Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A421JI09

Protein Details
Accession A0A421JI09    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
349-382GIRQFIRDLNKKRDHKHERERRGYNRKARTIQTVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
359-375KKRDHKHERERRGYNRK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 15, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026847  VPS13  
Amino Acid Sequences MACNLEENTTTVFDGEGLDKVRLPRYVYPNSVIKPYSVREARGQYWMYNIDESSFFEEVYFAHLVLAGEEKCILVTFKKIIMFDINQLVSKWIVGFDKVKSITVESTGLVIGLKSTRGNGTFIPIPERSNRNFLYQKMVIAVEEFNKHCKFSKEGEKKIVINVSGRGDRDVQSVAEVLPTLGEQIGWDLRFEEDPSKIGYSELVHSRIGYSKVGNTETGAANDIEKGKIKLSDIDMKEFLALGDMENIHLEFKCEVLRGLMDCCTVKNIADELAKEYDNLPLKIVNSPYLPERVKISEIKLSEIKLSEIDEPTPTRKVSFESTITSIEFEQCRFIDESNQSKRTPVEIGIRQFIRDLNKKRDHKHERERRGYNRKARTIQTVSYNKFLESFVINNI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.12
3 0.13
4 0.14
5 0.15
6 0.17
7 0.2
8 0.24
9 0.26
10 0.29
11 0.34
12 0.41
13 0.48
14 0.49
15 0.52
16 0.55
17 0.54
18 0.54
19 0.46
20 0.4
21 0.37
22 0.35
23 0.4
24 0.36
25 0.37
26 0.39
27 0.44
28 0.45
29 0.47
30 0.47
31 0.38
32 0.39
33 0.39
34 0.34
35 0.29
36 0.27
37 0.21
38 0.2
39 0.21
40 0.22
41 0.19
42 0.17
43 0.15
44 0.15
45 0.13
46 0.17
47 0.15
48 0.1
49 0.09
50 0.11
51 0.11
52 0.11
53 0.15
54 0.11
55 0.11
56 0.11
57 0.11
58 0.09
59 0.1
60 0.1
61 0.08
62 0.11
63 0.13
64 0.16
65 0.19
66 0.19
67 0.21
68 0.25
69 0.25
70 0.25
71 0.29
72 0.26
73 0.24
74 0.24
75 0.23
76 0.18
77 0.17
78 0.14
79 0.1
80 0.1
81 0.12
82 0.14
83 0.14
84 0.21
85 0.21
86 0.22
87 0.21
88 0.22
89 0.21
90 0.2
91 0.2
92 0.13
93 0.13
94 0.11
95 0.11
96 0.09
97 0.08
98 0.06
99 0.06
100 0.07
101 0.06
102 0.08
103 0.1
104 0.11
105 0.13
106 0.13
107 0.16
108 0.19
109 0.19
110 0.23
111 0.21
112 0.22
113 0.26
114 0.31
115 0.29
116 0.33
117 0.33
118 0.36
119 0.39
120 0.38
121 0.4
122 0.36
123 0.34
124 0.29
125 0.28
126 0.2
127 0.18
128 0.18
129 0.12
130 0.15
131 0.15
132 0.18
133 0.19
134 0.2
135 0.21
136 0.23
137 0.24
138 0.27
139 0.38
140 0.43
141 0.48
142 0.53
143 0.54
144 0.52
145 0.51
146 0.47
147 0.37
148 0.29
149 0.26
150 0.23
151 0.22
152 0.21
153 0.2
154 0.19
155 0.18
156 0.18
157 0.16
158 0.13
159 0.11
160 0.11
161 0.1
162 0.08
163 0.07
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.04
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.07
177 0.08
178 0.09
179 0.1
180 0.08
181 0.09
182 0.11
183 0.11
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.09
188 0.11
189 0.13
190 0.13
191 0.13
192 0.13
193 0.13
194 0.15
195 0.15
196 0.13
197 0.12
198 0.12
199 0.14
200 0.15
201 0.15
202 0.13
203 0.14
204 0.13
205 0.13
206 0.12
207 0.1
208 0.09
209 0.1
210 0.11
211 0.09
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.11
216 0.12
217 0.13
218 0.16
219 0.24
220 0.24
221 0.26
222 0.26
223 0.24
224 0.24
225 0.21
226 0.17
227 0.1
228 0.08
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.08
238 0.06
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.1
247 0.11
248 0.11
249 0.11
250 0.11
251 0.12
252 0.12
253 0.11
254 0.11
255 0.11
256 0.12
257 0.14
258 0.14
259 0.16
260 0.18
261 0.17
262 0.16
263 0.16
264 0.19
265 0.21
266 0.21
267 0.18
268 0.17
269 0.18
270 0.22
271 0.22
272 0.19
273 0.16
274 0.17
275 0.19
276 0.24
277 0.24
278 0.21
279 0.24
280 0.24
281 0.27
282 0.28
283 0.29
284 0.28
285 0.28
286 0.31
287 0.3
288 0.28
289 0.27
290 0.25
291 0.22
292 0.18
293 0.19
294 0.18
295 0.18
296 0.18
297 0.18
298 0.2
299 0.22
300 0.25
301 0.23
302 0.21
303 0.2
304 0.23
305 0.26
306 0.28
307 0.28
308 0.28
309 0.3
310 0.31
311 0.3
312 0.28
313 0.23
314 0.23
315 0.21
316 0.18
317 0.19
318 0.17
319 0.2
320 0.2
321 0.2
322 0.24
323 0.29
324 0.38
325 0.44
326 0.48
327 0.45
328 0.46
329 0.46
330 0.42
331 0.38
332 0.33
333 0.33
334 0.36
335 0.41
336 0.46
337 0.45
338 0.43
339 0.41
340 0.39
341 0.39
342 0.42
343 0.46
344 0.49
345 0.58
346 0.66
347 0.72
348 0.8
349 0.82
350 0.83
351 0.86
352 0.86
353 0.87
354 0.89
355 0.92
356 0.92
357 0.92
358 0.91
359 0.9
360 0.9
361 0.88
362 0.85
363 0.8
364 0.79
365 0.75
366 0.69
367 0.7
368 0.69
369 0.63
370 0.62
371 0.58
372 0.48
373 0.44
374 0.39
375 0.31
376 0.25