Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VPZ6

Protein Details
Accession A0A409VPZ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
126-153DPPKEKTGPAPSKKQKGKASSQNRTENLHydrophilic
568-587RESKDKSLWDRKPPAKRPNYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
102-143RRRAASHDVRRVPLRLRERAAAEMDPPKEKTGPAPSKKQKGK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.5, cyto 5.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039182  Pop1  
IPR009723  Pop1_N  
IPR012590  POPLD_dom  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
Pfam View protein in Pfam  
PF06978  POP1  
PF08170  POPLD  
Amino Acid Sequences MSQKRRNGEPNEATGRERKKLKISAAREIPVQSTSSSKQTQNDSAGPSRVIPTSLKGLPSSIGVEKFVEARAFEIDAMHSAMKTASASSTHRVWQTLPRHLRRRAASHDVRRVPLRLRERAAAEMDPPKEKTGPAPSKKQKGKASSQNRTENLLKRQIDKTWLETHLWHSKRMHMENMWGYRLATSPTEKSYRPSLRAVQHDAIIHDASYYSMIELQGSERLIINLLDLCCDPQNPSPGSKRYLNGSRVYQTHVYSAGEFPLGLIGPMTILWRPLSPKGTTSTPASTAGSQTSTQHSAVTSSKSTERSVWLRFHPSIHLDVMEALKTAASQTLAAYQSQNPSAQPESLDIIDLKGRQNVYEIMGPKSSQIIKGALSPVTSDKRSTFLELWRSLKSLRSPGSLPRGMVIGCTVDDPRLKFPPKNARPDKNAQGGIVLPSPSLAESDIWDDSIRTGLKKPKFKQADLDARRAKNEIPGTRLQTLRQDDRVPILLIQHSWETHEDDAKALHGWMLIVPEGWSMPFFNSLVFTGSRVAGQDERQTQAYEAGIPYFPRDYPCTNSYEGYAEERESKDKSLWDRKPPAKRPNYEALNTKSPWRADWYTVLGLQSSDATSVNFMATQREPQVPVVQMKPWLLQGTDVKNIVSNLFSVFNHGTSLVTDLNKIRLKRGLEPLSRDIKPAALFQSALVNVRLSMCSRGTPEDLAMIYPLSDERVRQWKRLLEARRSKEVLLDEVKEEDVHGVGDIIGSVTTGHFSFLRGQGFAIGAVSLASLLQLEQQHRRMQPNVKNDEDIPVFIVAVRNGNGRLYRSAYLEVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.6
3 0.57
4 0.57
5 0.54
6 0.55
7 0.61
8 0.67
9 0.69
10 0.69
11 0.72
12 0.73
13 0.7
14 0.64
15 0.58
16 0.5
17 0.41
18 0.36
19 0.27
20 0.25
21 0.25
22 0.29
23 0.32
24 0.34
25 0.38
26 0.43
27 0.48
28 0.49
29 0.5
30 0.49
31 0.49
32 0.48
33 0.43
34 0.38
35 0.34
36 0.29
37 0.27
38 0.22
39 0.21
40 0.25
41 0.27
42 0.27
43 0.25
44 0.25
45 0.24
46 0.24
47 0.24
48 0.22
49 0.21
50 0.2
51 0.2
52 0.2
53 0.21
54 0.21
55 0.18
56 0.14
57 0.14
58 0.15
59 0.15
60 0.14
61 0.14
62 0.12
63 0.12
64 0.14
65 0.13
66 0.11
67 0.11
68 0.1
69 0.1
70 0.1
71 0.09
72 0.09
73 0.12
74 0.15
75 0.19
76 0.22
77 0.25
78 0.27
79 0.28
80 0.29
81 0.34
82 0.39
83 0.46
84 0.53
85 0.59
86 0.66
87 0.71
88 0.77
89 0.75
90 0.75
91 0.72
92 0.73
93 0.73
94 0.74
95 0.78
96 0.74
97 0.72
98 0.68
99 0.63
100 0.59
101 0.58
102 0.57
103 0.54
104 0.53
105 0.53
106 0.53
107 0.53
108 0.5
109 0.42
110 0.38
111 0.37
112 0.35
113 0.34
114 0.33
115 0.32
116 0.29
117 0.29
118 0.3
119 0.34
120 0.42
121 0.45
122 0.55
123 0.61
124 0.71
125 0.77
126 0.8
127 0.78
128 0.75
129 0.79
130 0.79
131 0.8
132 0.8
133 0.82
134 0.82
135 0.75
136 0.73
137 0.7
138 0.67
139 0.63
140 0.62
141 0.56
142 0.51
143 0.53
144 0.5
145 0.5
146 0.46
147 0.43
148 0.41
149 0.4
150 0.37
151 0.35
152 0.39
153 0.42
154 0.4
155 0.4
156 0.35
157 0.4
158 0.46
159 0.48
160 0.48
161 0.39
162 0.45
163 0.47
164 0.5
165 0.44
166 0.36
167 0.33
168 0.28
169 0.27
170 0.22
171 0.17
172 0.17
173 0.18
174 0.22
175 0.26
176 0.26
177 0.28
178 0.36
179 0.4
180 0.4
181 0.43
182 0.45
183 0.49
184 0.54
185 0.58
186 0.49
187 0.46
188 0.44
189 0.39
190 0.34
191 0.27
192 0.21
193 0.14
194 0.12
195 0.09
196 0.09
197 0.08
198 0.06
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.09
208 0.09
209 0.1
210 0.1
211 0.09
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.11
218 0.12
219 0.14
220 0.14
221 0.2
222 0.21
223 0.25
224 0.31
225 0.34
226 0.38
227 0.4
228 0.38
229 0.39
230 0.45
231 0.45
232 0.43
233 0.43
234 0.42
235 0.4
236 0.43
237 0.38
238 0.31
239 0.28
240 0.25
241 0.22
242 0.19
243 0.18
244 0.14
245 0.11
246 0.1
247 0.08
248 0.08
249 0.07
250 0.05
251 0.05
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.05
256 0.05
257 0.06
258 0.06
259 0.08
260 0.11
261 0.14
262 0.18
263 0.18
264 0.2
265 0.22
266 0.25
267 0.26
268 0.27
269 0.25
270 0.23
271 0.24
272 0.23
273 0.2
274 0.19
275 0.17
276 0.16
277 0.14
278 0.14
279 0.16
280 0.17
281 0.16
282 0.16
283 0.15
284 0.16
285 0.17
286 0.18
287 0.16
288 0.15
289 0.19
290 0.2
291 0.21
292 0.2
293 0.23
294 0.25
295 0.28
296 0.3
297 0.3
298 0.34
299 0.33
300 0.33
301 0.31
302 0.28
303 0.26
304 0.23
305 0.2
306 0.14
307 0.14
308 0.14
309 0.11
310 0.09
311 0.07
312 0.06
313 0.05
314 0.06
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.09
320 0.1
321 0.11
322 0.12
323 0.13
324 0.14
325 0.16
326 0.16
327 0.12
328 0.14
329 0.15
330 0.14
331 0.13
332 0.12
333 0.12
334 0.12
335 0.12
336 0.09
337 0.09
338 0.1
339 0.11
340 0.1
341 0.11
342 0.11
343 0.11
344 0.12
345 0.13
346 0.13
347 0.16
348 0.16
349 0.16
350 0.16
351 0.16
352 0.15
353 0.17
354 0.16
355 0.13
356 0.13
357 0.12
358 0.12
359 0.14
360 0.15
361 0.12
362 0.12
363 0.12
364 0.13
365 0.16
366 0.16
367 0.15
368 0.14
369 0.17
370 0.18
371 0.2
372 0.19
373 0.19
374 0.25
375 0.28
376 0.3
377 0.27
378 0.28
379 0.25
380 0.26
381 0.24
382 0.24
383 0.22
384 0.22
385 0.22
386 0.26
387 0.32
388 0.31
389 0.28
390 0.22
391 0.21
392 0.19
393 0.18
394 0.14
395 0.07
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.07
400 0.09
401 0.1
402 0.12
403 0.18
404 0.2
405 0.21
406 0.28
407 0.38
408 0.43
409 0.53
410 0.58
411 0.58
412 0.62
413 0.68
414 0.67
415 0.62
416 0.56
417 0.45
418 0.38
419 0.32
420 0.27
421 0.22
422 0.15
423 0.08
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.06
429 0.05
430 0.05
431 0.07
432 0.07
433 0.08
434 0.08
435 0.07
436 0.07
437 0.09
438 0.09
439 0.08
440 0.13
441 0.2
442 0.26
443 0.35
444 0.38
445 0.46
446 0.51
447 0.51
448 0.54
449 0.56
450 0.6
451 0.56
452 0.62
453 0.59
454 0.54
455 0.54
456 0.48
457 0.39
458 0.34
459 0.36
460 0.29
461 0.27
462 0.31
463 0.34
464 0.36
465 0.37
466 0.31
467 0.32
468 0.35
469 0.33
470 0.33
471 0.3
472 0.27
473 0.29
474 0.29
475 0.23
476 0.19
477 0.17
478 0.14
479 0.13
480 0.13
481 0.12
482 0.1
483 0.11
484 0.12
485 0.12
486 0.12
487 0.15
488 0.13
489 0.13
490 0.13
491 0.12
492 0.11
493 0.09
494 0.08
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.06
500 0.05
501 0.06
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.07
509 0.07
510 0.07
511 0.08
512 0.08
513 0.1
514 0.1
515 0.1
516 0.1
517 0.1
518 0.1
519 0.1
520 0.11
521 0.11
522 0.13
523 0.18
524 0.19
525 0.2
526 0.21
527 0.21
528 0.2
529 0.19
530 0.18
531 0.14
532 0.12
533 0.11
534 0.11
535 0.1
536 0.11
537 0.11
538 0.11
539 0.13
540 0.16
541 0.18
542 0.23
543 0.25
544 0.27
545 0.28
546 0.28
547 0.26
548 0.24
549 0.22
550 0.2
551 0.18
552 0.16
553 0.18
554 0.19
555 0.21
556 0.2
557 0.21
558 0.2
559 0.23
560 0.31
561 0.38
562 0.43
563 0.5
564 0.58
565 0.65
566 0.74
567 0.79
568 0.81
569 0.8
570 0.78
571 0.75
572 0.75
573 0.72
574 0.66
575 0.64
576 0.59
577 0.56
578 0.52
579 0.5
580 0.44
581 0.39
582 0.36
583 0.36
584 0.33
585 0.28
586 0.31
587 0.32
588 0.29
589 0.3
590 0.29
591 0.21
592 0.19
593 0.16
594 0.13
595 0.09
596 0.08
597 0.07
598 0.07
599 0.07
600 0.08
601 0.07
602 0.08
603 0.08
604 0.11
605 0.12
606 0.15
607 0.18
608 0.2
609 0.21
610 0.22
611 0.26
612 0.26
613 0.28
614 0.27
615 0.26
616 0.27
617 0.26
618 0.26
619 0.24
620 0.22
621 0.18
622 0.2
623 0.24
624 0.25
625 0.28
626 0.27
627 0.25
628 0.25
629 0.25
630 0.22
631 0.17
632 0.13
633 0.11
634 0.12
635 0.12
636 0.16
637 0.16
638 0.16
639 0.16
640 0.16
641 0.14
642 0.12
643 0.15
644 0.13
645 0.12
646 0.15
647 0.15
648 0.23
649 0.27
650 0.27
651 0.28
652 0.31
653 0.34
654 0.39
655 0.48
656 0.5
657 0.51
658 0.56
659 0.6
660 0.62
661 0.59
662 0.53
663 0.43
664 0.37
665 0.33
666 0.3
667 0.26
668 0.2
669 0.2
670 0.19
671 0.24
672 0.22
673 0.22
674 0.19
675 0.16
676 0.15
677 0.16
678 0.17
679 0.13
680 0.15
681 0.15
682 0.16
683 0.19
684 0.22
685 0.23
686 0.23
687 0.22
688 0.22
689 0.21
690 0.19
691 0.17
692 0.13
693 0.1
694 0.1
695 0.09
696 0.1
697 0.1
698 0.11
699 0.16
700 0.27
701 0.3
702 0.34
703 0.41
704 0.43
705 0.49
706 0.57
707 0.6
708 0.6
709 0.67
710 0.7
711 0.72
712 0.69
713 0.62
714 0.58
715 0.52
716 0.48
717 0.42
718 0.38
719 0.3
720 0.3
721 0.3
722 0.25
723 0.23
724 0.16
725 0.12
726 0.1
727 0.08
728 0.07
729 0.06
730 0.06
731 0.06
732 0.05
733 0.05
734 0.04
735 0.05
736 0.05
737 0.06
738 0.06
739 0.08
740 0.08
741 0.1
742 0.15
743 0.2
744 0.22
745 0.21
746 0.21
747 0.21
748 0.21
749 0.2
750 0.15
751 0.1
752 0.07
753 0.07
754 0.07
755 0.05
756 0.04
757 0.04
758 0.04
759 0.04
760 0.08
761 0.13
762 0.17
763 0.24
764 0.3
765 0.37
766 0.42
767 0.48
768 0.51
769 0.57
770 0.61
771 0.64
772 0.68
773 0.64
774 0.63
775 0.58
776 0.58
777 0.5
778 0.42
779 0.34
780 0.26
781 0.22
782 0.19
783 0.21
784 0.15
785 0.17
786 0.17
787 0.18
788 0.18
789 0.23
790 0.25
791 0.25
792 0.29
793 0.3
794 0.31
795 0.32