FuNGI

A0A409WVC5

Protein Details

Accession

A0A409WVC5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
247-274	HSTNNSGKKGKKKTRDSKTKPKYHCENC	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
253-267	GKKGKKKTRDSKTKP

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 10, mito 5, cyto 2.5

Family & Domain DBs

Pfam	View protein in Pfam PF14223 Retrotran_gag_2

Amino Acid Sequences

MGPGKSDYSGFLKLKEDGTNWPAYKVEVLQHMYARGIDENLDNTAIKPEQLVAHNNKVYLATDTKHENPLDRERIKTLQAEHREYRKCEGIGTEILIATVPVSTFVQLRHYDTLAERWNALCTIYEHCGEDVSFDMWDRFHDLHFPGGSVQAFISEMSDMRDQLILNDADLSDKQFVAAIRRAFRQSEYNEFLASVCAGIRNAGKEITPNVLIQELKTEANSRHGASAIALNNKKLTALASSGPGSHSTNNSGKKGKKKTRDSKTKPKYHCENCGLDGHSIEWCWGPGGEIYDSSPQWWQDKQAELSKKNHTANTAETESSNRKPDHVALLANHTSPTSITDTTTHTTTTQDNTLTILISQLIKMLGEGATPLTESADAKPKHIALATHKLPCISDVKPLTAPSYALQSSSPYLGAVLDSDHFTPCRDALTNFTPFKETTHVADGRIVDALGKGDLTISVPCGNLTPTKVTLSNVYYVPSFSFTLVSIACILFHSNCQVIFKKTPHPTALLITESNVVFGRVPLSRGLFRYGPRPHIASDDEVEDQLLQEEEDLPNDLQSQHPQPNHDHEEQPQPPSAPPKPRRIMGLDVPDDVDIHAPRTTCTRSNSVTMPGFYKEKNQEARGSSSVVLLESQIGSLIATHNEIRDQYGEDFTDIDEASMCV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.36
3	0.33
4	0.31
5	0.35
6	0.41
7	0.39
8	0.38
9	0.35
10	0.32
11	0.33
12	0.28
13	0.27
14	0.26
15	0.29
16	0.3
17	0.32
18	0.32
19	0.3
20	0.28
21	0.26
22	0.2
23	0.17
24	0.15
25	0.15
26	0.16
27	0.16
28	0.17
29	0.15
30	0.14
31	0.19
32	0.17
33	0.16
34	0.15
35	0.15
36	0.19
37	0.22
38	0.3
39	0.32
40	0.41
41	0.42
42	0.42
43	0.4
44	0.37
45	0.34
46	0.3
47	0.27
48	0.19
49	0.21
50	0.27
51	0.3
52	0.35
53	0.35
54	0.35
55	0.38
56	0.47
57	0.53
58	0.5
59	0.5
60	0.49
61	0.51
62	0.5
63	0.48
64	0.45
65	0.45
66	0.5
67	0.55
68	0.57
69	0.62
70	0.66
71	0.64
72	0.63
73	0.6
74	0.52
75	0.46
76	0.42
77	0.37
78	0.32
79	0.3
80	0.26
81	0.19
82	0.19
83	0.16
84	0.14
85	0.09
86	0.07
87	0.05
88	0.06
89	0.06
90	0.07
91	0.09
92	0.1
93	0.16
94	0.17
95	0.22
96	0.23
97	0.23
98	0.25
99	0.25
100	0.31
101	0.31
102	0.3
103	0.26
104	0.24
105	0.25
106	0.23
107	0.22
108	0.17
109	0.13
110	0.16
111	0.18
112	0.19
113	0.18
114	0.18
115	0.18
116	0.16
117	0.16
118	0.13
119	0.11
120	0.1
121	0.09
122	0.1
123	0.09
124	0.1
125	0.13
126	0.12
127	0.12
128	0.16
129	0.17
130	0.2
131	0.2
132	0.2
133	0.17
134	0.19
135	0.18
136	0.14
137	0.13
138	0.09
139	0.09
140	0.09
141	0.09
142	0.07
143	0.07
144	0.09
145	0.11
146	0.1
147	0.11
148	0.12
149	0.11
150	0.11
151	0.16
152	0.13
153	0.12
154	0.13
155	0.12
156	0.12
157	0.12
158	0.14
159	0.1
160	0.1
161	0.09
162	0.11
163	0.12
164	0.15
165	0.2
166	0.22
167	0.24
168	0.28
169	0.3
170	0.29
171	0.31
172	0.33
173	0.32
174	0.36
175	0.37
176	0.35
177	0.33
178	0.32
179	0.29
180	0.23
181	0.19
182	0.11
183	0.06
184	0.06
185	0.06
186	0.07
187	0.08
188	0.09
189	0.1
190	0.11
191	0.11
192	0.12
193	0.13
194	0.15
195	0.15
196	0.13
197	0.13
198	0.15
199	0.15
200	0.13
201	0.14
202	0.13
203	0.12
204	0.13
205	0.15
206	0.13
207	0.19
208	0.21
209	0.19
210	0.18
211	0.18
212	0.17
213	0.15
214	0.2
215	0.17
216	0.23
217	0.23
218	0.23
219	0.23
220	0.23
221	0.22
222	0.17
223	0.14
224	0.09
225	0.1
226	0.1
227	0.12
228	0.12
229	0.13
230	0.13
231	0.14
232	0.14
233	0.14
234	0.14
235	0.17
236	0.23
237	0.27
238	0.3
239	0.34
240	0.38
241	0.46
242	0.56
243	0.6
244	0.64
245	0.71
246	0.77
247	0.82
248	0.88
249	0.88
250	0.89
251	0.9
252	0.9
253	0.84
254	0.83
255	0.82
256	0.77
257	0.77
258	0.71
259	0.64
260	0.56
261	0.54
262	0.47
263	0.37
264	0.31
265	0.22
266	0.17
267	0.14
268	0.12
269	0.08
270	0.06
271	0.06
272	0.05
273	0.05
274	0.06
275	0.08
276	0.07
277	0.07
278	0.09
279	0.11
280	0.11
281	0.11
282	0.12
283	0.11
284	0.13
285	0.13
286	0.16
287	0.17
288	0.2
289	0.23
290	0.28
291	0.34
292	0.36
293	0.4
294	0.43
295	0.46
296	0.45
297	0.43
298	0.38
299	0.33
300	0.32
301	0.32
302	0.28
303	0.21
304	0.19
305	0.21
306	0.23
307	0.23
308	0.26
309	0.21
310	0.2
311	0.21
312	0.22
313	0.23
314	0.21
315	0.2
316	0.16
317	0.21
318	0.21
319	0.19
320	0.18
321	0.13
322	0.12
323	0.1
324	0.12
325	0.09
326	0.09
327	0.09
328	0.11
329	0.14
330	0.15
331	0.16
332	0.14
333	0.12
334	0.13
335	0.14
336	0.14
337	0.13
338	0.12
339	0.12
340	0.12
341	0.12
342	0.1
343	0.09
344	0.07
345	0.06
346	0.06
347	0.06
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.05
363	0.07
364	0.15
365	0.16
366	0.17
367	0.18
368	0.18
369	0.19
370	0.19
371	0.2
372	0.17
373	0.26
374	0.29
375	0.3
376	0.31
377	0.3
378	0.29
379	0.28
380	0.26
381	0.17
382	0.2
383	0.18
384	0.2
385	0.22
386	0.22
387	0.22
388	0.19
389	0.19
390	0.13
391	0.16
392	0.14
393	0.13
394	0.13
395	0.12
396	0.13
397	0.13
398	0.12
399	0.07
400	0.07
401	0.07
402	0.07
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.06
407	0.07
408	0.08
409	0.08
410	0.09
411	0.1
412	0.09
413	0.1
414	0.11
415	0.11
416	0.15
417	0.2
418	0.27
419	0.26
420	0.27
421	0.27
422	0.26
423	0.27
424	0.26
425	0.22
426	0.18
427	0.24
428	0.25
429	0.23
430	0.26
431	0.24
432	0.21
433	0.19
434	0.16
435	0.1
436	0.09
437	0.09
438	0.06
439	0.05
440	0.05
441	0.04
442	0.05
443	0.06
444	0.05
445	0.07
446	0.08
447	0.08
448	0.08
449	0.09
450	0.1
451	0.11
452	0.13
453	0.14
454	0.14
455	0.17
456	0.18
457	0.18
458	0.21
459	0.21
460	0.22
461	0.19
462	0.19
463	0.17
464	0.16
465	0.16
466	0.15
467	0.13
468	0.11
469	0.11
470	0.1
471	0.12
472	0.11
473	0.11
474	0.1
475	0.09
476	0.09
477	0.08
478	0.1
479	0.08
480	0.09
481	0.11
482	0.11
483	0.11
484	0.15
485	0.18
486	0.21
487	0.26
488	0.29
489	0.36
490	0.41
491	0.46
492	0.44
493	0.45
494	0.42
495	0.39
496	0.39
497	0.32
498	0.26
499	0.22
500	0.22
501	0.19
502	0.18
503	0.15
504	0.13
505	0.1
506	0.1
507	0.12
508	0.1
509	0.11
510	0.13
511	0.16
512	0.19
513	0.2
514	0.25
515	0.25
516	0.26
517	0.34
518	0.37
519	0.39
520	0.39
521	0.4
522	0.36
523	0.38
524	0.39
525	0.32
526	0.29
527	0.26
528	0.24
529	0.22
530	0.21
531	0.16
532	0.14
533	0.11
534	0.09
535	0.06
536	0.06
537	0.08
538	0.08
539	0.09
540	0.11
541	0.1
542	0.11
543	0.12
544	0.12
545	0.13
546	0.18
547	0.23
548	0.28
549	0.3
550	0.33
551	0.37
552	0.45
553	0.5
554	0.5
555	0.47
556	0.43
557	0.51
558	0.51
559	0.5
560	0.44
561	0.38
562	0.37
563	0.42
564	0.46
565	0.46
566	0.5
567	0.58
568	0.61
569	0.62
570	0.64
571	0.61
572	0.61
573	0.58
574	0.6
575	0.52
576	0.47
577	0.45
578	0.4
579	0.35
580	0.28
581	0.23
582	0.14
583	0.14
584	0.15
585	0.14
586	0.15
587	0.21
588	0.25
589	0.27
590	0.31
591	0.36
592	0.37
593	0.42
594	0.44
595	0.45
596	0.44
597	0.41
598	0.39
599	0.36
600	0.36
601	0.33
602	0.39
603	0.38
604	0.43
605	0.49
606	0.5
607	0.53
608	0.54
609	0.59
610	0.52
611	0.48
612	0.4
613	0.34
614	0.3
615	0.24
616	0.2
617	0.14
618	0.14
619	0.11
620	0.1
621	0.09
622	0.08
623	0.07
624	0.08
625	0.09
626	0.08
627	0.11
628	0.12
629	0.13
630	0.16
631	0.16
632	0.18
633	0.18
634	0.21
635	0.21
636	0.24
637	0.24
638	0.22
639	0.22
640	0.19
641	0.21
642	0.17
643	0.15

A0A409WVC5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer