Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VDR6

Protein Details
Accession A0A409VDR6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-24SQINPRPRTSKPRGICRYYDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045072  MKRN-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0000209  P:protein polyubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF13920  zf-C3HC4_3  
PF14608  zf-CCCH_2  
PF18345  zf_CCCH_4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
Amino Acid Sequences MDNVSQINPRPRTSKPRGICRYYDSPRGCFAGDHCKFLHGKPPEDPESTAPLLLSPYDQAKKCRYYIQGYCKRGDSCWFRHTSDDGPSSSQVSIESDDEDTCSICFEKATTFGLLGGCSHVFCISCIKQWRDPQNRPGGVLDSENTKKCPMCRTPSKFITPSSRFYKQGTEEKEKVVSAYKESMARVPCRYFQKSLQTKNKPSCPYGKDCFYQHRNADGTPHVFREGVDVAMRVSIGRAILCDLALICFKRYRNQTSRHRYLQDMFIPFSFEPSDIVDVMPSPFMGPDARQLSAVRRLRDVRDMLSDALHESASLENLQEAVEALRDNLGRLGDLNVNPETRRNVEGDDSEAARHEDEVMVHLEFMADQMLTALNALGVRDGGRGWGAESPMMDDSSDGAPSDTLHESGYTSASSVSSMPALQSVSNSPSEGSVSGDDSGDDSDIDVPVGDEATERREFLRPRESETSPVSETVSSSMPADNNETVSTGYCQPQSSSSDSAEMVEGRSNDGPPFVTDGRGRVVGTNENNNNHNEETKNEENGLNSEGWLGWFTSLF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.66
3 0.73
4 0.79
5 0.81
6 0.78
7 0.76
8 0.76
9 0.72
10 0.73
11 0.67
12 0.6
13 0.57
14 0.55
15 0.47
16 0.38
17 0.36
18 0.37
19 0.34
20 0.35
21 0.32
22 0.35
23 0.36
24 0.35
25 0.41
26 0.36
27 0.39
28 0.41
29 0.48
30 0.49
31 0.5
32 0.51
33 0.45
34 0.46
35 0.42
36 0.36
37 0.28
38 0.23
39 0.21
40 0.19
41 0.16
42 0.11
43 0.17
44 0.24
45 0.27
46 0.32
47 0.39
48 0.44
49 0.45
50 0.51
51 0.49
52 0.52
53 0.58
54 0.64
55 0.67
56 0.66
57 0.66
58 0.64
59 0.59
60 0.52
61 0.52
62 0.49
63 0.46
64 0.5
65 0.52
66 0.48
67 0.5
68 0.52
69 0.47
70 0.46
71 0.43
72 0.36
73 0.34
74 0.33
75 0.32
76 0.29
77 0.25
78 0.18
79 0.15
80 0.16
81 0.14
82 0.14
83 0.13
84 0.13
85 0.14
86 0.13
87 0.12
88 0.09
89 0.1
90 0.09
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.09
95 0.11
96 0.14
97 0.13
98 0.13
99 0.14
100 0.15
101 0.14
102 0.13
103 0.12
104 0.1
105 0.09
106 0.1
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.16
111 0.15
112 0.21
113 0.29
114 0.34
115 0.4
116 0.48
117 0.58
118 0.61
119 0.67
120 0.7
121 0.73
122 0.69
123 0.64
124 0.58
125 0.5
126 0.41
127 0.35
128 0.27
129 0.23
130 0.26
131 0.26
132 0.25
133 0.25
134 0.25
135 0.27
136 0.35
137 0.35
138 0.41
139 0.5
140 0.57
141 0.63
142 0.68
143 0.72
144 0.66
145 0.63
146 0.64
147 0.57
148 0.56
149 0.54
150 0.52
151 0.47
152 0.46
153 0.48
154 0.44
155 0.48
156 0.49
157 0.5
158 0.48
159 0.48
160 0.48
161 0.41
162 0.36
163 0.33
164 0.26
165 0.21
166 0.22
167 0.22
168 0.22
169 0.23
170 0.26
171 0.25
172 0.27
173 0.28
174 0.28
175 0.31
176 0.37
177 0.4
178 0.39
179 0.41
180 0.48
181 0.53
182 0.6
183 0.65
184 0.67
185 0.71
186 0.75
187 0.78
188 0.71
189 0.66
190 0.64
191 0.59
192 0.57
193 0.54
194 0.51
195 0.46
196 0.45
197 0.51
198 0.47
199 0.49
200 0.43
201 0.43
202 0.4
203 0.37
204 0.36
205 0.31
206 0.3
207 0.24
208 0.24
209 0.2
210 0.18
211 0.18
212 0.18
213 0.15
214 0.12
215 0.11
216 0.1
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.04
225 0.04
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.05
231 0.05
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.11
236 0.12
237 0.18
238 0.23
239 0.31
240 0.37
241 0.47
242 0.56
243 0.63
244 0.7
245 0.7
246 0.67
247 0.61
248 0.55
249 0.52
250 0.46
251 0.38
252 0.31
253 0.25
254 0.25
255 0.22
256 0.21
257 0.16
258 0.11
259 0.09
260 0.09
261 0.1
262 0.08
263 0.08
264 0.07
265 0.06
266 0.07
267 0.06
268 0.05
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.05
273 0.05
274 0.1
275 0.12
276 0.12
277 0.13
278 0.14
279 0.16
280 0.25
281 0.29
282 0.25
283 0.26
284 0.29
285 0.3
286 0.34
287 0.33
288 0.25
289 0.25
290 0.25
291 0.22
292 0.2
293 0.18
294 0.13
295 0.12
296 0.1
297 0.07
298 0.06
299 0.05
300 0.06
301 0.06
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.08
316 0.08
317 0.07
318 0.08
319 0.1
320 0.11
321 0.11
322 0.14
323 0.14
324 0.15
325 0.15
326 0.17
327 0.17
328 0.16
329 0.18
330 0.16
331 0.16
332 0.17
333 0.18
334 0.19
335 0.18
336 0.16
337 0.15
338 0.14
339 0.13
340 0.11
341 0.11
342 0.08
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.09
347 0.09
348 0.08
349 0.08
350 0.07
351 0.06
352 0.06
353 0.05
354 0.03
355 0.03
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.06
371 0.06
372 0.07
373 0.08
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.11
378 0.11
379 0.11
380 0.1
381 0.08
382 0.1
383 0.1
384 0.1
385 0.08
386 0.07
387 0.07
388 0.08
389 0.11
390 0.1
391 0.1
392 0.1
393 0.1
394 0.1
395 0.11
396 0.12
397 0.08
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.08
402 0.07
403 0.07
404 0.07
405 0.07
406 0.07
407 0.08
408 0.09
409 0.08
410 0.09
411 0.11
412 0.13
413 0.14
414 0.14
415 0.13
416 0.13
417 0.14
418 0.13
419 0.12
420 0.11
421 0.11
422 0.12
423 0.11
424 0.11
425 0.1
426 0.1
427 0.09
428 0.08
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.07
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.05
438 0.05
439 0.06
440 0.11
441 0.12
442 0.12
443 0.14
444 0.21
445 0.24
446 0.29
447 0.39
448 0.35
449 0.42
450 0.48
451 0.48
452 0.47
453 0.48
454 0.47
455 0.39
456 0.38
457 0.32
458 0.25
459 0.24
460 0.21
461 0.18
462 0.13
463 0.13
464 0.14
465 0.14
466 0.15
467 0.19
468 0.18
469 0.18
470 0.18
471 0.17
472 0.16
473 0.16
474 0.18
475 0.17
476 0.19
477 0.2
478 0.2
479 0.21
480 0.24
481 0.27
482 0.28
483 0.29
484 0.27
485 0.27
486 0.26
487 0.26
488 0.23
489 0.2
490 0.16
491 0.16
492 0.15
493 0.17
494 0.18
495 0.19
496 0.18
497 0.18
498 0.18
499 0.16
500 0.22
501 0.19
502 0.22
503 0.22
504 0.24
505 0.27
506 0.28
507 0.27
508 0.23
509 0.26
510 0.29
511 0.33
512 0.41
513 0.43
514 0.45
515 0.47
516 0.47
517 0.47
518 0.42
519 0.41
520 0.32
521 0.29
522 0.34
523 0.36
524 0.37
525 0.35
526 0.34
527 0.32
528 0.33
529 0.33
530 0.24
531 0.2
532 0.18
533 0.15
534 0.15
535 0.14
536 0.12