FuNGI

A0A409VMF6

Protein Details

Accession

A0A409VMF6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
81-103	PLRIDGKKLKFYRKGPPSKKDAD	Basic
1104-1130	TGSILAKCTQKRHRKQRIYRMALHSGT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
93-95	RKG

Subcellular Location(s)

cyto 11, cyto_nucl 9.333, cyto_mito 7.833, nucl 6.5, mito 3.5, pero 2, E.R. 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP

Amino Acid Sequences

MELNIKFIPNHVNTYTVIRKVAEIVHSPKFMPQPENGRLMNFRVVLNDNPAGGVRNDGTGVLTFGEDHIASKFLKWVVDTPLRIDGKKLKFYRKGPPSKKDADLLKKTLFVDPSIEEERERINYGLRDMLRVDVIQFGVFYRNYPNSDAEKLEPRRYSIEWERSCIDRQTAWLRVEYDHRLMRIVCGDQLSESEGSSLVIPFSTIQKLGVGYDGRPYVCFDTLTPPIFETYPFHRTLTGTHKQDNYNFKHRLMCLDEGHRIVAPFATKLRILFVNEDGILQKFSEMCYSAGIAKQTIIQCMGPLHIEATKEGFFSEKRIRHLRNILSKFPWPIAFQLESLLRNGLLHSDEILSLLPKIQSLQENETSTYIGNLLRHYNEKLQIRPLRESPARCFDLALRSFKPIVHRGEFLCSHVTFTPTRVLLEGPFATQSNRIIRKYAGYEDHFMRVEFREEDRLNFRWEREVDAVPFLRARVGDILKNGFTLAGRFFEFLAYSNSALREHSVWFMNPFIYEDAVGRCVKVTASSIRDDLGVFKGDELGDKLLKIPSKYAARLAQAFTATDASVMIRREEWTDIDDLGKEPYLFTDGCGTLSFSLARKIWAKLCEMKHRPYIESSVPSAFQIRFLGYKGVISVDAFLEKERPGIHMCLRPSMKKFSVSKDAEQLAPIEIAQAFYAPNDCYLNRPLIMLLEDIGIPQPAFLELQNEVIKNIEKIDTSIDNFAALLGKYNLGNSFNLQDILRRLKRRYKFDLKPNSKDARLMDNPFWKHLREVVSASILRDIKHSARIYVPDSYLLVGVPDEGPAYEAAGFQNVFTLKAGEVFICIQRPGDEEPTFLSGLATISRSPVAFPGDVQRVRAIGKPPASMMCLFAHLKNVVVLPSEGNRSLASCLGGGDVDGDLFSVIFHKPLLPTSVDEPADYEPSGPKTLDRECHVEDICDFVVEYIHSDVLGLLSDRLLIIADQSAAVDYPKQGNPVSLDDDTLPKTLMRIKPDWHAAEVVSPRHTDYYESTKALGKLFRNIHVDENNPVLKSWSEEDLRHDPITEALRETIAQLLGHGVLHDGYPPETVDLYRQYSDELRYISATHALSDSVTGRLLESEIITGSILAKCTQKRHRKQRIYRMALHSGTLVGDIKSKLCEKPDSRDMQELLLGLEASWKAWNYAKSKVGRDNLGPSKLVHDNFGSYSFGLIALGVILEILDYIDKLESEN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.41
3	0.36
4	0.35
5	0.3
6	0.3
7	0.3
8	0.33
9	0.3
10	0.31
11	0.33
12	0.37
13	0.38
14	0.38
15	0.41
16	0.42
17	0.42
18	0.39
19	0.4
20	0.43
21	0.47
22	0.53
23	0.49
24	0.47
25	0.45
26	0.45
27	0.44
28	0.37
29	0.32
30	0.29
31	0.32
32	0.3
33	0.33
34	0.31
35	0.25
36	0.24
37	0.24
38	0.22
39	0.18
40	0.2
41	0.14
42	0.14
43	0.14
44	0.13
45	0.14
46	0.12
47	0.13
48	0.1
49	0.1
50	0.09
51	0.08
52	0.11
53	0.09
54	0.1
55	0.1
56	0.12
57	0.12
58	0.12
59	0.17
60	0.16
61	0.17
62	0.18
63	0.21
64	0.27
65	0.35
66	0.35
67	0.34
68	0.41
69	0.42
70	0.41
71	0.42
72	0.44
73	0.44
74	0.53
75	0.57
76	0.58
77	0.64
78	0.7
79	0.76
80	0.77
81	0.81
82	0.81
83	0.82
84	0.81
85	0.79
86	0.77
87	0.73
88	0.72
89	0.71
90	0.7
91	0.67
92	0.61
93	0.58
94	0.55
95	0.53
96	0.44
97	0.35
98	0.3
99	0.26
100	0.29
101	0.29
102	0.28
103	0.24
104	0.24
105	0.26
106	0.25
107	0.26
108	0.21
109	0.22
110	0.24
111	0.25
112	0.31
113	0.28
114	0.28
115	0.26
116	0.27
117	0.23
118	0.21
119	0.2
120	0.15
121	0.15
122	0.13
123	0.12
124	0.11
125	0.14
126	0.14
127	0.14
128	0.18
129	0.22
130	0.24
131	0.27
132	0.31
133	0.31
134	0.34
135	0.36
136	0.34
137	0.4
138	0.43
139	0.48
140	0.45
141	0.43
142	0.45
143	0.43
144	0.48
145	0.47
146	0.53
147	0.47
148	0.5
149	0.5
150	0.48
151	0.5
152	0.45
153	0.38
154	0.28
155	0.32
156	0.34
157	0.38
158	0.36
159	0.36
160	0.35
161	0.34
162	0.38
163	0.38
164	0.37
165	0.34
166	0.33
167	0.32
168	0.31
169	0.31
170	0.29
171	0.26
172	0.21
173	0.19
174	0.19
175	0.17
176	0.17
177	0.18
178	0.14
179	0.12
180	0.11
181	0.1
182	0.1
183	0.1
184	0.09
185	0.07
186	0.06
187	0.07
188	0.07
189	0.1
190	0.11
191	0.11
192	0.11
193	0.12
194	0.13
195	0.13
196	0.17
197	0.15
198	0.13
199	0.18
200	0.2
201	0.19
202	0.19
203	0.22
204	0.2
205	0.2
206	0.2
207	0.17
208	0.2
209	0.25
210	0.26
211	0.24
212	0.22
213	0.22
214	0.22
215	0.22
216	0.19
217	0.21
218	0.24
219	0.25
220	0.25
221	0.25
222	0.25
223	0.29
224	0.34
225	0.37
226	0.37
227	0.41
228	0.45
229	0.47
230	0.54
231	0.58
232	0.57
233	0.57
234	0.56
235	0.53
236	0.54
237	0.51
238	0.5
239	0.46
240	0.43
241	0.38
242	0.39
243	0.41
244	0.35
245	0.36
246	0.3
247	0.25
248	0.21
249	0.18
250	0.14
251	0.12
252	0.13
253	0.14
254	0.14
255	0.14
256	0.17
257	0.18
258	0.19
259	0.2
260	0.2
261	0.21
262	0.2
263	0.21
264	0.18
265	0.16
266	0.15
267	0.12
268	0.11
269	0.08
270	0.09
271	0.1
272	0.11
273	0.1
274	0.11
275	0.12
276	0.12
277	0.14
278	0.15
279	0.13
280	0.12
281	0.16
282	0.16
283	0.16
284	0.16
285	0.14
286	0.14
287	0.15
288	0.15
289	0.11
290	0.1
291	0.1
292	0.1
293	0.11
294	0.11
295	0.13
296	0.13
297	0.12
298	0.12
299	0.13
300	0.11
301	0.17
302	0.26
303	0.27
304	0.33
305	0.41
306	0.45
307	0.5
308	0.59
309	0.61
310	0.62
311	0.64
312	0.62
313	0.57
314	0.57
315	0.51
316	0.45
317	0.39
318	0.3
319	0.26
320	0.26
321	0.23
322	0.2
323	0.21
324	0.21
325	0.19
326	0.19
327	0.18
328	0.13
329	0.12
330	0.12
331	0.1
332	0.09
333	0.08
334	0.08
335	0.09
336	0.08
337	0.09
338	0.09
339	0.08
340	0.07
341	0.08
342	0.07
343	0.07
344	0.08
345	0.1
346	0.14
347	0.17
348	0.22
349	0.26
350	0.27
351	0.28
352	0.28
353	0.26
354	0.21
355	0.18
356	0.14
357	0.11
358	0.1
359	0.11
360	0.13
361	0.14
362	0.17
363	0.19
364	0.23
365	0.27
366	0.3
367	0.31
368	0.38
369	0.41
370	0.42
371	0.44
372	0.42
373	0.43
374	0.44
375	0.46
376	0.42
377	0.46
378	0.44
379	0.4
380	0.38
381	0.32
382	0.36
383	0.36
384	0.35
385	0.28
386	0.29
387	0.3
388	0.3
389	0.33
390	0.31
391	0.33
392	0.31
393	0.32
394	0.3
395	0.35
396	0.34
397	0.3
398	0.28
399	0.22
400	0.21
401	0.2
402	0.21
403	0.16
404	0.17
405	0.2
406	0.16
407	0.17
408	0.15
409	0.15
410	0.13
411	0.16
412	0.15
413	0.11
414	0.11
415	0.11
416	0.12
417	0.13
418	0.16
419	0.2
420	0.25
421	0.25
422	0.26
423	0.26
424	0.29
425	0.31
426	0.32
427	0.29
428	0.27
429	0.3
430	0.3
431	0.32
432	0.29
433	0.26
434	0.23
435	0.19
436	0.19
437	0.17
438	0.17
439	0.21
440	0.21
441	0.24
442	0.27
443	0.28
444	0.3
445	0.29
446	0.29
447	0.28
448	0.28
449	0.29
450	0.28
451	0.28
452	0.24
453	0.26
454	0.26
455	0.2
456	0.2
457	0.15
458	0.13
459	0.11
460	0.11
461	0.12
462	0.13
463	0.14
464	0.16
465	0.18
466	0.17
467	0.17
468	0.16
469	0.11
470	0.1
471	0.09
472	0.08
473	0.08
474	0.08
475	0.09
476	0.09
477	0.09
478	0.09
479	0.09
480	0.12
481	0.11
482	0.11
483	0.12
484	0.12
485	0.12
486	0.12
487	0.12
488	0.1
489	0.1
490	0.11
491	0.12
492	0.11
493	0.12
494	0.12
495	0.11
496	0.1
497	0.1
498	0.09
499	0.08
500	0.08
501	0.08
502	0.08
503	0.11
504	0.1
505	0.09
506	0.09
507	0.09
508	0.08
509	0.08
510	0.1
511	0.11
512	0.14
513	0.15
514	0.16
515	0.16
516	0.16
517	0.15
518	0.14
519	0.12
520	0.1
521	0.09
522	0.09
523	0.09
524	0.09
525	0.09
526	0.09
527	0.09
528	0.08
529	0.08
530	0.09
531	0.1
532	0.12
533	0.12
534	0.12
535	0.16
536	0.19
537	0.2
538	0.23
539	0.24
540	0.24
541	0.26
542	0.26
543	0.22
544	0.18
545	0.18
546	0.14
547	0.12
548	0.1
549	0.08
550	0.07
551	0.06
552	0.08
553	0.08
554	0.08
555	0.08
556	0.09
557	0.1
558	0.11
559	0.11
560	0.1
561	0.11
562	0.1
563	0.1
564	0.1
565	0.09
566	0.09
567	0.09
568	0.07
569	0.06
570	0.06
571	0.07
572	0.07
573	0.07
574	0.1
575	0.09
576	0.1
577	0.1
578	0.1
579	0.09
580	0.09
581	0.1
582	0.07
583	0.09
584	0.09
585	0.11
586	0.13
587	0.14
588	0.17
589	0.18
590	0.21
591	0.25
592	0.29
593	0.37
594	0.39
595	0.42
596	0.44
597	0.44
598	0.42
599	0.37
600	0.37
601	0.29
602	0.27
603	0.25
604	0.2
605	0.18
606	0.17
607	0.18
608	0.14
609	0.12
610	0.11
611	0.1
612	0.1
613	0.1
614	0.11
615	0.09
616	0.09
617	0.08
618	0.08
619	0.07
620	0.06
621	0.06
622	0.05
623	0.06
624	0.06
625	0.06
626	0.07
627	0.07
628	0.08
629	0.08
630	0.09
631	0.1
632	0.13
633	0.17
634	0.19
635	0.2
636	0.25
637	0.27
638	0.29
639	0.3
640	0.33
641	0.31
642	0.34
643	0.35
644	0.34
645	0.42
646	0.41
647	0.4
648	0.39
649	0.39
650	0.32
651	0.3
652	0.26
653	0.17
654	0.14
655	0.12
656	0.07
657	0.06
658	0.06
659	0.05
660	0.05
661	0.04
662	0.04
663	0.06
664	0.05
665	0.07
666	0.08
667	0.08
668	0.1
669	0.12
670	0.14
671	0.12
672	0.12
673	0.11
674	0.1
675	0.11
676	0.09
677	0.07
678	0.06
679	0.06
680	0.06
681	0.06
682	0.06
683	0.05
684	0.04
685	0.04
686	0.04
687	0.04
688	0.04
689	0.06
690	0.06
691	0.1
692	0.12
693	0.12
694	0.12
695	0.12
696	0.13
697	0.11
698	0.12
699	0.09
700	0.08
701	0.08
702	0.11
703	0.12
704	0.13
705	0.14
706	0.12
707	0.11
708	0.11
709	0.11
710	0.09
711	0.07
712	0.07
713	0.06
714	0.07
715	0.07
716	0.08
717	0.09
718	0.09
719	0.1
720	0.09
721	0.1
722	0.1
723	0.11
724	0.11
725	0.11
726	0.14
727	0.22
728	0.26
729	0.3
730	0.34
731	0.42
732	0.49
733	0.56
734	0.62
735	0.64
736	0.66
737	0.72
738	0.79
739	0.78
740	0.77
741	0.77
742	0.72
743	0.62
744	0.58
745	0.49
746	0.46
747	0.43
748	0.41
749	0.37
750	0.4
751	0.4
752	0.4
753	0.4
754	0.32
755	0.28
756	0.28
757	0.28
758	0.23
759	0.24
760	0.22
761	0.24
762	0.24
763	0.23
764	0.24
765	0.2
766	0.18
767	0.18
768	0.19
769	0.17
770	0.24
771	0.24
772	0.21
773	0.22
774	0.25
775	0.26
776	0.26
777	0.25
778	0.18
779	0.18
780	0.17
781	0.14
782	0.11
783	0.09
784	0.06
785	0.06
786	0.05
787	0.05
788	0.05
789	0.04
790	0.05
791	0.05
792	0.06
793	0.05
794	0.06
795	0.06
796	0.07
797	0.07
798	0.06
799	0.09
800	0.09
801	0.09
802	0.09
803	0.1
804	0.08
805	0.1
806	0.1
807	0.08
808	0.09
809	0.09
810	0.11
811	0.11
812	0.11
813	0.1
814	0.1
815	0.13
816	0.15
817	0.19
818	0.18
819	0.18
820	0.19
821	0.22
822	0.21
823	0.19
824	0.15
825	0.09
826	0.09
827	0.1
828	0.09
829	0.07
830	0.07
831	0.08
832	0.08
833	0.08
834	0.1
835	0.12
836	0.11
837	0.12
838	0.17
839	0.24
840	0.24
841	0.25
842	0.24
843	0.22
844	0.24
845	0.27
846	0.24
847	0.22
848	0.25
849	0.24
850	0.25
851	0.25
852	0.26
853	0.22
854	0.21
855	0.16
856	0.17
857	0.18
858	0.17
859	0.19
860	0.17
861	0.17
862	0.16
863	0.15
864	0.12
865	0.12
866	0.12
867	0.1
868	0.12
869	0.14
870	0.13
871	0.14
872	0.13
873	0.13
874	0.14
875	0.14
876	0.12
877	0.09
878	0.09
879	0.09
880	0.08
881	0.07
882	0.07
883	0.05
884	0.05
885	0.04
886	0.04
887	0.04
888	0.04
889	0.04
890	0.05
891	0.05
892	0.05
893	0.06
894	0.07
895	0.08
896	0.1
897	0.12
898	0.12
899	0.14
900	0.17
901	0.23
902	0.22
903	0.21
904	0.21
905	0.2
906	0.21
907	0.19
908	0.17
909	0.14
910	0.16
911	0.18
912	0.16
913	0.16
914	0.19
915	0.24
916	0.28
917	0.29
918	0.32
919	0.32
920	0.38
921	0.37
922	0.33
923	0.28
924	0.27
925	0.24
926	0.18
927	0.15
928	0.1
929	0.1
930	0.09
931	0.11
932	0.08
933	0.08
934	0.07
935	0.07
936	0.07
937	0.07
938	0.07
939	0.06
940	0.05
941	0.05
942	0.05
943	0.05
944	0.05
945	0.05
946	0.04
947	0.05
948	0.05
949	0.06
950	0.05
951	0.06
952	0.06
953	0.06
954	0.06
955	0.07
956	0.08
957	0.13
958	0.14
959	0.17
960	0.17
961	0.19
962	0.22
963	0.24
964	0.27
965	0.23
966	0.23
967	0.21
968	0.24
969	0.24
970	0.21
971	0.18
972	0.13
973	0.14
974	0.21
975	0.24
976	0.27
977	0.29
978	0.32
979	0.38
980	0.46
981	0.46
982	0.4
983	0.37
984	0.31
985	0.33
986	0.35
987	0.31
988	0.25
989	0.24
990	0.23
991	0.23
992	0.24
993	0.2
994	0.21
995	0.27
996	0.29
997	0.3
998	0.3
999	0.33
1000	0.34
1001	0.35
1002	0.36
1003	0.29
1004	0.33
1005	0.36
1006	0.4
1007	0.4
1008	0.4
1009	0.43
1010	0.41
1011	0.41
1012	0.36
1013	0.38
1014	0.34
1015	0.3
1016	0.29
1017	0.24
1018	0.21
1019	0.22
1020	0.21
1021	0.21
1022	0.22
1023	0.23
1024	0.3
1025	0.34
1026	0.38
1027	0.35
1028	0.33
1029	0.28
1030	0.29
1031	0.32
1032	0.26
1033	0.22
1034	0.19
1035	0.19
1036	0.18
1037	0.19
1038	0.17
1039	0.14
1040	0.13
1041	0.11
1042	0.11
1043	0.11
1044	0.11
1045	0.1
1046	0.08
1047	0.07
1048	0.07
1049	0.08
1050	0.08
1051	0.09
1052	0.09
1053	0.1
1054	0.11
1055	0.11
1056	0.12
1057	0.14
1058	0.18
1059	0.21
1060	0.21
1061	0.21
1062	0.23
1063	0.25
1064	0.28
1065	0.27
1066	0.24
1067	0.22
1068	0.22
1069	0.22
1070	0.21
1071	0.23
1072	0.2
1073	0.17
1074	0.16
1075	0.15
1076	0.14
1077	0.15
1078	0.15
1079	0.11
1080	0.12
1081	0.11
1082	0.1
1083	0.11
1084	0.11
1085	0.1
1086	0.09
1087	0.09
1088	0.09
1089	0.09
1090	0.08
1091	0.08
1092	0.09
1093	0.1
1094	0.11
1095	0.12
1096	0.18
1097	0.21
1098	0.31
1099	0.41
1100	0.5
1101	0.6
1102	0.7
1103	0.8
1104	0.85
1105	0.92
1106	0.94
1107	0.95
1108	0.93
1109	0.91
1110	0.87
1111	0.84
1112	0.74
1113	0.64
1114	0.53
1115	0.42
1116	0.34
1117	0.26
1118	0.2
1119	0.12
1120	0.15
1121	0.15
1122	0.15
1123	0.19
1124	0.22
1125	0.24
1126	0.27
1127	0.36
1128	0.37
1129	0.45
1130	0.53
1131	0.57
1132	0.58
1133	0.62
1134	0.58
1135	0.5
1136	0.48
1137	0.39
1138	0.3
1139	0.23
1140	0.19
1141	0.11
1142	0.14
1143	0.12
1144	0.11
1145	0.13
1146	0.13
1147	0.14
1148	0.19
1149	0.26
1150	0.25
1151	0.33
1152	0.4
1153	0.44
1154	0.51
1155	0.57
1156	0.59
1157	0.58
1158	0.59
1159	0.61
1160	0.61
1161	0.59
1162	0.53
1163	0.45
1164	0.44
1165	0.46
1166	0.42
1167	0.35
1168	0.29
1169	0.28
1170	0.29
1171	0.3
1172	0.26
1173	0.2
1174	0.19
1175	0.16
1176	0.14
1177	0.11
1178	0.09
1179	0.07
1180	0.05
1181	0.05
1182	0.04
1183	0.03
1184	0.03
1185	0.03
1186	0.03
1187	0.03
1188	0.04
1189	0.04
1190	0.05
1191	0.06

A0A409VMF6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer