Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A439D567

Protein Details
Accession A0A439D567    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MAEPPTKRRRLRDVDNETSERHydrophilic
23-50TPSSLSHPISPPRKKKNREGIRIASPFRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
34-40PRKKKNR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.5, cyto 7, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010347  Tdp1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06087  Tyr-DNA_phospho  
CDD cd09123  PLDc_Tdp1_2  
Amino Acid Sequences MAEPPTKRRRLRDVDNETSERATPSSLSHPISPPRKKKNREGIRIASPFRLTSIRDLSDAYNVGAVSLSDLVGDPLIAELWDFNYLHDVDFLMEHLDEDTRALTKVHIVHGFWKREDPNRLLLQEQANRHKNVTLHTAYMPEMFGTHHSKMLVLVRHDDMAQVIIHTANMIAKDWTNMTNGAWISPLLPKLESPPEVDGTRGAMGSGSRFKFDLLSYLRAYNTIRNVCGCLVEELAKYDFSAVRGALVASVPGKHDVDQETGTTRWGWQGLKETLRSVPAQAGTSDVVVQISSIATLGANDTWLQRTLFDSLSASRSPPQQLPSSARPRNSRPNFKIIFPTPDEIRRSLDGYSSGGSIHTKIQSAAQAKQLQYLRPLFHHWANDCANGVLASTSAPGDDVSCHKEAGRKRAAPHIKTYIRYGDKSIDWALLTSANISKQAWGEATNKAGEVRIASWEIGVLVWPELLTGDTEAKMVGTFKTDEPKIENDNGEKNSPLVGLRIPYDLPLQKYGNSEDPWVATMSYTEPDWLGRRWPGY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.84
3 0.79
4 0.7
5 0.63
6 0.53
7 0.44
8 0.34
9 0.26
10 0.18
11 0.19
12 0.23
13 0.27
14 0.29
15 0.31
16 0.36
17 0.44
18 0.54
19 0.61
20 0.64
21 0.7
22 0.78
23 0.82
24 0.87
25 0.89
26 0.89
27 0.89
28 0.89
29 0.85
30 0.85
31 0.85
32 0.77
33 0.7
34 0.61
35 0.51
36 0.44
37 0.39
38 0.31
39 0.3
40 0.34
41 0.31
42 0.3
43 0.31
44 0.3
45 0.3
46 0.3
47 0.23
48 0.18
49 0.16
50 0.15
51 0.13
52 0.12
53 0.09
54 0.08
55 0.08
56 0.06
57 0.06
58 0.07
59 0.06
60 0.06
61 0.05
62 0.04
63 0.05
64 0.04
65 0.04
66 0.04
67 0.05
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.12
72 0.13
73 0.13
74 0.13
75 0.12
76 0.1
77 0.1
78 0.1
79 0.08
80 0.08
81 0.07
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.08
91 0.13
92 0.15
93 0.2
94 0.22
95 0.22
96 0.3
97 0.38
98 0.42
99 0.38
100 0.42
101 0.41
102 0.46
103 0.52
104 0.47
105 0.47
106 0.48
107 0.48
108 0.43
109 0.43
110 0.42
111 0.41
112 0.45
113 0.46
114 0.47
115 0.47
116 0.48
117 0.46
118 0.41
119 0.38
120 0.39
121 0.32
122 0.28
123 0.27
124 0.28
125 0.25
126 0.25
127 0.21
128 0.13
129 0.11
130 0.09
131 0.12
132 0.16
133 0.16
134 0.17
135 0.17
136 0.18
137 0.19
138 0.24
139 0.24
140 0.2
141 0.22
142 0.22
143 0.22
144 0.22
145 0.2
146 0.15
147 0.12
148 0.11
149 0.07
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.08
161 0.1
162 0.1
163 0.11
164 0.11
165 0.1
166 0.14
167 0.13
168 0.13
169 0.12
170 0.11
171 0.1
172 0.12
173 0.13
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.14
178 0.18
179 0.18
180 0.19
181 0.2
182 0.21
183 0.21
184 0.21
185 0.18
186 0.15
187 0.14
188 0.12
189 0.09
190 0.07
191 0.07
192 0.09
193 0.15
194 0.14
195 0.14
196 0.14
197 0.15
198 0.15
199 0.15
200 0.2
201 0.17
202 0.2
203 0.21
204 0.22
205 0.22
206 0.22
207 0.23
208 0.19
209 0.22
210 0.2
211 0.2
212 0.19
213 0.2
214 0.19
215 0.19
216 0.16
217 0.11
218 0.1
219 0.11
220 0.1
221 0.11
222 0.11
223 0.1
224 0.09
225 0.1
226 0.09
227 0.08
228 0.1
229 0.08
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.06
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.1
243 0.12
244 0.13
245 0.13
246 0.13
247 0.14
248 0.13
249 0.13
250 0.12
251 0.1
252 0.09
253 0.11
254 0.1
255 0.1
256 0.16
257 0.19
258 0.21
259 0.21
260 0.22
261 0.2
262 0.22
263 0.21
264 0.15
265 0.14
266 0.12
267 0.12
268 0.11
269 0.12
270 0.1
271 0.1
272 0.09
273 0.07
274 0.06
275 0.05
276 0.05
277 0.04
278 0.03
279 0.03
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.04
285 0.03
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.06
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.09
294 0.11
295 0.11
296 0.11
297 0.11
298 0.11
299 0.14
300 0.14
301 0.13
302 0.13
303 0.16
304 0.18
305 0.19
306 0.21
307 0.22
308 0.25
309 0.3
310 0.37
311 0.44
312 0.45
313 0.48
314 0.5
315 0.53
316 0.6
317 0.63
318 0.65
319 0.6
320 0.66
321 0.62
322 0.59
323 0.6
324 0.52
325 0.48
326 0.4
327 0.39
328 0.31
329 0.35
330 0.36
331 0.3
332 0.3
333 0.26
334 0.25
335 0.22
336 0.21
337 0.17
338 0.15
339 0.15
340 0.12
341 0.1
342 0.1
343 0.1
344 0.1
345 0.12
346 0.12
347 0.12
348 0.12
349 0.13
350 0.18
351 0.21
352 0.22
353 0.26
354 0.3
355 0.3
356 0.36
357 0.36
358 0.32
359 0.35
360 0.36
361 0.31
362 0.28
363 0.33
364 0.3
365 0.32
366 0.36
367 0.31
368 0.34
369 0.34
370 0.33
371 0.29
372 0.25
373 0.21
374 0.16
375 0.15
376 0.08
377 0.06
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.04
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.07
386 0.1
387 0.14
388 0.15
389 0.15
390 0.16
391 0.21
392 0.26
393 0.34
394 0.41
395 0.41
396 0.42
397 0.53
398 0.61
399 0.59
400 0.61
401 0.61
402 0.57
403 0.55
404 0.56
405 0.55
406 0.51
407 0.49
408 0.45
409 0.39
410 0.35
411 0.36
412 0.33
413 0.26
414 0.21
415 0.2
416 0.18
417 0.14
418 0.14
419 0.12
420 0.13
421 0.12
422 0.13
423 0.13
424 0.14
425 0.14
426 0.15
427 0.14
428 0.16
429 0.17
430 0.19
431 0.21
432 0.2
433 0.19
434 0.18
435 0.18
436 0.15
437 0.14
438 0.13
439 0.13
440 0.14
441 0.14
442 0.13
443 0.13
444 0.12
445 0.1
446 0.1
447 0.07
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.06
455 0.07
456 0.09
457 0.09
458 0.1
459 0.1
460 0.09
461 0.1
462 0.1
463 0.09
464 0.1
465 0.12
466 0.15
467 0.23
468 0.24
469 0.26
470 0.29
471 0.34
472 0.36
473 0.39
474 0.41
475 0.37
476 0.44
477 0.45
478 0.43
479 0.38
480 0.33
481 0.29
482 0.26
483 0.22
484 0.16
485 0.16
486 0.16
487 0.17
488 0.19
489 0.18
490 0.18
491 0.24
492 0.27
493 0.28
494 0.32
495 0.32
496 0.33
497 0.36
498 0.39
499 0.4
500 0.37
501 0.36
502 0.32
503 0.32
504 0.3
505 0.28
506 0.23
507 0.16
508 0.15
509 0.14
510 0.14
511 0.13
512 0.13
513 0.12
514 0.15
515 0.19
516 0.2
517 0.23