Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A439CM43

Protein Details
Accession A0A439CM43    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
226-246AATGGKTKRERERKAKQVVEIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
87-109GSQRGGRGARERGGRGGRFPRDR
232-241TKRERERKAK
254-309ERPRGGRGGPRGGAGRGGARGDGRGRGEGRGRGGRGDXRGEGRGEGRSEARGGRPA
Subcellular Location(s) cyto 14, cyto_nucl 12, nucl 6, cysk 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSVASKNLFALLGNDEEDDQPSGPVKTVEKTLPRTTKRNVEPQAPIKPAGTTSTRRAGPGGNEGAFRDRNAGSNANQRKSTDEVPRGSQRGGRGARERGGRGGRFPRDRDDRHTKGLATGGSEKQAAQSWGAPEGGAEAKDEQAGEEIAQSELKEATAEDAEDVATPAEPEDKHVSYVDYLAQQAEKKLALGDNLELRKPNEGSKVDKKWASAKALNKEDDDDFIAATGGKTKRERERKAKQVVEIDQRYVEPERPRGGRGGPRGGAGRGGARGDGRGRGEGRGRGGRGDXRGEGRGEGRSEARGGRPAGRETASINTSDENAFPSLGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.15
3 0.15
4 0.16
5 0.16
6 0.14
7 0.13
8 0.14
9 0.14
10 0.14
11 0.16
12 0.17
13 0.18
14 0.22
15 0.27
16 0.33
17 0.39
18 0.48
19 0.55
20 0.59
21 0.64
22 0.66
23 0.7
24 0.69
25 0.73
26 0.68
27 0.66
28 0.68
29 0.69
30 0.71
31 0.64
32 0.58
33 0.48
34 0.44
35 0.38
36 0.33
37 0.31
38 0.27
39 0.29
40 0.35
41 0.35
42 0.35
43 0.35
44 0.34
45 0.32
46 0.35
47 0.34
48 0.28
49 0.28
50 0.28
51 0.32
52 0.29
53 0.26
54 0.23
55 0.18
56 0.2
57 0.23
58 0.25
59 0.23
60 0.32
61 0.4
62 0.4
63 0.42
64 0.39
65 0.39
66 0.41
67 0.44
68 0.43
69 0.42
70 0.41
71 0.45
72 0.51
73 0.49
74 0.46
75 0.42
76 0.35
77 0.38
78 0.38
79 0.37
80 0.37
81 0.39
82 0.43
83 0.45
84 0.44
85 0.41
86 0.44
87 0.39
88 0.4
89 0.44
90 0.47
91 0.48
92 0.49
93 0.51
94 0.53
95 0.56
96 0.58
97 0.6
98 0.56
99 0.56
100 0.56
101 0.48
102 0.41
103 0.4
104 0.32
105 0.25
106 0.25
107 0.2
108 0.19
109 0.19
110 0.17
111 0.15
112 0.17
113 0.14
114 0.11
115 0.12
116 0.12
117 0.13
118 0.13
119 0.11
120 0.09
121 0.1
122 0.1
123 0.08
124 0.08
125 0.07
126 0.07
127 0.08
128 0.08
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.05
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.05
142 0.04
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.04
152 0.04
153 0.03
154 0.03
155 0.06
156 0.06
157 0.09
158 0.13
159 0.13
160 0.14
161 0.15
162 0.15
163 0.13
164 0.14
165 0.12
166 0.09
167 0.09
168 0.08
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.1
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.09
177 0.08
178 0.09
179 0.1
180 0.14
181 0.15
182 0.16
183 0.16
184 0.16
185 0.19
186 0.19
187 0.2
188 0.22
189 0.23
190 0.3
191 0.37
192 0.42
193 0.44
194 0.44
195 0.43
196 0.43
197 0.45
198 0.44
199 0.41
200 0.42
201 0.46
202 0.51
203 0.51
204 0.45
205 0.43
206 0.37
207 0.33
208 0.28
209 0.19
210 0.13
211 0.11
212 0.11
213 0.08
214 0.08
215 0.13
216 0.12
217 0.17
218 0.2
219 0.26
220 0.36
221 0.46
222 0.56
223 0.6
224 0.69
225 0.75
226 0.82
227 0.8
228 0.76
229 0.73
230 0.71
231 0.71
232 0.62
233 0.54
234 0.45
235 0.4
236 0.38
237 0.32
238 0.3
239 0.25
240 0.28
241 0.32
242 0.33
243 0.35
244 0.35
245 0.39
246 0.41
247 0.43
248 0.46
249 0.4
250 0.41
251 0.42
252 0.39
253 0.35
254 0.28
255 0.23
256 0.18
257 0.17
258 0.16
259 0.14
260 0.16
261 0.17
262 0.2
263 0.2
264 0.23
265 0.24
266 0.27
267 0.31
268 0.32
269 0.37
270 0.39
271 0.38
272 0.39
273 0.41
274 0.43
275 0.41
276 0.44
277 0.41
278 0.38
279 0.4
280 0.36
281 0.36
282 0.34
283 0.32
284 0.28
285 0.26
286 0.25
287 0.24
288 0.26
289 0.26
290 0.28
291 0.3
292 0.33
293 0.36
294 0.37
295 0.4
296 0.38
297 0.36
298 0.32
299 0.36
300 0.31
301 0.27
302 0.26
303 0.22
304 0.22
305 0.22
306 0.2
307 0.16
308 0.16