Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409YYX6

Protein Details
Accession A0A409YYX6    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
410-443EDPPRKMAKWGWRKNQREQKARKKRHEIECEDDNBasic
556-580QDVIDRKKRGKGAPKKAKTKSALSHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
414-434RKMAKWGWRKNQREQKARKKR
561-575RKKRGKGAPKKAKTK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013219  Ribosomal_S27/S33_mit  
IPR001214  SET_dom  
IPR046341  SET_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08293  MRP-S33  
PF00856  SET  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50280  SET  
CDD cd20071  SET_SMYD  
Amino Acid Sequences MVGLEPQYNSSTTQPKISRTELKVDFAEGESSQSRKSWMISGRQHVIHTIHLSSPTGQDSTISCLIDPALIPLLPSPLPDPVQTYDGEPNFVIKQSPRIDINTMQNEEIGLGIYASRFIPAGTLIAREHPALIVPAGSFPTEAYEEMGNALPEKRRAEMLSMANCYRVKEPKEGEEVVGEVEGIVRTNALVLDLKTPVTSSRKRSRDEEDQIPLAKEVYGGVYPLINRCNHSCGPNAAVKWDLETLSLSLYALRDIEKDEEILKTYADPAHSREKRMQKLFNNYKFSCDCPWCEVQVDGKDQLTREEKIRASDELRDALGSWIFMHPTYKKWSDDLCASDDLVIRSHQEALSLLGVEGMHGLQLFFVEEIALCYAMLGDELQFKKWAAKTIQLSQVENKVTYKTFLTWLEDPPRKMAKWGWRKNQREQKARKKRHEIECEDDNVIAEGSMRFFLVYLCQIPTHSAHPRQFEFNKLISTAMASVSASRLAALTKLRCSIFQTSYNPQNLRTGAKYLRSRLRGPSMVAYYPDQFNIPKIIRQYPELEMVNEDEEERLQDVIDRKKRGKGAPKKAKTKSALSHLSYSDQSNFVAFQATSPLLVF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.42
3 0.47
4 0.52
5 0.56
6 0.53
7 0.61
8 0.56
9 0.57
10 0.52
11 0.47
12 0.42
13 0.33
14 0.32
15 0.22
16 0.23
17 0.21
18 0.22
19 0.21
20 0.2
21 0.21
22 0.21
23 0.22
24 0.25
25 0.29
26 0.38
27 0.45
28 0.51
29 0.56
30 0.56
31 0.55
32 0.52
33 0.47
34 0.42
35 0.37
36 0.31
37 0.26
38 0.26
39 0.27
40 0.24
41 0.25
42 0.22
43 0.2
44 0.17
45 0.17
46 0.16
47 0.21
48 0.23
49 0.21
50 0.18
51 0.18
52 0.19
53 0.18
54 0.17
55 0.12
56 0.11
57 0.1
58 0.11
59 0.11
60 0.14
61 0.12
62 0.13
63 0.13
64 0.15
65 0.16
66 0.17
67 0.2
68 0.2
69 0.22
70 0.21
71 0.23
72 0.27
73 0.26
74 0.27
75 0.23
76 0.23
77 0.22
78 0.22
79 0.22
80 0.16
81 0.23
82 0.25
83 0.29
84 0.29
85 0.31
86 0.35
87 0.37
88 0.45
89 0.45
90 0.43
91 0.39
92 0.36
93 0.33
94 0.29
95 0.23
96 0.15
97 0.07
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.05
106 0.06
107 0.06
108 0.08
109 0.08
110 0.1
111 0.1
112 0.13
113 0.14
114 0.14
115 0.14
116 0.12
117 0.12
118 0.11
119 0.1
120 0.08
121 0.07
122 0.08
123 0.08
124 0.09
125 0.08
126 0.07
127 0.09
128 0.1
129 0.1
130 0.11
131 0.1
132 0.1
133 0.11
134 0.12
135 0.1
136 0.1
137 0.12
138 0.13
139 0.17
140 0.18
141 0.18
142 0.2
143 0.21
144 0.23
145 0.27
146 0.31
147 0.32
148 0.34
149 0.33
150 0.35
151 0.35
152 0.33
153 0.31
154 0.31
155 0.3
156 0.34
157 0.36
158 0.37
159 0.43
160 0.42
161 0.38
162 0.32
163 0.29
164 0.22
165 0.18
166 0.13
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.06
178 0.07
179 0.09
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.13
185 0.19
186 0.24
187 0.3
188 0.39
189 0.46
190 0.5
191 0.54
192 0.58
193 0.61
194 0.62
195 0.6
196 0.55
197 0.51
198 0.49
199 0.45
200 0.38
201 0.28
202 0.21
203 0.14
204 0.1
205 0.08
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.09
212 0.12
213 0.12
214 0.14
215 0.15
216 0.21
217 0.21
218 0.23
219 0.23
220 0.22
221 0.24
222 0.26
223 0.24
224 0.2
225 0.2
226 0.17
227 0.16
228 0.16
229 0.12
230 0.09
231 0.1
232 0.09
233 0.08
234 0.08
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.07
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.1
247 0.1
248 0.11
249 0.11
250 0.1
251 0.08
252 0.1
253 0.1
254 0.11
255 0.11
256 0.13
257 0.23
258 0.25
259 0.28
260 0.34
261 0.41
262 0.48
263 0.53
264 0.57
265 0.52
266 0.61
267 0.69
268 0.69
269 0.69
270 0.61
271 0.6
272 0.53
273 0.5
274 0.43
275 0.35
276 0.29
277 0.25
278 0.26
279 0.22
280 0.22
281 0.21
282 0.2
283 0.2
284 0.21
285 0.18
286 0.17
287 0.17
288 0.16
289 0.19
290 0.18
291 0.16
292 0.16
293 0.2
294 0.2
295 0.22
296 0.23
297 0.21
298 0.2
299 0.22
300 0.22
301 0.18
302 0.17
303 0.15
304 0.14
305 0.12
306 0.11
307 0.07
308 0.07
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.08
313 0.08
314 0.11
315 0.17
316 0.19
317 0.2
318 0.22
319 0.23
320 0.24
321 0.26
322 0.26
323 0.23
324 0.2
325 0.19
326 0.18
327 0.18
328 0.16
329 0.14
330 0.12
331 0.1
332 0.1
333 0.11
334 0.1
335 0.09
336 0.09
337 0.09
338 0.09
339 0.08
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.06
344 0.06
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.03
350 0.03
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.03
355 0.03
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.03
365 0.04
366 0.09
367 0.1
368 0.11
369 0.12
370 0.12
371 0.17
372 0.19
373 0.24
374 0.2
375 0.27
376 0.3
377 0.36
378 0.43
379 0.41
380 0.41
381 0.37
382 0.41
383 0.35
384 0.32
385 0.27
386 0.21
387 0.19
388 0.19
389 0.18
390 0.14
391 0.17
392 0.18
393 0.22
394 0.21
395 0.26
396 0.34
397 0.37
398 0.36
399 0.38
400 0.41
401 0.36
402 0.36
403 0.38
404 0.39
405 0.46
406 0.55
407 0.6
408 0.66
409 0.72
410 0.8
411 0.85
412 0.84
413 0.84
414 0.85
415 0.85
416 0.87
417 0.91
418 0.9
419 0.91
420 0.9
421 0.9
422 0.9
423 0.86
424 0.81
425 0.75
426 0.68
427 0.58
428 0.49
429 0.38
430 0.28
431 0.21
432 0.14
433 0.1
434 0.06
435 0.06
436 0.07
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.07
442 0.09
443 0.1
444 0.11
445 0.12
446 0.12
447 0.14
448 0.16
449 0.2
450 0.25
451 0.31
452 0.35
453 0.4
454 0.42
455 0.48
456 0.48
457 0.48
458 0.46
459 0.4
460 0.38
461 0.32
462 0.3
463 0.22
464 0.21
465 0.17
466 0.12
467 0.1
468 0.08
469 0.08
470 0.09
471 0.09
472 0.08
473 0.07
474 0.07
475 0.07
476 0.1
477 0.15
478 0.17
479 0.19
480 0.24
481 0.24
482 0.25
483 0.29
484 0.33
485 0.33
486 0.36
487 0.4
488 0.42
489 0.5
490 0.56
491 0.52
492 0.47
493 0.48
494 0.43
495 0.42
496 0.38
497 0.36
498 0.33
499 0.41
500 0.45
501 0.48
502 0.55
503 0.55
504 0.56
505 0.58
506 0.62
507 0.57
508 0.54
509 0.53
510 0.48
511 0.45
512 0.44
513 0.39
514 0.34
515 0.32
516 0.29
517 0.24
518 0.2
519 0.2
520 0.25
521 0.24
522 0.25
523 0.28
524 0.35
525 0.35
526 0.38
527 0.4
528 0.36
529 0.41
530 0.39
531 0.35
532 0.3
533 0.29
534 0.27
535 0.23
536 0.2
537 0.14
538 0.13
539 0.13
540 0.12
541 0.1
542 0.09
543 0.13
544 0.2
545 0.3
546 0.37
547 0.43
548 0.46
549 0.53
550 0.61
551 0.66
552 0.7
553 0.7
554 0.74
555 0.78
556 0.85
557 0.88
558 0.88
559 0.88
560 0.83
561 0.82
562 0.78
563 0.77
564 0.76
565 0.69
566 0.68
567 0.6
568 0.58
569 0.51
570 0.46
571 0.39
572 0.31
573 0.27
574 0.23
575 0.21
576 0.17
577 0.19
578 0.15
579 0.13
580 0.17
581 0.17