Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A421JST5

Protein Details
Accession A0A421JST5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-47TPVDNDKKQKHLKVDDSNKLTHydrophilic
417-436TERSKKPSLKEQPKGKTKPDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
419-435RSKKPSLKEQPKGKTKP
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 10.666, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011006  CheY-like_superfamily  
IPR033871  LSm5  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR001789  Sig_transdc_resp-reg_receiver  
IPR047575  Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0036180  P:filamentous growth of a population of unicellular organisms in response to biotic stimulus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0000160  P:phosphorelay signal transduction system  
GO:1900445  P:positive regulation of filamentous growth of a population of unicellular organisms in response to biotic stimulus  
GO:0006950  P:response to stress  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PF00072  Response_reg  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50110  RESPONSE_REGULATORY  
PS52002  SM  
CDD cd01732  LSm5  
cd17546  REC_hyHK_CKI1_RcsC-like  
Amino Acid Sequences MNQYPNPDTAISTGLIKNSSTNKLTGTPVDNDKKQKHLKVDDSNKLTISTSTESYIKPQLVQVPTSSGTAPATAPPQPVQAVVQQQNYPRRVWVKLPHGTPTTVLAYPQDIIDDLKTSIISKYPHGIANFSDVADIQLFIDQNFQQPNSPITKQQQQQQPSRYIKLEADKNVWSILDGYFPTGMTLHDALIIDVAHERPLSYTSQTQAHLQPQIQAREARFSEHSAFEPTYTPRDGQFLKLHNHNVKHPQPVNLKRSPSALYNPNQYYQPQQQLQAPMKYTNTTANNNRKNTAAYNNIRESSVSPSSITNHRRSYSNPVNSPLSTAVNVNTNSENNGEKENPKAVLLLPKNFTLAGAGTGTSGGTAGSTNSNSSNKKRNSSVYDNFGSENYKNDIKIKPLQETPETPKPKEKQQEVTERSKKPSLKEQPKGKTKPDAAKDKVLPSISVLIVEDNAINQAILGAFLRKRKIHYQIAKNGQEAIDKWRTGGFHLVLMDIQLPVKSGIEATKEIRHLEKLNKIGVFDSIVNNESMEILQDENKLDLNVFRSPVIIVALTASSNSSVDRKNALTAGCNDYLTKPVNLVWLQDKITEWGCMQALIDFEGWKSRNVEVELPILPLEIIDKSVGNKVRVLMTSDKEFYGKLIGFDDYVNMVLEDVVEVGGDNINNEPGKKMLLNGGHVAMIIPDTV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.19
4 0.23
5 0.26
6 0.32
7 0.3
8 0.3
9 0.3
10 0.33
11 0.36
12 0.36
13 0.35
14 0.34
15 0.41
16 0.48
17 0.52
18 0.58
19 0.59
20 0.63
21 0.68
22 0.69
23 0.69
24 0.71
25 0.74
26 0.76
27 0.82
28 0.82
29 0.78
30 0.73
31 0.65
32 0.56
33 0.48
34 0.38
35 0.33
36 0.26
37 0.22
38 0.22
39 0.24
40 0.23
41 0.27
42 0.32
43 0.28
44 0.25
45 0.27
46 0.32
47 0.32
48 0.33
49 0.3
50 0.29
51 0.29
52 0.3
53 0.26
54 0.2
55 0.17
56 0.17
57 0.16
58 0.14
59 0.16
60 0.17
61 0.2
62 0.19
63 0.22
64 0.21
65 0.22
66 0.21
67 0.23
68 0.29
69 0.32
70 0.35
71 0.36
72 0.42
73 0.5
74 0.5
75 0.46
76 0.44
77 0.43
78 0.42
79 0.45
80 0.48
81 0.49
82 0.54
83 0.55
84 0.56
85 0.54
86 0.51
87 0.45
88 0.4
89 0.34
90 0.27
91 0.25
92 0.19
93 0.18
94 0.18
95 0.17
96 0.13
97 0.1
98 0.1
99 0.11
100 0.11
101 0.1
102 0.1
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.15
107 0.15
108 0.16
109 0.2
110 0.22
111 0.26
112 0.26
113 0.26
114 0.23
115 0.27
116 0.26
117 0.21
118 0.19
119 0.15
120 0.15
121 0.14
122 0.13
123 0.07
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.13
128 0.12
129 0.15
130 0.17
131 0.18
132 0.18
133 0.19
134 0.23
135 0.25
136 0.27
137 0.29
138 0.32
139 0.4
140 0.42
141 0.49
142 0.53
143 0.54
144 0.61
145 0.62
146 0.66
147 0.63
148 0.63
149 0.57
150 0.51
151 0.48
152 0.48
153 0.48
154 0.42
155 0.4
156 0.37
157 0.36
158 0.34
159 0.3
160 0.22
161 0.17
162 0.13
163 0.12
164 0.1
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.1
169 0.09
170 0.09
171 0.1
172 0.1
173 0.09
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.1
178 0.1
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.09
187 0.11
188 0.12
189 0.14
190 0.16
191 0.2
192 0.21
193 0.23
194 0.25
195 0.28
196 0.29
197 0.27
198 0.3
199 0.31
200 0.33
201 0.33
202 0.32
203 0.29
204 0.32
205 0.31
206 0.29
207 0.25
208 0.26
209 0.26
210 0.24
211 0.25
212 0.22
213 0.22
214 0.19
215 0.21
216 0.19
217 0.2
218 0.19
219 0.19
220 0.16
221 0.2
222 0.2
223 0.22
224 0.26
225 0.27
226 0.31
227 0.35
228 0.41
229 0.42
230 0.44
231 0.44
232 0.47
233 0.47
234 0.51
235 0.49
236 0.49
237 0.54
238 0.6
239 0.62
240 0.59
241 0.57
242 0.49
243 0.5
244 0.44
245 0.38
246 0.34
247 0.34
248 0.31
249 0.36
250 0.37
251 0.36
252 0.35
253 0.32
254 0.32
255 0.31
256 0.35
257 0.29
258 0.3
259 0.31
260 0.37
261 0.41
262 0.38
263 0.35
264 0.29
265 0.29
266 0.27
267 0.25
268 0.25
269 0.24
270 0.27
271 0.34
272 0.42
273 0.49
274 0.5
275 0.5
276 0.44
277 0.42
278 0.4
279 0.36
280 0.35
281 0.32
282 0.36
283 0.37
284 0.37
285 0.35
286 0.32
287 0.28
288 0.24
289 0.22
290 0.17
291 0.15
292 0.15
293 0.18
294 0.25
295 0.28
296 0.28
297 0.3
298 0.31
299 0.32
300 0.34
301 0.41
302 0.43
303 0.45
304 0.41
305 0.41
306 0.42
307 0.41
308 0.4
309 0.32
310 0.23
311 0.17
312 0.15
313 0.12
314 0.14
315 0.14
316 0.14
317 0.13
318 0.12
319 0.13
320 0.14
321 0.14
322 0.11
323 0.13
324 0.13
325 0.13
326 0.15
327 0.16
328 0.14
329 0.13
330 0.13
331 0.12
332 0.18
333 0.2
334 0.21
335 0.21
336 0.21
337 0.21
338 0.2
339 0.19
340 0.12
341 0.1
342 0.07
343 0.06
344 0.06
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.04
349 0.04
350 0.03
351 0.03
352 0.03
353 0.04
354 0.05
355 0.05
356 0.06
357 0.08
358 0.13
359 0.16
360 0.2
361 0.29
362 0.31
363 0.35
364 0.37
365 0.41
366 0.44
367 0.5
368 0.5
369 0.47
370 0.45
371 0.42
372 0.39
373 0.34
374 0.3
375 0.21
376 0.2
377 0.16
378 0.16
379 0.15
380 0.19
381 0.2
382 0.22
383 0.28
384 0.28
385 0.29
386 0.3
387 0.33
388 0.32
389 0.35
390 0.38
391 0.41
392 0.43
393 0.4
394 0.46
395 0.45
396 0.51
397 0.55
398 0.52
399 0.52
400 0.56
401 0.65
402 0.63
403 0.71
404 0.71
405 0.66
406 0.65
407 0.62
408 0.57
409 0.5
410 0.54
411 0.55
412 0.57
413 0.62
414 0.68
415 0.71
416 0.78
417 0.8
418 0.74
419 0.71
420 0.68
421 0.67
422 0.66
423 0.66
424 0.59
425 0.61
426 0.6
427 0.54
428 0.51
429 0.43
430 0.35
431 0.27
432 0.26
433 0.18
434 0.16
435 0.13
436 0.1
437 0.09
438 0.09
439 0.08
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.04
449 0.07
450 0.09
451 0.13
452 0.17
453 0.18
454 0.23
455 0.3
456 0.38
457 0.45
458 0.52
459 0.59
460 0.64
461 0.72
462 0.71
463 0.65
464 0.58
465 0.49
466 0.41
467 0.33
468 0.31
469 0.27
470 0.23
471 0.23
472 0.24
473 0.23
474 0.23
475 0.27
476 0.2
477 0.17
478 0.17
479 0.17
480 0.15
481 0.15
482 0.14
483 0.09
484 0.08
485 0.06
486 0.07
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.07
491 0.09
492 0.11
493 0.14
494 0.16
495 0.2
496 0.22
497 0.23
498 0.24
499 0.26
500 0.28
501 0.32
502 0.36
503 0.36
504 0.39
505 0.38
506 0.36
507 0.33
508 0.29
509 0.25
510 0.2
511 0.18
512 0.15
513 0.15
514 0.15
515 0.14
516 0.13
517 0.11
518 0.09
519 0.08
520 0.07
521 0.07
522 0.09
523 0.11
524 0.11
525 0.12
526 0.12
527 0.12
528 0.11
529 0.12
530 0.14
531 0.15
532 0.15
533 0.15
534 0.15
535 0.15
536 0.15
537 0.14
538 0.11
539 0.08
540 0.08
541 0.08
542 0.07
543 0.07
544 0.07
545 0.07
546 0.07
547 0.08
548 0.11
549 0.13
550 0.15
551 0.19
552 0.19
553 0.21
554 0.23
555 0.23
556 0.24
557 0.26
558 0.3
559 0.28
560 0.27
561 0.26
562 0.24
563 0.28
564 0.26
565 0.22
566 0.17
567 0.16
568 0.22
569 0.22
570 0.24
571 0.23
572 0.25
573 0.25
574 0.26
575 0.26
576 0.22
577 0.23
578 0.22
579 0.18
580 0.18
581 0.17
582 0.15
583 0.15
584 0.13
585 0.12
586 0.12
587 0.13
588 0.1
589 0.1
590 0.17
591 0.17
592 0.19
593 0.21
594 0.21
595 0.25
596 0.28
597 0.31
598 0.27
599 0.3
600 0.28
601 0.26
602 0.25
603 0.19
604 0.16
605 0.12
606 0.12
607 0.08
608 0.08
609 0.08
610 0.09
611 0.1
612 0.18
613 0.23
614 0.23
615 0.24
616 0.25
617 0.29
618 0.3
619 0.33
620 0.33
621 0.32
622 0.37
623 0.37
624 0.36
625 0.32
626 0.3
627 0.26
628 0.26
629 0.23
630 0.18
631 0.18
632 0.18
633 0.18
634 0.18
635 0.19
636 0.13
637 0.13
638 0.12
639 0.1
640 0.09
641 0.08
642 0.08
643 0.07
644 0.06
645 0.05
646 0.04
647 0.04
648 0.05
649 0.07
650 0.07
651 0.07
652 0.08
653 0.12
654 0.14
655 0.14
656 0.15
657 0.15
658 0.18
659 0.18
660 0.19
661 0.23
662 0.26
663 0.29
664 0.3
665 0.31
666 0.27
667 0.26
668 0.25
669 0.17