Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A439CXH9

Protein Details
Accession A0A439CXH9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-67QYDSSGRRSNTRHQRHHQRLEDERHSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
139-151KGSVKEGRRRGRG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 15, cyto 12, nucl 10, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045071  BBP-like  
IPR004087  KH_dom  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR032570  SF1-HH  
IPR047086  SF1-HH_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0045131  F:pre-mRNA branch point binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF16275  SF1-HH  
Amino Acid Sequences MTSEQIEAYALHVRIEEITQKLRLDDVVPANQNRRSPSPEPQYDSSGRRSNTRHQRHHQRLEDERHSLIRTAMGTIPGYRPPPDYIPRHASGSMIIDKVYIPTKEFPGINFIGQLLGPRGRSLAEMNTQSGANIVIRGKGSVKEGRRRGRGVAVGRRDTGGSQDREPLHCLITADTHEKIKKAKALLQDTIEVIVTSPDHSNHRKSQQLRDLAVINGTFRDDENRGERHRDAWKREIGASIKCNTCGGGHVSRDCADRNIIPPWRQSKKPGPPADQLEIEYRQLLAEI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.18
3 0.2
4 0.18
5 0.22
6 0.25
7 0.25
8 0.25
9 0.25
10 0.24
11 0.2
12 0.23
13 0.25
14 0.28
15 0.33
16 0.36
17 0.41
18 0.43
19 0.45
20 0.44
21 0.43
22 0.44
23 0.44
24 0.5
25 0.55
26 0.58
27 0.61
28 0.59
29 0.61
30 0.59
31 0.58
32 0.55
33 0.52
34 0.46
35 0.46
36 0.48
37 0.52
38 0.57
39 0.64
40 0.67
41 0.7
42 0.81
43 0.85
44 0.9
45 0.88
46 0.85
47 0.84
48 0.83
49 0.78
50 0.7
51 0.61
52 0.54
53 0.47
54 0.39
55 0.31
56 0.24
57 0.18
58 0.17
59 0.16
60 0.15
61 0.15
62 0.15
63 0.17
64 0.18
65 0.19
66 0.18
67 0.19
68 0.2
69 0.25
70 0.31
71 0.33
72 0.37
73 0.41
74 0.42
75 0.42
76 0.4
77 0.34
78 0.28
79 0.28
80 0.24
81 0.17
82 0.15
83 0.13
84 0.12
85 0.14
86 0.16
87 0.12
88 0.12
89 0.13
90 0.15
91 0.18
92 0.18
93 0.17
94 0.2
95 0.2
96 0.18
97 0.16
98 0.14
99 0.12
100 0.11
101 0.12
102 0.08
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.1
109 0.11
110 0.11
111 0.14
112 0.15
113 0.15
114 0.16
115 0.15
116 0.14
117 0.13
118 0.11
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.09
127 0.13
128 0.17
129 0.22
130 0.29
131 0.37
132 0.44
133 0.47
134 0.48
135 0.46
136 0.44
137 0.45
138 0.43
139 0.43
140 0.42
141 0.39
142 0.38
143 0.37
144 0.32
145 0.27
146 0.25
147 0.23
148 0.2
149 0.19
150 0.24
151 0.25
152 0.26
153 0.28
154 0.24
155 0.19
156 0.18
157 0.17
158 0.12
159 0.13
160 0.13
161 0.14
162 0.14
163 0.17
164 0.17
165 0.18
166 0.2
167 0.22
168 0.24
169 0.23
170 0.27
171 0.32
172 0.36
173 0.38
174 0.37
175 0.35
176 0.32
177 0.3
178 0.25
179 0.16
180 0.11
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.09
186 0.14
187 0.18
188 0.24
189 0.3
190 0.36
191 0.42
192 0.45
193 0.53
194 0.56
195 0.6
196 0.56
197 0.51
198 0.48
199 0.4
200 0.38
201 0.28
202 0.2
203 0.14
204 0.13
205 0.11
206 0.09
207 0.13
208 0.12
209 0.16
210 0.21
211 0.26
212 0.28
213 0.33
214 0.34
215 0.35
216 0.44
217 0.48
218 0.5
219 0.52
220 0.55
221 0.53
222 0.53
223 0.54
224 0.48
225 0.46
226 0.44
227 0.42
228 0.38
229 0.36
230 0.34
231 0.29
232 0.25
233 0.22
234 0.23
235 0.23
236 0.26
237 0.27
238 0.29
239 0.31
240 0.32
241 0.31
242 0.28
243 0.26
244 0.25
245 0.26
246 0.31
247 0.36
248 0.37
249 0.44
250 0.51
251 0.54
252 0.55
253 0.61
254 0.64
255 0.68
256 0.75
257 0.76
258 0.74
259 0.75
260 0.79
261 0.76
262 0.68
263 0.59
264 0.54
265 0.47
266 0.42
267 0.33
268 0.26