Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A439D1Y6

Protein Details
Accession A0A439D1Y6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
610-629KEAMKKPKVGEEKTKKNISTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
367-385KLKPKNARSKRALEKKAPK
Subcellular Location(s) plas 10, nucl 8, pero 3, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013149  ADH-like_C  
IPR013154  ADH-like_N  
IPR002328  ADH_Zn_CS  
IPR007109  Brix  
IPR047109  CAD-like  
IPR011032  GroES-like_sf  
IPR036291  NAD(P)-bd_dom_sf  
IPR020843  PKS_ER  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0016616  F:oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF08240  ADH_N  
PF00107  ADH_zinc_N  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00059  ADH_ZINC  
PS50833  BRIX  
CDD cd05283  CAD1  
Amino Acid Sequences MADIKFEGWLGHNPESVNGKMEWGPFEPKKWTEDDVDIEISHCGICGSDLHVLNSGWFQTDYPCCVGHEIVGKAVRVGNNVKHVKVGDRVGVGAQSRTCQQPDCPECSSGNDTYCQRLMVNTYGCDYPNNEGKSYGGYADYNRSNQQFVVQIPEGLSSADAAPMLCGGVTVYSPLRRNGCGPGKSVGVVGVGGLGHFAVLFAKAMGADKVVGISRKASKRDDVLKLGADEYVATDDDKDWYKTHSRSLDLIICTANSINLPMTEYLGLLKRGGEFVQVGAADNGDFPKINVFSLISGGVKISGSATGAPWEIKEMLQLAADKKIKPWIEERPMKEANQAVIDMDQGKARYRYVLVNENFEKHGISNKLKPKNARSKRALEKKAPKINENPKSTLFLRGTTCSQIVQDALADLHSLRQPLAKKFSKKNDIHPFEDPSSLIFFSEKNDTSLLVFGSSSKKRPNTLTFARTFATNQILDMIELHIIPESFRTLSQFKSRKFAVGLRPMMVFSGTAWDSPVANEYTILKSILIDMFKGDTSSEKIDVEGLQYLVSVAADEPAGDDVKPTVHLRLYLLDTKRSGQRLPRIELEEMGPRMDFRIGRSQQPDEAIWKEAMKKPKVGEEKTKKNISTDIVGDKIGRIHLGKQDLSDLQTRKMKGLKRNRDVEGGSGTADGDDTQKRQKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.35
3 0.33
4 0.3
5 0.23
6 0.24
7 0.24
8 0.26
9 0.26
10 0.24
11 0.33
12 0.32
13 0.36
14 0.4
15 0.39
16 0.41
17 0.41
18 0.41
19 0.37
20 0.39
21 0.4
22 0.37
23 0.36
24 0.33
25 0.3
26 0.26
27 0.22
28 0.17
29 0.12
30 0.08
31 0.06
32 0.06
33 0.07
34 0.09
35 0.16
36 0.17
37 0.18
38 0.21
39 0.21
40 0.22
41 0.22
42 0.19
43 0.15
44 0.14
45 0.13
46 0.16
47 0.19
48 0.22
49 0.23
50 0.23
51 0.22
52 0.24
53 0.24
54 0.21
55 0.25
56 0.22
57 0.25
58 0.27
59 0.26
60 0.25
61 0.28
62 0.26
63 0.24
64 0.28
65 0.28
66 0.35
67 0.39
68 0.38
69 0.38
70 0.37
71 0.37
72 0.38
73 0.36
74 0.3
75 0.27
76 0.28
77 0.25
78 0.27
79 0.24
80 0.21
81 0.19
82 0.16
83 0.18
84 0.21
85 0.22
86 0.21
87 0.24
88 0.32
89 0.36
90 0.4
91 0.41
92 0.39
93 0.39
94 0.42
95 0.43
96 0.36
97 0.32
98 0.31
99 0.3
100 0.32
101 0.32
102 0.27
103 0.22
104 0.21
105 0.22
106 0.24
107 0.25
108 0.22
109 0.23
110 0.24
111 0.24
112 0.24
113 0.22
114 0.21
115 0.26
116 0.27
117 0.26
118 0.25
119 0.25
120 0.26
121 0.25
122 0.21
123 0.15
124 0.14
125 0.15
126 0.21
127 0.24
128 0.24
129 0.27
130 0.27
131 0.27
132 0.26
133 0.27
134 0.24
135 0.21
136 0.26
137 0.22
138 0.21
139 0.2
140 0.21
141 0.18
142 0.15
143 0.14
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.06
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.04
153 0.04
154 0.03
155 0.04
156 0.04
157 0.06
158 0.08
159 0.12
160 0.15
161 0.19
162 0.21
163 0.22
164 0.24
165 0.32
166 0.38
167 0.36
168 0.37
169 0.35
170 0.34
171 0.33
172 0.31
173 0.23
174 0.14
175 0.12
176 0.09
177 0.07
178 0.05
179 0.05
180 0.04
181 0.04
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.04
188 0.03
189 0.04
190 0.04
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.08
198 0.09
199 0.08
200 0.12
201 0.19
202 0.24
203 0.29
204 0.31
205 0.32
206 0.38
207 0.46
208 0.48
209 0.44
210 0.41
211 0.39
212 0.37
213 0.34
214 0.27
215 0.19
216 0.13
217 0.1
218 0.09
219 0.07
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.09
224 0.11
225 0.12
226 0.11
227 0.15
228 0.21
229 0.22
230 0.28
231 0.3
232 0.3
233 0.3
234 0.34
235 0.35
236 0.29
237 0.29
238 0.23
239 0.19
240 0.17
241 0.15
242 0.11
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.07
248 0.07
249 0.08
250 0.07
251 0.07
252 0.08
253 0.1
254 0.1
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.07
262 0.07
263 0.09
264 0.08
265 0.08
266 0.07
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.04
274 0.07
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.09
281 0.1
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.04
290 0.04
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.1
305 0.09
306 0.15
307 0.17
308 0.17
309 0.17
310 0.23
311 0.22
312 0.23
313 0.26
314 0.29
315 0.36
316 0.42
317 0.44
318 0.45
319 0.47
320 0.45
321 0.43
322 0.36
323 0.28
324 0.22
325 0.2
326 0.13
327 0.1
328 0.11
329 0.09
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.08
334 0.09
335 0.09
336 0.1
337 0.11
338 0.13
339 0.15
340 0.23
341 0.23
342 0.28
343 0.29
344 0.29
345 0.28
346 0.26
347 0.23
348 0.14
349 0.19
350 0.18
351 0.2
352 0.25
353 0.33
354 0.41
355 0.43
356 0.48
357 0.52
358 0.59
359 0.65
360 0.67
361 0.64
362 0.66
363 0.73
364 0.79
365 0.76
366 0.75
367 0.76
368 0.76
369 0.78
370 0.71
371 0.64
372 0.63
373 0.67
374 0.66
375 0.61
376 0.54
377 0.48
378 0.5
379 0.47
380 0.45
381 0.35
382 0.3
383 0.27
384 0.26
385 0.27
386 0.24
387 0.24
388 0.17
389 0.16
390 0.14
391 0.11
392 0.09
393 0.07
394 0.06
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.04
399 0.06
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.11
404 0.15
405 0.19
406 0.28
407 0.33
408 0.39
409 0.47
410 0.56
411 0.63
412 0.62
413 0.69
414 0.71
415 0.7
416 0.67
417 0.62
418 0.58
419 0.49
420 0.47
421 0.36
422 0.26
423 0.23
424 0.18
425 0.15
426 0.1
427 0.09
428 0.1
429 0.15
430 0.15
431 0.14
432 0.14
433 0.14
434 0.14
435 0.15
436 0.13
437 0.09
438 0.08
439 0.08
440 0.15
441 0.17
442 0.2
443 0.25
444 0.28
445 0.31
446 0.37
447 0.42
448 0.44
449 0.49
450 0.53
451 0.49
452 0.48
453 0.45
454 0.4
455 0.35
456 0.29
457 0.26
458 0.18
459 0.16
460 0.16
461 0.15
462 0.14
463 0.14
464 0.12
465 0.08
466 0.08
467 0.08
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.08
473 0.08
474 0.08
475 0.12
476 0.13
477 0.17
478 0.27
479 0.33
480 0.33
481 0.39
482 0.4
483 0.39
484 0.4
485 0.43
486 0.42
487 0.44
488 0.45
489 0.41
490 0.4
491 0.37
492 0.34
493 0.28
494 0.19
495 0.09
496 0.12
497 0.11
498 0.1
499 0.11
500 0.11
501 0.11
502 0.11
503 0.14
504 0.1
505 0.1
506 0.11
507 0.12
508 0.14
509 0.14
510 0.15
511 0.12
512 0.11
513 0.13
514 0.15
515 0.13
516 0.11
517 0.11
518 0.12
519 0.12
520 0.12
521 0.1
522 0.1
523 0.13
524 0.15
525 0.16
526 0.15
527 0.15
528 0.16
529 0.16
530 0.16
531 0.14
532 0.11
533 0.1
534 0.09
535 0.09
536 0.08
537 0.07
538 0.06
539 0.04
540 0.05
541 0.05
542 0.05
543 0.05
544 0.06
545 0.07
546 0.07
547 0.07
548 0.07
549 0.08
550 0.12
551 0.12
552 0.14
553 0.15
554 0.16
555 0.17
556 0.21
557 0.25
558 0.29
559 0.3
560 0.32
561 0.32
562 0.35
563 0.39
564 0.39
565 0.38
566 0.39
567 0.46
568 0.49
569 0.53
570 0.56
571 0.54
572 0.52
573 0.49
574 0.44
575 0.42
576 0.35
577 0.31
578 0.24
579 0.19
580 0.2
581 0.22
582 0.2
583 0.17
584 0.27
585 0.29
586 0.36
587 0.42
588 0.43
589 0.43
590 0.45
591 0.43
592 0.37
593 0.37
594 0.32
595 0.28
596 0.28
597 0.31
598 0.33
599 0.41
600 0.4
601 0.42
602 0.42
603 0.5
604 0.58
605 0.58
606 0.64
607 0.65
608 0.72
609 0.76
610 0.81
611 0.73
612 0.66
613 0.64
614 0.57
615 0.52
616 0.46
617 0.42
618 0.35
619 0.35
620 0.32
621 0.28
622 0.26
623 0.22
624 0.2
625 0.16
626 0.19
627 0.24
628 0.3
629 0.3
630 0.29
631 0.33
632 0.32
633 0.34
634 0.37
635 0.33
636 0.34
637 0.4
638 0.4
639 0.4
640 0.45
641 0.49
642 0.52
643 0.61
644 0.65
645 0.68
646 0.75
647 0.74
648 0.75
649 0.69
650 0.63
651 0.56
652 0.46
653 0.37
654 0.29
655 0.25
656 0.18
657 0.16
658 0.12
659 0.12
660 0.15
661 0.18