FuNGI

A0A409YTK4

Protein Details

Accession

A0A409YTK4

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
230-257	LQNSSLPLKKTSKRKRTRDQPPLSLFDP	Hydrophilic
1113-1134	MDEDRRVKRKKGLFDRRRFVVA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
242-244	KRK
1115-1125	EDRRVKRKKGL

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005100 NGN-domain IPR036735 NGN_dom_sf IPR039659 SPT5 IPR008991 Translation_prot_SH3-like_sf
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03439 Spt5-NGN

Amino Acid Sequences

MPNLSKLQDVSRFLDLEAVVDREEEEEDEYGDEDMEDFLDNSVVDEEDVLRGERNRFWKDLENDDDGVETYMEGLAQRMLLQRREEHSEAHPHAANFEAYPIYRVRCIVGMEEEAVFYLLQDTDSEKLIRSAFTRGSIRGHIYVESLMSEKVVALLRRTPGIIRRSTGGVITQAIDQEEWPRLMTMTASKVEFASQGQWVQIRNGDYRGDVGLVSLCASWGSEVLLVPRLQNSSLPLKKTSKRKRTRDQPPLSLFDPSVYQCQSNLQAMRTGQGTYRAGCITFQHGLIVKRYDHHSLKSGVLSIPSEHFYLFLQSKHPFIALHPLPRPAEWSISPNDSVTTSDHSRKGVVRSIGPYLVDVELDGEEHELVAIEWKNIRKIFSIADFVEICSGASTGTSGWIQTINDDIAVIISKTSVLDLGEGPCPTSVANVNETHISEHEVHVNWLKNASPTYLHVAPLVATTSKAKSDDVFHRNNDGISPLVGTEIIVSKKGHPWKGYRGVVKNVVGHNNGPALRLQPANTLAITSTASSSATISTTTSSSLHDVTDTRNAWDPNSRTPVSRSRSASPVPMLLENPTPPAPSPSHPLLDTRLLSIPLWVLVNGGGFNNKDVVVSVTRVGQRLCICRDAFKTTTLLEPSWVSISHPNPTRDNGLLVVIRGEHCGKYVRRIHHRYGDTRSSVFVQLAVLARKAGESDVITDERLELSPEYLCLAYESPQDKKLNQTLMHTLREQARQILQQYPPQNSPVSCDQMSTETRSPANVIQQLIEPASESGQNQLPARLGDLDRDQYDEYMSPASEVIHRGGRRQDNSEKSIVLYRGGYRGLTDSNAAIGPGDSVSHVGVRLPDHEQDFRSAHDSYYDKFKRFRGPGPSESQYSNGDSSSRRSAVVYRGGGHRAPDMRTTSTPDYDAASRNVPLQNLNLQALIPIHQPDQTHSDMSVDIAQNLEDLASPAATNPDTRSQLRFYSTSYSSKKASSNHGCPKRRTAEAKERASDVRHHLNELLHSAPFDEQSMVSIQEAMTFQRAWDAKGRGTQLNCCDADNFRVMLHCKPRCGWNMSAARIFAKDFIEKYGRDPSEAQKVQEAFLVRISVLQRQYRETLQPPAKKLARMDEDRRVKRKKGLFDRRRFVVAHHPALKCYEDDIDAIGWKAMSSDESDHERSTGLSLPGLPQARLTGNYFVVKPQWRSTTMSQVFHGLDTLYPVIKTSVGYNQRGQLPHLRIHDPDRIGSRNQFPTYLPLLVYDSNWITETDDKANYEVFPNRTAKVRVNEMLDAVLQLLRVRGARAPTN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.3
3	0.24
4	0.22
5	0.19
6	0.15
7	0.15
8	0.15
9	0.12
10	0.13
11	0.12
12	0.12
13	0.11
14	0.12
15	0.12
16	0.12
17	0.11
18	0.1
19	0.09
20	0.08
21	0.07
22	0.07
23	0.07
24	0.07
25	0.07
26	0.08
27	0.08
28	0.08
29	0.09
30	0.09
31	0.08
32	0.08
33	0.09
34	0.09
35	0.11
36	0.11
37	0.13
38	0.16
39	0.2
40	0.25
41	0.33
42	0.37
43	0.38
44	0.42
45	0.48
46	0.5
47	0.56
48	0.55
49	0.52
50	0.48
51	0.45
52	0.41
53	0.32
54	0.28
55	0.19
56	0.13
57	0.08
58	0.08
59	0.08
60	0.07
61	0.07
62	0.06
63	0.07
64	0.09
65	0.15
66	0.2
67	0.24
68	0.28
69	0.34
70	0.38
71	0.46
72	0.45
73	0.42
74	0.43
75	0.48
76	0.48
77	0.47
78	0.46
79	0.38
80	0.37
81	0.36
82	0.31
83	0.21
84	0.2
85	0.17
86	0.14
87	0.16
88	0.18
89	0.18
90	0.19
91	0.2
92	0.19
93	0.2
94	0.21
95	0.21
96	0.22
97	0.21
98	0.21
99	0.21
100	0.19
101	0.16
102	0.15
103	0.12
104	0.08
105	0.08
106	0.07
107	0.07
108	0.08
109	0.1
110	0.1
111	0.13
112	0.14
113	0.13
114	0.16
115	0.17
116	0.18
117	0.18
118	0.22
119	0.21
120	0.27
121	0.3
122	0.29
123	0.32
124	0.34
125	0.36
126	0.34
127	0.33
128	0.28
129	0.26
130	0.24
131	0.2
132	0.18
133	0.15
134	0.12
135	0.1
136	0.1
137	0.08
138	0.1
139	0.14
140	0.14
141	0.16
142	0.2
143	0.22
144	0.23
145	0.25
146	0.25
147	0.28
148	0.34
149	0.35
150	0.33
151	0.34
152	0.35
153	0.35
154	0.32
155	0.27
156	0.22
157	0.19
158	0.18
159	0.17
160	0.15
161	0.15
162	0.14
163	0.13
164	0.14
165	0.15
166	0.15
167	0.14
168	0.14
169	0.13
170	0.13
171	0.14
172	0.15
173	0.17
174	0.19
175	0.19
176	0.19
177	0.19
178	0.2
179	0.19
180	0.16
181	0.14
182	0.14
183	0.15
184	0.16
185	0.18
186	0.18
187	0.19
188	0.22
189	0.22
190	0.22
191	0.24
192	0.23
193	0.21
194	0.21
195	0.2
196	0.17
197	0.13
198	0.12
199	0.1
200	0.09
201	0.1
202	0.08
203	0.07
204	0.06
205	0.07
206	0.06
207	0.05
208	0.06
209	0.06
210	0.07
211	0.08
212	0.12
213	0.13
214	0.13
215	0.15
216	0.16
217	0.15
218	0.16
219	0.19
220	0.25
221	0.3
222	0.32
223	0.36
224	0.42
225	0.49
226	0.59
227	0.66
228	0.67
229	0.73
230	0.8
231	0.86
232	0.89
233	0.93
234	0.93
235	0.91
236	0.9
237	0.85
238	0.8
239	0.7
240	0.62
241	0.5
242	0.4
243	0.34
244	0.25
245	0.24
246	0.2
247	0.19
248	0.17
249	0.2
250	0.22
251	0.25
252	0.26
253	0.22
254	0.25
255	0.25
256	0.26
257	0.24
258	0.21
259	0.17
260	0.21
261	0.22
262	0.19
263	0.21
264	0.2
265	0.19
266	0.19
267	0.2
268	0.18
269	0.18
270	0.17
271	0.17
272	0.2
273	0.22
274	0.24
275	0.26
276	0.22
277	0.23
278	0.27
279	0.32
280	0.32
281	0.33
282	0.34
283	0.33
284	0.35
285	0.33
286	0.31
287	0.24
288	0.23
289	0.21
290	0.18
291	0.17
292	0.16
293	0.15
294	0.13
295	0.13
296	0.12
297	0.16
298	0.16
299	0.15
300	0.18
301	0.19
302	0.2
303	0.2
304	0.21
305	0.16
306	0.15
307	0.24
308	0.23
309	0.29
310	0.3
311	0.34
312	0.34
313	0.34
314	0.37
315	0.28
316	0.28
317	0.23
318	0.24
319	0.23
320	0.25
321	0.25
322	0.22
323	0.21
324	0.18
325	0.18
326	0.16
327	0.18
328	0.19
329	0.24
330	0.26
331	0.26
332	0.28
333	0.3
334	0.32
335	0.33
336	0.31
337	0.3
338	0.3
339	0.33
340	0.31
341	0.28
342	0.25
343	0.2
344	0.17
345	0.13
346	0.1
347	0.08
348	0.07
349	0.07
350	0.07
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.05
355	0.04
356	0.04
357	0.08
358	0.08
359	0.09
360	0.12
361	0.14
362	0.19
363	0.2
364	0.22
365	0.19
366	0.21
367	0.23
368	0.22
369	0.26
370	0.21
371	0.23
372	0.22
373	0.2
374	0.19
375	0.16
376	0.13
377	0.09
378	0.08
379	0.05
380	0.05
381	0.05
382	0.04
383	0.06
384	0.06
385	0.05
386	0.06
387	0.08
388	0.08
389	0.08
390	0.1
391	0.08
392	0.08
393	0.08
394	0.07
395	0.06
396	0.06
397	0.06
398	0.04
399	0.04
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.05
404	0.04
405	0.05
406	0.07
407	0.09
408	0.11
409	0.11
410	0.11
411	0.1
412	0.11
413	0.09
414	0.1
415	0.11
416	0.11
417	0.15
418	0.15
419	0.16
420	0.17
421	0.18
422	0.17
423	0.14
424	0.15
425	0.13
426	0.13
427	0.16
428	0.15
429	0.15
430	0.19
431	0.2
432	0.18
433	0.17
434	0.17
435	0.15
436	0.16
437	0.16
438	0.13
439	0.13
440	0.18
441	0.19
442	0.18
443	0.17
444	0.16
445	0.15
446	0.14
447	0.14
448	0.08
449	0.07
450	0.09
451	0.1
452	0.11
453	0.12
454	0.12
455	0.12
456	0.18
457	0.26
458	0.31
459	0.34
460	0.33
461	0.36
462	0.36
463	0.35
464	0.29
465	0.21
466	0.15
467	0.11
468	0.1
469	0.07
470	0.06
471	0.06
472	0.06
473	0.05
474	0.07
475	0.08
476	0.09
477	0.1
478	0.11
479	0.18
480	0.24
481	0.27
482	0.28
483	0.32
484	0.39
485	0.48
486	0.52
487	0.53
488	0.52
489	0.52
490	0.53
491	0.51
492	0.46
493	0.4
494	0.38
495	0.32
496	0.28
497	0.24
498	0.23
499	0.21
500	0.17
501	0.15
502	0.12
503	0.13
504	0.14
505	0.13
506	0.13
507	0.14
508	0.14
509	0.14
510	0.13
511	0.1
512	0.1
513	0.1
514	0.08
515	0.07
516	0.06
517	0.06
518	0.06
519	0.07
520	0.06
521	0.06
522	0.06
523	0.06
524	0.07
525	0.07
526	0.08
527	0.08
528	0.08
529	0.09
530	0.1
531	0.09
532	0.09
533	0.1
534	0.11
535	0.16
536	0.16
537	0.16
538	0.19
539	0.2
540	0.2
541	0.25
542	0.25
543	0.25
544	0.31
545	0.3
546	0.27
547	0.31
548	0.39
549	0.37
550	0.42
551	0.39
552	0.36
553	0.4
554	0.4
555	0.38
556	0.31
557	0.28
558	0.23
559	0.2
560	0.18
561	0.15
562	0.15
563	0.12
564	0.14
565	0.12
566	0.11
567	0.1
568	0.13
569	0.14
570	0.14
571	0.19
572	0.19
573	0.2
574	0.2
575	0.21
576	0.21
577	0.22
578	0.21
579	0.18
580	0.16
581	0.16
582	0.15
583	0.14
584	0.11
585	0.08
586	0.08
587	0.06
588	0.05
589	0.05
590	0.05
591	0.05
592	0.05
593	0.05
594	0.05
595	0.06
596	0.06
597	0.06
598	0.06
599	0.06
600	0.08
601	0.07
602	0.08
603	0.09
604	0.11
605	0.12
606	0.14
607	0.13
608	0.15
609	0.17
610	0.2
611	0.22
612	0.23
613	0.22
614	0.24
615	0.26
616	0.28
617	0.26
618	0.23
619	0.23
620	0.19
621	0.21
622	0.19
623	0.17
624	0.13
625	0.12
626	0.11
627	0.11
628	0.1
629	0.09
630	0.12
631	0.13
632	0.17
633	0.22
634	0.24
635	0.25
636	0.26
637	0.28
638	0.24
639	0.23
640	0.19
641	0.15
642	0.13
643	0.11
644	0.1
645	0.08
646	0.08
647	0.08
648	0.09
649	0.07
650	0.08
651	0.13
652	0.13
653	0.21
654	0.27
655	0.32
656	0.41
657	0.47
658	0.51
659	0.54
660	0.58
661	0.55
662	0.55
663	0.53
664	0.45
665	0.4
666	0.36
667	0.3
668	0.26
669	0.21
670	0.15
671	0.1
672	0.1
673	0.11
674	0.1
675	0.09
676	0.08
677	0.08
678	0.08
679	0.08
680	0.06
681	0.05
682	0.05
683	0.07
684	0.09
685	0.1
686	0.1
687	0.1
688	0.1
689	0.09
690	0.09
691	0.08
692	0.06
693	0.06
694	0.06
695	0.06
696	0.07
697	0.06
698	0.06
699	0.06
700	0.07
701	0.07
702	0.12
703	0.14
704	0.15
705	0.2
706	0.22
707	0.22
708	0.26
709	0.29
710	0.3
711	0.29
712	0.3
713	0.32
714	0.35
715	0.37
716	0.32
717	0.31
718	0.3
719	0.31
720	0.29
721	0.23
722	0.22
723	0.22
724	0.24
725	0.26
726	0.24
727	0.27
728	0.3
729	0.31
730	0.3
731	0.29
732	0.29
733	0.23
734	0.26
735	0.24
736	0.25
737	0.22
738	0.21
739	0.2
740	0.22
741	0.23
742	0.24
743	0.22
744	0.19
745	0.19
746	0.19
747	0.2
748	0.18
749	0.21
750	0.19
751	0.18
752	0.16
753	0.17
754	0.17
755	0.16
756	0.14
757	0.1
758	0.07
759	0.07
760	0.07
761	0.07
762	0.08
763	0.1
764	0.12
765	0.12
766	0.13
767	0.13
768	0.12
769	0.13
770	0.14
771	0.12
772	0.12
773	0.14
774	0.15
775	0.14
776	0.16
777	0.16
778	0.13
779	0.14
780	0.12
781	0.11
782	0.09
783	0.09
784	0.07
785	0.07
786	0.08
787	0.08
788	0.09
789	0.1
790	0.15
791	0.15
792	0.17
793	0.24
794	0.3
795	0.31
796	0.36
797	0.43
798	0.43
799	0.47
800	0.46
801	0.39
802	0.34
803	0.36
804	0.3
805	0.23
806	0.18
807	0.16
808	0.16
809	0.16
810	0.15
811	0.11
812	0.12
813	0.12
814	0.11
815	0.11
816	0.09
817	0.09
818	0.09
819	0.08
820	0.07
821	0.06
822	0.05
823	0.05
824	0.05
825	0.04
826	0.05
827	0.05
828	0.05
829	0.05
830	0.06
831	0.07
832	0.08
833	0.1
834	0.12
835	0.14
836	0.17
837	0.19
838	0.19
839	0.22
840	0.21
841	0.21
842	0.22
843	0.2
844	0.17
845	0.19
846	0.2
847	0.17
848	0.27
849	0.3
850	0.29
851	0.32
852	0.36
853	0.41
854	0.44
855	0.49
856	0.49
857	0.52
858	0.55
859	0.59
860	0.59
861	0.52
862	0.48
863	0.44
864	0.36
865	0.3
866	0.25
867	0.18
868	0.17
869	0.16
870	0.19
871	0.22
872	0.2
873	0.19
874	0.19
875	0.21
876	0.25
877	0.31
878	0.28
879	0.25
880	0.28
881	0.3
882	0.29
883	0.28
884	0.27
885	0.23
886	0.23
887	0.25
888	0.25
889	0.26
890	0.27
891	0.32
892	0.31
893	0.29
894	0.29
895	0.25
896	0.24
897	0.22
898	0.24
899	0.19
900	0.18
901	0.17
902	0.2
903	0.21
904	0.19
905	0.18
906	0.18
907	0.2
908	0.21
909	0.21
910	0.17
911	0.15
912	0.16
913	0.15
914	0.14
915	0.11
916	0.1
917	0.1
918	0.13
919	0.13
920	0.15
921	0.19
922	0.2
923	0.19
924	0.18
925	0.18
926	0.16
927	0.17
928	0.19
929	0.14
930	0.12
931	0.12
932	0.11
933	0.1
934	0.1
935	0.09
936	0.04
937	0.05
938	0.05
939	0.05
940	0.05
941	0.05
942	0.07
943	0.08
944	0.09
945	0.11
946	0.17
947	0.21
948	0.23
949	0.26
950	0.27
951	0.3
952	0.32
953	0.31
954	0.27
955	0.29
956	0.3
957	0.35
958	0.36
959	0.36
960	0.35
961	0.37
962	0.39
963	0.36
964	0.43
965	0.44
966	0.5
967	0.58
968	0.66
969	0.7
970	0.69
971	0.75
972	0.7
973	0.69
974	0.66
975	0.65
976	0.66
977	0.69
978	0.72
979	0.66
980	0.63
981	0.58
982	0.53
983	0.48
984	0.44
985	0.44
986	0.38
987	0.37
988	0.37
989	0.36
990	0.35
991	0.32
992	0.27
993	0.18
994	0.17
995	0.16
996	0.14
997	0.13
998	0.12
999	0.1
1000	0.09
1001	0.1
1002	0.11
1003	0.11
1004	0.1
1005	0.1
1006	0.09
1007	0.1
1008	0.11
1009	0.11
1010	0.12
1011	0.11
1012	0.11
1013	0.17
1014	0.18
1015	0.17
1016	0.24
1017	0.26
1018	0.27
1019	0.32
1020	0.36
1021	0.34
1022	0.36
1023	0.4
1024	0.37
1025	0.41
1026	0.39
1027	0.35
1028	0.33
1029	0.29
1030	0.3
1031	0.27
1032	0.23
1033	0.16
1034	0.2
1035	0.21
1036	0.26
1037	0.35
1038	0.34
1039	0.35
1040	0.37
1041	0.44
1042	0.46
1043	0.49
1044	0.45
1045	0.44
1046	0.49
1047	0.5
1048	0.5
1049	0.44
1050	0.39
1051	0.35
1052	0.33
1053	0.26
1054	0.21
1055	0.2
1056	0.18
1057	0.22
1058	0.25
1059	0.25
1060	0.28
1061	0.35
1062	0.33
1063	0.32
1064	0.35
1065	0.34
1066	0.41
1067	0.43
1068	0.4
1069	0.37
1070	0.37
1071	0.35
1072	0.35
1073	0.32
1074	0.22
1075	0.21
1076	0.21
1077	0.14
1078	0.17
1079	0.18
1080	0.21
1081	0.25
1082	0.29
1083	0.29
1084	0.32
1085	0.36
1086	0.36
1087	0.4
1088	0.39
1089	0.43
1090	0.47
1091	0.52
1092	0.52
1093	0.58
1094	0.58
1095	0.55
1096	0.54
1097	0.54
1098	0.54
1099	0.55
1100	0.58
1101	0.59
1102	0.66
1103	0.71
1104	0.78
1105	0.75
1106	0.72
1107	0.73
1108	0.74
1109	0.74
1110	0.75
1111	0.78
1112	0.79
1113	0.83
1114	0.85
1115	0.8
1116	0.77
1117	0.66
1118	0.58
1119	0.58
1120	0.55
1121	0.54
1122	0.54
1123	0.51
1124	0.48
1125	0.5
1126	0.49
1127	0.38
1128	0.32
1129	0.25
1130	0.18
1131	0.17
1132	0.17
1133	0.15
1134	0.15
1135	0.14
1136	0.13
1137	0.1
1138	0.09
1139	0.09
1140	0.08
1141	0.07
1142	0.09
1143	0.12
1144	0.15
1145	0.22
1146	0.24
1147	0.24
1148	0.24
1149	0.24
1150	0.21
1151	0.21
1152	0.22
1153	0.17
1154	0.16
1155	0.16
1156	0.17
1157	0.23
1158	0.25
1159	0.23
1160	0.18
1161	0.21
1162	0.22
1163	0.24
1164	0.25
1165	0.23
1166	0.24
1167	0.27
1168	0.27
1169	0.26
1170	0.31
1171	0.35
1172	0.36
1173	0.39
1174	0.41
1175	0.41
1176	0.47
1177	0.49
1178	0.53
1179	0.53
1180	0.51
1181	0.46
1182	0.45
1183	0.43
1184	0.37
1185	0.33
1186	0.22
1187	0.16
1188	0.16
1189	0.17
1190	0.13
1191	0.12
1192	0.13
1193	0.13
1194	0.13
1195	0.14
1196	0.13
1197	0.21
1198	0.27
1199	0.32
1200	0.35
1201	0.4
1202	0.45
1203	0.46
1204	0.47
1205	0.46
1206	0.44
1207	0.46
1208	0.48
1209	0.45
1210	0.43
1211	0.47
1212	0.51
1213	0.44
1214	0.44
1215	0.44
1216	0.42
1217	0.44
1218	0.47
1219	0.5
1220	0.51
1221	0.5
1222	0.47
1223	0.42
1224	0.45
1225	0.44
1226	0.4
1227	0.31
1228	0.25
1229	0.26
1230	0.25
1231	0.25
1232	0.23
1233	0.19
1234	0.19
1235	0.19
1236	0.18
1237	0.17
1238	0.2
1239	0.23
1240	0.24
1241	0.26
1242	0.26
1243	0.26
1244	0.27
1245	0.25
1246	0.27
1247	0.3
1248	0.28
1249	0.32
1250	0.34
1251	0.34
1252	0.39
1253	0.43
1254	0.45
1255	0.45
1256	0.5
1257	0.49
1258	0.5
1259	0.5
1260	0.44
1261	0.41
1262	0.34
1263	0.27
1264	0.2
1265	0.16
1266	0.11
1267	0.1
1268	0.1
1269	0.11
1270	0.12
1271	0.13
1272	0.16

A0A409YTK4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer