Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VRW7

Protein Details
Accession A0A409VRW7    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MPSKSTTKSATKTKEKKSTSTHydrophilic
30-50AEPSKPAKSLKRKKDAEPAVDHydrophilic
57-79EEPSKATKKAKKDVQEKPKSAKAHydrophilic
90-113VEEPAKPSKPSKKADKKKTESVAAHydrophilic
374-398EDEQKKAERRLLKRQEQRKKKLAEMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
34-48KPAKSLKRKKDAEPA
53-81KKDTEEPSKATKKAKKDVQEKPKSAKAPK
94-146AKPSKPSKKADKKKTESVAAPEPAASPAKDEAPSKPSKKEKSASKPSSSAPAP
150-176ISKENTQKPKPSKKASSSAAPKKKSKA
377-394QKKAERRLLKRQEQRKKK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 10, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MPSKSTTKSATKTKEKKSTSTPIVETPAAAEPSKPAKSLKRKKDAEPAVDSDKKDTEEPSKATKKAKKDVQEKPKSAKAPKAVEETEMEVEEPAKPSKPSKKADKKKTESVAAPEPAASPAKDEAPSKPSKKEKSASKPSSSAPAPLVSISKENTQKPKPSKKASSSAAPKKKSKAPTPQPEESDDEEEEKPEQEGEDASEDEEDEGHLHGFSTDEDSSDDDAMDDEPTEFDMGKLPTIAKDDATVKKKLEKAKKLHSEDRGVLYLGRIPHGFYEEQMKAYFSQFGDVTRIRLSRNKKTGRSKHYGFIEFESAAVAKIVAETMDNYLMMGHILRCKLIPKDEVHPELWVGANRKWRVVPQDQVARAAHNKPRTEDEQKKAERRLLKRQEQRKKKLAEMGIKYNFDAVGYVWFFHPSSIFKWLTFNFQENRTDSSLETTLLYIISTAPQKQSLFCLF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.8
3 0.8
4 0.79
5 0.79
6 0.76
7 0.74
8 0.67
9 0.62
10 0.62
11 0.55
12 0.46
13 0.38
14 0.35
15 0.29
16 0.26
17 0.21
18 0.21
19 0.28
20 0.3
21 0.29
22 0.29
23 0.37
24 0.49
25 0.59
26 0.65
27 0.69
28 0.73
29 0.78
30 0.84
31 0.82
32 0.79
33 0.75
34 0.7
35 0.68
36 0.67
37 0.6
38 0.53
39 0.47
40 0.41
41 0.36
42 0.34
43 0.32
44 0.34
45 0.37
46 0.43
47 0.48
48 0.51
49 0.59
50 0.62
51 0.64
52 0.67
53 0.71
54 0.72
55 0.74
56 0.8
57 0.81
58 0.85
59 0.83
60 0.8
61 0.79
62 0.77
63 0.72
64 0.7
65 0.67
66 0.64
67 0.63
68 0.63
69 0.56
70 0.51
71 0.47
72 0.42
73 0.36
74 0.28
75 0.23
76 0.16
77 0.16
78 0.15
79 0.15
80 0.13
81 0.14
82 0.15
83 0.23
84 0.32
85 0.41
86 0.47
87 0.56
88 0.66
89 0.74
90 0.84
91 0.87
92 0.85
93 0.86
94 0.84
95 0.8
96 0.72
97 0.68
98 0.64
99 0.54
100 0.47
101 0.38
102 0.32
103 0.27
104 0.25
105 0.19
106 0.13
107 0.13
108 0.15
109 0.17
110 0.18
111 0.19
112 0.24
113 0.32
114 0.33
115 0.4
116 0.47
117 0.51
118 0.58
119 0.62
120 0.66
121 0.69
122 0.76
123 0.75
124 0.72
125 0.68
126 0.62
127 0.61
128 0.52
129 0.43
130 0.33
131 0.27
132 0.22
133 0.2
134 0.2
135 0.14
136 0.15
137 0.14
138 0.19
139 0.23
140 0.27
141 0.34
142 0.39
143 0.46
144 0.54
145 0.63
146 0.66
147 0.7
148 0.74
149 0.72
150 0.75
151 0.71
152 0.7
153 0.7
154 0.71
155 0.71
156 0.68
157 0.66
158 0.63
159 0.66
160 0.64
161 0.63
162 0.63
163 0.65
164 0.7
165 0.73
166 0.73
167 0.69
168 0.64
169 0.6
170 0.52
171 0.45
172 0.34
173 0.3
174 0.24
175 0.23
176 0.2
177 0.16
178 0.13
179 0.1
180 0.09
181 0.06
182 0.06
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.08
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.05
213 0.04
214 0.04
215 0.05
216 0.05
217 0.04
218 0.04
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.09
225 0.11
226 0.12
227 0.09
228 0.1
229 0.15
230 0.21
231 0.25
232 0.26
233 0.24
234 0.29
235 0.34
236 0.4
237 0.45
238 0.48
239 0.51
240 0.59
241 0.68
242 0.7
243 0.72
244 0.69
245 0.64
246 0.58
247 0.53
248 0.44
249 0.35
250 0.28
251 0.21
252 0.19
253 0.14
254 0.13
255 0.1
256 0.09
257 0.09
258 0.12
259 0.12
260 0.1
261 0.16
262 0.15
263 0.17
264 0.17
265 0.17
266 0.15
267 0.16
268 0.19
269 0.12
270 0.13
271 0.12
272 0.13
273 0.17
274 0.16
275 0.17
276 0.17
277 0.18
278 0.18
279 0.25
280 0.31
281 0.36
282 0.46
283 0.52
284 0.58
285 0.68
286 0.76
287 0.78
288 0.8
289 0.73
290 0.7
291 0.69
292 0.65
293 0.55
294 0.48
295 0.43
296 0.34
297 0.3
298 0.24
299 0.17
300 0.12
301 0.1
302 0.08
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.05
309 0.06
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.09
319 0.1
320 0.1
321 0.11
322 0.15
323 0.18
324 0.21
325 0.25
326 0.25
327 0.32
328 0.39
329 0.42
330 0.39
331 0.37
332 0.32
333 0.28
334 0.27
335 0.24
336 0.2
337 0.21
338 0.28
339 0.29
340 0.31
341 0.31
342 0.33
343 0.37
344 0.4
345 0.43
346 0.43
347 0.51
348 0.49
349 0.53
350 0.49
351 0.45
352 0.43
353 0.43
354 0.42
355 0.4
356 0.42
357 0.4
358 0.46
359 0.5
360 0.56
361 0.58
362 0.58
363 0.62
364 0.67
365 0.71
366 0.7
367 0.69
368 0.68
369 0.66
370 0.71
371 0.71
372 0.73
373 0.76
374 0.82
375 0.86
376 0.88
377 0.9
378 0.88
379 0.84
380 0.8
381 0.79
382 0.76
383 0.75
384 0.71
385 0.71
386 0.69
387 0.64
388 0.57
389 0.5
390 0.41
391 0.31
392 0.25
393 0.15
394 0.15
395 0.14
396 0.15
397 0.14
398 0.16
399 0.16
400 0.16
401 0.18
402 0.14
403 0.16
404 0.23
405 0.24
406 0.23
407 0.29
408 0.3
409 0.36
410 0.36
411 0.4
412 0.37
413 0.4
414 0.46
415 0.42
416 0.46
417 0.41
418 0.39
419 0.33
420 0.34
421 0.31
422 0.25
423 0.23
424 0.19
425 0.17
426 0.15
427 0.14
428 0.09
429 0.08
430 0.12
431 0.14
432 0.17
433 0.19
434 0.24
435 0.25
436 0.26