Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A421JPQ1

Protein Details
Accession A0A421JPQ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MSHNTSKYRSHKRQKSSASNPTYYVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
606-607KR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10.5, cyto 3.5, mito 2, pero 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003150  DNA-bd_RFX  
IPR039136  NUFIP1-like  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF02257  RFX_DNA_binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51526  RFX_DBD  
Amino Acid Sequences MSHNTSKYRSHKRQKSSASNPTYYVTQQQQQQQHAHQQQQQAQHQHQHSRQQSEQPQQGSPQQLSTQPQQHRHASSSHLPQQFDNDTYISSYNYTPGSRSNPISKLPPSSSSSSTLPQPMSSGNLDISSHTHLSTSPMKRVASSELDSTSVMRTSPVITTATPGSYYYQPAIQATFSGLEPQLQQPQRQQALNQLPHSSSSTGYTYNPQQTVPSSAFTSFDYSGAFKIPEYSTTQQQQQQQQQQITPTGIIPSSSRKQQPSYPLSTQPTLSSITNALSPSAAAAFRQHQKNNLSISSHFNLVSLGPGDKRPGSHLSDTSTSTLSTTAVATSKHPAQRSSTFDNTVINDLLINLASVDGSNINNYLLSVLYKLNTPLAIDDFYNLLYNNDRLRDLLDLEYHQKLDKTIVPYTTVEFVIEGINQLLNFFKNPNLLEEYLPNLEDKENKLLNINYHELLRTFLAIKILYEILIQLPLGAEEDPQSYTIPRLSIYKTYFIICQKLINNYPSSSNTTSEQQKLILGQSKLGKLIKLVYPNLLIKRLGSRGESKYNYLGVIWNENIVSEDIKQLCAQNELSDLSEIFSGEIRLSSNQLLGSSTTPKRSGSHKRSSSKHKIKVPEAITESSPTNPFLSTEQPTTNPTTTGPIPQVTSTAETTTGPPLSSPNLSCIKPFLKFPAVDTFSILNSENEDNWFTEVLFECYNRISIFGPNLIHEIFLKNENLVNNSSLLNNLMETLIKPLNIQVTIPNIDLCLYLVIVIELSPYLLLIKSSTNINLLKTLRLNLMHLINNLNSELTRLNSPKFPINNSTIFLIVIKKLINLNDLLITFIKLINKDSKKSMMSTDIENFLKMNSQTLKLEAQDDDDSLLFNLNTNLNTTSMGEINFSFRNDILSNDLVYTLIGYNFDPNINSELRSSISMKFINEEINIIDDFFKKDLLMFLNSSFSDEEEEEVEEPEPRGDDPTQEISQESLEGLSPSIQPQAGAELPSTTSGTTPSTGTSEKRSEGTNESVLSPREFSRLQALINLIDKRLLSQHFKAKYPILIYNNYITFILNDILKYIFLKQQQAQLQNLQRSTQDLDAGGSGGSNNSFGNWWVFNSFIQEYMSLMGEIVGLYDSVEKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.9
2 0.91
3 0.9
4 0.9
5 0.87
6 0.8
7 0.73
8 0.65
9 0.57
10 0.48
11 0.45
12 0.4
13 0.37
14 0.41
15 0.47
16 0.51
17 0.55
18 0.6
19 0.59
20 0.63
21 0.65
22 0.67
23 0.65
24 0.66
25 0.65
26 0.68
27 0.7
28 0.68
29 0.66
30 0.67
31 0.68
32 0.69
33 0.69
34 0.7
35 0.69
36 0.69
37 0.68
38 0.69
39 0.71
40 0.71
41 0.72
42 0.65
43 0.61
44 0.56
45 0.58
46 0.54
47 0.46
48 0.4
49 0.36
50 0.38
51 0.4
52 0.44
53 0.47
54 0.48
55 0.55
56 0.58
57 0.63
58 0.62
59 0.59
60 0.54
61 0.52
62 0.52
63 0.54
64 0.56
65 0.54
66 0.51
67 0.49
68 0.53
69 0.5
70 0.43
71 0.36
72 0.28
73 0.23
74 0.24
75 0.24
76 0.19
77 0.17
78 0.16
79 0.16
80 0.18
81 0.18
82 0.17
83 0.21
84 0.27
85 0.3
86 0.34
87 0.39
88 0.4
89 0.43
90 0.49
91 0.47
92 0.48
93 0.46
94 0.47
95 0.44
96 0.45
97 0.45
98 0.42
99 0.41
100 0.37
101 0.37
102 0.37
103 0.33
104 0.29
105 0.27
106 0.24
107 0.24
108 0.23
109 0.21
110 0.16
111 0.17
112 0.17
113 0.16
114 0.18
115 0.19
116 0.18
117 0.16
118 0.16
119 0.15
120 0.2
121 0.28
122 0.3
123 0.31
124 0.36
125 0.36
126 0.37
127 0.39
128 0.39
129 0.36
130 0.34
131 0.31
132 0.27
133 0.28
134 0.27
135 0.26
136 0.22
137 0.16
138 0.14
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.12
143 0.13
144 0.13
145 0.13
146 0.15
147 0.17
148 0.17
149 0.16
150 0.15
151 0.17
152 0.17
153 0.2
154 0.18
155 0.18
156 0.19
157 0.19
158 0.19
159 0.16
160 0.14
161 0.13
162 0.14
163 0.12
164 0.13
165 0.13
166 0.13
167 0.15
168 0.17
169 0.25
170 0.26
171 0.29
172 0.32
173 0.42
174 0.45
175 0.45
176 0.42
177 0.43
178 0.51
179 0.54
180 0.51
181 0.44
182 0.4
183 0.4
184 0.42
185 0.33
186 0.24
187 0.2
188 0.2
189 0.19
190 0.19
191 0.22
192 0.26
193 0.31
194 0.31
195 0.28
196 0.28
197 0.28
198 0.32
199 0.29
200 0.25
201 0.2
202 0.2
203 0.21
204 0.2
205 0.23
206 0.18
207 0.17
208 0.16
209 0.15
210 0.15
211 0.16
212 0.15
213 0.1
214 0.14
215 0.14
216 0.15
217 0.21
218 0.24
219 0.28
220 0.32
221 0.38
222 0.39
223 0.45
224 0.52
225 0.54
226 0.59
227 0.6
228 0.59
229 0.56
230 0.53
231 0.49
232 0.41
233 0.33
234 0.25
235 0.2
236 0.16
237 0.15
238 0.13
239 0.18
240 0.21
241 0.27
242 0.32
243 0.34
244 0.38
245 0.42
246 0.51
247 0.51
248 0.55
249 0.52
250 0.54
251 0.55
252 0.53
253 0.48
254 0.39
255 0.34
256 0.29
257 0.25
258 0.19
259 0.16
260 0.14
261 0.16
262 0.15
263 0.13
264 0.1
265 0.1
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.07
270 0.09
271 0.14
272 0.22
273 0.29
274 0.3
275 0.35
276 0.38
277 0.43
278 0.44
279 0.41
280 0.37
281 0.32
282 0.37
283 0.32
284 0.31
285 0.26
286 0.22
287 0.2
288 0.17
289 0.16
290 0.11
291 0.1
292 0.1
293 0.11
294 0.13
295 0.14
296 0.15
297 0.17
298 0.21
299 0.24
300 0.27
301 0.28
302 0.29
303 0.31
304 0.32
305 0.3
306 0.25
307 0.21
308 0.17
309 0.16
310 0.12
311 0.1
312 0.08
313 0.08
314 0.09
315 0.09
316 0.1
317 0.14
318 0.2
319 0.23
320 0.25
321 0.25
322 0.3
323 0.35
324 0.4
325 0.44
326 0.42
327 0.4
328 0.39
329 0.4
330 0.35
331 0.31
332 0.25
333 0.17
334 0.13
335 0.11
336 0.1
337 0.08
338 0.06
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.03
343 0.04
344 0.05
345 0.05
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.05
353 0.05
354 0.06
355 0.07
356 0.07
357 0.08
358 0.09
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.08
363 0.1
364 0.1
365 0.09
366 0.1
367 0.09
368 0.09
369 0.1
370 0.09
371 0.08
372 0.09
373 0.11
374 0.12
375 0.13
376 0.13
377 0.12
378 0.13
379 0.14
380 0.14
381 0.13
382 0.13
383 0.13
384 0.16
385 0.17
386 0.17
387 0.16
388 0.15
389 0.14
390 0.15
391 0.17
392 0.18
393 0.2
394 0.2
395 0.22
396 0.22
397 0.23
398 0.22
399 0.18
400 0.14
401 0.11
402 0.11
403 0.09
404 0.08
405 0.07
406 0.05
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.07
413 0.07
414 0.08
415 0.11
416 0.11
417 0.14
418 0.17
419 0.18
420 0.18
421 0.18
422 0.19
423 0.17
424 0.17
425 0.14
426 0.11
427 0.11
428 0.13
429 0.14
430 0.18
431 0.18
432 0.18
433 0.2
434 0.21
435 0.22
436 0.24
437 0.24
438 0.18
439 0.18
440 0.18
441 0.16
442 0.16
443 0.13
444 0.1
445 0.09
446 0.09
447 0.1
448 0.1
449 0.1
450 0.1
451 0.1
452 0.09
453 0.08
454 0.07
455 0.06
456 0.06
457 0.06
458 0.04
459 0.04
460 0.04
461 0.05
462 0.04
463 0.04
464 0.05
465 0.06
466 0.06
467 0.07
468 0.08
469 0.07
470 0.08
471 0.09
472 0.08
473 0.08
474 0.1
475 0.12
476 0.17
477 0.19
478 0.21
479 0.21
480 0.21
481 0.24
482 0.23
483 0.24
484 0.18
485 0.2
486 0.19
487 0.23
488 0.25
489 0.24
490 0.24
491 0.22
492 0.24
493 0.22
494 0.26
495 0.23
496 0.21
497 0.21
498 0.23
499 0.26
500 0.26
501 0.24
502 0.19
503 0.18
504 0.17
505 0.18
506 0.2
507 0.16
508 0.17
509 0.2
510 0.2
511 0.22
512 0.22
513 0.19
514 0.14
515 0.17
516 0.17
517 0.17
518 0.18
519 0.16
520 0.18
521 0.21
522 0.22
523 0.2
524 0.18
525 0.14
526 0.17
527 0.18
528 0.16
529 0.16
530 0.2
531 0.22
532 0.29
533 0.3
534 0.28
535 0.28
536 0.27
537 0.25
538 0.2
539 0.18
540 0.12
541 0.13
542 0.11
543 0.1
544 0.09
545 0.09
546 0.1
547 0.08
548 0.07
549 0.06
550 0.09
551 0.09
552 0.1
553 0.1
554 0.11
555 0.11
556 0.12
557 0.12
558 0.09
559 0.1
560 0.1
561 0.1
562 0.09
563 0.08
564 0.07
565 0.07
566 0.07
567 0.06
568 0.05
569 0.05
570 0.05
571 0.05
572 0.05
573 0.06
574 0.07
575 0.07
576 0.08
577 0.08
578 0.08
579 0.08
580 0.08
581 0.09
582 0.13
583 0.15
584 0.16
585 0.17
586 0.18
587 0.19
588 0.26
589 0.36
590 0.39
591 0.48
592 0.54
593 0.6
594 0.66
595 0.74
596 0.77
597 0.77
598 0.76
599 0.72
600 0.7
601 0.66
602 0.68
603 0.6
604 0.54
605 0.48
606 0.41
607 0.35
608 0.3
609 0.28
610 0.21
611 0.2
612 0.15
613 0.12
614 0.11
615 0.11
616 0.11
617 0.14
618 0.15
619 0.16
620 0.17
621 0.17
622 0.2
623 0.22
624 0.21
625 0.18
626 0.16
627 0.17
628 0.16
629 0.18
630 0.17
631 0.14
632 0.14
633 0.14
634 0.15
635 0.12
636 0.14
637 0.12
638 0.11
639 0.11
640 0.1
641 0.11
642 0.13
643 0.12
644 0.1
645 0.09
646 0.1
647 0.11
648 0.13
649 0.12
650 0.14
651 0.18
652 0.19
653 0.19
654 0.21
655 0.21
656 0.21
657 0.21
658 0.21
659 0.22
660 0.22
661 0.24
662 0.3
663 0.3
664 0.29
665 0.3
666 0.26
667 0.21
668 0.23
669 0.21
670 0.12
671 0.11
672 0.12
673 0.11
674 0.11
675 0.12
676 0.11
677 0.11
678 0.11
679 0.09
680 0.1
681 0.1
682 0.11
683 0.11
684 0.1
685 0.1
686 0.1
687 0.11
688 0.1
689 0.1
690 0.09
691 0.1
692 0.12
693 0.14
694 0.14
695 0.13
696 0.15
697 0.14
698 0.13
699 0.12
700 0.11
701 0.1
702 0.12
703 0.11
704 0.1
705 0.12
706 0.13
707 0.14
708 0.15
709 0.14
710 0.13
711 0.13
712 0.13
713 0.11
714 0.11
715 0.09
716 0.08
717 0.07
718 0.06
719 0.06
720 0.06
721 0.1
722 0.1
723 0.09
724 0.1
725 0.1
726 0.13
727 0.13
728 0.13
729 0.11
730 0.14
731 0.15
732 0.16
733 0.14
734 0.12
735 0.12
736 0.12
737 0.11
738 0.07
739 0.05
740 0.05
741 0.05
742 0.05
743 0.04
744 0.04
745 0.04
746 0.03
747 0.03
748 0.03
749 0.03
750 0.03
751 0.03
752 0.04
753 0.05
754 0.06
755 0.07
756 0.08
757 0.09
758 0.12
759 0.14
760 0.14
761 0.19
762 0.19
763 0.21
764 0.21
765 0.22
766 0.21
767 0.21
768 0.21
769 0.19
770 0.22
771 0.21
772 0.21
773 0.22
774 0.19
775 0.19
776 0.18
777 0.15
778 0.11
779 0.1
780 0.1
781 0.09
782 0.14
783 0.15
784 0.17
785 0.2
786 0.22
787 0.27
788 0.29
789 0.31
790 0.32
791 0.35
792 0.35
793 0.33
794 0.32
795 0.25
796 0.23
797 0.2
798 0.17
799 0.13
800 0.12
801 0.11
802 0.11
803 0.13
804 0.14
805 0.14
806 0.13
807 0.14
808 0.14
809 0.14
810 0.14
811 0.12
812 0.12
813 0.11
814 0.12
815 0.13
816 0.12
817 0.15
818 0.23
819 0.27
820 0.29
821 0.32
822 0.36
823 0.35
824 0.36
825 0.36
826 0.33
827 0.32
828 0.33
829 0.32
830 0.32
831 0.31
832 0.29
833 0.26
834 0.19
835 0.22
836 0.17
837 0.2
838 0.17
839 0.19
840 0.2
841 0.22
842 0.24
843 0.21
844 0.23
845 0.18
846 0.2
847 0.18
848 0.18
849 0.16
850 0.14
851 0.14
852 0.11
853 0.12
854 0.08
855 0.08
856 0.09
857 0.1
858 0.1
859 0.12
860 0.12
861 0.12
862 0.13
863 0.13
864 0.13
865 0.13
866 0.13
867 0.12
868 0.11
869 0.14
870 0.15
871 0.15
872 0.14
873 0.13
874 0.17
875 0.16
876 0.17
877 0.18
878 0.17
879 0.17
880 0.16
881 0.16
882 0.13
883 0.12
884 0.12
885 0.08
886 0.07
887 0.07
888 0.08
889 0.1
890 0.1
891 0.11
892 0.11
893 0.11
894 0.15
895 0.15
896 0.16
897 0.14
898 0.15
899 0.16
900 0.18
901 0.19
902 0.17
903 0.21
904 0.22
905 0.22
906 0.23
907 0.23
908 0.23
909 0.21
910 0.2
911 0.15
912 0.15
913 0.14
914 0.13
915 0.14
916 0.12
917 0.14
918 0.13
919 0.13
920 0.11
921 0.12
922 0.14
923 0.16
924 0.17
925 0.16
926 0.17
927 0.2
928 0.2
929 0.22
930 0.19
931 0.16
932 0.16
933 0.15
934 0.15
935 0.12
936 0.14
937 0.12
938 0.13
939 0.14
940 0.12
941 0.12
942 0.12
943 0.11
944 0.1
945 0.14
946 0.13
947 0.15
948 0.19
949 0.24
950 0.25
951 0.24
952 0.24
953 0.21
954 0.21
955 0.19
956 0.15
957 0.09
958 0.09
959 0.08
960 0.08
961 0.09
962 0.1
963 0.1
964 0.13
965 0.12
966 0.11
967 0.11
968 0.15
969 0.15
970 0.15
971 0.14
972 0.13
973 0.14
974 0.15
975 0.16
976 0.11
977 0.1
978 0.11
979 0.13
980 0.13
981 0.13
982 0.13
983 0.16
984 0.18
985 0.21
986 0.26
987 0.28
988 0.29
989 0.3
990 0.31
991 0.32
992 0.34
993 0.37
994 0.34
995 0.31
996 0.31
997 0.34
998 0.33
999 0.31
1000 0.28
1001 0.24
1002 0.25
1003 0.24
1004 0.23
1005 0.27
1006 0.27
1007 0.26
1008 0.27
1009 0.28
1010 0.26
1011 0.32
1012 0.31
1013 0.24
1014 0.24
1015 0.23
1016 0.21
1017 0.25
1018 0.27
1019 0.28
1020 0.33
1021 0.42
1022 0.45
1023 0.48
1024 0.5
1025 0.48
1026 0.48
1027 0.46
1028 0.47
1029 0.43
1030 0.42
1031 0.43
1032 0.44
1033 0.41
1034 0.37
1035 0.33
1036 0.26
1037 0.21
1038 0.19
1039 0.18
1040 0.13
1041 0.12
1042 0.13
1043 0.13
1044 0.13
1045 0.14
1046 0.15
1047 0.18
1048 0.21
1049 0.28
1050 0.3
1051 0.38
1052 0.44
1053 0.48
1054 0.49
1055 0.53
1056 0.57
1057 0.57
1058 0.55
1059 0.49
1060 0.42
1061 0.41
1062 0.4
1063 0.34
1064 0.28
1065 0.22
1066 0.21
1067 0.2
1068 0.2
1069 0.16
1070 0.12
1071 0.1
1072 0.09
1073 0.08
1074 0.08
1075 0.07
1076 0.08
1077 0.09
1078 0.1
1079 0.14
1080 0.14
1081 0.15
1082 0.16
1083 0.17
1084 0.17
1085 0.22
1086 0.22
1087 0.19
1088 0.19
1089 0.18
1090 0.17
1091 0.17
1092 0.18
1093 0.12
1094 0.11
1095 0.1
1096 0.08
1097 0.08
1098 0.08
1099 0.06
1100 0.05
1101 0.05