Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A439D8W1

Protein Details
Accession A0A439D8W1    Localization Confidence High Confidence Score 23.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-57VSSKSSKSRDPTSGKKRHRESNHIEKSERKHKRSKSDAVPTPNPAHydrophilic
61-86ADGGDSTPKRKRKGHKSSKAKDSHVDBasic
104-142DGDNGEKPSKRKRKEKKEKEREKKKPKKSRESQNQVLDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-47KSRDPTSGKKRHRESNHIEKSERKHKRSK
68-81PKRKRKGHKSSKAK
110-133KPSKRKRKEKKEKEREKKKPKKSR
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MADVATAMLPNPVSSKSSKSRDPTSGKKRHRESNHIEKSERKHKRSKSDAVPTPNPAIEAADGGDSTPKRKRKGHKSSKAKDSHVDEGQPQDQATIPSDAHEKDGDNGEKPSKRKRKEKKEKEREKKKPKKSRESQNQVLDDNNDSENHDDNDDYSTAHEGVVTVSQYLPLHPLGLNEPLHGYANQHLEPLLNRYVPSFGGVLLAYRNPRIGEAPGKGSLTEHSGMEDMAVLESVNEAAVSFGWLTVEIDIFRPSRGAWLEGLVNIQSGGHIGVVCWGKFNASIESERLPRDWQWIDQHSSQSNGEAEPESTSSPSPLAQGDTEVGHTEVHATGYWVDGQGSKITAETPICFRIKNYEVGSSGDYGYLSIEGTMLTEEEEQEKARKEREVQQRKLSRGIVPHRERRSMLELGMTKFSNDEGREAEGQRTES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.24
3 0.32
4 0.39
5 0.46
6 0.51
7 0.56
8 0.63
9 0.69
10 0.73
11 0.74
12 0.79
13 0.81
14 0.84
15 0.85
16 0.85
17 0.86
18 0.86
19 0.84
20 0.85
21 0.86
22 0.81
23 0.77
24 0.74
25 0.74
26 0.74
27 0.75
28 0.71
29 0.7
30 0.73
31 0.81
32 0.83
33 0.84
34 0.83
35 0.84
36 0.84
37 0.84
38 0.8
39 0.74
40 0.68
41 0.58
42 0.48
43 0.38
44 0.31
45 0.22
46 0.18
47 0.14
48 0.1
49 0.09
50 0.09
51 0.14
52 0.13
53 0.17
54 0.24
55 0.3
56 0.37
57 0.46
58 0.56
59 0.62
60 0.74
61 0.8
62 0.83
63 0.88
64 0.91
65 0.93
66 0.9
67 0.83
68 0.79
69 0.73
70 0.7
71 0.62
72 0.55
73 0.46
74 0.44
75 0.41
76 0.34
77 0.28
78 0.22
79 0.19
80 0.18
81 0.18
82 0.15
83 0.14
84 0.14
85 0.17
86 0.17
87 0.18
88 0.17
89 0.16
90 0.16
91 0.23
92 0.23
93 0.22
94 0.24
95 0.29
96 0.33
97 0.37
98 0.45
99 0.48
100 0.56
101 0.65
102 0.73
103 0.78
104 0.84
105 0.92
106 0.92
107 0.94
108 0.96
109 0.97
110 0.97
111 0.97
112 0.97
113 0.96
114 0.95
115 0.95
116 0.94
117 0.94
118 0.93
119 0.93
120 0.93
121 0.92
122 0.89
123 0.87
124 0.79
125 0.69
126 0.6
127 0.5
128 0.41
129 0.33
130 0.25
131 0.17
132 0.14
133 0.15
134 0.15
135 0.14
136 0.13
137 0.11
138 0.11
139 0.13
140 0.12
141 0.11
142 0.09
143 0.1
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.06
148 0.07
149 0.08
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.09
157 0.08
158 0.09
159 0.09
160 0.1
161 0.1
162 0.14
163 0.14
164 0.13
165 0.13
166 0.13
167 0.14
168 0.13
169 0.12
170 0.11
171 0.15
172 0.15
173 0.14
174 0.13
175 0.13
176 0.14
177 0.16
178 0.14
179 0.12
180 0.11
181 0.12
182 0.13
183 0.12
184 0.13
185 0.09
186 0.07
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.08
196 0.09
197 0.09
198 0.11
199 0.13
200 0.14
201 0.16
202 0.17
203 0.17
204 0.16
205 0.16
206 0.14
207 0.13
208 0.12
209 0.1
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.08
214 0.08
215 0.05
216 0.04
217 0.04
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.02
224 0.02
225 0.02
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.11
243 0.12
244 0.12
245 0.11
246 0.12
247 0.12
248 0.12
249 0.13
250 0.09
251 0.08
252 0.07
253 0.06
254 0.05
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.09
261 0.11
262 0.1
263 0.11
264 0.11
265 0.11
266 0.12
267 0.14
268 0.12
269 0.12
270 0.14
271 0.15
272 0.18
273 0.2
274 0.2
275 0.19
276 0.19
277 0.18
278 0.23
279 0.23
280 0.24
281 0.29
282 0.33
283 0.37
284 0.37
285 0.4
286 0.35
287 0.36
288 0.32
289 0.27
290 0.23
291 0.18
292 0.17
293 0.14
294 0.13
295 0.12
296 0.12
297 0.11
298 0.11
299 0.11
300 0.1
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.1
305 0.11
306 0.1
307 0.11
308 0.12
309 0.12
310 0.12
311 0.11
312 0.11
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.08
317 0.09
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.09
322 0.09
323 0.08
324 0.08
325 0.09
326 0.1
327 0.1
328 0.11
329 0.1
330 0.1
331 0.1
332 0.13
333 0.13
334 0.13
335 0.16
336 0.21
337 0.22
338 0.22
339 0.22
340 0.27
341 0.29
342 0.34
343 0.33
344 0.32
345 0.33
346 0.35
347 0.36
348 0.29
349 0.27
350 0.2
351 0.17
352 0.13
353 0.12
354 0.09
355 0.08
356 0.06
357 0.06
358 0.05
359 0.05
360 0.06
361 0.05
362 0.06
363 0.07
364 0.08
365 0.1
366 0.11
367 0.12
368 0.16
369 0.23
370 0.25
371 0.28
372 0.32
373 0.36
374 0.45
375 0.55
376 0.61
377 0.63
378 0.7
379 0.75
380 0.74
381 0.75
382 0.69
383 0.63
384 0.61
385 0.63
386 0.64
387 0.65
388 0.7
389 0.7
390 0.72
391 0.69
392 0.66
393 0.62
394 0.55
395 0.46
396 0.45
397 0.43
398 0.4
399 0.43
400 0.37
401 0.31
402 0.28
403 0.28
404 0.27
405 0.23
406 0.23
407 0.2
408 0.25
409 0.3
410 0.31
411 0.34