Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A439D578

Protein Details
Accession A0A439D578    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
129-149HLTHGYRKGRKKISKVSKYFEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
137-140GRKK
Subcellular Location(s) mito 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015424  PyrdxlP-dep_Trfase  
IPR015421  PyrdxlP-dep_Trfase_major  
IPR015422  PyrdxlP-dep_Trfase_small  
IPR001085  Ser_HO-MeTrfase  
IPR039429  SHMT-like_dom  
Gene Ontology GO:0004372  F:glycine hydroxymethyltransferase activity  
GO:0030170  F:pyridoxal phosphate binding  
GO:0019264  P:glycine biosynthetic process from serine  
GO:0035999  P:tetrahydrofolate interconversion  
Pfam View protein in Pfam  
PF00464  SHMT  
CDD cd00378  SHMT  
Amino Acid Sequences MSLFRTARRSASISTLGVFSGPERYLVDIKRFKSQYVQTKGLEAVDPTMFRLLRQEEYRQKSCLNLIASENVMSPAVLEALSSVVQKEWGVNVQSKTAMSGSNANLYVYSALLECHDRIMGLDLAHGGHLTHGYRKGRKKISKVSKYFETFPYYLDPKTGFIDYDGLEAAAEQYQPRIVVAGTSAYSRLIDYARIKQITSKVGAYLVSDISHISGLIAAGLVPSPFEHSDIITSSTAKLLQGPRGGIIFYRRGIKPTGTGSIENAIDASVFPGHQSSPHNNSIAALSVALQQALTPEFKQYQKQVLLNSKALAETLTSLGYSLSSGGTDTHLVLLDLRPHGIDGARLERVLELLGVASNRNVLYGDTSVKEPSGLRIGSPAMTARGLGSQDFVEVAKFIDRAVGVTKKLSVLAEEQAEGAGEEPTNLKHFLRFIEENDGHEMMLELRSEISDWVEQFTT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.31
3 0.26
4 0.22
5 0.2
6 0.14
7 0.14
8 0.14
9 0.14
10 0.14
11 0.18
12 0.24
13 0.27
14 0.36
15 0.38
16 0.4
17 0.48
18 0.48
19 0.46
20 0.49
21 0.54
22 0.55
23 0.57
24 0.61
25 0.52
26 0.54
27 0.54
28 0.47
29 0.39
30 0.29
31 0.24
32 0.2
33 0.2
34 0.18
35 0.21
36 0.19
37 0.18
38 0.24
39 0.24
40 0.28
41 0.32
42 0.4
43 0.45
44 0.54
45 0.58
46 0.54
47 0.52
48 0.48
49 0.47
50 0.44
51 0.36
52 0.3
53 0.29
54 0.29
55 0.28
56 0.26
57 0.23
58 0.18
59 0.15
60 0.12
61 0.1
62 0.07
63 0.07
64 0.06
65 0.05
66 0.05
67 0.06
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.08
73 0.08
74 0.09
75 0.1
76 0.13
77 0.15
78 0.2
79 0.21
80 0.22
81 0.23
82 0.22
83 0.22
84 0.19
85 0.17
86 0.14
87 0.18
88 0.18
89 0.21
90 0.21
91 0.2
92 0.19
93 0.18
94 0.17
95 0.11
96 0.11
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.09
106 0.12
107 0.12
108 0.1
109 0.11
110 0.1
111 0.1
112 0.1
113 0.1
114 0.06
115 0.05
116 0.07
117 0.08
118 0.11
119 0.17
120 0.23
121 0.31
122 0.4
123 0.49
124 0.57
125 0.64
126 0.69
127 0.74
128 0.79
129 0.82
130 0.8
131 0.77
132 0.75
133 0.71
134 0.66
135 0.59
136 0.54
137 0.44
138 0.38
139 0.37
140 0.31
141 0.27
142 0.26
143 0.23
144 0.17
145 0.19
146 0.18
147 0.13
148 0.12
149 0.14
150 0.12
151 0.12
152 0.11
153 0.09
154 0.08
155 0.08
156 0.07
157 0.06
158 0.06
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.1
178 0.13
179 0.18
180 0.23
181 0.24
182 0.24
183 0.26
184 0.29
185 0.28
186 0.27
187 0.22
188 0.17
189 0.18
190 0.18
191 0.15
192 0.12
193 0.1
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.05
200 0.04
201 0.04
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.02
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.09
218 0.11
219 0.09
220 0.1
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.11
226 0.11
227 0.14
228 0.15
229 0.15
230 0.15
231 0.15
232 0.15
233 0.12
234 0.14
235 0.13
236 0.12
237 0.17
238 0.17
239 0.18
240 0.2
241 0.2
242 0.2
243 0.2
244 0.23
245 0.2
246 0.2
247 0.19
248 0.2
249 0.19
250 0.16
251 0.14
252 0.09
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.05
260 0.05
261 0.08
262 0.12
263 0.16
264 0.22
265 0.25
266 0.26
267 0.25
268 0.25
269 0.23
270 0.21
271 0.15
272 0.09
273 0.07
274 0.09
275 0.09
276 0.08
277 0.08
278 0.07
279 0.07
280 0.09
281 0.09
282 0.07
283 0.09
284 0.13
285 0.15
286 0.19
287 0.22
288 0.28
289 0.31
290 0.34
291 0.37
292 0.42
293 0.45
294 0.42
295 0.4
296 0.33
297 0.28
298 0.26
299 0.2
300 0.12
301 0.09
302 0.08
303 0.07
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.05
310 0.04
311 0.04
312 0.05
313 0.05
314 0.06
315 0.07
316 0.07
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.09
322 0.12
323 0.12
324 0.12
325 0.11
326 0.11
327 0.12
328 0.11
329 0.12
330 0.11
331 0.15
332 0.16
333 0.15
334 0.16
335 0.15
336 0.15
337 0.13
338 0.1
339 0.06
340 0.05
341 0.06
342 0.06
343 0.07
344 0.06
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.08
350 0.1
351 0.12
352 0.14
353 0.14
354 0.15
355 0.16
356 0.15
357 0.16
358 0.14
359 0.15
360 0.19
361 0.17
362 0.16
363 0.18
364 0.19
365 0.19
366 0.19
367 0.17
368 0.13
369 0.13
370 0.13
371 0.11
372 0.13
373 0.13
374 0.12
375 0.12
376 0.11
377 0.11
378 0.11
379 0.11
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.11
387 0.11
388 0.12
389 0.17
390 0.2
391 0.19
392 0.21
393 0.23
394 0.21
395 0.23
396 0.21
397 0.18
398 0.17
399 0.2
400 0.2
401 0.19
402 0.18
403 0.16
404 0.16
405 0.14
406 0.11
407 0.08
408 0.06
409 0.07
410 0.08
411 0.1
412 0.13
413 0.15
414 0.15
415 0.16
416 0.19
417 0.21
418 0.27
419 0.28
420 0.29
421 0.37
422 0.38
423 0.38
424 0.41
425 0.39
426 0.3
427 0.28
428 0.25
429 0.16
430 0.16
431 0.14
432 0.09
433 0.09
434 0.1
435 0.11
436 0.11
437 0.13
438 0.15
439 0.15