Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VHB0

Protein Details
Accession A0A409VHB0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-45SEPQPTKKTTKAKATTKAVVHydrophilic
82-110EPERPAKRARVTQAKKKAATPKAKGKAKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
85-115RPAKRARVTQAKKKAATPKAKGKAKATPKPR
Subcellular Location(s) nucl 10.5, mito 9, cyto_nucl 7.5, pero 4, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Amino Acid Sequences MTRQLRPRKSRPSYAALVEFEDGDDSEPQPTKKTTKAKATTKAVVVEEDSESDFAGGENEAAEDDEDAEVEDDVMEEDSEEEPERPAKRARVTQAKKKAATPKAKGKAKATPKPRAVSIQDAVAPSAARGSKRQMYVLPAPSVHHRHRAVPLYSRSGQAERLTSKPALFASSSQTLTNGFTHNSKITDRVNKAWGYNIGAGPLWDMAEDRGWFKEAITTGDDVDTEAKRRPMVYPDIPVMNGWTFLSKEEASPYLPTDDTTTEEGNLKPPPPVKCHFGPIDAQEKKELAIFDSLTLSPDCYVFNAGGPVWGLDWCPFYVEERSSRSYTQYLAVGPFPSHSHSPDIGRKVTRPSYACIQIWSLSSKEKPTRSKKPVPITGQMKCELILAIDSGPAFELKWCPLPSHDQFNGNKQIKKLGLLGGTFEDGTFAVYVVPDPTTLKPSKKTDSQPLYVKLQPILRIELEETSCWTFDWANSEVIAIGTTNGIISVFNLGSYLKNIVSAGNISSPIFCPLLTFPENCLLDVPTITNVLPTHYLSVHQSAIRALAWVKAPPALPSGLPSVGRSPTVIASGGYDGMECMTDIRSGHGSVMNRTRDVINALHYSPFAGGPITMDHENTVKAYSASPSMLGRGHSLLEPQGPVWSVHASDYHPQLAVGAADGSCSTTNTLRSTRRGGTVPFFVYKVFQMDYNRHTKEFRMLDHFLPQESVDRPSAARSAKDKGKDKDFYPPPSCGAWPPEVGVHRVVWNCGNGLASCGLLAAGTSSGLCRVDWVLGRWVKDKIPYGSVSSVRLEDAGSEDGMDVDSDASGEASE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.7
3 0.6
4 0.54
5 0.44
6 0.37
7 0.29
8 0.24
9 0.18
10 0.13
11 0.13
12 0.11
13 0.16
14 0.19
15 0.2
16 0.24
17 0.28
18 0.31
19 0.39
20 0.48
21 0.52
22 0.59
23 0.68
24 0.73
25 0.78
26 0.81
27 0.79
28 0.73
29 0.69
30 0.59
31 0.51
32 0.43
33 0.36
34 0.29
35 0.24
36 0.21
37 0.16
38 0.15
39 0.13
40 0.11
41 0.09
42 0.08
43 0.07
44 0.06
45 0.06
46 0.06
47 0.06
48 0.06
49 0.07
50 0.06
51 0.07
52 0.07
53 0.06
54 0.07
55 0.07
56 0.07
57 0.06
58 0.06
59 0.05
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.05
64 0.07
65 0.07
66 0.09
67 0.1
68 0.1
69 0.11
70 0.17
71 0.19
72 0.22
73 0.27
74 0.33
75 0.39
76 0.47
77 0.55
78 0.61
79 0.68
80 0.74
81 0.79
82 0.82
83 0.77
84 0.76
85 0.77
86 0.75
87 0.77
88 0.75
89 0.75
90 0.76
91 0.81
92 0.79
93 0.74
94 0.74
95 0.74
96 0.75
97 0.73
98 0.73
99 0.73
100 0.71
101 0.69
102 0.67
103 0.61
104 0.59
105 0.52
106 0.45
107 0.41
108 0.37
109 0.34
110 0.27
111 0.22
112 0.14
113 0.18
114 0.16
115 0.15
116 0.17
117 0.23
118 0.29
119 0.31
120 0.34
121 0.32
122 0.37
123 0.43
124 0.46
125 0.41
126 0.36
127 0.36
128 0.4
129 0.45
130 0.42
131 0.43
132 0.4
133 0.41
134 0.48
135 0.54
136 0.51
137 0.52
138 0.54
139 0.52
140 0.52
141 0.5
142 0.46
143 0.4
144 0.39
145 0.33
146 0.34
147 0.3
148 0.3
149 0.32
150 0.3
151 0.29
152 0.27
153 0.25
154 0.22
155 0.19
156 0.18
157 0.2
158 0.23
159 0.24
160 0.21
161 0.21
162 0.2
163 0.21
164 0.21
165 0.17
166 0.14
167 0.15
168 0.18
169 0.2
170 0.21
171 0.2
172 0.23
173 0.28
174 0.35
175 0.38
176 0.39
177 0.42
178 0.41
179 0.41
180 0.41
181 0.36
182 0.32
183 0.31
184 0.27
185 0.23
186 0.21
187 0.2
188 0.16
189 0.14
190 0.1
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.09
195 0.1
196 0.1
197 0.11
198 0.12
199 0.12
200 0.12
201 0.15
202 0.14
203 0.15
204 0.16
205 0.16
206 0.15
207 0.15
208 0.15
209 0.11
210 0.14
211 0.12
212 0.12
213 0.15
214 0.16
215 0.16
216 0.18
217 0.19
218 0.21
219 0.28
220 0.3
221 0.31
222 0.32
223 0.32
224 0.32
225 0.29
226 0.26
227 0.19
228 0.16
229 0.12
230 0.1
231 0.09
232 0.1
233 0.13
234 0.11
235 0.12
236 0.13
237 0.14
238 0.14
239 0.15
240 0.16
241 0.14
242 0.14
243 0.14
244 0.14
245 0.13
246 0.15
247 0.16
248 0.15
249 0.14
250 0.16
251 0.16
252 0.17
253 0.18
254 0.16
255 0.17
256 0.21
257 0.24
258 0.28
259 0.31
260 0.34
261 0.34
262 0.39
263 0.37
264 0.34
265 0.33
266 0.31
267 0.38
268 0.34
269 0.33
270 0.29
271 0.27
272 0.26
273 0.25
274 0.21
275 0.12
276 0.13
277 0.13
278 0.12
279 0.14
280 0.13
281 0.12
282 0.12
283 0.11
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.07
288 0.08
289 0.07
290 0.07
291 0.08
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.08
301 0.07
302 0.08
303 0.08
304 0.1
305 0.12
306 0.14
307 0.16
308 0.19
309 0.23
310 0.24
311 0.25
312 0.25
313 0.24
314 0.23
315 0.21
316 0.18
317 0.15
318 0.15
319 0.15
320 0.13
321 0.12
322 0.12
323 0.11
324 0.12
325 0.12
326 0.13
327 0.15
328 0.16
329 0.2
330 0.25
331 0.28
332 0.29
333 0.29
334 0.29
335 0.32
336 0.34
337 0.35
338 0.31
339 0.3
340 0.32
341 0.36
342 0.34
343 0.29
344 0.27
345 0.23
346 0.22
347 0.21
348 0.16
349 0.14
350 0.15
351 0.19
352 0.23
353 0.28
354 0.36
355 0.44
356 0.54
357 0.6
358 0.69
359 0.71
360 0.75
361 0.77
362 0.72
363 0.72
364 0.68
365 0.63
366 0.56
367 0.5
368 0.41
369 0.33
370 0.28
371 0.19
372 0.13
373 0.09
374 0.06
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.06
384 0.06
385 0.11
386 0.11
387 0.12
388 0.13
389 0.2
390 0.22
391 0.28
392 0.29
393 0.31
394 0.32
395 0.37
396 0.45
397 0.43
398 0.43
399 0.35
400 0.38
401 0.32
402 0.33
403 0.29
404 0.22
405 0.19
406 0.17
407 0.17
408 0.13
409 0.13
410 0.12
411 0.1
412 0.07
413 0.05
414 0.06
415 0.05
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.05
422 0.05
423 0.06
424 0.07
425 0.12
426 0.15
427 0.17
428 0.23
429 0.27
430 0.31
431 0.37
432 0.41
433 0.46
434 0.49
435 0.52
436 0.51
437 0.5
438 0.5
439 0.45
440 0.41
441 0.34
442 0.3
443 0.28
444 0.24
445 0.23
446 0.19
447 0.18
448 0.17
449 0.17
450 0.15
451 0.12
452 0.12
453 0.11
454 0.11
455 0.1
456 0.1
457 0.08
458 0.08
459 0.12
460 0.12
461 0.12
462 0.12
463 0.12
464 0.11
465 0.11
466 0.1
467 0.06
468 0.04
469 0.04
470 0.03
471 0.03
472 0.03
473 0.03
474 0.03
475 0.03
476 0.05
477 0.05
478 0.05
479 0.05
480 0.06
481 0.06
482 0.07
483 0.09
484 0.07
485 0.07
486 0.08
487 0.08
488 0.08
489 0.08
490 0.08
491 0.07
492 0.08
493 0.08
494 0.08
495 0.09
496 0.1
497 0.1
498 0.09
499 0.09
500 0.09
501 0.14
502 0.16
503 0.16
504 0.15
505 0.22
506 0.22
507 0.21
508 0.21
509 0.17
510 0.15
511 0.15
512 0.14
513 0.08
514 0.08
515 0.08
516 0.09
517 0.08
518 0.09
519 0.11
520 0.11
521 0.12
522 0.11
523 0.12
524 0.12
525 0.15
526 0.15
527 0.14
528 0.14
529 0.13
530 0.14
531 0.12
532 0.11
533 0.09
534 0.1
535 0.11
536 0.11
537 0.11
538 0.13
539 0.13
540 0.13
541 0.15
542 0.13
543 0.12
544 0.13
545 0.15
546 0.14
547 0.15
548 0.15
549 0.16
550 0.16
551 0.16
552 0.15
553 0.13
554 0.12
555 0.13
556 0.12
557 0.09
558 0.09
559 0.1
560 0.1
561 0.08
562 0.07
563 0.06
564 0.06
565 0.06
566 0.05
567 0.05
568 0.05
569 0.06
570 0.07
571 0.09
572 0.1
573 0.11
574 0.12
575 0.15
576 0.15
577 0.19
578 0.27
579 0.27
580 0.26
581 0.27
582 0.26
583 0.24
584 0.26
585 0.22
586 0.19
587 0.19
588 0.2
589 0.19
590 0.19
591 0.18
592 0.16
593 0.14
594 0.1
595 0.07
596 0.06
597 0.07
598 0.08
599 0.11
600 0.1
601 0.11
602 0.11
603 0.12
604 0.13
605 0.12
606 0.12
607 0.09
608 0.1
609 0.1
610 0.11
611 0.12
612 0.12
613 0.13
614 0.12
615 0.13
616 0.14
617 0.14
618 0.14
619 0.14
620 0.14
621 0.13
622 0.14
623 0.14
624 0.14
625 0.14
626 0.12
627 0.13
628 0.13
629 0.13
630 0.13
631 0.13
632 0.12
633 0.12
634 0.14
635 0.15
636 0.18
637 0.21
638 0.2
639 0.19
640 0.18
641 0.17
642 0.16
643 0.13
644 0.1
645 0.08
646 0.06
647 0.06
648 0.07
649 0.08
650 0.07
651 0.08
652 0.1
653 0.11
654 0.14
655 0.18
656 0.25
657 0.28
658 0.33
659 0.39
660 0.4
661 0.42
662 0.43
663 0.42
664 0.41
665 0.41
666 0.4
667 0.36
668 0.33
669 0.29
670 0.27
671 0.24
672 0.22
673 0.17
674 0.18
675 0.2
676 0.26
677 0.31
678 0.39
679 0.41
680 0.4
681 0.4
682 0.39
683 0.44
684 0.43
685 0.42
686 0.4
687 0.41
688 0.4
689 0.46
690 0.45
691 0.37
692 0.33
693 0.29
694 0.26
695 0.24
696 0.26
697 0.2
698 0.2
699 0.19
700 0.21
701 0.26
702 0.24
703 0.28
704 0.28
705 0.35
706 0.4
707 0.49
708 0.55
709 0.57
710 0.64
711 0.64
712 0.61
713 0.64
714 0.65
715 0.66
716 0.61
717 0.56
718 0.5
719 0.48
720 0.48
721 0.41
722 0.39
723 0.33
724 0.29
725 0.28
726 0.31
727 0.29
728 0.3
729 0.28
730 0.25
731 0.26
732 0.27
733 0.28
734 0.25
735 0.24
736 0.23
737 0.21
738 0.21
739 0.16
740 0.17
741 0.15
742 0.12
743 0.11
744 0.1
745 0.09
746 0.07
747 0.07
748 0.05
749 0.05
750 0.05
751 0.05
752 0.05
753 0.08
754 0.09
755 0.09
756 0.1
757 0.11
758 0.15
759 0.18
760 0.21
761 0.28
762 0.31
763 0.34
764 0.36
765 0.38
766 0.36
767 0.4
768 0.44
769 0.39
770 0.41
771 0.4
772 0.42
773 0.45
774 0.44
775 0.41
776 0.36
777 0.33
778 0.28
779 0.26
780 0.21
781 0.16
782 0.17
783 0.16
784 0.13
785 0.12
786 0.12
787 0.11
788 0.12
789 0.11
790 0.08
791 0.06
792 0.06
793 0.06
794 0.06