Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A439D7U8

Protein Details
Accession A0A439D7U8    Localization Confidence High Confidence Score 25.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MAKDKKDKKSKKASKQQSDAVATPHydrophilic
53-76DEAHREFRKHRATKAWKGHRAEKLBasic
418-446LIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYKGGPLDVHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-13KKDKKSKKA
60-72RKHRATKAWKGHR
424-437KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAKDKKDKKSKKASKQQSDAVATPSASPASPAQKPPAQLMDLVESFLSEQGFDEAHREFRKHRATKAWKGHRAEKLGDKESHSLVGIFQAWETLPTATTPATKKSKSDGRSSSSLSSGPATNTPSSDESSDEESSDDDDVAMADAPAAESSSESSSSDSSSSSESDSESDSESDDGNGGAAMAGSSNSIITPTTKSLKRKAQSDSESSSSESDSDEDMTSSNSKKEEKPQSKKIKTQDSSDESSSSDSSSESDSDSDSDSEDENAKPKKTEKVQSDSDSSSSSDSDDSSSSSESESDSEKEVKIAAKVPLPASDSDSSSESESESKKGKQNTNIVGEAAASAASDSSATLEKASPEYAPLPPDPATFKTNNRGKNGPALKKSQNQPFSRISKDVQVDPRLSSNAYVSHGYGEQAHRDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYKGGPLDVHTSRSFKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.93
2 0.92
3 0.88
4 0.86
5 0.81
6 0.71
7 0.64
8 0.55
9 0.44
10 0.37
11 0.31
12 0.23
13 0.17
14 0.17
15 0.18
16 0.22
17 0.27
18 0.3
19 0.35
20 0.38
21 0.4
22 0.42
23 0.43
24 0.38
25 0.34
26 0.33
27 0.32
28 0.29
29 0.27
30 0.22
31 0.17
32 0.16
33 0.16
34 0.13
35 0.07
36 0.07
37 0.08
38 0.09
39 0.09
40 0.11
41 0.11
42 0.18
43 0.21
44 0.23
45 0.25
46 0.34
47 0.45
48 0.48
49 0.53
50 0.57
51 0.64
52 0.72
53 0.8
54 0.81
55 0.79
56 0.81
57 0.83
58 0.8
59 0.75
60 0.7
61 0.68
62 0.65
63 0.63
64 0.6
65 0.55
66 0.5
67 0.46
68 0.42
69 0.33
70 0.25
71 0.18
72 0.18
73 0.15
74 0.12
75 0.11
76 0.1
77 0.1
78 0.1
79 0.11
80 0.09
81 0.08
82 0.08
83 0.1
84 0.09
85 0.14
86 0.15
87 0.22
88 0.29
89 0.3
90 0.32
91 0.39
92 0.46
93 0.46
94 0.53
95 0.52
96 0.51
97 0.54
98 0.55
99 0.5
100 0.43
101 0.39
102 0.31
103 0.26
104 0.21
105 0.18
106 0.17
107 0.18
108 0.17
109 0.17
110 0.19
111 0.19
112 0.2
113 0.19
114 0.18
115 0.17
116 0.21
117 0.21
118 0.18
119 0.16
120 0.15
121 0.15
122 0.14
123 0.12
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.03
136 0.03
137 0.05
138 0.06
139 0.07
140 0.07
141 0.09
142 0.09
143 0.1
144 0.1
145 0.09
146 0.09
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.1
152 0.1
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.09
160 0.09
161 0.08
162 0.07
163 0.05
164 0.05
165 0.04
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.02
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.04
177 0.05
178 0.07
179 0.1
180 0.15
181 0.2
182 0.24
183 0.31
184 0.4
185 0.43
186 0.46
187 0.49
188 0.52
189 0.52
190 0.53
191 0.49
192 0.43
193 0.4
194 0.35
195 0.31
196 0.22
197 0.18
198 0.14
199 0.11
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.1
209 0.11
210 0.13
211 0.15
212 0.24
213 0.34
214 0.43
215 0.5
216 0.59
217 0.69
218 0.72
219 0.77
220 0.75
221 0.75
222 0.67
223 0.63
224 0.61
225 0.54
226 0.52
227 0.47
228 0.4
229 0.3
230 0.29
231 0.24
232 0.16
233 0.11
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.09
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.1
249 0.1
250 0.14
251 0.17
252 0.17
253 0.18
254 0.2
255 0.27
256 0.32
257 0.4
258 0.41
259 0.45
260 0.5
261 0.52
262 0.53
263 0.47
264 0.41
265 0.34
266 0.28
267 0.22
268 0.16
269 0.14
270 0.1
271 0.09
272 0.1
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.1
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.08
281 0.09
282 0.1
283 0.1
284 0.12
285 0.14
286 0.14
287 0.14
288 0.15
289 0.15
290 0.14
291 0.17
292 0.17
293 0.18
294 0.2
295 0.2
296 0.21
297 0.22
298 0.21
299 0.22
300 0.21
301 0.2
302 0.19
303 0.2
304 0.18
305 0.17
306 0.17
307 0.13
308 0.15
309 0.15
310 0.17
311 0.2
312 0.23
313 0.28
314 0.36
315 0.41
316 0.45
317 0.53
318 0.56
319 0.58
320 0.54
321 0.49
322 0.41
323 0.35
324 0.27
325 0.18
326 0.11
327 0.05
328 0.04
329 0.04
330 0.03
331 0.03
332 0.03
333 0.05
334 0.06
335 0.07
336 0.08
337 0.09
338 0.1
339 0.12
340 0.13
341 0.11
342 0.12
343 0.15
344 0.15
345 0.18
346 0.17
347 0.19
348 0.19
349 0.21
350 0.22
351 0.23
352 0.27
353 0.28
354 0.32
355 0.39
356 0.44
357 0.49
358 0.51
359 0.51
360 0.47
361 0.54
362 0.59
363 0.58
364 0.57
365 0.58
366 0.59
367 0.64
368 0.7
369 0.7
370 0.69
371 0.64
372 0.65
373 0.66
374 0.64
375 0.61
376 0.57
377 0.49
378 0.48
379 0.49
380 0.5
381 0.49
382 0.49
383 0.45
384 0.44
385 0.45
386 0.39
387 0.36
388 0.29
389 0.24
390 0.21
391 0.22
392 0.22
393 0.19
394 0.19
395 0.19
396 0.19
397 0.21
398 0.21
399 0.21
400 0.21
401 0.21
402 0.19
403 0.19
404 0.2
405 0.2
406 0.26
407 0.24
408 0.24
409 0.3
410 0.33
411 0.39
412 0.43
413 0.48
414 0.51
415 0.6
416 0.69
417 0.75
418 0.82
419 0.84
420 0.9
421 0.91
422 0.9
423 0.9
424 0.89
425 0.89
426 0.89
427 0.86
428 0.76
429 0.68
430 0.66
431 0.57
432 0.53
433 0.45
434 0.38
435 0.33