Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A421JQN5

Protein Details
Accession A0A421JQN5    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-34FSSLISKEISKKRKKVHNKVHKSNPIPNNHKTHydrophilic
310-335KKINANGKKFKQTKFKVRGSKYQYTLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-24SKKRKKVHNKVHK
317-318KK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004098  Prp18  
IPR039979  PRPF18  
IPR002675  Ribosomal_L38e  
Gene Ontology GO:0005840  C:ribosome  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF02840  Prp18  
PF01781  Ribosomal_L38e  
Amino Acid Sequences MDFSSLISKEISKKRKKVHNKVHKSNPIPNNHKTIQKNDKSIPKIHQEPKVETKQPVEPTVEPTVEPPVSSDELTEEQLNFKLSEFNQPIDDSLTTKEKITKLKQLLRYQTKNEKYKQWLDKEAPFYQDPTKQLITLDQISNIQTNKDNLYIILRVYTKEMIKTWEGSIQSSDKEQQLLLFETKRDIVPLLYELRTGKLTDDILTSLSTIIYYIQQKDYRHANESYMKLSIGNVAWPIGVLNVGIHARSASERITGQKKTANIMIDDKTRRWITSVKRLITMAREIKDIKEFVELARRADIKSAVVKVNKKINANGKKFKQTKFKVRGSKYQYTLVVNDASKAKKLQQSLPPTLKITNL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.78
3 0.86
4 0.88
5 0.9
6 0.91
7 0.92
8 0.94
9 0.95
10 0.94
11 0.9
12 0.89
13 0.86
14 0.85
15 0.81
16 0.76
17 0.74
18 0.68
19 0.69
20 0.64
21 0.66
22 0.66
23 0.66
24 0.69
25 0.67
26 0.73
27 0.69
28 0.7
29 0.67
30 0.65
31 0.67
32 0.67
33 0.67
34 0.64
35 0.66
36 0.69
37 0.71
38 0.67
39 0.6
40 0.57
41 0.56
42 0.54
43 0.51
44 0.47
45 0.39
46 0.39
47 0.41
48 0.37
49 0.3
50 0.27
51 0.29
52 0.24
53 0.23
54 0.18
55 0.18
56 0.19
57 0.19
58 0.18
59 0.15
60 0.17
61 0.19
62 0.19
63 0.15
64 0.14
65 0.16
66 0.17
67 0.14
68 0.13
69 0.16
70 0.15
71 0.25
72 0.25
73 0.26
74 0.26
75 0.26
76 0.26
77 0.24
78 0.24
79 0.15
80 0.16
81 0.19
82 0.18
83 0.19
84 0.23
85 0.25
86 0.32
87 0.36
88 0.42
89 0.47
90 0.54
91 0.62
92 0.64
93 0.71
94 0.72
95 0.73
96 0.71
97 0.73
98 0.74
99 0.73
100 0.69
101 0.67
102 0.64
103 0.68
104 0.69
105 0.65
106 0.63
107 0.6
108 0.62
109 0.6
110 0.55
111 0.5
112 0.42
113 0.38
114 0.35
115 0.34
116 0.3
117 0.28
118 0.27
119 0.23
120 0.23
121 0.22
122 0.22
123 0.21
124 0.2
125 0.16
126 0.16
127 0.16
128 0.18
129 0.16
130 0.14
131 0.12
132 0.14
133 0.14
134 0.14
135 0.13
136 0.11
137 0.13
138 0.13
139 0.11
140 0.13
141 0.12
142 0.11
143 0.13
144 0.15
145 0.13
146 0.14
147 0.15
148 0.15
149 0.16
150 0.17
151 0.16
152 0.17
153 0.17
154 0.16
155 0.17
156 0.15
157 0.14
158 0.14
159 0.15
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.11
164 0.11
165 0.12
166 0.13
167 0.12
168 0.11
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.1
173 0.09
174 0.07
175 0.07
176 0.09
177 0.11
178 0.1
179 0.12
180 0.11
181 0.12
182 0.13
183 0.12
184 0.11
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.07
194 0.06
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.07
199 0.09
200 0.11
201 0.15
202 0.2
203 0.2
204 0.24
205 0.31
206 0.31
207 0.33
208 0.32
209 0.31
210 0.34
211 0.35
212 0.33
213 0.26
214 0.23
215 0.19
216 0.19
217 0.17
218 0.11
219 0.1
220 0.09
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.07
225 0.05
226 0.05
227 0.04
228 0.03
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.07
236 0.08
237 0.07
238 0.09
239 0.11
240 0.17
241 0.23
242 0.24
243 0.26
244 0.28
245 0.28
246 0.3
247 0.32
248 0.28
249 0.24
250 0.28
251 0.28
252 0.32
253 0.34
254 0.32
255 0.35
256 0.34
257 0.32
258 0.3
259 0.34
260 0.34
261 0.42
262 0.5
263 0.45
264 0.46
265 0.47
266 0.46
267 0.43
268 0.44
269 0.39
270 0.32
271 0.33
272 0.32
273 0.33
274 0.36
275 0.32
276 0.25
277 0.23
278 0.22
279 0.2
280 0.28
281 0.27
282 0.24
283 0.3
284 0.3
285 0.26
286 0.29
287 0.29
288 0.22
289 0.27
290 0.29
291 0.29
292 0.34
293 0.39
294 0.42
295 0.5
296 0.51
297 0.49
298 0.53
299 0.57
300 0.62
301 0.66
302 0.7
303 0.68
304 0.74
305 0.78
306 0.78
307 0.79
308 0.78
309 0.8
310 0.8
311 0.83
312 0.82
313 0.82
314 0.85
315 0.83
316 0.82
317 0.75
318 0.72
319 0.66
320 0.6
321 0.54
322 0.47
323 0.43
324 0.34
325 0.34
326 0.32
327 0.3
328 0.29
329 0.31
330 0.35
331 0.35
332 0.4
333 0.45
334 0.49
335 0.57
336 0.64
337 0.68
338 0.65
339 0.62