FuNGI

A0A439D6C3

Protein Details

Accession

A0A439D6C3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
132-151	GVAPRAKMNQQRSRRFRSAQ	Hydrophilic
991-1011	QYNNGPPPKYQRHDQRGGRGY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 8.5, cyto_mito 8, nucl 7, cyto 6.5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGIPAAFRWLSTKYPKIISPVIEDKPIVMEDGSVIPVDTTRPNPNGEEFDNLYLDMNGIVHPCSHPEDKPAPKDEEEMMLEIFKYTDRVVNMVRPRKLLMIAIGKHPPPPNLYLSLTAMPQTPTNTLSPTDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAKEKQADKEELLKMIKQQNGGVLPPETLASLTKKAFDSNSITPGTPFMEILAISLRYWCAYKLNTDPGWANMKVIISDATVPGEGEHKIMNFVRSQRASPDHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLATHEPHFRVLREDVFFQEGKARTCKICGQKGHDAQSCRGEAKQKDGEFDEKDKPLQQKPFIWLHVSVLREYLAVELEVPGLPFRWDLERAIDDWVFMCFFVGNDFLPHLPALEIRENGIDTLTAIWRDNLTFMGGYMTKDGHVDLERAQYIFDGLGKQEDAIFRRRKEVEDRREASFKRRKLQEQQRNGQNPSHGTRGYGDAPENGLPGGLSKALTHDMIVKRGATASDANTANKSAAAVLKSQIQGLMSTPKNQDQPGSPELQTAPALAKRKASMMEADGTSTPGSESVKSDAAKSDELEDSVRLWEDGYADRYYEQKFHVDTKDIDFRRKVAWAYTEGLAWVLRYYFQGCPSWEWFYPYHYAPFAQDFKDIATLEIKFEKGRIARPFEQLMSVQPAASRHVLPDVFHSLMTESESPIIDFYPEDFVVDLNGKKMAWQGVALLPFIEMPRLLAAIEEKYPLLTAEDAARNEPGRECLLLSEENQELYDDIIAQFYSKKQGAPKCKLDPRKSQGLSGKIEKMPEYLPHATLEYPLERKGMPDIDDDRSLTVHYDMPSSSHTHKSMLLRGVKLPVPALNNSDIEELKGKTRSSGRSYRGAPLGRQYNDGRRERMNYGPDSRRDGNNRHPSQYNNGGRRNGPNAFSGTPPMVPPGWAPPPPGFPGFGSGIPPPPPGYHGGGRGGHGNNRNDGYGNYGSQAYNQRHGPPGVPPYQDYGGQYNNGPPPKYQRHDQRGGRGYGYR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.46
3	0.49
4	0.51
5	0.47
6	0.47
7	0.48
8	0.46
9	0.45
10	0.42
11	0.36
12	0.34
13	0.31
14	0.24
15	0.16
16	0.13
17	0.11
18	0.13
19	0.13
20	0.1
21	0.1
22	0.09
23	0.09
24	0.12
25	0.14
26	0.17
27	0.23
28	0.26
29	0.29
30	0.32
31	0.36
32	0.39
33	0.37
34	0.39
35	0.34
36	0.35
37	0.33
38	0.3
39	0.26
40	0.21
41	0.19
42	0.13
43	0.1
44	0.08
45	0.09
46	0.09
47	0.09
48	0.1
49	0.13
50	0.18
51	0.21
52	0.22
53	0.29
54	0.38
55	0.45
56	0.52
57	0.55
58	0.55
59	0.53
60	0.55
61	0.49
62	0.46
63	0.39
64	0.33
65	0.28
66	0.23
67	0.21
68	0.18
69	0.16
70	0.11
71	0.1
72	0.1
73	0.13
74	0.13
75	0.17
76	0.2
77	0.28
78	0.37
79	0.44
80	0.46
81	0.45
82	0.46
83	0.45
84	0.44
85	0.38
86	0.35
87	0.35
88	0.34
89	0.38
90	0.41
91	0.39
92	0.43
93	0.44
94	0.4
95	0.35
96	0.36
97	0.35
98	0.34
99	0.36
100	0.33
101	0.33
102	0.32
103	0.29
104	0.26
105	0.24
106	0.2
107	0.19
108	0.19
109	0.17
110	0.18
111	0.19
112	0.2
113	0.19
114	0.2
115	0.19
116	0.18
117	0.21
118	0.21
119	0.22
120	0.24
121	0.25
122	0.25
123	0.29
124	0.35
125	0.38
126	0.46
127	0.53
128	0.6
129	0.69
130	0.75
131	0.79
132	0.81
133	0.78
134	0.75
135	0.76
136	0.76
137	0.74
138	0.76
139	0.72
140	0.68
141	0.72
142	0.67
143	0.58
144	0.56
145	0.49
146	0.41
147	0.44
148	0.42
149	0.39
150	0.39
151	0.38
152	0.37
153	0.41
154	0.41
155	0.34
156	0.33
157	0.33
158	0.33
159	0.32
160	0.28
161	0.22
162	0.19
163	0.18
164	0.17
165	0.12
166	0.1
167	0.12
168	0.13
169	0.16
170	0.17
171	0.19
172	0.2
173	0.22
174	0.22
175	0.24
176	0.28
177	0.27
178	0.31
179	0.3
180	0.29
181	0.27
182	0.28
183	0.25
184	0.19
185	0.15
186	0.11
187	0.1
188	0.09
189	0.1
190	0.11
191	0.1
192	0.09
193	0.1
194	0.1
195	0.1
196	0.11
197	0.11
198	0.12
199	0.13
200	0.18
201	0.23
202	0.3
203	0.3
204	0.32
205	0.32
206	0.31
207	0.36
208	0.31
209	0.27
210	0.2
211	0.2
212	0.18
213	0.17
214	0.14
215	0.09
216	0.1
217	0.1
218	0.09
219	0.09
220	0.09
221	0.09
222	0.1
223	0.09
224	0.09
225	0.1
226	0.09
227	0.12
228	0.14
229	0.15
230	0.17
231	0.2
232	0.27
233	0.28
234	0.29
235	0.31
236	0.35
237	0.4
238	0.43
239	0.49
240	0.47
241	0.51
242	0.53
243	0.51
244	0.54
245	0.47
246	0.41
247	0.32
248	0.26
249	0.22
250	0.22
251	0.18
252	0.11
253	0.1
254	0.09
255	0.09
256	0.07
257	0.06
258	0.03
259	0.02
260	0.02
261	0.03
262	0.04
263	0.05
264	0.06
265	0.07
266	0.11
267	0.12
268	0.13
269	0.17
270	0.19
271	0.23
272	0.24
273	0.25
274	0.23
275	0.25
276	0.25
277	0.21
278	0.25
279	0.23
280	0.23
281	0.25
282	0.26
283	0.23
284	0.26
285	0.33
286	0.34
287	0.4
288	0.42
289	0.46
290	0.54
291	0.59
292	0.64
293	0.61
294	0.56
295	0.51
296	0.51
297	0.45
298	0.37
299	0.33
300	0.32
301	0.29
302	0.34
303	0.39
304	0.34
305	0.35
306	0.37
307	0.4
308	0.36
309	0.39
310	0.37
311	0.31
312	0.32
313	0.34
314	0.36
315	0.38
316	0.41
317	0.41
318	0.39
319	0.43
320	0.46
321	0.43
322	0.41
323	0.34
324	0.31
325	0.31
326	0.28
327	0.22
328	0.18
329	0.16
330	0.14
331	0.13
332	0.1
333	0.07
334	0.06
335	0.06
336	0.05
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.06
341	0.06
342	0.06
343	0.06
344	0.07
345	0.09
346	0.1
347	0.11
348	0.14
349	0.15
350	0.16
351	0.19
352	0.17
353	0.14
354	0.13
355	0.13
356	0.1
357	0.08
358	0.08
359	0.05
360	0.05
361	0.05
362	0.06
363	0.05
364	0.06
365	0.07
366	0.07
367	0.07
368	0.07
369	0.07
370	0.06
371	0.07
372	0.1
373	0.12
374	0.12
375	0.12
376	0.13
377	0.13
378	0.13
379	0.12
380	0.08
381	0.05
382	0.07
383	0.07
384	0.07
385	0.07
386	0.07
387	0.08
388	0.08
389	0.08
390	0.07
391	0.07
392	0.06
393	0.06
394	0.08
395	0.08
396	0.08
397	0.09
398	0.09
399	0.08
400	0.08
401	0.08
402	0.08
403	0.08
404	0.09
405	0.09
406	0.12
407	0.13
408	0.13
409	0.12
410	0.1
411	0.1
412	0.09
413	0.08
414	0.06
415	0.05
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.08
420	0.1
421	0.11
422	0.19
423	0.24
424	0.24
425	0.3
426	0.31
427	0.33
428	0.41
429	0.49
430	0.51
431	0.55
432	0.57
433	0.55
434	0.59
435	0.57
436	0.57
437	0.55
438	0.5
439	0.48
440	0.52
441	0.54
442	0.59
443	0.69
444	0.69
445	0.71
446	0.75
447	0.76
448	0.75
449	0.71
450	0.62
451	0.54
452	0.47
453	0.4
454	0.35
455	0.26
456	0.21
457	0.2
458	0.21
459	0.2
460	0.18
461	0.16
462	0.12
463	0.14
464	0.13
465	0.12
466	0.09
467	0.07
468	0.06
469	0.06
470	0.06
471	0.05
472	0.04
473	0.04
474	0.06
475	0.07
476	0.07
477	0.07
478	0.13
479	0.13
480	0.15
481	0.15
482	0.14
483	0.13
484	0.14
485	0.13
486	0.09
487	0.09
488	0.08
489	0.13
490	0.14
491	0.14
492	0.15
493	0.15
494	0.13
495	0.12
496	0.11
497	0.06
498	0.07
499	0.07
500	0.08
501	0.08
502	0.12
503	0.12
504	0.12
505	0.12
506	0.1
507	0.1
508	0.1
509	0.16
510	0.13
511	0.16
512	0.18
513	0.2
514	0.22
515	0.22
516	0.23
517	0.18
518	0.23
519	0.22
520	0.24
521	0.21
522	0.21
523	0.21
524	0.21
525	0.18
526	0.13
527	0.12
528	0.12
529	0.15
530	0.14
531	0.16
532	0.15
533	0.16
534	0.17
535	0.17
536	0.15
537	0.13
538	0.15
539	0.14
540	0.14
541	0.13
542	0.12
543	0.11
544	0.09
545	0.08
546	0.06
547	0.07
548	0.07
549	0.08
550	0.09
551	0.13
552	0.13
553	0.14
554	0.15
555	0.16
556	0.16
557	0.15
558	0.16
559	0.13
560	0.13
561	0.13
562	0.11
563	0.1
564	0.1
565	0.1
566	0.07
567	0.06
568	0.06
569	0.07
570	0.08
571	0.11
572	0.1
573	0.1
574	0.11
575	0.14
576	0.14
577	0.15
578	0.14
579	0.15
580	0.16
581	0.2
582	0.21
583	0.22
584	0.23
585	0.25
586	0.33
587	0.31
588	0.34
589	0.31
590	0.3
591	0.28
592	0.29
593	0.25
594	0.19
595	0.21
596	0.19
597	0.21
598	0.2
599	0.18
600	0.16
601	0.16
602	0.13
603	0.1
604	0.08
605	0.05
606	0.05
607	0.06
608	0.08
609	0.09
610	0.12
611	0.15
612	0.15
613	0.19
614	0.21
615	0.25
616	0.22
617	0.25
618	0.23
619	0.23
620	0.25
621	0.22
622	0.21
623	0.18
624	0.18
625	0.16
626	0.2
627	0.2
628	0.18
629	0.18
630	0.16
631	0.16
632	0.19
633	0.18
634	0.14
635	0.14
636	0.13
637	0.13
638	0.15
639	0.15
640	0.11
641	0.12
642	0.15
643	0.15
644	0.21
645	0.25
646	0.32
647	0.35
648	0.39
649	0.41
650	0.36
651	0.36
652	0.3
653	0.26
654	0.24
655	0.2
656	0.17
657	0.15
658	0.16
659	0.17
660	0.18
661	0.16
662	0.11
663	0.15
664	0.15
665	0.15
666	0.18
667	0.2
668	0.18
669	0.18
670	0.18
671	0.14
672	0.14
673	0.16
674	0.13
675	0.09
676	0.1
677	0.1
678	0.1
679	0.09
680	0.09
681	0.07
682	0.07
683	0.07
684	0.1
685	0.1
686	0.1
687	0.09
688	0.09
689	0.1
690	0.13
691	0.12
692	0.09
693	0.1
694	0.09
695	0.1
696	0.13
697	0.13
698	0.11
699	0.11
700	0.12
701	0.14
702	0.16
703	0.15
704	0.13
705	0.11
706	0.11
707	0.11
708	0.09
709	0.06
710	0.05
711	0.06
712	0.06
713	0.06
714	0.06
715	0.07
716	0.09
717	0.1
718	0.1
719	0.09
720	0.09
721	0.09
722	0.09
723	0.09
724	0.07
725	0.07
726	0.11
727	0.15
728	0.16
729	0.17
730	0.19
731	0.18
732	0.19
733	0.19
734	0.17
735	0.15
736	0.15
737	0.14
738	0.13
739	0.15
740	0.15
741	0.15
742	0.17
743	0.15
744	0.15
745	0.15
746	0.14
747	0.11
748	0.11
749	0.1
750	0.07
751	0.06
752	0.06
753	0.06
754	0.06
755	0.08
756	0.08
757	0.14
758	0.14
759	0.17
760	0.24
761	0.32
762	0.42
763	0.49
764	0.57
765	0.61
766	0.69
767	0.77
768	0.77
769	0.8
770	0.76
771	0.78
772	0.71
773	0.69
774	0.66
775	0.63
776	0.61
777	0.55
778	0.55
779	0.46
780	0.46
781	0.4
782	0.35
783	0.3
784	0.27
785	0.29
786	0.25
787	0.24
788	0.24
789	0.24
790	0.22
791	0.22
792	0.22
793	0.19
794	0.19
795	0.19
796	0.19
797	0.18
798	0.19
799	0.21
800	0.22
801	0.19
802	0.23
803	0.26
804	0.28
805	0.3
806	0.3
807	0.26
808	0.23
809	0.22
810	0.17
811	0.15
812	0.15
813	0.13
814	0.14
815	0.14
816	0.15
817	0.17
818	0.2
819	0.23
820	0.25
821	0.25
822	0.26
823	0.31
824	0.33
825	0.38
826	0.41
827	0.42
828	0.39
829	0.4
830	0.43
831	0.4
832	0.36
833	0.31
834	0.27
835	0.25
836	0.25
837	0.26
838	0.24
839	0.23
840	0.23
841	0.24
842	0.21
843	0.2
844	0.21
845	0.19
846	0.2
847	0.24
848	0.22
849	0.25
850	0.32
851	0.37
852	0.41
853	0.49
854	0.5
855	0.54
856	0.57
857	0.58
858	0.59
859	0.55
860	0.5
861	0.49
862	0.53
863	0.46
864	0.49
865	0.47
866	0.49
867	0.55
868	0.58
869	0.53
870	0.49
871	0.53
872	0.52
873	0.54
874	0.52
875	0.49
876	0.52
877	0.56
878	0.56
879	0.58
880	0.58
881	0.59
882	0.59
883	0.6
884	0.62
885	0.65
886	0.66
887	0.63
888	0.63
889	0.59
890	0.6
891	0.64
892	0.62
893	0.6
894	0.62
895	0.61
896	0.61
897	0.63
898	0.62
899	0.55
900	0.48
901	0.42
902	0.41
903	0.38
904	0.35
905	0.33
906	0.28
907	0.25
908	0.24
909	0.23
910	0.19
911	0.18
912	0.18
913	0.21
914	0.26
915	0.26
916	0.3
917	0.29
918	0.34
919	0.37
920	0.37
921	0.31
922	0.26
923	0.29
924	0.28
925	0.26
926	0.24
927	0.22
928	0.25
929	0.25
930	0.26
931	0.23
932	0.21
933	0.23
934	0.24
935	0.28
936	0.28
937	0.3
938	0.35
939	0.35
940	0.35
941	0.39
942	0.38
943	0.39
944	0.42
945	0.42
946	0.41
947	0.41
948	0.41
949	0.36
950	0.33
951	0.33
952	0.28
953	0.26
954	0.22
955	0.22
956	0.21
957	0.25
958	0.34
959	0.31
960	0.34
961	0.37
962	0.39
963	0.42
964	0.44
965	0.41
966	0.39
967	0.43
968	0.44
969	0.43
970	0.4
971	0.41
972	0.41
973	0.42
974	0.38
975	0.35
976	0.31
977	0.31
978	0.31
979	0.32
980	0.37
981	0.39
982	0.38
983	0.36
984	0.43
985	0.51
986	0.56
987	0.59
988	0.63
989	0.67
990	0.76
991	0.81
992	0.82
993	0.8
994	0.78

A0A439D6C3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer