FuNGI

A0A409WQI6

Protein Details

Accession

A0A409WQI6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
438-464	IPRVNYSPRNNKRKKTRTRPQPALFRP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
449-454	KRKKTR

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto_nucl 12.5, cyto 7, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039659 SPT5
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II

Amino Acid Sequences

MMYDTRDFDFYGDLYWASRIDNTGVTFQTADHAYFMISGKPTGYDHVERSITIRTRQFISTSLMTAQDTPDSPPASTRFICIDEERCSQGFETIYPYLPLAASVAIQGQPMEDREKEVGMTDEVFFGDVHWEMDTTNIPPDYPPVVFLSGKPSSIEYEDNTIKFRISPSLSTICEEHEDDPGTRRASSLFVCKYPDQCPNHFMRSYPALRDSSMFLPQAVNRFLDLEAEVDVREEEEVEESDADADFLDDEYNLDVEDHSIYLPPQRLFPGDDDSASSFEEPRAKGVVTDGEAELDLGRDGTLGTILALEQERSLWRFQCSPKSQWATGHRLCSSLEGLDEFRDICINPCIPNWIYLDADMVPEVFKRVNATLGLYHNSQGVIMHAIDAKTWNDAVTTSPNRHLFRNCTWVRVRGGAYDGDVAFVCHVGEDVVDVLLIPRVNYSPRNNKRKKTRTRPQPALFRPEDYVHGRLQVSHRGERRYAVGVNEFEFGLLRKTVDTRSLSSEKIGMTSWQCGTFLSSGHPSLHKCAIPYLVGWNISEGDTVRHPHGIEAVVLKVEENVATLRSCEDGEEFVSAWNDVVKVCKVGDFIEVKSGQHTGRSGWVIAVFGDSGDTLMVLDIVSRNDDPVEFKIFSNWVILSSPPMNHVLQPSLLVKKLPKDVLPWINARVRVTKFRHAFRSRVGFIQGISFDSTTESITLQVVIDDSYDPNHPYPVVTLDFYDVVGAQSNAPLNRAFQPSRGIPSGTERNTVKTVAGTPTWNSHHGASMTSPAFNPHALTPIWNPSWENAPALNPYLSTETEAQSSPPSSSSLSSNPSPPAHPFLRKELIGIGLCASVNGGTYSNMKCVVNVREQNGRLSLYHHMKNVNRYLEPDWVKPTHPNPVKTTSRLVVISDNKPGTFVRPFRGYKPEKPPLMTVAIVEHTPGSVDKVIGDAIYSAEELCATFETRDDQALHRDMAKKLRDRAMFAPSQDNC

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.13
3	0.13
4	0.12
5	0.13
6	0.13
7	0.14
8	0.18
9	0.19
10	0.22
11	0.22
12	0.22
13	0.21
14	0.2
15	0.22
16	0.2
17	0.18
18	0.15
19	0.14
20	0.13
21	0.15
22	0.16
23	0.15
24	0.15
25	0.15
26	0.14
27	0.16
28	0.17
29	0.19
30	0.24
31	0.25
32	0.27
33	0.33
34	0.33
35	0.31
36	0.33
37	0.38
38	0.36
39	0.38
40	0.41
41	0.37
42	0.4
43	0.42
44	0.41
45	0.35
46	0.37
47	0.32
48	0.29
49	0.27
50	0.25
51	0.24
52	0.24
53	0.22
54	0.19
55	0.17
56	0.19
57	0.22
58	0.22
59	0.22
60	0.26
61	0.27
62	0.3
63	0.3
64	0.29
65	0.27
66	0.28
67	0.31
68	0.3
69	0.32
70	0.32
71	0.35
72	0.37
73	0.34
74	0.33
75	0.3
76	0.29
77	0.25
78	0.2
79	0.23
80	0.2
81	0.21
82	0.2
83	0.2
84	0.17
85	0.16
86	0.15
87	0.1
88	0.08
89	0.08
90	0.07
91	0.09
92	0.09
93	0.09
94	0.09
95	0.09
96	0.1
97	0.12
98	0.16
99	0.15
100	0.18
101	0.19
102	0.2
103	0.19
104	0.19
105	0.19
106	0.16
107	0.17
108	0.14
109	0.13
110	0.12
111	0.13
112	0.11
113	0.1
114	0.1
115	0.09
116	0.09
117	0.09
118	0.09
119	0.08
120	0.1
121	0.11
122	0.1
123	0.14
124	0.13
125	0.13
126	0.14
127	0.17
128	0.18
129	0.17
130	0.17
131	0.16
132	0.19
133	0.2
134	0.2
135	0.25
136	0.23
137	0.23
138	0.23
139	0.21
140	0.2
141	0.22
142	0.24
143	0.18
144	0.23
145	0.27
146	0.27
147	0.28
148	0.26
149	0.24
150	0.23
151	0.23
152	0.22
153	0.21
154	0.22
155	0.26
156	0.31
157	0.32
158	0.32
159	0.31
160	0.27
161	0.27
162	0.27
163	0.22
164	0.2
165	0.21
166	0.21
167	0.24
168	0.27
169	0.25
170	0.23
171	0.22
172	0.19
173	0.2
174	0.22
175	0.27
176	0.26
177	0.27
178	0.32
179	0.34
180	0.37
181	0.38
182	0.45
183	0.41
184	0.41
185	0.44
186	0.45
187	0.49
188	0.46
189	0.42
190	0.39
191	0.41
192	0.41
193	0.39
194	0.38
195	0.33
196	0.33
197	0.33
198	0.32
199	0.26
200	0.27
201	0.24
202	0.19
203	0.2
204	0.21
205	0.25
206	0.23
207	0.21
208	0.17
209	0.18
210	0.17
211	0.16
212	0.15
213	0.1
214	0.1
215	0.1
216	0.09
217	0.08
218	0.08
219	0.07
220	0.07
221	0.06
222	0.05
223	0.06
224	0.07
225	0.08
226	0.08
227	0.08
228	0.08
229	0.08
230	0.07
231	0.06
232	0.05
233	0.04
234	0.05
235	0.05
236	0.04
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.06
244	0.06
245	0.06
246	0.06
247	0.06
248	0.07
249	0.11
250	0.16
251	0.15
252	0.16
253	0.18
254	0.19
255	0.2
256	0.22
257	0.24
258	0.2
259	0.2
260	0.2
261	0.2
262	0.2
263	0.18
264	0.16
265	0.11
266	0.12
267	0.17
268	0.15
269	0.16
270	0.17
271	0.16
272	0.16
273	0.17
274	0.18
275	0.14
276	0.16
277	0.14
278	0.12
279	0.12
280	0.12
281	0.1
282	0.08
283	0.06
284	0.04
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.04
290	0.03
291	0.03
292	0.03
293	0.03
294	0.05
295	0.05
296	0.06
297	0.05
298	0.07
299	0.08
300	0.1
301	0.12
302	0.13
303	0.15
304	0.2
305	0.24
306	0.34
307	0.38
308	0.4
309	0.47
310	0.5
311	0.5
312	0.51
313	0.54
314	0.53
315	0.51
316	0.53
317	0.44
318	0.39
319	0.38
320	0.33
321	0.27
322	0.18
323	0.15
324	0.11
325	0.11
326	0.1
327	0.11
328	0.09
329	0.08
330	0.08
331	0.08
332	0.08
333	0.11
334	0.11
335	0.12
336	0.12
337	0.16
338	0.16
339	0.18
340	0.18
341	0.17
342	0.16
343	0.15
344	0.16
345	0.12
346	0.12
347	0.09
348	0.08
349	0.06
350	0.06
351	0.07
352	0.06
353	0.06
354	0.08
355	0.08
356	0.1
357	0.1
358	0.12
359	0.13
360	0.15
361	0.18
362	0.16
363	0.16
364	0.15
365	0.14
366	0.13
367	0.1
368	0.08
369	0.07
370	0.07
371	0.07
372	0.08
373	0.08
374	0.08
375	0.09
376	0.09
377	0.08
378	0.08
379	0.08
380	0.07
381	0.07
382	0.08
383	0.14
384	0.17
385	0.18
386	0.23
387	0.29
388	0.31
389	0.33
390	0.35
391	0.34
392	0.34
393	0.43
394	0.38
395	0.38
396	0.39
397	0.4
398	0.38
399	0.36
400	0.33
401	0.24
402	0.25
403	0.19
404	0.18
405	0.16
406	0.14
407	0.11
408	0.1
409	0.09
410	0.07
411	0.07
412	0.06
413	0.04
414	0.04
415	0.03
416	0.03
417	0.03
418	0.03
419	0.03
420	0.03
421	0.03
422	0.03
423	0.04
424	0.05
425	0.04
426	0.05
427	0.06
428	0.08
429	0.12
430	0.19
431	0.28
432	0.38
433	0.49
434	0.56
435	0.63
436	0.73
437	0.79
438	0.84
439	0.84
440	0.85
441	0.85
442	0.88
443	0.91
444	0.87
445	0.86
446	0.79
447	0.76
448	0.67
449	0.58
450	0.49
451	0.4
452	0.37
453	0.29
454	0.27
455	0.19
456	0.21
457	0.19
458	0.19
459	0.2
460	0.23
461	0.23
462	0.26
463	0.3
464	0.3
465	0.3
466	0.29
467	0.3
468	0.25
469	0.23
470	0.19
471	0.18
472	0.17
473	0.17
474	0.17
475	0.14
476	0.11
477	0.1
478	0.09
479	0.07
480	0.06
481	0.06
482	0.05
483	0.07
484	0.08
485	0.13
486	0.14
487	0.15
488	0.21
489	0.23
490	0.23
491	0.22
492	0.23
493	0.18
494	0.17
495	0.16
496	0.12
497	0.1
498	0.13
499	0.13
500	0.11
501	0.11
502	0.1
503	0.12
504	0.1
505	0.1
506	0.1
507	0.1
508	0.11
509	0.12
510	0.14
511	0.13
512	0.16
513	0.19
514	0.17
515	0.16
516	0.16
517	0.17
518	0.15
519	0.15
520	0.14
521	0.12
522	0.12
523	0.12
524	0.11
525	0.1
526	0.1
527	0.1
528	0.08
529	0.07
530	0.08
531	0.1
532	0.1
533	0.11
534	0.11
535	0.11
536	0.12
537	0.12
538	0.11
539	0.1
540	0.09
541	0.08
542	0.08
543	0.08
544	0.06
545	0.06
546	0.05
547	0.04
548	0.04
549	0.05
550	0.05
551	0.06
552	0.06
553	0.07
554	0.07
555	0.07
556	0.07
557	0.07
558	0.08
559	0.08
560	0.08
561	0.08
562	0.08
563	0.08
564	0.07
565	0.06
566	0.06
567	0.05
568	0.07
569	0.07
570	0.08
571	0.08
572	0.09
573	0.09
574	0.09
575	0.14
576	0.14
577	0.14
578	0.18
579	0.19
580	0.18
581	0.18
582	0.19
583	0.15
584	0.15
585	0.15
586	0.11
587	0.14
588	0.15
589	0.14
590	0.13
591	0.13
592	0.11
593	0.11
594	0.1
595	0.06
596	0.05
597	0.05
598	0.04
599	0.04
600	0.03
601	0.03
602	0.03
603	0.03
604	0.03
605	0.03
606	0.03
607	0.04
608	0.04
609	0.06
610	0.06
611	0.07
612	0.07
613	0.08
614	0.1
615	0.11
616	0.16
617	0.15
618	0.15
619	0.17
620	0.17
621	0.17
622	0.17
623	0.15
624	0.11
625	0.1
626	0.1
627	0.12
628	0.13
629	0.13
630	0.12
631	0.15
632	0.15
633	0.15
634	0.17
635	0.15
636	0.14
637	0.15
638	0.16
639	0.16
640	0.16
641	0.16
642	0.17
643	0.2
644	0.25
645	0.25
646	0.23
647	0.25
648	0.32
649	0.36
650	0.38
651	0.36
652	0.35
653	0.37
654	0.38
655	0.36
656	0.35
657	0.32
658	0.38
659	0.41
660	0.45
661	0.47
662	0.51
663	0.6
664	0.57
665	0.57
666	0.55
667	0.59
668	0.51
669	0.47
670	0.44
671	0.34
672	0.3
673	0.3
674	0.24
675	0.16
676	0.16
677	0.13
678	0.11
679	0.12
680	0.12
681	0.09
682	0.09
683	0.08
684	0.07
685	0.08
686	0.08
687	0.07
688	0.06
689	0.06
690	0.06
691	0.06
692	0.06
693	0.06
694	0.07
695	0.09
696	0.11
697	0.11
698	0.12
699	0.11
700	0.11
701	0.12
702	0.14
703	0.14
704	0.13
705	0.13
706	0.14
707	0.14
708	0.13
709	0.12
710	0.09
711	0.07
712	0.08
713	0.08
714	0.06
715	0.08
716	0.11
717	0.1
718	0.12
719	0.12
720	0.13
721	0.18
722	0.24
723	0.23
724	0.22
725	0.28
726	0.29
727	0.34
728	0.33
729	0.29
730	0.24
731	0.31
732	0.37
733	0.34
734	0.37
735	0.33
736	0.35
737	0.36
738	0.36
739	0.29
740	0.22
741	0.23
742	0.2
743	0.21
744	0.19
745	0.19
746	0.24
747	0.26
748	0.26
749	0.25
750	0.23
751	0.25
752	0.23
753	0.23
754	0.18
755	0.22
756	0.21
757	0.2
758	0.19
759	0.18
760	0.18
761	0.18
762	0.18
763	0.13
764	0.15
765	0.14
766	0.17
767	0.17
768	0.23
769	0.24
770	0.23
771	0.23
772	0.22
773	0.27
774	0.25
775	0.24
776	0.18
777	0.19
778	0.2
779	0.22
780	0.2
781	0.15
782	0.16
783	0.17
784	0.16
785	0.17
786	0.17
787	0.16
788	0.18
789	0.18
790	0.17
791	0.17
792	0.17
793	0.15
794	0.14
795	0.15
796	0.14
797	0.15
798	0.18
799	0.19
800	0.23
801	0.24
802	0.27
803	0.3
804	0.3
805	0.31
806	0.31
807	0.34
808	0.35
809	0.4
810	0.4
811	0.43
812	0.48
813	0.45
814	0.43
815	0.38
816	0.38
817	0.31
818	0.28
819	0.21
820	0.16
821	0.16
822	0.14
823	0.13
824	0.07
825	0.07
826	0.08
827	0.08
828	0.08
829	0.12
830	0.14
831	0.16
832	0.18
833	0.18
834	0.18
835	0.23
836	0.27
837	0.33
838	0.37
839	0.38
840	0.44
841	0.46
842	0.48
843	0.45
844	0.41
845	0.32
846	0.3
847	0.35
848	0.34
849	0.36
850	0.37
851	0.41
852	0.43
853	0.51
854	0.56
855	0.53
856	0.47
857	0.47
858	0.46
859	0.49
860	0.49
861	0.44
862	0.43
863	0.39
864	0.4
865	0.43
866	0.44
867	0.45
868	0.48
869	0.5
870	0.5
871	0.57
872	0.61
873	0.57
874	0.6
875	0.52
876	0.49
877	0.44
878	0.4
879	0.4
880	0.4
881	0.4
882	0.41
883	0.41
884	0.36
885	0.37
886	0.36
887	0.33
888	0.34
889	0.34
890	0.34
891	0.41
892	0.44
893	0.47
894	0.57
895	0.6
896	0.61
897	0.67
898	0.7
899	0.67
900	0.67
901	0.66
902	0.59
903	0.56
904	0.47
905	0.37
906	0.32
907	0.27
908	0.24
909	0.21
910	0.16
911	0.12
912	0.12
913	0.12
914	0.12
915	0.12
916	0.12
917	0.11
918	0.12
919	0.13
920	0.12
921	0.12
922	0.08
923	0.07
924	0.08
925	0.08
926	0.07
927	0.07
928	0.07
929	0.07
930	0.08
931	0.09
932	0.1
933	0.1
934	0.11
935	0.14
936	0.15
937	0.19
938	0.2
939	0.22
940	0.27
941	0.31
942	0.31
943	0.34
944	0.38
945	0.39
946	0.45
947	0.51
948	0.52
949	0.56
950	0.63
951	0.61
952	0.61
953	0.61
954	0.61
955	0.57
956	0.52

A0A409WQI6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer