Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409YA39

Protein Details
Accession A0A409YA39    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
158-177LAPLPPKPRRNKEKSVRGVSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
166-167RR
Subcellular Location(s) mito 10, nucl 9.5, cyto_nucl 7.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSNNHWQTQQSSTSSSTSTVTTIAIKSTSPEDIYEALKASNHFKLPSPPTNATFGDLAKFKDKNGKILRPSNRWLLFLSSATKALKSHSFVNTKGEAVALKSIGMSTLAGMLWGALGEEEKNQWTLAAQALNDLHAEVYPDYKFCPEKKHGGAQVTTLAPLPPKPRRNKEKSVRGVSVALSNASSDGSGSSMTTPTRADIQGPFAQPQQFSESQTPYASPLNTIVIGSSQLRSLLNAPTSPHFGFVEPTSSAPTQPFAGGLPSTSSNFNVEPYFYMNSTDWSSSHSPVSELFGTYPYDISFEPDLSVLEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.3
3 0.26
4 0.21
5 0.19
6 0.16
7 0.14
8 0.15
9 0.15
10 0.15
11 0.14
12 0.13
13 0.14
14 0.16
15 0.18
16 0.16
17 0.16
18 0.17
19 0.19
20 0.2
21 0.19
22 0.17
23 0.15
24 0.16
25 0.17
26 0.19
27 0.22
28 0.23
29 0.23
30 0.25
31 0.33
32 0.39
33 0.45
34 0.48
35 0.48
36 0.48
37 0.51
38 0.49
39 0.43
40 0.36
41 0.29
42 0.25
43 0.23
44 0.23
45 0.24
46 0.24
47 0.23
48 0.31
49 0.32
50 0.39
51 0.46
52 0.51
53 0.53
54 0.62
55 0.69
56 0.66
57 0.69
58 0.69
59 0.62
60 0.55
61 0.48
62 0.43
63 0.37
64 0.32
65 0.31
66 0.22
67 0.23
68 0.22
69 0.21
70 0.17
71 0.18
72 0.21
73 0.21
74 0.25
75 0.29
76 0.32
77 0.32
78 0.37
79 0.36
80 0.31
81 0.29
82 0.24
83 0.17
84 0.14
85 0.15
86 0.1
87 0.08
88 0.08
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.06
93 0.04
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.03
101 0.03
102 0.02
103 0.03
104 0.03
105 0.04
106 0.05
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.07
113 0.08
114 0.09
115 0.08
116 0.09
117 0.09
118 0.1
119 0.1
120 0.09
121 0.07
122 0.05
123 0.07
124 0.05
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.1
130 0.13
131 0.13
132 0.2
133 0.22
134 0.29
135 0.32
136 0.38
137 0.39
138 0.39
139 0.38
140 0.32
141 0.32
142 0.25
143 0.22
144 0.16
145 0.12
146 0.09
147 0.11
148 0.16
149 0.21
150 0.29
151 0.37
152 0.47
153 0.57
154 0.65
155 0.73
156 0.77
157 0.8
158 0.81
159 0.8
160 0.71
161 0.63
162 0.56
163 0.46
164 0.38
165 0.28
166 0.19
167 0.12
168 0.1
169 0.09
170 0.08
171 0.07
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.11
184 0.11
185 0.12
186 0.12
187 0.17
188 0.21
189 0.22
190 0.22
191 0.22
192 0.24
193 0.22
194 0.23
195 0.23
196 0.2
197 0.23
198 0.25
199 0.25
200 0.24
201 0.25
202 0.23
203 0.2
204 0.21
205 0.18
206 0.15
207 0.14
208 0.14
209 0.14
210 0.13
211 0.11
212 0.08
213 0.1
214 0.1
215 0.09
216 0.08
217 0.09
218 0.09
219 0.1
220 0.12
221 0.14
222 0.15
223 0.16
224 0.18
225 0.19
226 0.24
227 0.23
228 0.23
229 0.2
230 0.19
231 0.2
232 0.19
233 0.2
234 0.16
235 0.16
236 0.18
237 0.18
238 0.18
239 0.17
240 0.17
241 0.15
242 0.14
243 0.14
244 0.1
245 0.12
246 0.11
247 0.11
248 0.12
249 0.13
250 0.15
251 0.16
252 0.16
253 0.17
254 0.17
255 0.19
256 0.17
257 0.16
258 0.16
259 0.18
260 0.2
261 0.17
262 0.2
263 0.19
264 0.21
265 0.23
266 0.23
267 0.19
268 0.22
269 0.25
270 0.24
271 0.26
272 0.23
273 0.21
274 0.21
275 0.26
276 0.22
277 0.2
278 0.19
279 0.18
280 0.2
281 0.19
282 0.19
283 0.14
284 0.15
285 0.14
286 0.18
287 0.18
288 0.16
289 0.16
290 0.16