FuNGI

A0A409X8Q6

Protein Details

Accession

A0A409X8Q6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
249-273	GSTSNPGKRGKKKTRGSKSKPDYHC	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
255-268	GKRGKKKTRGSKSK

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 11.5, cyto 7.5, pero 4

Family & Domain DBs

Pfam	View protein in Pfam PF14223 Retrotran_gag_2

Amino Acid Sequences

MGPGKSDNYSGFLKLKEDGSNWPAYKIEILQHLNARGIVDNLEPPIFPLDSITVHNNQYYRSSDTKFEKPLDRETAKSLQAERREFRKAEGLGTEILIATLPVSIFVQLRHHTTLAERWQALCEIYEHRGEDVSFDMWDKFHDLRFPGGSVHAFISKMSDMRDQLILNDADLTDKQFVAAIRRAFRQSEYNEYLASVCAGIRNAGKEITPAILIQELKTEANSRHGASAISPNVKTSEALASSSSNSHGSTSNPGKRGKKKTRGSKSKPDYHCDHCGKDGHSEQRCWAPGGGGYDTAPQWWKDKHAESQKKNSHSNANIVESHESACAFTESSSSKPEHVALLSATNHITYTPSDSTTLSNVTPTLPTPLPDYNTLLNTYITLVNGLGEGTFPITKSLDAKPDHVALVLHNLPCTRDVEPLKAPSYALQSLTSKYLGTVLDCGASDHYTPRRDLLTNFTPVKEATRVADGRIVD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.28
3	0.28
4	0.28
5	0.31
6	0.32
7	0.4
8	0.38
9	0.37
10	0.34
11	0.32
12	0.32
13	0.28
14	0.27
15	0.26
16	0.29
17	0.32
18	0.36
19	0.37
20	0.36
21	0.34
22	0.31
23	0.24
24	0.21
25	0.18
26	0.15
27	0.15
28	0.16
29	0.16
30	0.14
31	0.15
32	0.17
33	0.15
34	0.13
35	0.13
36	0.13
37	0.14
38	0.18
39	0.21
40	0.21
41	0.23
42	0.26
43	0.25
44	0.24
45	0.27
46	0.28
47	0.29
48	0.31
49	0.32
50	0.37
51	0.42
52	0.48
53	0.5
54	0.52
55	0.54
56	0.53
57	0.58
58	0.59
59	0.56
60	0.51
61	0.52
62	0.52
63	0.47
64	0.46
65	0.44
66	0.42
67	0.46
68	0.52
69	0.5
70	0.5
71	0.54
72	0.51
73	0.48
74	0.5
75	0.43
76	0.39
77	0.36
78	0.32
79	0.26
80	0.25
81	0.22
82	0.14
83	0.12
84	0.09
85	0.07
86	0.05
87	0.05
88	0.04
89	0.05
90	0.05
91	0.06
92	0.07
93	0.09
94	0.14
95	0.15
96	0.19
97	0.21
98	0.21
99	0.21
100	0.22
101	0.28
102	0.29
103	0.32
104	0.29
105	0.27
106	0.28
107	0.29
108	0.27
109	0.21
110	0.16
111	0.14
112	0.16
113	0.17
114	0.17
115	0.16
116	0.17
117	0.16
118	0.15
119	0.14
120	0.12
121	0.1
122	0.11
123	0.11
124	0.09
125	0.1
126	0.13
127	0.12
128	0.13
129	0.16
130	0.16
131	0.18
132	0.2
133	0.2
134	0.17
135	0.17
136	0.17
137	0.14
138	0.14
139	0.13
140	0.12
141	0.11
142	0.13
143	0.12
144	0.12
145	0.13
146	0.15
147	0.14
148	0.16
149	0.19
150	0.16
151	0.16
152	0.19
153	0.17
154	0.14
155	0.13
156	0.11
157	0.1
158	0.1
159	0.12
160	0.08
161	0.08
162	0.08
163	0.09
164	0.1
165	0.13
166	0.18
167	0.19
168	0.21
169	0.24
170	0.26
171	0.25
172	0.26
173	0.28
174	0.27
175	0.31
176	0.33
177	0.31
178	0.29
179	0.28
180	0.27
181	0.2
182	0.17
183	0.09
184	0.05
185	0.05
186	0.06
187	0.07
188	0.07
189	0.08
190	0.09
191	0.09
192	0.09
193	0.09
194	0.09
195	0.09
196	0.08
197	0.07
198	0.07
199	0.09
200	0.09
201	0.08
202	0.09
203	0.09
204	0.09
205	0.1
206	0.11
207	0.09
208	0.14
209	0.16
210	0.15
211	0.15
212	0.15
213	0.15
214	0.14
215	0.18
216	0.16
217	0.17
218	0.16
219	0.16
220	0.17
221	0.17
222	0.16
223	0.12
224	0.11
225	0.09
226	0.1
227	0.1
228	0.1
229	0.1
230	0.11
231	0.1
232	0.09
233	0.09
234	0.09
235	0.09
236	0.1
237	0.16
238	0.23
239	0.27
240	0.3
241	0.36
242	0.42
243	0.51
244	0.61
245	0.65
246	0.68
247	0.72
248	0.79
249	0.84
250	0.88
251	0.87
252	0.87
253	0.85
254	0.85
255	0.8
256	0.75
257	0.69
258	0.63
259	0.65
260	0.57
261	0.5
262	0.43
263	0.43
264	0.38
265	0.38
266	0.38
267	0.37
268	0.36
269	0.36
270	0.34
271	0.36
272	0.36
273	0.31
274	0.26
275	0.18
276	0.17
277	0.19
278	0.18
279	0.13
280	0.12
281	0.13
282	0.12
283	0.13
284	0.12
285	0.1
286	0.13
287	0.13
288	0.17
289	0.21
290	0.25
291	0.33
292	0.42
293	0.52
294	0.54
295	0.64
296	0.67
297	0.68
298	0.69
299	0.64
300	0.61
301	0.53
302	0.54
303	0.47
304	0.43
305	0.38
306	0.36
307	0.34
308	0.26
309	0.24
310	0.18
311	0.14
312	0.11
313	0.1
314	0.09
315	0.08
316	0.07
317	0.09
318	0.1
319	0.12
320	0.15
321	0.15
322	0.16
323	0.17
324	0.18
325	0.16
326	0.15
327	0.15
328	0.12
329	0.15
330	0.15
331	0.15
332	0.14
333	0.12
334	0.12
335	0.11
336	0.11
337	0.08
338	0.13
339	0.13
340	0.14
341	0.16
342	0.16
343	0.18
344	0.18
345	0.2
346	0.14
347	0.14
348	0.13
349	0.13
350	0.13
351	0.12
352	0.15
353	0.14
354	0.15
355	0.18
356	0.21
357	0.23
358	0.24
359	0.27
360	0.24
361	0.26
362	0.26
363	0.23
364	0.2
365	0.18
366	0.17
367	0.15
368	0.12
369	0.11
370	0.09
371	0.08
372	0.08
373	0.08
374	0.06
375	0.05
376	0.05
377	0.06
378	0.07
379	0.07
380	0.09
381	0.1
382	0.11
383	0.14
384	0.18
385	0.23
386	0.25
387	0.27
388	0.29
389	0.3
390	0.3
391	0.27
392	0.24
393	0.17
394	0.22
395	0.24
396	0.21
397	0.2
398	0.2
399	0.21
400	0.22
401	0.24
402	0.18
403	0.22
404	0.24
405	0.29
406	0.34
407	0.38
408	0.39
409	0.37
410	0.36
411	0.31
412	0.34
413	0.31
414	0.27
415	0.25
416	0.25
417	0.26
418	0.29
419	0.26
420	0.2
421	0.18
422	0.2
423	0.17
424	0.16
425	0.16
426	0.14
427	0.15
428	0.15
429	0.16
430	0.15
431	0.16
432	0.15
433	0.2
434	0.25
435	0.27
436	0.29
437	0.31
438	0.33
439	0.34
440	0.35
441	0.38
442	0.38
443	0.43
444	0.44
445	0.42
446	0.4
447	0.38
448	0.4
449	0.34
450	0.29
451	0.23
452	0.3
453	0.3
454	0.3

A0A409X8Q6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer