Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409V9B2

Protein Details
Accession A0A409V9B2    Localization Confidence Low Confidence Score 8.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
753-789WNEVLLDSTKRKRRKKMKKHKLKKRRRVSCLSGSSSEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
762-779KRKRRKKMKKHKLKKRRR
Subcellular Location(s) plas 17, cyto 4, nucl 2, E.R. 2, cyto_mito 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028606  Clp1  
IPR045116  Clp1/Grc3  
IPR010655  Clp1_C  
IPR038238  Clp1_C_sf  
IPR032324  Clp1_N  
IPR038239  Clp1_N_sf  
IPR032319  CLP1_P  
IPR013177  COX24_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005849  C:mRNA cleavage factor complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0051731  F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity  
GO:0031124  P:mRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF06807  Clp1  
PF16573  CLP1_N  
PF16575  CLP1_P  
PF08213  COX24_C  
Amino Acid Sequences MSEKKPVAETKTWDLGPENEYRFELDPGTSLAIKLIEGHAEIFGFELVEGKTYLFGYECKAAVFTWQGCVIEISEPSTEYISDETPMQVYGNLHIALEQKRVRALRQIRGSPVPNQDRASQDPPRVLILGPDDAGKTSLAKILVNYAVRAGQNWTPFLANVDPSHKGGWAAPGTVSVAPVSGPIPTASPANPLGSAASTAPMSLSANALLPLVYWYGHPDIKKNPLLMDRLIRNLGSNIMDRFDLDPEGRASGLIVDTPSAFASSSSSNEHRQKLIKACIDAFKINIIVVVGHEKLLVEMKRTYGSSLTVVKVPKSGGVVEVEDAYRRRVHNYQIHTYMYGQVLRPPPGIADGSLGGENVHDLVLSPLSTVINFGELQFYRIGSDTMAPSDVLPIGATRSVSEMQPVPVDPASPCSGLLNMVLALLSPQNPDENERYDEELLDLTVVGFLVVTSIDVAKKRLTVLAPNRGSFTGRAAILGSYEWGVRNCLLSVTCLTNDYNVERFSSGFLFPMSPLSRLAQLPASRRAYSSFFSSKSGGGRFVNSAKPTKGTVVTAKNNTKPDSPSDPKTDTISSASTAGDALRNPNTLSDAKSSTSGAAGQAGSISGAPSTTQPLNLADTFSSLSTPQEHNRQLAINPKDFKIHQFFSMHRPLLLINQPPSIFRPVPSNHPITSSLKPEAEEAIRQKYGLGGHSSELFIDADAEAARQLTRALTISKAGATMSWEATLKHLGLDVSKEADRVNLQEQFDKEWNEVLLDSTKRKRRKKMKKHKLKKRRRVSCLSGSSSEVL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.41
3 0.38
4 0.4
5 0.35
6 0.3
7 0.31
8 0.32
9 0.32
10 0.3
11 0.27
12 0.2
13 0.18
14 0.18
15 0.2
16 0.17
17 0.15
18 0.15
19 0.14
20 0.13
21 0.13
22 0.13
23 0.11
24 0.11
25 0.12
26 0.11
27 0.11
28 0.11
29 0.1
30 0.09
31 0.07
32 0.06
33 0.08
34 0.08
35 0.09
36 0.1
37 0.09
38 0.11
39 0.11
40 0.11
41 0.1
42 0.11
43 0.14
44 0.17
45 0.17
46 0.16
47 0.17
48 0.16
49 0.18
50 0.23
51 0.2
52 0.19
53 0.21
54 0.21
55 0.21
56 0.22
57 0.2
58 0.16
59 0.16
60 0.15
61 0.14
62 0.14
63 0.14
64 0.14
65 0.13
66 0.12
67 0.13
68 0.12
69 0.12
70 0.12
71 0.12
72 0.12
73 0.12
74 0.12
75 0.12
76 0.12
77 0.13
78 0.16
79 0.15
80 0.14
81 0.16
82 0.2
83 0.2
84 0.27
85 0.28
86 0.25
87 0.31
88 0.33
89 0.33
90 0.39
91 0.44
92 0.46
93 0.53
94 0.56
95 0.56
96 0.61
97 0.62
98 0.59
99 0.62
100 0.59
101 0.54
102 0.52
103 0.51
104 0.49
105 0.52
106 0.53
107 0.49
108 0.46
109 0.44
110 0.43
111 0.4
112 0.36
113 0.29
114 0.25
115 0.22
116 0.2
117 0.17
118 0.17
119 0.15
120 0.15
121 0.16
122 0.13
123 0.11
124 0.1
125 0.12
126 0.12
127 0.12
128 0.12
129 0.16
130 0.2
131 0.2
132 0.19
133 0.17
134 0.19
135 0.19
136 0.19
137 0.19
138 0.18
139 0.2
140 0.21
141 0.21
142 0.18
143 0.18
144 0.2
145 0.19
146 0.17
147 0.17
148 0.2
149 0.21
150 0.21
151 0.22
152 0.2
153 0.18
154 0.17
155 0.21
156 0.18
157 0.17
158 0.16
159 0.16
160 0.17
161 0.17
162 0.16
163 0.09
164 0.08
165 0.07
166 0.08
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.08
173 0.1
174 0.09
175 0.12
176 0.14
177 0.14
178 0.14
179 0.13
180 0.13
181 0.12
182 0.12
183 0.09
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.08
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.08
203 0.12
204 0.15
205 0.15
206 0.18
207 0.23
208 0.3
209 0.34
210 0.32
211 0.32
212 0.34
213 0.37
214 0.36
215 0.37
216 0.31
217 0.31
218 0.31
219 0.28
220 0.24
221 0.22
222 0.21
223 0.17
224 0.17
225 0.14
226 0.14
227 0.14
228 0.14
229 0.14
230 0.13
231 0.13
232 0.11
233 0.12
234 0.12
235 0.13
236 0.11
237 0.1
238 0.09
239 0.08
240 0.08
241 0.07
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.05
250 0.07
251 0.08
252 0.1
253 0.13
254 0.16
255 0.23
256 0.29
257 0.31
258 0.33
259 0.35
260 0.39
261 0.42
262 0.46
263 0.42
264 0.39
265 0.39
266 0.39
267 0.38
268 0.33
269 0.27
270 0.2
271 0.17
272 0.15
273 0.13
274 0.09
275 0.06
276 0.06
277 0.09
278 0.08
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.12
284 0.12
285 0.12
286 0.13
287 0.14
288 0.16
289 0.16
290 0.16
291 0.13
292 0.13
293 0.14
294 0.16
295 0.15
296 0.17
297 0.18
298 0.17
299 0.18
300 0.17
301 0.15
302 0.14
303 0.13
304 0.11
305 0.11
306 0.11
307 0.1
308 0.11
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.11
313 0.13
314 0.13
315 0.17
316 0.19
317 0.26
318 0.32
319 0.37
320 0.41
321 0.41
322 0.42
323 0.38
324 0.36
325 0.31
326 0.25
327 0.21
328 0.15
329 0.17
330 0.19
331 0.2
332 0.19
333 0.17
334 0.15
335 0.16
336 0.16
337 0.11
338 0.09
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.06
344 0.06
345 0.05
346 0.04
347 0.04
348 0.03
349 0.03
350 0.03
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.05
357 0.05
358 0.04
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.09
363 0.09
364 0.11
365 0.1
366 0.1
367 0.09
368 0.1
369 0.1
370 0.07
371 0.08
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.06
377 0.07
378 0.06
379 0.05
380 0.05
381 0.04
382 0.04
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.07
387 0.08
388 0.08
389 0.09
390 0.09
391 0.09
392 0.1
393 0.1
394 0.09
395 0.09
396 0.09
397 0.08
398 0.1
399 0.11
400 0.11
401 0.11
402 0.09
403 0.1
404 0.09
405 0.09
406 0.07
407 0.05
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.05
416 0.06
417 0.06
418 0.09
419 0.11
420 0.14
421 0.16
422 0.17
423 0.19
424 0.19
425 0.18
426 0.16
427 0.14
428 0.1
429 0.08
430 0.07
431 0.04
432 0.04
433 0.03
434 0.03
435 0.02
436 0.02
437 0.02
438 0.02
439 0.02
440 0.03
441 0.03
442 0.05
443 0.06
444 0.07
445 0.08
446 0.09
447 0.09
448 0.12
449 0.12
450 0.19
451 0.25
452 0.34
453 0.36
454 0.36
455 0.37
456 0.35
457 0.35
458 0.27
459 0.23
460 0.16
461 0.13
462 0.13
463 0.12
464 0.12
465 0.11
466 0.1
467 0.08
468 0.06
469 0.06
470 0.07
471 0.07
472 0.08
473 0.08
474 0.08
475 0.08
476 0.09
477 0.08
478 0.09
479 0.1
480 0.11
481 0.11
482 0.12
483 0.12
484 0.12
485 0.13
486 0.14
487 0.15
488 0.13
489 0.14
490 0.13
491 0.13
492 0.13
493 0.14
494 0.12
495 0.1
496 0.1
497 0.1
498 0.09
499 0.15
500 0.14
501 0.13
502 0.14
503 0.15
504 0.17
505 0.17
506 0.18
507 0.17
508 0.2
509 0.23
510 0.3
511 0.33
512 0.31
513 0.31
514 0.33
515 0.31
516 0.29
517 0.31
518 0.27
519 0.24
520 0.26
521 0.27
522 0.26
523 0.27
524 0.26
525 0.24
526 0.2
527 0.21
528 0.21
529 0.23
530 0.26
531 0.26
532 0.28
533 0.26
534 0.27
535 0.26
536 0.26
537 0.25
538 0.22
539 0.26
540 0.31
541 0.36
542 0.42
543 0.47
544 0.49
545 0.52
546 0.51
547 0.48
548 0.42
549 0.42
550 0.43
551 0.43
552 0.43
553 0.45
554 0.46
555 0.44
556 0.45
557 0.4
558 0.32
559 0.29
560 0.25
561 0.19
562 0.18
563 0.16
564 0.12
565 0.12
566 0.1
567 0.1
568 0.09
569 0.12
570 0.13
571 0.14
572 0.14
573 0.14
574 0.17
575 0.17
576 0.19
577 0.19
578 0.19
579 0.19
580 0.21
581 0.21
582 0.17
583 0.17
584 0.15
585 0.11
586 0.11
587 0.1
588 0.09
589 0.08
590 0.08
591 0.07
592 0.07
593 0.06
594 0.04
595 0.04
596 0.05
597 0.05
598 0.1
599 0.1
600 0.11
601 0.12
602 0.13
603 0.17
604 0.17
605 0.18
606 0.13
607 0.14
608 0.15
609 0.13
610 0.13
611 0.1
612 0.11
613 0.13
614 0.17
615 0.2
616 0.28
617 0.3
618 0.31
619 0.33
620 0.34
621 0.32
622 0.38
623 0.4
624 0.38
625 0.39
626 0.38
627 0.4
628 0.39
629 0.43
630 0.41
631 0.38
632 0.35
633 0.36
634 0.38
635 0.41
636 0.49
637 0.43
638 0.35
639 0.34
640 0.3
641 0.32
642 0.36
643 0.34
644 0.27
645 0.31
646 0.31
647 0.32
648 0.34
649 0.35
650 0.3
651 0.25
652 0.31
653 0.29
654 0.37
655 0.42
656 0.43
657 0.37
658 0.39
659 0.43
660 0.4
661 0.41
662 0.39
663 0.37
664 0.34
665 0.34
666 0.31
667 0.32
668 0.29
669 0.31
670 0.29
671 0.32
672 0.31
673 0.3
674 0.29
675 0.27
676 0.27
677 0.25
678 0.24
679 0.19
680 0.2
681 0.22
682 0.22
683 0.19
684 0.18
685 0.14
686 0.1
687 0.1
688 0.08
689 0.08
690 0.08
691 0.08
692 0.07
693 0.07
694 0.07
695 0.06
696 0.07
697 0.07
698 0.09
699 0.11
700 0.12
701 0.13
702 0.15
703 0.16
704 0.16
705 0.16
706 0.14
707 0.13
708 0.14
709 0.15
710 0.14
711 0.15
712 0.15
713 0.15
714 0.17
715 0.2
716 0.17
717 0.14
718 0.15
719 0.14
720 0.15
721 0.17
722 0.17
723 0.18
724 0.19
725 0.19
726 0.17
727 0.2
728 0.2
729 0.21
730 0.25
731 0.27
732 0.28
733 0.33
734 0.35
735 0.38
736 0.41
737 0.4
738 0.34
739 0.31
740 0.3
741 0.25
742 0.24
743 0.2
744 0.22
745 0.23
746 0.3
747 0.37
748 0.46
749 0.55
750 0.64
751 0.72
752 0.77
753 0.85
754 0.89
755 0.91
756 0.93
757 0.95
758 0.97
759 0.97
760 0.97
761 0.97
762 0.97
763 0.97
764 0.96
765 0.94
766 0.93
767 0.91
768 0.9
769 0.88
770 0.83
771 0.75