 0.07
772 0.09
773 0.1
774 0.1
775 0.1
776 0.1
777 0.1
778 0.13
779 0.2
780 0.18
781 0.19
782 0.23
783 0.26
784 0.34
785 0.42
786 0.49
787 0.47
788 0.54
789 0.63
790 0.64
791 0.65
792 0.64
793 0.61
794 0.58
795 0.57
796 0.52
797 0.48
798 0.44
799 0.41
800 0.36
801 0.31
802 0.26
803 0.22
804 0.19
805 0.15
806 0.15
807 0.21
808 0.26
809 0.28
810 0.28
811 0.35
812 0.37
813 0.42
814 0.44
815 0.39
816 0.37
817 0.35
818 0.35
819 0.3
820 0.3
821 0.24
822 0.25
823 0.24
824 0.2
825 0.22
826 0.22
827 0.23
828 0.2
829 0.22
830 0.23
831 0.22
832 0.23
833 0.21
834 0.19
835 0.21
836 0.21
837 0.2
838 0.16
839 0.16
840 0.15
841 0.14
842 0.15
843 0.12
844 0.11
845 0.09
846 0.07
847 0.08
848 0.07
849 0.07
850 0.11
851 0.12
852 0.15
853 0.16
854 0.18
855 0.18
856 0.2
857 0.22
858 0.23
859 0.25
860 0.25
861 0.28
862 0.35
863 0.39
864 0.4
865 0.41
866 0.36
867 0.38
868 0.37
869 0.42
870 0.38
871 0.38
872 0.35
873 0.36
874 0.36
875 0.31
876 0.28
877 0.23
878 0.19
879 0.21
880 0.22
881 0.19
882 0.22
883 0.23
884 0.3
885 0.31
886 0.35
887 0.29
888 0.3
889 0.3
890 0.28
891 0.29
892 0.25
893 0.23
894 0.2
895 0.19
896 0.17
897 0.19
898 0.19
899 0.17
900 0.14
901 0.16
902 0.15
903 0.15
904 0.14
905 0.11
906 0.11
907 0.1
908 0.09
909 0.06
910 0.06
911 0.06
912 0.07
913 0.1
914 0.09
915 0.11
916 0.17
917 0.2
918 0.22
919 0.24
920 0.27
921 0.26
922 0.27
923 0.28
924 0.27
925 0.29
926 0.3
927 0.32
928 0.31
929 0.3
930 0.28
931 0.26
932 0.22
933 0.18
934 0.17
935 0.13
936 0.13
937 0.12
938 0.12
939 0.14
940 0.15
941 0.17
942 0.17
943 0.17
944 0.15
945 0.16
946 0.19
947 0.2
948 0.21
949 0.22
950 0.23
951 0.24
952 0.24
953 0.24
954 0.22
955 0.19
956 0.2
957 0.18
958 0.2
959 0.2
960 0.22
961 0.24
962 0.26
963 0.26
964 0.25
965 0.23
966 0.2
967 0.18
968 0.18
969 0.15
970 0.12
971 0.1
972 0.08
973 0.08
974 0.06
975 0.07
976 0.05
977 0.05
978 0.05
979 0.05
980 0.05
981 0.05
982 0.06
983 0.05
984 0.04
985 0.05
986 0.06
987 0.06
988 0.06
989 0.07
990 0.09
991 0.13
992 0.15
993 0.16
994 0.19
995 0.21
996 0.26
997 0.36
998 0.4
999 0.44
1000 0.5
1001 0.55
1002 0.57
1003 0.65
1004 0.64
1005 0.57
1006 0.57
1007 0.56
1008 0.59
1009 0.62
1010 0.61
1011 0.6
1012 0.66
1013 0.66
1014 0.64
1015 0.65
1016 0.61
1017 0.57
1018 0.56
1019 0.5
1020 0.47
1021 0.49
1022 0.52
1023 0.54
1024 0.53
1025 0.51
1026 0.53
1027 0.6
1028 0.58
1029 0.6
1030 0.59
1031 0.55
1032 0.54
1033 0.57
1034 0.57
1035 0.58
1036 0.6
1037 0.61
1038 0.59
1039 0.62
1040 0.59
1041 0.54
1042 0.48
1043 0.4
1044 0.34
1045 0.27
1046 0.21
1047 0.15
1048 0.17
1049 0.21
1050 0.2