Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A421JWD6

Protein Details
Accession A0A421JWD6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-35SPVAKVTKVTKAKKQQQEPEPETNTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
324-345KKLNKEQTKESKSKGKITKKKK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Gene Ontology GO:0000502  C:proteasome complex  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MAKTRSKSKPSPVAKVTKVTKAKKQQQEPEPETNTTLIPNKVTTKAISELVKFTTREQEKSTKKDSLFEEDPSKLYLTINTKKYLSSKPQFKPKVITLPHSIHPTDIRICLIIRDELVKTNEQLESLETELTKVDQILPGTVLKKDYKNFEKRRELFNQYDLFLFDDALMNLMPSLLGKIFYKSNKIPVPVRVVSGDKELSLVTLKNQVNKVLTSTWYLPPMGNIVSINIGNLNEEVEKLIDNVNKVVESFDVKTIKSFMIKTDVSPALPLYYTDNLFDEEDLAKEEDKKEDVEDEEEVDKFTSFEKGLLELGDVETVTKIIGKKLNKEQTKESKSKGKITKKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.76
3 0.71
4 0.7
5 0.72
6 0.69
7 0.7
8 0.72
9 0.78
10 0.79
11 0.84
12 0.84
13 0.83
14 0.87
15 0.85
16 0.83
17 0.77
18 0.69
19 0.61
20 0.52
21 0.43
22 0.36
23 0.33
24 0.26
25 0.23
26 0.24
27 0.26
28 0.28
29 0.3
30 0.27
31 0.27
32 0.28
33 0.31
34 0.31
35 0.29
36 0.28
37 0.3
38 0.33
39 0.3
40 0.29
41 0.34
42 0.34
43 0.36
44 0.39
45 0.45
46 0.49
47 0.55
48 0.59
49 0.56
50 0.53
51 0.57
52 0.54
53 0.53
54 0.48
55 0.45
56 0.44
57 0.38
58 0.39
59 0.33
60 0.31
61 0.22
62 0.2
63 0.21
64 0.24
65 0.3
66 0.33
67 0.34
68 0.34
69 0.35
70 0.4
71 0.42
72 0.44
73 0.46
74 0.52
75 0.56
76 0.67
77 0.7
78 0.68
79 0.66
80 0.62
81 0.62
82 0.55
83 0.53
84 0.49
85 0.48
86 0.49
87 0.46
88 0.41
89 0.33
90 0.31
91 0.3
92 0.25
93 0.22
94 0.19
95 0.16
96 0.16
97 0.15
98 0.15
99 0.13
100 0.11
101 0.12
102 0.12
103 0.15
104 0.17
105 0.17
106 0.16
107 0.18
108 0.17
109 0.15
110 0.15
111 0.12
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.09
116 0.09
117 0.08
118 0.09
119 0.08
120 0.06
121 0.06
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.1
127 0.11
128 0.12
129 0.14
130 0.14
131 0.18
132 0.2
133 0.26
134 0.33
135 0.43
136 0.5
137 0.57
138 0.65
139 0.65
140 0.69
141 0.68
142 0.66
143 0.58
144 0.56
145 0.48
146 0.38
147 0.35
148 0.29
149 0.23
150 0.17
151 0.14
152 0.08
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.04
165 0.05
166 0.06
167 0.1
168 0.11
169 0.16
170 0.17
171 0.24
172 0.25
173 0.28
174 0.29
175 0.3
176 0.36
177 0.32
178 0.32
179 0.27
180 0.26
181 0.23
182 0.24
183 0.2
184 0.13
185 0.12
186 0.11
187 0.1
188 0.1
189 0.09
190 0.07
191 0.16
192 0.17
193 0.2
194 0.21
195 0.23
196 0.24
197 0.24
198 0.25
199 0.18
200 0.18
201 0.17
202 0.19
203 0.19
204 0.19
205 0.19
206 0.17
207 0.16
208 0.16
209 0.13
210 0.11
211 0.09
212 0.08
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.08
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.06
222 0.06
223 0.07
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.1
228 0.11
229 0.11
230 0.12
231 0.13
232 0.12
233 0.12
234 0.12
235 0.1
236 0.12
237 0.13
238 0.17
239 0.18
240 0.18
241 0.19
242 0.21
243 0.21
244 0.21
245 0.19
246 0.16
247 0.21
248 0.21
249 0.21
250 0.26
251 0.26
252 0.23
253 0.24
254 0.22
255 0.17
256 0.16
257 0.16
258 0.13
259 0.15
260 0.16
261 0.16
262 0.16
263 0.17
264 0.17
265 0.17
266 0.14
267 0.12
268 0.12
269 0.13
270 0.13
271 0.12
272 0.15
273 0.16
274 0.17
275 0.18
276 0.19
277 0.18
278 0.2
279 0.21
280 0.21
281 0.2
282 0.2
283 0.2
284 0.19
285 0.18
286 0.16
287 0.14
288 0.12
289 0.12
290 0.13
291 0.11
292 0.13
293 0.13
294 0.14
295 0.14
296 0.15
297 0.14
298 0.12
299 0.12
300 0.11
301 0.1
302 0.09
303 0.08
304 0.08
305 0.07
306 0.09
307 0.1
308 0.15
309 0.22
310 0.26
311 0.34
312 0.45
313 0.55
314 0.59
315 0.64
316 0.69
317 0.73
318 0.78
319 0.77
320 0.73
321 0.73
322 0.72
323 0.76
324 0.76
325 0.76