Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409YHJ9

Protein Details
Accession A0A409YHJ9    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
129-148GVAPRAKMNQQRSRRFRSAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
973-974GR
Subcellular Location(s) mito 14.5, cyto_mito 8.5, extr 5, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MASLTRHIILLLCFVNRNLLQGVPALFRWLSKKYPKIILPVEEEEDEKYEAEDGEKITVPINMALPNPNGVEFDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPAPETEEEMMVEVFKYTERVVNMVRPRKLLFMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAKEKEEAKKESILLWEAMGKTVSEEEKNKKSWDSNAITPGTPFMDLLASSLRYWVVQKMNSDPGWRNIQVIISDAGVPGEGEHKIMDYIRRQRSNPGHDPNTRHVIYGLDADLIMLALATHEPHFRVLREDVFANDTSPSACRMCGQEGHYAAQCTGTKAEIQKKPPPEKKPFIFLDVSILREYLEVELDIPHLPFPFTLEQAIDDWILLIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDTLLKIWKQELPRMGGYMTNHGHLELSRAQIILEGLAQREDEIFRRRREAEERQDQNAKRRKLEQQQRENGFESGPSQTMALTTAPTAPSQKTAANGGSSAHPSLPQRPAYDFAAKADSIGLGAAPTAESIQMTPAAVQALAGSNRDVVANRRAIRMANMSAAEVLKAELAGLSPVKPSAKVTSPSAPAQEAEQLPVIPPNPLPTQDEDMDDVPGLGIRPDTSKVSANRSHSADTAEGLFNDDVHPMIEDDGIAGAKRKFEEGPGSEDADGEDDVVVVDDEPEESGDATTALALKVNPDGTVEQEDTIKLWEPGYKERYYRQKFGVELTDKEFRKEVTKHYVEGLCWVLHYYYQGTPSWQWYYPYHFAPFAADFEEIDKMDIKFDLGQPFKPFEQLMGVFPAARQADYLFHSLMTEEESPIIDFYPPTFEIDMNGKKMAWQGVALLPFIDEKRLLDAMAKEYPNITDDERRRNSWGDNVVFAAVDHPIYPFYEALYGKRKSQEPVPIDVNLSKGMSGSVLPNPECIPGSTYYCPLSEQGLPDIKNDQSLSVRYYFPKQLIPHRSVLLPGVKRPARVLTGEDLEVTRNGGRRGRGGWDRGGGPGRGGGMDRGMRNDPFHTRPNNYGSQSYGDRSRNGYQQNGYPRQSYATPTSYTSSYASQNEGRGSRGGYNNYAGGDSHSRGGYGGRGGYGAPPQNGYGGYRNDNNGYGRGGGYGGGGGGGGYGGYGRGGGNYGNYGGGGSSSYGGYGGYGGYGQQQQQQQNQPYAQRGRGSYNNAPRGGGRGW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.24
3 0.23
4 0.25
5 0.21
6 0.2
7 0.19
8 0.21
9 0.23
10 0.19
11 0.19
12 0.19
13 0.18
14 0.2
15 0.24
16 0.25
17 0.32
18 0.39
19 0.46
20 0.5
21 0.58
22 0.6
23 0.64
24 0.66
25 0.64
26 0.61
27 0.58
28 0.55
29 0.47
30 0.44
31 0.37
32 0.33
33 0.28
34 0.21
35 0.17
36 0.14
37 0.13
38 0.14
39 0.15
40 0.13
41 0.16
42 0.17
43 0.16
44 0.16
45 0.17
46 0.17
47 0.16
48 0.17
49 0.16
50 0.17
51 0.2
52 0.2
53 0.21
54 0.21
55 0.19
56 0.18
57 0.17
58 0.2
59 0.17
60 0.18
61 0.17
62 0.17
63 0.17
64 0.15
65 0.15
66 0.11
67 0.1
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.12
74 0.16
75 0.2
76 0.2
77 0.26
78 0.32
79 0.35
80 0.4
81 0.39
82 0.39
83 0.38
84 0.41
85 0.35
86 0.32
87 0.27
88 0.23
89 0.21
90 0.17
91 0.14
92 0.11
93 0.1
94 0.07
95 0.09
96 0.09
97 0.13
98 0.13
99 0.17
100 0.19
101 0.27
102 0.37
103 0.44
104 0.46
105 0.46
106 0.46
107 0.46
108 0.45
109 0.41
110 0.33
111 0.28
112 0.28
113 0.24
114 0.24
115 0.21
116 0.21
117 0.17
118 0.15
119 0.12
120 0.13
121 0.19
122 0.26
123 0.36
124 0.45
125 0.55
126 0.66
127 0.74
128 0.8
129 0.82
130 0.78
131 0.75
132 0.76
133 0.76
134 0.75
135 0.77
136 0.72
137 0.68
138 0.71
139 0.67
140 0.61
141 0.59
142 0.54
143 0.46
144 0.46
145 0.42
146 0.38
147 0.38
148 0.35
149 0.27
150 0.24
151 0.24
152 0.2
153 0.2
154 0.17
155 0.14
156 0.12
157 0.15
158 0.17
159 0.18
160 0.24
161 0.31
162 0.37
163 0.41
164 0.42
165 0.43
166 0.45
167 0.46
168 0.5
169 0.48
170 0.46
171 0.49
172 0.49
173 0.45
174 0.42
175 0.37
176 0.28
177 0.23
178 0.17
179 0.11
180 0.1
181 0.09
182 0.1
183 0.11
184 0.11
185 0.11
186 0.12
187 0.12
188 0.11
189 0.13
190 0.18
191 0.2
192 0.22
193 0.25
194 0.29
195 0.36
196 0.37
197 0.4
198 0.37
199 0.37
200 0.41
201 0.39
202 0.35
203 0.29
204 0.3
205 0.25
206 0.24
207 0.2
208 0.13
209 0.13
210 0.12
211 0.11
212 0.08
213 0.08
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.09
221 0.1
222 0.15
223 0.21
224 0.31
225 0.39
226 0.45
227 0.45
228 0.54
229 0.62
230 0.67
231 0.68
232 0.68
233 0.67
234 0.68
235 0.73
236 0.69
237 0.68
238 0.59
239 0.49
240 0.4
241 0.34
242 0.29
243 0.25
244 0.19
245 0.11
246 0.11
247 0.1
248 0.09
249 0.08
250 0.06
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.03
255 0.04
256 0.05
257 0.07
258 0.08
259 0.11
260 0.13
261 0.14
262 0.18
263 0.2
264 0.21
265 0.23
266 0.23
267 0.21
268 0.23
269 0.22
270 0.18
271 0.16
272 0.14
273 0.12
274 0.12
275 0.13
276 0.11
277 0.11
278 0.12
279 0.14
280 0.17
281 0.21
282 0.23
283 0.26
284 0.27
285 0.3
286 0.3
287 0.28
288 0.25
289 0.25
290 0.23
291 0.18
292 0.17
293 0.15
294 0.16
295 0.21
296 0.31
297 0.32
298 0.38
299 0.43
300 0.52
301 0.62
302 0.67
303 0.71
304 0.71
305 0.75
306 0.72
307 0.73
308 0.66
309 0.6
310 0.53
311 0.44
312 0.42
313 0.34
314 0.32
315 0.24
316 0.22
317 0.17
318 0.16
319 0.16
320 0.09
321 0.08
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.08
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.07
332 0.11
333 0.11
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.13
338 0.13
339 0.14
340 0.11
341 0.08
342 0.08
343 0.07
344 0.06
345 0.05
346 0.04
347 0.03
348 0.03
349 0.03
350 0.03
351 0.03
352 0.04
353 0.05
354 0.06
355 0.07
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.08
360 0.12
361 0.12
362 0.12
363 0.11
364 0.12
365 0.12
366 0.11
367 0.11
368 0.07
369 0.06
370 0.08
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.1
375 0.14
376 0.16
377 0.21
378 0.22
379 0.26
380 0.26
381 0.27
382 0.26
383 0.25
384 0.23
385 0.25
386 0.22
387 0.19
388 0.18
389 0.17
390 0.17
391 0.14
392 0.17
393 0.13
394 0.14
395 0.13
396 0.13
397 0.13
398 0.13
399 0.13
400 0.1
401 0.08
402 0.07
403 0.07
404 0.07
405 0.07
406 0.07
407 0.07
408 0.08
409 0.11
410 0.18
411 0.24
412 0.25
413 0.3
414 0.32
415 0.36
416 0.42
417 0.48
418 0.5
419 0.55
420 0.57
421 0.57
422 0.64
423 0.61
424 0.63
425 0.62
426 0.55
427 0.48
428 0.5
429 0.54
430 0.57
431 0.65
432 0.66
433 0.68
434 0.74
435 0.75
436 0.72
437 0.65
438 0.55
439 0.45
440 0.35
441 0.26
442 0.18
443 0.14
444 0.11
445 0.09
446 0.08
447 0.08
448 0.09
449 0.07
450 0.06
451 0.06
452 0.07
453 0.08
454 0.09
455 0.1
456 0.1
457 0.11
458 0.13
459 0.14
460 0.13
461 0.15
462 0.16
463 0.14
464 0.14
465 0.13
466 0.13
467 0.13
468 0.12
469 0.1
470 0.11
471 0.12
472 0.17
473 0.21
474 0.22
475 0.22
476 0.23
477 0.26
478 0.27
479 0.3
480 0.25
481 0.21
482 0.21
483 0.2
484 0.18
485 0.15
486 0.12
487 0.08
488 0.07
489 0.06
490 0.03
491 0.03
492 0.03
493 0.03
494 0.03
495 0.03
496 0.03
497 0.03
498 0.03
499 0.04
500 0.04
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.04
508 0.06
509 0.06
510 0.07
511 0.06
512 0.06
513 0.07
514 0.07
515 0.08
516 0.09
517 0.13
518 0.18
519 0.19
520 0.2
521 0.2
522 0.2
523 0.22
524 0.22
525 0.19
526 0.15
527 0.14
528 0.13
529 0.13
530 0.13
531 0.11
532 0.07
533 0.06
534 0.04
535 0.04
536 0.04
537 0.03
538 0.03
539 0.04
540 0.04
541 0.04
542 0.04
543 0.06
544 0.06
545 0.06
546 0.08
547 0.1
548 0.14
549 0.15
550 0.18
551 0.22
552 0.25
553 0.25
554 0.25
555 0.22
556 0.19
557 0.17
558 0.18
559 0.14
560 0.12
561 0.12
562 0.1
563 0.1
564 0.11
565 0.11
566 0.07
567 0.07
568 0.1
569 0.1
570 0.11
571 0.13
572 0.14
573 0.17
574 0.18
575 0.18
576 0.16
577 0.16
578 0.15
579 0.13
580 0.11
581 0.07
582 0.06
583 0.05
584 0.04
585 0.03
586 0.04
587 0.05
588 0.07
589 0.08
590 0.09
591 0.14
592 0.16
593 0.22
594 0.26
595 0.29
596 0.31
597 0.32
598 0.32
599 0.28
600 0.28
601 0.22
602 0.18
603 0.16
604 0.12
605 0.1
606 0.11
607 0.1
608 0.08
609 0.08
610 0.08
611 0.06
612 0.06
613 0.06
614 0.04
615 0.05
616 0.05
617 0.04
618 0.04
619 0.04
620 0.04
621 0.04
622 0.06
623 0.06
624 0.07
625 0.08
626 0.09
627 0.09
628 0.11
629 0.17
630 0.16
631 0.22
632 0.22
633 0.23
634 0.22
635 0.22
636 0.2
637 0.15
638 0.13
639 0.08
640 0.06
641 0.04
642 0.04
643 0.04
644 0.04
645 0.03
646 0.03
647 0.03
648 0.03
649 0.03
650 0.03
651 0.03
652 0.04
653 0.04
654 0.04
655 0.04
656 0.04
657 0.04
658 0.04
659 0.04
660 0.05
661 0.05
662 0.05
663 0.06
664 0.07
665 0.07
666 0.07
667 0.08
668 0.09
669 0.12
670 0.11
671 0.11
672 0.11
673 0.11
674 0.1
675 0.11
676 0.1
677 0.07
678 0.07
679 0.09
680 0.11
681 0.18
682 0.23
683 0.24
684 0.25
685 0.31
686 0.42
687 0.45
688 0.47
689 0.45
690 0.44
691 0.43
692 0.44
693 0.46
694 0.38
695 0.34
696 0.34
697 0.37
698 0.33
699 0.33
700 0.31
701 0.24
702 0.27
703 0.28
704 0.29
705 0.32
706 0.33
707 0.33
708 0.36
709 0.37
710 0.31
711 0.31
712 0.27
713 0.17
714 0.15
715 0.15
716 0.11
717 0.09
718 0.1
719 0.1
720 0.09
721 0.12
722 0.12
723 0.14
724 0.15
725 0.18
726 0.2
727 0.19
728 0.21
729 0.2
730 0.27
731 0.29
732 0.3
733 0.28
734 0.25
735 0.24
736 0.24
737 0.23
738 0.16
739 0.15
740 0.12
741 0.11
742 0.11
743 0.13
744 0.1
745 0.1
746 0.11
747 0.09
748 0.1
749 0.1
750 0.09
751 0.1
752 0.13
753 0.19
754 0.19
755 0.21
756 0.23
757 0.26
758 0.25
759 0.25
760 0.22
761 0.16
762 0.19
763 0.17
764 0.16
765 0.16
766 0.16
767 0.14
768 0.14
769 0.18
770 0.14
771 0.13
772 0.12
773 0.1
774 0.12
775 0.14
776 0.17
777 0.12
778 0.12
779 0.12
780 0.12
781 0.11
782 0.12
783 0.1
784 0.08
785 0.09
786 0.09
787 0.09
788 0.09
789 0.1
790 0.07
791 0.06
792 0.07
793 0.11
794 0.11
795 0.13
796 0.13
797 0.13
798 0.14
799 0.21
800 0.24
801 0.21
802 0.21
803 0.19
804 0.19
805 0.22
806 0.22
807 0.16
808 0.13
809 0.12
810 0.15
811 0.16
812 0.15
813 0.12
814 0.11
815 0.12
816 0.12
817 0.11
818 0.08
819 0.08
820 0.11
821 0.12
822 0.11
823 0.13
824 0.15
825 0.17
826 0.23
827 0.22
828 0.19
829 0.19
830 0.2
831 0.18
832 0.18
833 0.17
834 0.2
835 0.25
836 0.35
837 0.39
838 0.4
839 0.43
840 0.43
841 0.43
842 0.41
843 0.44
844 0.35
845 0.32
846 0.31
847 0.28
848 0.25
849 0.22
850 0.16
851 0.09
852 0.07
853 0.06
854 0.06
855 0.06
856 0.07
857 0.08
858 0.08
859 0.08
860 0.13
861 0.13
862 0.17
863 0.25
864 0.26
865 0.28
866 0.34
867 0.36
868 0.33
869 0.39
870 0.44
871 0.4
872 0.44
873 0.44
874 0.39
875 0.39
876 0.37
877 0.32
878 0.24
879 0.21
880 0.15
881 0.12
882 0.1
883 0.09
884 0.09
885 0.1
886 0.11
887 0.15
888 0.15
889 0.17
890 0.17
891 0.18
892 0.18
893 0.16
894 0.16
895 0.15
896 0.2
897 0.2
898 0.22
899 0.22
900 0.21
901 0.22
902 0.2
903 0.2
904 0.17
905 0.17
906 0.2
907 0.24
908 0.25
909 0.25
910 0.27
911 0.24
912 0.26
913 0.24
914 0.21
915 0.19
916 0.2
917 0.22
918 0.22
919 0.24
920 0.23
921 0.28
922 0.3
923 0.29
924 0.33
925 0.34
926 0.41
927 0.47
928 0.48
929 0.47
930 0.45
931 0.44
932 0.38
933 0.38
934 0.37
935 0.31
936 0.3
937 0.36
938 0.36
939 0.36
940 0.37
941 0.37
942 0.32
943 0.31
944 0.32
945 0.27
946 0.28
947 0.28
948 0.26
949 0.22
950 0.21
951 0.19
952 0.17
953 0.15
954 0.15
955 0.18
956 0.21
957 0.23
958 0.25
959 0.27
960 0.33
961 0.38
962 0.38
963 0.39
964 0.39
965 0.38
966 0.39
967 0.4
968 0.33
969 0.26
970 0.23
971 0.2
972 0.17
973 0.17
974 0.13
975 0.14
976 0.18
977 0.19
978 0.21
979 0.24
980 0.25
981 0.26
982 0.3
983 0.32
984 0.32
985 0.39
986 0.42
987 0.43
988 0.47
989 0.51
990 0.54
991 0.51
992 0.48
993 0.43
994 0.41
995 0.39
996 0.37
997 0.39
998 0.35
999 0.34
1000 0.38
1001 0.4
1002 0.42
1003 0.44
1004 0.46
1005 0.41
1006 0.45
1007 0.53
1008 0.56
1009 0.54
1010 0.49
1011 0.45
1012 0.43
1013 0.41
1014 0.39
1015 0.35
1016 0.31
1017 0.31
1018 0.31
1019 0.33
1020 0.31
1021 0.31
1022 0.28
1023 0.25
1024 0.25
1025 0.25
1026 0.27
1027 0.27
1028 0.3
1029 0.33
1030 0.32
1031 0.31
1032 0.28
1033 0.28
1034 0.3
1035 0.33
1036 0.34
1037 0.32
1038 0.33
1039 0.32
1040 0.31
1041 0.29
1042 0.23
1043 0.21
1044 0.22
1045 0.21
1046 0.21
1047 0.2
1048 0.19
1049 0.19
1050 0.2
1051 0.18
1052 0.16
1053 0.16
1054 0.13
1055 0.13
1056 0.14
1057 0.16
1058 0.21
1059 0.23
1060 0.21
1061 0.21
1062 0.22
1063 0.23
1064 0.24
1065 0.24
1066 0.25
1067 0.25
1068 0.28
1069 0.31
1070 0.34
1071 0.34
1072 0.37
1073 0.36
1074 0.32
1075 0.29
1076 0.26
1077 0.22
1078 0.19
1079 0.17
1080 0.14
1081 0.12
1082 0.1
1083 0.08
1084 0.06
1085 0.05
1086 0.04
1087 0.04
1088 0.03
1089 0.03
1090 0.03
1091 0.03
1092 0.03
1093 0.03
1094 0.04
1095 0.04
1096 0.05
1097 0.06
1098 0.07
1099 0.08
1100 0.1
1101 0.11
1102 0.1
1103 0.1
1104 0.1
1105 0.09
1106 0.09
1107 0.08
1108 0.07
1109 0.08
1110 0.07
1111 0.07
1112 0.07
1113 0.07
1114 0.07
1115 0.07
1116 0.06
1117 0.05
1118 0.05
1119 0.05
1120 0.1
1121 0.13
1122 0.15
1123 0.2
1124 0.27
1125 0.33
1126 0.41
1127 0.5
1128 0.53
1129 0.56
1130 0.6
1131 0.59
1132 0.62
1133 0.63
1134 0.6
1135 0.56
1136 0.53
1137 0.53
1138 0.55
1139 0.58
1140 0.58
1141 0.62
1142 0.65
1143 0.6
1144 0.58
1145 0.52