Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409YJW3

Protein Details
Accession A0A409YJW3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
486-514AFFPKSTLRLIRRRKQRHRHQLQHSLTSIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
498-500RRK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11, cyto 5.5, cysk 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027806  HARBI1_dom  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13359  DDE_Tnp_4  
Amino Acid Sequences MLLQGADEEIMDTLLSLPLDDIPLDILLQDFADYANLDDDLLGSLSDSDHDDASELALEEEEDRSFDIGLDEELAGLDDMLFEMELENSPNWEVQDNESRNSESEGGDGDESGDWVDEAVIGSSHHSSRSFSRFIAESLQNLYSSRYLKSRKEGVRVSPQLPDFLSTVKHTRPDVFRQDIRISPRTFDTLVEWLENDPVFSSRGTQAQLPVDYQVAIVLYRFGHSGNASGLDKVARWAGCSKGMVVLATRRVLTAILRPSFREEMISMPTAQEKKEAKHFSAKRSKCKEWGEGWCMVDGTLVPLFARPHWYGESYFDRKSNYSMNVQIINTPDLRIIDCGYGFTGSTHDASAWEKTWIYAHHEKVFEDNEFIWADSAYPIETWVVAPYKKPDSDRPDNTFFNNHVSMIRIRSEHAIGFLKGRFQSLKALRVNIVDAKSHKYATYWILACIAVHNFALRCEKIEKAHQADVSEHHHNNASLPDPFDAFFPKSTLRLIRRRKQRHRHQLQHSLTSIRNNMQRQAPTERTGRAARIVALSAARTRREELKDILINKWCPN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.07
4 0.07
5 0.08
6 0.09
7 0.09
8 0.08
9 0.08
10 0.08
11 0.08
12 0.08
13 0.07
14 0.07
15 0.07
16 0.07
17 0.05
18 0.05
19 0.07
20 0.07
21 0.07
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.08
26 0.08
27 0.08
28 0.08
29 0.07
30 0.06
31 0.06
32 0.06
33 0.07
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.09
38 0.1
39 0.1
40 0.1
41 0.1
42 0.09
43 0.07
44 0.07
45 0.08
46 0.08
47 0.09
48 0.09
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.09
55 0.08
56 0.08
57 0.09
58 0.08
59 0.08
60 0.07
61 0.08
62 0.07
63 0.06
64 0.05
65 0.04
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.03
70 0.04
71 0.05
72 0.06
73 0.08
74 0.08
75 0.09
76 0.1
77 0.11
78 0.12
79 0.12
80 0.13
81 0.16
82 0.26
83 0.28
84 0.29
85 0.31
86 0.31
87 0.3
88 0.32
89 0.29
90 0.19
91 0.17
92 0.16
93 0.15
94 0.14
95 0.13
96 0.11
97 0.09
98 0.09
99 0.08
100 0.07
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.09
111 0.09
112 0.11
113 0.11
114 0.13
115 0.19
116 0.25
117 0.26
118 0.24
119 0.27
120 0.26
121 0.27
122 0.31
123 0.27
124 0.22
125 0.23
126 0.24
127 0.21
128 0.2
129 0.21
130 0.18
131 0.18
132 0.18
133 0.23
134 0.28
135 0.32
136 0.39
137 0.46
138 0.48
139 0.55
140 0.58
141 0.57
142 0.62
143 0.63
144 0.58
145 0.53
146 0.48
147 0.42
148 0.37
149 0.32
150 0.22
151 0.18
152 0.18
153 0.15
154 0.19
155 0.19
156 0.22
157 0.22
158 0.27
159 0.31
160 0.37
161 0.42
162 0.45
163 0.45
164 0.47
165 0.49
166 0.48
167 0.49
168 0.48
169 0.41
170 0.36
171 0.35
172 0.33
173 0.3
174 0.26
175 0.22
176 0.19
177 0.19
178 0.17
179 0.16
180 0.14
181 0.15
182 0.14
183 0.11
184 0.08
185 0.08
186 0.09
187 0.08
188 0.1
189 0.1
190 0.12
191 0.13
192 0.14
193 0.16
194 0.18
195 0.19
196 0.17
197 0.16
198 0.14
199 0.13
200 0.12
201 0.09
202 0.06
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.11
222 0.08
223 0.09
224 0.11
225 0.12
226 0.15
227 0.15
228 0.14
229 0.13
230 0.14
231 0.12
232 0.12
233 0.13
234 0.12
235 0.13
236 0.13
237 0.1
238 0.1
239 0.11
240 0.11
241 0.13
242 0.17
243 0.19
244 0.19
245 0.2
246 0.23
247 0.24
248 0.23
249 0.19
250 0.14
251 0.13
252 0.15
253 0.16
254 0.12
255 0.11
256 0.15
257 0.14
258 0.14
259 0.18
260 0.18
261 0.19
262 0.27
263 0.29
264 0.28
265 0.37
266 0.4
267 0.44
268 0.52
269 0.56
270 0.57
271 0.62
272 0.63
273 0.62
274 0.63
275 0.59
276 0.55
277 0.57
278 0.51
279 0.47
280 0.44
281 0.36
282 0.32
283 0.25
284 0.19
285 0.12
286 0.09
287 0.06
288 0.05
289 0.05
290 0.06
291 0.07
292 0.07
293 0.12
294 0.11
295 0.13
296 0.15
297 0.17
298 0.16
299 0.2
300 0.27
301 0.26
302 0.27
303 0.26
304 0.27
305 0.26
306 0.28
307 0.27
308 0.23
309 0.22
310 0.24
311 0.24
312 0.25
313 0.25
314 0.24
315 0.22
316 0.21
317 0.18
318 0.15
319 0.13
320 0.11
321 0.11
322 0.1
323 0.1
324 0.09
325 0.09
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.08
334 0.08
335 0.07
336 0.08
337 0.09
338 0.11
339 0.11
340 0.11
341 0.1
342 0.1
343 0.12
344 0.13
345 0.19
346 0.24
347 0.27
348 0.31
349 0.32
350 0.32
351 0.33
352 0.34
353 0.27
354 0.22
355 0.19
356 0.16
357 0.15
358 0.15
359 0.12
360 0.09
361 0.09
362 0.08
363 0.08
364 0.06
365 0.05
366 0.06
367 0.05
368 0.06
369 0.05
370 0.08
371 0.11
372 0.11
373 0.12
374 0.17
375 0.22
376 0.24
377 0.28
378 0.34
379 0.4
380 0.5
381 0.56
382 0.58
383 0.6
384 0.58
385 0.57
386 0.52
387 0.44
388 0.4
389 0.33
390 0.27
391 0.21
392 0.22
393 0.22
394 0.21
395 0.22
396 0.17
397 0.18
398 0.19
399 0.21
400 0.18
401 0.2
402 0.2
403 0.18
404 0.21
405 0.2
406 0.22
407 0.21
408 0.23
409 0.2
410 0.19
411 0.28
412 0.29
413 0.37
414 0.35
415 0.37
416 0.36
417 0.36
418 0.38
419 0.33
420 0.3
421 0.25
422 0.24
423 0.27
424 0.28
425 0.28
426 0.25
427 0.21
428 0.23
429 0.23
430 0.28
431 0.24
432 0.22
433 0.23
434 0.23
435 0.22
436 0.21
437 0.18
438 0.12
439 0.11
440 0.13
441 0.11
442 0.14
443 0.19
444 0.17
445 0.19
446 0.21
447 0.24
448 0.26
449 0.34
450 0.4
451 0.4
452 0.45
453 0.44
454 0.43
455 0.42
456 0.42
457 0.4
458 0.4
459 0.34
460 0.31
461 0.31
462 0.3
463 0.29
464 0.28
465 0.25
466 0.2
467 0.21
468 0.21
469 0.19
470 0.19
471 0.19
472 0.2
473 0.19
474 0.18
475 0.19
476 0.19
477 0.2
478 0.24
479 0.32
480 0.36
481 0.44
482 0.54
483 0.61
484 0.7
485 0.8
486 0.86
487 0.89
488 0.92
489 0.93
490 0.94
491 0.95
492 0.94
493 0.94
494 0.9
495 0.86
496 0.78
497 0.72
498 0.63
499 0.59
500 0.52
501 0.48
502 0.48
503 0.43
504 0.46
505 0.48
506 0.5
507 0.48
508 0.54
509 0.52
510 0.5
511 0.52
512 0.49
513 0.47
514 0.47
515 0.44
516 0.4
517 0.37
518 0.34
519 0.32
520 0.3
521 0.27
522 0.24
523 0.24
524 0.25
525 0.28
526 0.29
527 0.29
528 0.31
529 0.38
530 0.42
531 0.45
532 0.44
533 0.49
534 0.52
535 0.52
536 0.55
537 0.54