Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A421JPR8

Protein Details
Accession A0A421JPR8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
99-118GVAPRAKMNQQRARRFRSAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
388-405RKRREQEMRREEGKKRRK
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 5, cyto 5, cyto_mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSRKYPKIISPVIEAEENDIGGPKYEDPNPNGEIDNLYLDMNGIVHPCSHPEHKPAPETEDEMFLDVFTYTDRVLMMARPRKVLMIAVDGVAPRAKMNQQRARRFRSAQDAKIKQEEMERDIRERELRGEVIDDAIKGKKQWDSNAITPGTPFMDRLAEALRYWVAYKLTSDPGWANLQVIISDATVPGEGEHKLMSFIRSQRSDPQYNPNTKHCIYGLDADLIFLGLATHEPHFRVLREDVFANQGKRMTVSDQLSMTQEENELIQEKDKRKPFLWLHVNVLREYLAVELFNPQLPFAFDLERAIDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDVRDNGIDILVNCWKRSLPRLRDYVTCDGQLNIDSVEKLMGNLAYKEDEIFRKRREQEMRREEGKKRRKMVDEQEQALKDVYLPQVTKGKDKAPITADVNMPLMTTSGELVEGYAPLSNSDIVQNRDIITNANLANNDAAAALKKLIDSKKTPVSAVQAREAVQEESSATSEESSDVEVKKRPAEEDEETPDDVKLWEPGYRKRYYQTKFHLQTDEEIDQTRRQVVRHYLEGVAWVLLYYYQGCPSWQWYFPYHYAPFAADFTNIGELVPEGVIKFDLGEPFRPYEQLMSVLPAASGHTLPEVFRGLMSDEDSEIIDFYPEDFKIDMNGKKMSWQGIPLLPFIDETRLLTAVQAKYKLLTPEEIDRNTNKQAVLFISTENKNYTKFEEELYTKKTKQVQFKFAKSSLAGTAIKNESFQPNAIFKFPLKEGNMPNINNKEYFQVTYEMPPKTVGKSMLLNGYIPHLPALTEEDKSNLMYGGPRYGRFNAPSDNREYINAGPAGTEIYKVYAMRRGGYRSYLQYLKDGVLPDSAPQGQNQGYNQGYSRNYNQGYNNQGYNRNQGQGGYNQGGYNQGYNQQGYQNQGYNQNYNQGYQNQGYQNQGYNQNYNQGYRQGGNNQNYGQGQGQGYGQGQGYGQGQGQNQGYGQGRRDYNQGQSRSGYLPPGRGNYRGGRNGYRQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.62
3 0.66
4 0.66
5 0.6
6 0.57
7 0.54
8 0.5
9 0.44
10 0.38
11 0.33
12 0.28
13 0.25
14 0.19
15 0.16
16 0.14
17 0.13
18 0.15
19 0.13
20 0.17
21 0.24
22 0.3
23 0.31
24 0.37
25 0.37
26 0.38
27 0.36
28 0.32
29 0.28
30 0.23
31 0.23
32 0.18
33 0.16
34 0.13
35 0.13
36 0.12
37 0.1
38 0.09
39 0.08
40 0.08
41 0.09
42 0.1
43 0.12
44 0.17
45 0.22
46 0.26
47 0.33
48 0.4
49 0.45
50 0.51
51 0.51
52 0.52
53 0.5
54 0.49
55 0.43
56 0.39
57 0.33
58 0.29
59 0.25
60 0.19
61 0.17
62 0.13
63 0.11
64 0.08
65 0.09
66 0.07
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.09
71 0.14
72 0.23
73 0.29
74 0.32
75 0.34
76 0.35
77 0.36
78 0.36
79 0.35
80 0.28
81 0.25
82 0.23
83 0.21
84 0.22
85 0.2
86 0.2
87 0.18
88 0.15
89 0.1
90 0.13
91 0.19
92 0.26
93 0.37
94 0.45
95 0.54
96 0.65
97 0.74
98 0.79
99 0.81
100 0.77
101 0.73
102 0.75
103 0.74
104 0.71
105 0.73
106 0.7
107 0.67
108 0.69
109 0.63
110 0.54
111 0.52
112 0.47
113 0.42
114 0.44
115 0.41
116 0.38
117 0.39
118 0.41
119 0.38
120 0.36
121 0.34
122 0.3
123 0.28
124 0.26
125 0.26
126 0.22
127 0.21
128 0.2
129 0.17
130 0.15
131 0.17
132 0.17
133 0.16
134 0.19
135 0.22
136 0.25
137 0.3
138 0.36
139 0.41
140 0.44
141 0.51
142 0.49
143 0.43
144 0.39
145 0.35
146 0.29
147 0.22
148 0.18
149 0.12
150 0.13
151 0.13
152 0.15
153 0.16
154 0.15
155 0.14
156 0.16
157 0.15
158 0.14
159 0.14
160 0.16
161 0.14
162 0.13
163 0.15
164 0.18
165 0.21
166 0.21
167 0.22
168 0.2
169 0.22
170 0.24
171 0.22
172 0.19
173 0.16
174 0.16
175 0.14
176 0.14
177 0.11
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.08
190 0.1
191 0.11
192 0.12
193 0.16
194 0.21
195 0.28
196 0.3
197 0.32
198 0.4
199 0.47
200 0.5
201 0.48
202 0.54
203 0.55
204 0.61
205 0.63
206 0.6
207 0.59
208 0.55
209 0.54
210 0.44
211 0.38
212 0.32
213 0.32
214 0.28
215 0.24
216 0.23
217 0.2
218 0.19
219 0.16
220 0.13
221 0.08
222 0.06
223 0.03
224 0.04
225 0.05
226 0.07
227 0.08
228 0.09
229 0.13
230 0.14
231 0.15
232 0.19
233 0.2
234 0.21
235 0.23
236 0.23
237 0.21
238 0.25
239 0.28
240 0.25
241 0.24
242 0.23
243 0.21
244 0.22
245 0.22
246 0.18
247 0.21
248 0.22
249 0.23
250 0.22
251 0.23
252 0.23
253 0.23
254 0.21
255 0.15
256 0.13
257 0.11
258 0.1
259 0.1
260 0.1
261 0.09
262 0.13
263 0.19
264 0.22
265 0.3
266 0.36
267 0.39
268 0.38
269 0.48
270 0.48
271 0.51
272 0.56
273 0.52
274 0.53
275 0.52
276 0.53
277 0.44
278 0.4
279 0.3
280 0.21
281 0.18
282 0.11
283 0.08
284 0.06
285 0.06
286 0.08
287 0.09
288 0.11
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.11
293 0.12
294 0.11
295 0.12
296 0.1
297 0.11
298 0.12
299 0.12
300 0.12
301 0.11
302 0.1
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.07
307 0.06
308 0.06
309 0.05
310 0.05
311 0.06
312 0.07
313 0.06
314 0.06
315 0.08
316 0.07
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.12
323 0.16
324 0.16
325 0.16
326 0.16
327 0.16
328 0.15
329 0.14
330 0.1
331 0.06
332 0.08
333 0.13
334 0.14
335 0.13
336 0.14
337 0.15
338 0.16
339 0.25
340 0.32
341 0.35
342 0.42
343 0.48
344 0.5
345 0.54
346 0.58
347 0.56
348 0.47
349 0.41
350 0.34
351 0.28
352 0.26
353 0.22
354 0.17
355 0.11
356 0.09
357 0.08
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.07
365 0.07
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.09
370 0.11
371 0.15
372 0.19
373 0.24
374 0.26
375 0.34
376 0.37
377 0.45
378 0.53
379 0.56
380 0.62
381 0.67
382 0.71
383 0.69
384 0.72
385 0.71
386 0.71
387 0.73
388 0.7
389 0.67
390 0.67
391 0.66
392 0.68
393 0.7
394 0.7
395 0.67
396 0.62
397 0.6
398 0.54
399 0.49
400 0.41
401 0.31
402 0.2
403 0.16
404 0.14
405 0.12
406 0.12
407 0.13
408 0.18
409 0.19
410 0.23
411 0.22
412 0.24
413 0.28
414 0.28
415 0.31
416 0.28
417 0.31
418 0.3
419 0.31
420 0.29
421 0.23
422 0.23
423 0.19
424 0.16
425 0.12
426 0.1
427 0.06
428 0.06
429 0.05
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.05
438 0.04
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.09
444 0.11
445 0.13
446 0.13
447 0.14
448 0.14
449 0.14
450 0.14
451 0.12
452 0.1
453 0.11
454 0.11
455 0.12
456 0.11
457 0.11
458 0.1
459 0.09
460 0.08
461 0.05
462 0.05
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.05
467 0.05
468 0.09
469 0.11
470 0.15
471 0.17
472 0.21
473 0.26
474 0.27
475 0.27
476 0.24
477 0.28
478 0.3
479 0.29
480 0.27
481 0.23
482 0.22
483 0.23
484 0.23
485 0.17
486 0.12
487 0.11
488 0.09
489 0.08
490 0.08
491 0.07
492 0.06
493 0.05
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.08
499 0.08
500 0.1
501 0.13
502 0.14
503 0.15
504 0.16
505 0.16
506 0.16
507 0.21
508 0.22
509 0.23
510 0.26
511 0.26
512 0.25
513 0.25
514 0.23
515 0.17
516 0.15
517 0.11
518 0.08
519 0.07
520 0.11
521 0.13
522 0.2
523 0.25
524 0.27
525 0.28
526 0.32
527 0.4
528 0.4
529 0.46
530 0.47
531 0.52
532 0.54
533 0.56
534 0.54
535 0.46
536 0.45
537 0.41
538 0.35
539 0.25
540 0.22
541 0.2
542 0.17
543 0.17
544 0.19
545 0.15
546 0.15
547 0.18
548 0.24
549 0.26
550 0.28
551 0.29
552 0.25
553 0.24
554 0.25
555 0.2
556 0.13
557 0.09
558 0.07
559 0.05
560 0.04
561 0.04
562 0.05
563 0.05
564 0.06
565 0.06
566 0.07
567 0.07
568 0.11
569 0.14
570 0.15
571 0.17
572 0.19
573 0.23
574 0.25
575 0.31
576 0.27
577 0.25
578 0.23
579 0.21
580 0.2
581 0.16
582 0.15
583 0.09
584 0.09
585 0.09
586 0.09
587 0.08
588 0.07
589 0.06
590 0.05
591 0.05
592 0.05
593 0.05
594 0.04
595 0.04
596 0.04
597 0.04
598 0.05
599 0.05
600 0.08
601 0.09
602 0.11
603 0.13
604 0.15
605 0.16
606 0.16
607 0.15
608 0.13
609 0.13
610 0.13
611 0.11
612 0.11
613 0.11
614 0.1
615 0.1
616 0.09
617 0.08
618 0.07
619 0.07
620 0.05
621 0.06
622 0.06
623 0.06
624 0.08
625 0.09
626 0.08
627 0.07
628 0.08
629 0.08
630 0.09
631 0.1
632 0.09
633 0.08
634 0.09
635 0.09
636 0.08
637 0.07
638 0.06
639 0.05
640 0.05
641 0.05
642 0.07
643 0.07
644 0.09
645 0.08
646 0.08
647 0.11
648 0.17
649 0.19
650 0.19
651 0.21
652 0.2
653 0.23
654 0.25
655 0.25
656 0.2
657 0.19
658 0.19
659 0.2
660 0.21
661 0.19
662 0.18
663 0.15
664 0.15
665 0.14
666 0.12
667 0.1
668 0.09
669 0.1
670 0.11
671 0.1
672 0.11
673 0.16
674 0.17
675 0.19
676 0.2
677 0.18
678 0.18
679 0.21
680 0.23
681 0.18
682 0.18
683 0.17
684 0.24
685 0.3
686 0.3
687 0.3
688 0.31
689 0.33
690 0.34
691 0.34
692 0.26
693 0.21
694 0.21
695 0.2
696 0.21
697 0.17
698 0.16
699 0.2
700 0.21
701 0.22
702 0.23
703 0.23
704 0.21
705 0.22
706 0.24
707 0.22
708 0.22
709 0.22
710 0.25
711 0.27
712 0.3
713 0.34
714 0.37
715 0.33
716 0.37
717 0.44
718 0.44
719 0.51
720 0.55
721 0.6
722 0.62
723 0.68
724 0.69
725 0.63
726 0.6
727 0.5
728 0.44
729 0.34
730 0.31
731 0.27
732 0.2
733 0.25
734 0.24
735 0.23
736 0.22
737 0.22
738 0.2
739 0.19
740 0.2
741 0.18
742 0.2
743 0.22
744 0.22
745 0.22
746 0.2
747 0.23
748 0.23
749 0.26
750 0.25
751 0.3
752 0.31
753 0.38
754 0.44
755 0.41
756 0.47
757 0.45
758 0.44
759 0.38
760 0.36
761 0.31
762 0.27
763 0.26
764 0.21
765 0.19
766 0.19
767 0.24
768 0.29
769 0.27
770 0.25
771 0.27
772 0.26
773 0.26
774 0.28
775 0.24
776 0.21
777 0.23
778 0.25
779 0.27
780 0.26
781 0.24
782 0.2
783 0.22
784 0.19
785 0.17
786 0.15
787 0.1
788 0.09
789 0.1
790 0.16
791 0.15
792 0.15
793 0.15
794 0.17
795 0.18
796 0.18
797 0.18
798 0.12
799 0.1
800 0.12
801 0.13
802 0.19
803 0.21
804 0.22
805 0.25
806 0.28
807 0.32
808 0.32
809 0.35
810 0.36
811 0.39
812 0.42
813 0.44
814 0.43
815 0.39
816 0.38
817 0.37
818 0.3
819 0.29
820 0.26
821 0.2
822 0.17
823 0.16
824 0.17
825 0.14
826 0.14
827 0.09
828 0.1
829 0.12
830 0.12
831 0.14
832 0.18
833 0.19
834 0.21
835 0.25
836 0.28
837 0.29
838 0.33
839 0.35
840 0.34
841 0.39
842 0.39
843 0.36
844 0.35
845 0.34
846 0.31
847 0.3
848 0.26
849 0.21
850 0.19
851 0.19
852 0.16
853 0.19
854 0.2
855 0.18
856 0.17
857 0.2
858 0.19
859 0.23
860 0.23
861 0.25
862 0.23
863 0.24
864 0.25
865 0.27
866 0.28
867 0.29
868 0.33
869 0.34
870 0.36
871 0.39
872 0.43
873 0.43
874 0.48
875 0.47
876 0.47
877 0.43
878 0.49
879 0.47
880 0.51
881 0.48
882 0.43
883 0.4
884 0.37
885 0.36
886 0.33
887 0.36
888 0.3
889 0.28
890 0.25
891 0.25
892 0.27
893 0.24
894 0.22
895 0.17
896 0.2
897 0.21
898 0.22
899 0.23
900 0.25
901 0.26
902 0.3
903 0.33
904 0.32
905 0.32
906 0.4
907 0.42
908 0.42
909 0.4
910 0.43
911 0.4
912 0.37
913 0.39
914 0.34
915 0.35
916 0.32
917 0.38
918 0.34
919 0.36
920 0.39
921 0.36
922 0.38
923 0.38
924 0.45
925 0.42
926 0.42
927 0.4
928 0.44
929 0.43
930 0.42
931 0.39
932 0.35
933 0.35
934 0.33
935 0.37
936 0.38
937 0.45
938 0.47
939 0.49
940 0.45
941 0.47
942 0.45
943 0.42
944 0.35
945 0.3
946 0.26
947 0.22
948 0.21
949 0.19
950 0.19
951 0.19
952 0.17
953 0.14
954 0.13
955 0.14
956 0.15
957 0.14
958 0.15
959 0.17
960 0.18
961 0.22
962 0.23
963 0.22
964 0.21
965 0.25
966 0.28
967 0.28
968 0.32
969 0.33
970 0.35
971 0.35
972 0.42
973 0.4
974 0.45
975 0.5
976 0.5
977 0.46
978 0.46
979 0.48
980 0.44
981 0.42
982 0.4
983 0.35
984 0.38
985 0.39
986 0.45
987 0.44
988 0.45
989 0.48
990 0.49
991 0.55
992 0.56
993 0.57