Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A439CLM6

Protein Details
Accession A0A439CLM6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
397-423DSDSDDEQRHKKRKKGKGGKADLGPHGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
405-418RHKKRKKGKGGKAD
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 9.5, extr 7, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Amino Acid Sequences MYENLCTLPLSAELFTQALHPTEPLLGVGLATGHVQCFRLPSTEKASEEDADTSVLSDGKGTIDTAWRTRRHKGSCRSLVFSHDGSSLYSAGTDSLIKHFSPATGQVISKIAVPTSKSVPDSPTLLSALSPQTLLLACDSGVLHLLDLRDGALAASKPQQSHFPHDDFVSSLTPLPPSAESTSGFSKQWISTGGTTLAVTDLRRGVLVRSEDQEDELLCSTFIAGMGPKKHKDNGVVAVGTGSGVLTLWDKGAWDDQFDRIIVDSGRAGGESVDCLVQIPEGLSRDKKVAVGLGDGSLRIVNLGRREVEEYLRHDDLEAIVGLGFDCQGRMISGGGQTVKIWDESAAPGSDGDEDSDDDSDDDDDNDDDSNSDASGDAMPGKGNTKRQAKKDSESDDSDSDDEQRHKKRKKGKGGKADLGPHGAHGILKFKGLD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.13
3 0.14
4 0.14
5 0.13
6 0.13
7 0.13
8 0.12
9 0.13
10 0.13
11 0.11
12 0.1
13 0.09
14 0.08
15 0.08
16 0.07
17 0.06
18 0.07
19 0.07
20 0.07
21 0.08
22 0.09
23 0.1
24 0.13
25 0.14
26 0.19
27 0.22
28 0.26
29 0.33
30 0.39
31 0.39
32 0.4
33 0.41
34 0.37
35 0.35
36 0.32
37 0.24
38 0.18
39 0.17
40 0.15
41 0.12
42 0.11
43 0.09
44 0.08
45 0.08
46 0.08
47 0.09
48 0.08
49 0.09
50 0.14
51 0.17
52 0.24
53 0.31
54 0.37
55 0.42
56 0.5
57 0.58
58 0.62
59 0.69
60 0.72
61 0.76
62 0.78
63 0.79
64 0.76
65 0.68
66 0.64
67 0.58
68 0.49
69 0.4
70 0.31
71 0.26
72 0.22
73 0.22
74 0.17
75 0.12
76 0.11
77 0.09
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.1
83 0.12
84 0.12
85 0.13
86 0.13
87 0.13
88 0.14
89 0.16
90 0.17
91 0.17
92 0.17
93 0.18
94 0.19
95 0.19
96 0.19
97 0.17
98 0.14
99 0.13
100 0.15
101 0.16
102 0.18
103 0.21
104 0.2
105 0.22
106 0.23
107 0.23
108 0.24
109 0.22
110 0.2
111 0.18
112 0.16
113 0.14
114 0.14
115 0.14
116 0.12
117 0.11
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.1
122 0.08
123 0.07
124 0.06
125 0.07
126 0.07
127 0.06
128 0.07
129 0.07
130 0.06
131 0.07
132 0.08
133 0.06
134 0.06
135 0.07
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.06
141 0.07
142 0.12
143 0.14
144 0.14
145 0.15
146 0.23
147 0.24
148 0.32
149 0.36
150 0.33
151 0.32
152 0.32
153 0.32
154 0.25
155 0.24
156 0.17
157 0.12
158 0.11
159 0.1
160 0.1
161 0.09
162 0.1
163 0.09
164 0.1
165 0.11
166 0.12
167 0.12
168 0.15
169 0.17
170 0.18
171 0.18
172 0.16
173 0.17
174 0.15
175 0.16
176 0.15
177 0.14
178 0.13
179 0.15
180 0.15
181 0.12
182 0.12
183 0.11
184 0.1
185 0.08
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.1
194 0.12
195 0.13
196 0.14
197 0.16
198 0.16
199 0.16
200 0.16
201 0.12
202 0.11
203 0.1
204 0.08
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.04
211 0.04
212 0.07
213 0.12
214 0.16
215 0.17
216 0.2
217 0.22
218 0.24
219 0.26
220 0.27
221 0.27
222 0.27
223 0.25
224 0.22
225 0.2
226 0.18
227 0.15
228 0.1
229 0.06
230 0.02
231 0.02
232 0.03
233 0.03
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.05
239 0.09
240 0.08
241 0.1
242 0.11
243 0.12
244 0.13
245 0.13
246 0.12
247 0.1
248 0.11
249 0.09
250 0.08
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.06
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.08
269 0.1
270 0.11
271 0.12
272 0.14
273 0.15
274 0.15
275 0.13
276 0.14
277 0.13
278 0.13
279 0.12
280 0.12
281 0.12
282 0.11
283 0.1
284 0.08
285 0.07
286 0.06
287 0.07
288 0.08
289 0.11
290 0.13
291 0.14
292 0.15
293 0.18
294 0.19
295 0.23
296 0.24
297 0.26
298 0.3
299 0.3
300 0.28
301 0.25
302 0.24
303 0.2
304 0.17
305 0.13
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.07
320 0.09
321 0.12
322 0.12
323 0.12
324 0.12
325 0.13
326 0.13
327 0.12
328 0.11
329 0.09
330 0.1
331 0.11
332 0.13
333 0.12
334 0.12
335 0.11
336 0.12
337 0.12
338 0.11
339 0.11
340 0.09
341 0.09
342 0.1
343 0.11
344 0.1
345 0.09
346 0.09
347 0.1
348 0.09
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.09
353 0.09
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.07
359 0.07
360 0.06
361 0.07
362 0.07
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.09
367 0.1
368 0.14
369 0.18
370 0.25
371 0.33
372 0.43
373 0.5
374 0.58
375 0.67
376 0.7
377 0.73
378 0.75
379 0.73
380 0.69
381 0.67
382 0.63
383 0.54
384 0.5
385 0.43
386 0.35
387 0.31
388 0.3
389 0.3
390 0.35
391 0.43
392 0.51
393 0.58
394 0.65
395 0.73
396 0.78
397 0.84
398 0.87
399 0.87
400 0.88
401 0.9
402 0.9
403 0.87
404 0.83
405 0.75
406 0.69
407 0.58
408 0.47
409 0.38
410 0.3
411 0.24
412 0.19
413 0.21
414 0.17